MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrobacter hamburgensis X14 plasmid 1

Total Repeats: 4241

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007959	AAG	3	9	138	146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92109251
2	NC_007959	GTG	2	6	186	191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92109251
3	NC_007959	TTGC	2	8	293	300	0 %	50 %	25 %	25 %	92109251
4	NC_007959	CT	3	6	315	320	0 %	50 %	0 %	50 %	92109251
5	NC_007959	GAA	2	6	333	338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92109251
6	NC_007959	GAC	2	6	410	415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109251
7	NC_007959	CTG	2	6	435	440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109251
8	NC_007959	TCG	2	6	469	474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109251
9	NC_007959	CTG	2	6	507	512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109251
10	NC_007959	GGC	2	6	516	521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109251
11	NC_007959	CAT	2	6	524	529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92109251
12	NC_007959	CGACG	2	10	530	539	20 %	0 %	40 %	40 %	92109251
13	NC_007959	CGA	2	6	559	564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109251
14	NC_007959	GAA	2	6	605	610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92109251
15	NC_007959	GAT	2	6	741	746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92109251
16	NC_007959	AAC	2	6	787	792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92109251
17	NC_007959	AGC	2	6	803	808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109251
18	NC_007959	CGC	3	9	870	878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109251
19	NC_007959	CGC	2	6	882	887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109251
20	NC_007959	TGA	2	6	928	933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92109251
21	NC_007959	GCTC	2	8	1005	1012	0 %	25 %	25 %	50 %	92109251
22	NC_007959	GCC	2	6	1075	1080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109251
23	NC_007959	CAAA	2	8	1092	1099	75 %	0 %	0 %	25 %	92109251
24	NC_007959	CTG	2	6	1240	1245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109251
25	NC_007959	CTC	2	6	1266	1271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	92109251
26	NC_007959	CGC	2	6	1272	1277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109251
27	NC_007959	CG	3	6	1284	1289	0 %	0 %	50 %	50 %	92109251
28	NC_007959	CTG	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109251
29	NC_007959	CGC	2	6	1369	1374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109251
30	NC_007959	ACG	2	6	1376	1381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109251
31	NC_007959	CAC	2	6	1421	1426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92109251
32	NC_007959	TCA	2	6	2533	2538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92109252
33	NC_007959	ATC	2	6	2541	2546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92109252
34	NC_007959	GCC	2	6	2547	2552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109252
35	NC_007959	GCT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109252
36	NC_007959	GCC	2	6	2647	2652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109252
37	NC_007959	GC	3	6	2709	2714	0 %	0 %	50 %	50 %	92109253
38	NC_007959	CTG	2	6	2715	2720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109253
39	NC_007959	AGGA	2	8	2734	2741	50 %	0 %	50 %	0 %	92109253
40	NC_007959	CCG	2	6	2750	2755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109253
41	NC_007959	ACG	2	6	2779	2784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109253
42	NC_007959	GGC	2	6	2831	2836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109253
43	NC_007959	CCAGCT	2	12	2843	2854	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	92109253
44	NC_007959	CTGC	2	8	2900	2907	0 %	25 %	25 %	50 %	92109253
45	NC_007959	TGC	2	6	2921	2926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109253
46	NC_007959	ACC	2	6	3091	3096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92109253
47	NC_007959	CG	4	8	3116	3123	0 %	0 %	50 %	50 %	92109253
48	NC_007959	ATG	2	6	3154	3159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92109253
49	NC_007959	TG	3	6	3197	3202	0 %	50 %	50 %	0 %	92109253
50	NC_007959	GCACCT	2	12	3224	3235	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	92109253
51	NC_007959	AGT	2	6	3278	3283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92109253
52	NC_007959	GATG	2	8	3320	3327	25 %	25 %	50 %	0 %	92109253
53	NC_007959	CTC	2	6	3336	3341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	92109253
54	NC_007959	TGA	2	6	3374	3379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92109253
55	NC_007959	GCGTG	2	10	3380	3389	0 %	20 %	60 %	20 %	92109253
56	NC_007959	GTCG	2	8	3411	3418	0 %	25 %	50 %	25 %	92109253
57	NC_007959	CCG	2	6	3494	3499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109253
58	NC_007959	GC	3	6	3526	3531	0 %	0 %	50 %	50 %	92109253
59	NC_007959	CTG	2	6	3540	3545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109253
60	NC_007959	CAC	2	6	3549	3554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92109253
61	NC_007959	ACA	2	6	4087	4092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92109254
62	NC_007959	CGAT	2	8	4170	4177	25 %	25 %	25 %	25 %	92109254
63	NC_007959	ATC	2	6	4286	4291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92109254
64	NC_007959	GGA	2	6	4333	4338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92109254
65	NC_007959	GC	3	6	4368	4373	0 %	0 %	50 %	50 %	92109254
66	NC_007959	GCGTT	2	10	4380	4389	0 %	40 %	40 %	20 %	92109254
67	NC_007959	TCG	2	6	4406	4411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109254
68	NC_007959	GCC	2	6	4478	4483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109254
69	NC_007959	GC	3	6	4500	4505	0 %	0 %	50 %	50 %	92109254
70	NC_007959	CT	3	6	4543	4548	0 %	50 %	0 %	50 %	92109254
71	NC_007959	GAT	2	6	4624	4629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92109254
72	NC_007959	CGG	2	6	4638	4643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109254
73	NC_007959	GGC	2	6	4677	4682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109254
74	NC_007959	CGG	2	6	4810	4815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109254
75	NC_007959	GCC	2	6	4860	4865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109254
