MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrobacter hamburgensis X14 plasmid 2

Total Repeats: 3593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007960	CGC	3	9	26834	26842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109512
502	NC_007960	GCA	2	6	26854	26859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109512
503	NC_007960	GAC	2	6	26994	26999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109512
504	NC_007960	ACTG	2	8	27017	27024	25 %	25 %	25 %	25 %	92109512
505	NC_007960	TCGC	2	8	27034	27041	0 %	25 %	25 %	50 %	92109512
506	NC_007960	ATG	2	6	27091	27096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92109512
507	NC_007960	GC	3	6	27103	27108	0 %	0 %	50 %	50 %	92109512
508	NC_007960	CGA	2	6	27116	27121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109512
509	NC_007960	AGC	2	6	27197	27202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109512
510	NC_007960	CT	3	6	27208	27213	0 %	50 %	0 %	50 %	92109512
511	NC_007960	GGC	2	6	27299	27304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109512
512	NC_007960	GCGG	2	8	27309	27316	0 %	0 %	75 %	25 %	92109512
513	NC_007960	AGT	2	6	27407	27412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92109512
514	NC_007960	GC	3	6	27735	27740	0 %	0 %	50 %	50 %	92109513
515	NC_007960	CAT	2	6	27792	27797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92109513
516	NC_007960	TGT	2	6	27801	27806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	92109513
517	NC_007960	GCGAT	2	10	27812	27821	20 %	20 %	40 %	20 %	92109513
518	NC_007960	CGG	2	6	27822	27827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109513
519	NC_007960	TTG	2	6	27836	27841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	92109513
520	NC_007960	AGGA	2	8	27878	27885	50 %	0 %	50 %	0 %	92109513
521	NC_007960	GCG	2	6	27912	27917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109513
522	NC_007960	TCC	2	6	28043	28048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	92109513
523	NC_007960	GC	3	6	28110	28115	0 %	0 %	50 %	50 %	92109513
524	NC_007960	GAAC	2	8	28130	28137	50 %	0 %	25 %	25 %	92109513
525	NC_007960	CG	3	6	28219	28224	0 %	0 %	50 %	50 %	92109513
526	NC_007960	GCG	2	6	28240	28245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109513
527	NC_007960	GTC	2	6	28370	28375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109513
528	NC_007960	GCT	2	6	28389	28394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109513
529	NC_007960	GAT	2	6	28440	28445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92109513
530	NC_007960	CAC	2	6	28446	28451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92109513
531	NC_007960	GGCC	2	8	28482	28489	0 %	0 %	50 %	50 %	92109513
532	NC_007960	CTGTG	2	10	28541	28550	0 %	40 %	40 %	20 %	92109513
533	NC_007960	CCG	2	6	28577	28582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109513
534	NC_007960	CGA	2	6	28620	28625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109513
535	NC_007960	CGC	2	6	28653	28658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109513
536	NC_007960	CGG	2	6	28665	28670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109513
537	NC_007960	GCT	2	6	28695	28700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109513
538	NC_007960	TCG	2	6	28708	28713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109513
539	NC_007960	GCG	3	9	28714	28722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109513
540	NC_007960	G	6	6	28722	28727	0 %	0 %	100 %	0 %	92109513
541	NC_007960	CTC	2	6	28735	28740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	92109513
542	NC_007960	GCG	2	6	28860	28865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109513
543	NC_007960	GATG	2	8	28884	28891	25 %	25 %	50 %	0 %	92109513
544	NC_007960	TGCCGT	2	12	28950	28961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109513
545	NC_007960	CGA	2	6	29007	29012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109513
546	NC_007960	CGG	3	9	29069	29077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109513
547	NC_007960	CGA	2	6	29127	29132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109513
548	NC_007960	TCG	2	6	29138	29143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109513
549	NC_007960	GGCC	2	8	29154	29161	0 %	0 %	50 %	50 %	92109513
550	NC_007960	TC	3	6	29187	29192	0 %	50 %	0 %	50 %	92109513
551	NC_007960	GTC	2	6	29320	29325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109513
552	NC_007960	GTC	2	6	29455	29460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109513
553	NC_007960	GAA	2	6	29473	29478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92109513
554	NC_007960	GAGC	2	8	29522	29529	25 %	0 %	50 %	25 %	92109513
555	NC_007960	TGT	2	6	29546	29551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	92109513
556	NC_007960	TCC	2	6	29582	29587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	92109513
557	NC_007960	CAA	2	6	29613	29618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92109513
558	NC_007960	CT	3	6	29740	29745	0 %	50 %	0 %	50 %	92109513
559	NC_007960	CGGC	2	8	29877	29884	0 %	0 %	50 %	50 %	92109513
560	NC_007960	TCA	2	6	29920	29925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92109513
561	NC_007960	TAG	2	6	29927	29932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92109513
562	NC_007960	TCG	2	6	29939	29944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109513
563	NC_007960	TGC	2	6	29951	29956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109513
564	NC_007960	CGG	2	6	29970	29975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109513