76	NC_007959	TCA	2	6	4899	4904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92109254
77	NC_007959	GCGG	2	8	4913	4920	0 %	0 %	75 %	25 %	92109254
78	NC_007959	CGG	2	6	5015	5020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109254
79	NC_007959	GTT	2	6	5071	5076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	92109254
80	NC_007959	TATCA	2	10	5142	5151	40 %	40 %	0 %	20 %	92109255
81	NC_007959	TCG	2	6	5161	5166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109255
82	NC_007959	CCG	2	6	5211	5216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109255
83	NC_007959	GAG	2	6	5296	5301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92109255
84	NC_007959	CAA	2	6	5313	5318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92109255
85	NC_007959	CGA	2	6	5355	5360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109255
86	NC_007959	ACG	2	6	5423	5428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109255
87	NC_007959	TCCC	2	8	5453	5460	0 %	25 %	0 %	75 %	92109255
88	NC_007959	CGT	2	6	5583	5588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109255
89	NC_007959	GGA	2	6	5681	5686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92109255
90	NC_007959	CGA	2	6	5802	5807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109255
91	NC_007959	CG	3	6	5837	5842	0 %	0 %	50 %	50 %	92109255
92	NC_007959	CTG	2	6	5860	5865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109255
93	NC_007959	GAT	2	6	5868	5873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92109255
94	NC_007959	CG	4	8	5891	5898	0 %	0 %	50 %	50 %	92109255
95	NC_007959	CGC	2	6	5954	5959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109255
96	NC_007959	GC	3	6	6122	6127	0 %	0 %	50 %	50 %	92109256
97	NC_007959	CAA	2	6	6193	6198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92109256
98	NC_007959	CAT	2	6	6217	6222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92109256
99	NC_007959	GGCCGC	2	12	6226	6237	0 %	0 %	50 %	50 %	92109256
100	NC_007959	TCC	2	6	6255	6260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	92109256
101	NC_007959	CG	3	6	6267	6272	0 %	0 %	50 %	50 %	92109256
102	NC_007959	GC	4	8	6273	6280	0 %	0 %	50 %	50 %	92109256
103	NC_007959	CAT	2	6	6295	6300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92109256
104	NC_007959	TGCA	2	8	6353	6360	25 %	25 %	25 %	25 %	92109256
105	NC_007959	GAA	2	6	6377	6382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92109256
106	NC_007959	TGA	2	6	6423	6428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92109256
107	NC_007959	GCTC	2	8	6435	6442	0 %	25 %	25 %	50 %	92109256
108	NC_007959	CCG	3	9	6459	6467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109256
109	NC_007959	CGC	2	6	6494	6499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109256
110	NC_007959	GTC	2	6	6500	6505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109256
111	NC_007959	GCTCG	2	10	6553	6562	0 %	20 %	40 %	40 %	92109256
112	NC_007959	CGG	3	9	6571	6579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109256
113	NC_007959	AGG	2	6	6585	6590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92109256
114	NC_007959	CG	3	6	6665	6670	0 %	0 %	50 %	50 %	92109256
115	NC_007959	GAG	2	6	6770	6775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92109256
116	NC_007959	CCG	2	6	6781	6786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109256
117	NC_007959	CGG	2	6	6862	6867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109256
118	NC_007959	GAG	2	6	6899	6904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92109256
119	NC_007959	GCC	2	6	6957	6962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109256
120	NC_007959	GATG	2	8	7042	7049	25 %	25 %	50 %	0 %	92109256
121	NC_007959	CGC	2	6	7192	7197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109256
122	NC_007959	AAG	2	6	7338	7343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92109257
123	NC_007959	CAT	2	6	7385	7390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92109257
124	NC_007959	CGC	2	6	7408	7413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109257
125	NC_007959	GCG	2	6	7443	7448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109257
126	NC_007959	GTG	2	6	7482	7487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92109257
127	NC_007959	GGAC	2	8	7489	7496	25 %	0 %	50 %	25 %	92109257
128	NC_007959	CGG	3	9	7504	7512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109257
129	NC_007959	GCC	2	6	7730	7735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109257
130	NC_007959	TCG	3	9	7744	7752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109257
131	NC_007959	CGGC	2	8	7775	7782	0 %	0 %	50 %	50 %	92109257
132	NC_007959	GCT	2	6	7784	7789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109257
133	NC_007959	GAC	2	6	7884	7889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109257
134	NC_007959	CGA	2	6	8014	8019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109257
135	NC_007959	GGA	2	6	8021	8026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92109257
136	NC_007959	GGT	2	6	8066	8071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92109257
137	NC_007959	GATC	2	8	8078	8085	25 %	25 %	25 %	25 %	92109257
138	NC_007959	GC	3	6	8127	8132	0 %	0 %	50 %	50 %	92109257
139	NC_007959	CTGCAT	2	12	8148	8159	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	92109257
140	NC_007959	CG	3	6	8302	8307	0 %	0 %	50 %	50 %	92109257
141	NC_007959	CTA	2	6	8309	8314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92109257
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267	NC_007959	CGC	2	6	16622	16627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109262
268	NC_007959	GA	3	6	16656	16661	50 %	0 %	50 %	0 %	92109262
269	NC_007959	ACAGA	2	10	16691	16700	60 %	0 %	20 %	20 %	92109262
270	NC_007959	CG	3	6	19091	19096	0 %	0 %	50 %	50 %	92109263
271	NC_007959	GAT	2	6	19156	19161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92109263
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273	NC_007959	TCG	2	6	19191	19196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109263
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400	NC_007959	CGC	2	6	27139	27144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109267
401	NC_007959	CGG	2	6	27161	27166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109267
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