565	NC_007960	GCC	2	6	29994	29999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109513
566	NC_007960	TCG	2	6	30011	30016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109513
567	NC_007960	CAT	2	6	30024	30029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92109513
568	NC_007960	ACT	2	6	30057	30062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92109513
569	NC_007960	TG	3	6	30541	30546	0 %	50 %	50 %	0 %	92109514
570	NC_007960	CGTC	2	8	30585	30592	0 %	25 %	25 %	50 %	92109514
571	NC_007960	CGC	2	6	30679	30684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109514
572	NC_007960	CAG	2	6	30856	30861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109514
573	NC_007960	GC	3	6	30924	30929	0 %	0 %	50 %	50 %	92109514
574	NC_007960	GAT	3	9	30934	30942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92109514
575	NC_007960	CCG	2	6	30978	30983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109514
576	NC_007960	CAG	2	6	30997	31002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109514
577	NC_007960	TTC	2	6	31024	31029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92109514
578	NC_007960	CCA	2	6	31032	31037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92109514
579	NC_007960	CGGC	2	8	31085	31092	0 %	0 %	50 %	50 %	92109514
580	NC_007960	CGA	2	6	31173	31178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109514
581	NC_007960	CAG	2	6	31195	31200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109514
582	NC_007960	CGGG	2	8	31206	31213	0 %	0 %	75 %	25 %	92109514
583	NC_007960	CGC	2	6	31241	31246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109514
584	NC_007960	GAG	2	6	31286	31291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92109514
585	NC_007960	GATC	2	8	31372	31379	25 %	25 %	25 %	25 %	92109515
586	NC_007960	ATC	2	6	31502	31507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92109515
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588	NC_007960	CCG	2	6	31552	31557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109515
589	NC_007960	CGC	2	6	31562	31567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109515
590	NC_007960	TC	3	6	31582	31587	0 %	50 %	0 %	50 %	92109515
591	NC_007960	GGC	2	6	31588	31593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109515
592	NC_007960	CGCCGG	2	12	31627	31638	0 %	0 %	50 %	50 %	92109515
593	NC_007960	GTC	2	6	31793	31798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109515
594	NC_007960	GCC	2	6	31874	31879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109515
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597	NC_007960	GCA	2	6	31948	31953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109515
598	NC_007960	CGA	2	6	32095	32100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109516
599	NC_007960	GCG	2	6	32117	32122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109516
600	NC_007960	GCCG	2	8	32164	32171	0 %	0 %	50 %	50 %	92109516
601	NC_007960	CGG	2	6	32184	32189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109516
602	NC_007960	GAA	2	6	32206	32211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92109516
603	NC_007960	AGG	2	6	32249	32254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92109516
604	NC_007960	C	6	6	32269	32274	0 %	0 %	0 %	100 %	92109516
605	NC_007960	CGGTGC	2	12	32322	32333	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	92109516
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607	NC_007960	CGA	2	6	32400	32405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109516
608	NC_007960	GCTT	2	8	32424	32431	0 %	50 %	25 %	25 %	92109516
609	NC_007960	ACG	2	6	32432	32437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109516
610	NC_007960	TCT	2	6	32442	32447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92109516
611	NC_007960	CGT	2	6	32509	32514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109516
612	NC_007960	TGT	2	6	32517	32522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	92109516
613	NC_007960	ATG	2	6	32534	32539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92109516
614	NC_007960	TGA	2	6	32646	32651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92109516
615	NC_007960	CGC	2	6	32664	32669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109516
616	NC_007960	TCC	2	6	32801	32806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	92109516
617	NC_007960	GGC	2	6	32836	32841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109516
618	NC_007960	GC	3	6	32876	32881	0 %	0 %	50 %	50 %	92109516
619	NC_007960	GCTG	2	8	32887	32894	0 %	25 %	50 %	25 %	92109516
620	NC_007960	GCA	2	6	32901	32906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109516
621	NC_007960	GTC	2	6	32908	32913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109516
622	NC_007960	CGG	2	6	32925	32930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109516
623	NC_007960	ACC	2	6	32945	32950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92109516
624	NC_007960	T	6	6	33003	33008	0 %	100 %	0 %	0 %	92109516
625	NC_007960	CAC	2	6	33057	33062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92109516
626	NC_007960	GAT	2	6	33121	33126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92109516
627	NC_007960	CCA	2	6	33144	33149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92109516
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629	NC_007960	CTGCGC	2	12	33283	33294	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	92109516
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