MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Neorickettsia sennetsu str. Miyayama chromosome

Total Repeats: 533

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007798	AAAAG	2	10	1575	1584	80 %	0 %	20 %	0 %	88608502
2	NC_007798	GAGAA	2	10	1740	1749	60 %	0 %	40 %	0 %	88608502
3	NC_007798	TCTTT	2	10	2637	2646	0 %	80 %	0 %	20 %	88608550
4	NC_007798	CTTCG	2	10	3335	3344	0 %	40 %	20 %	40 %	88608550
5	NC_007798	AATTT	2	10	4140	4149	40 %	60 %	0 %	0 %	88608480
6	NC_007798	TCTTT	2	10	8109	8118	0 %	80 %	0 %	20 %	88608655
7	NC_007798	TTTCT	2	10	9812	9821	0 %	80 %	0 %	20 %	88608443
8	NC_007798	CGTTT	2	10	10645	10654	0 %	60 %	20 %	20 %	88608767
9	NC_007798	GGTGT	2	10	12002	12011	0 %	40 %	60 %	0 %	88608767
10	NC_007798	GAAAA	2	10	12836	12845	80 %	0 %	20 %	0 %	88608294
11	NC_007798	CTTTC	2	10	13624	13633	0 %	60 %	0 %	40 %	88608023
12	NC_007798	TTTTC	2	10	13947	13956	0 %	80 %	0 %	20 %	88608023
13	NC_007798	CTTAT	2	10	14939	14948	20 %	60 %	0 %	20 %	88608792
14	NC_007798	AACCA	2	10	15003	15012	60 %	0 %	0 %	40 %	88608792
15	NC_007798	AAAAG	2	10	20559	20568	80 %	0 %	20 %	0 %	88608147
16	NC_007798	CAGAT	2	10	22037	22046	40 %	20 %	20 %	20 %	88608498
17	NC_007798	TTTTG	2	10	23230	23239	0 %	80 %	20 %	0 %	88608045
18	NC_007798	GCACA	2	10	31418	31427	40 %	0 %	20 %	40 %	88608305
19	NC_007798	GCGTA	2	10	32473	32482	20 %	20 %	40 %	20 %	88608009
20	NC_007798	CGTTG	2	10	32751	32760	0 %	40 %	40 %	20 %	88608009
21	NC_007798	TGATT	2	10	35243	35252	20 %	60 %	20 %	0 %	88608780
22	NC_007798	TTTCT	2	10	38674	38683	0 %	80 %	0 %	20 %	88608193
23	NC_007798	TTGAT	2	10	39982	39991	20 %	60 %	20 %	0 %	88608193
24	NC_007798	CTTCT	2	10	40012	40021	0 %	60 %	0 %	40 %	88608193
25	NC_007798	TTTGT	2	10	41442	41451	0 %	80 %	20 %	0 %	88608626
26	NC_007798	TTTGT	2	10	42792	42801	0 %	80 %	20 %	0 %	88608626
27	NC_007798	ATTTG	2	10	43474	43483	20 %	60 %	20 %	0 %	88608626
28	NC_007798	AAGAA	2	10	46150	46159	80 %	0 %	20 %	0 %	88608010
29	NC_007798	TTTGT	3	15	47087	47101	0 %	80 %	20 %	0 %	88608314
30	NC_007798	TGTTT	2	10	47365	47374	0 %	80 %	20 %	0 %	88608109
31	NC_007798	GCAAA	2	10	47798	47807	60 %	0 %	20 %	20 %	88608109
32	NC_007798	TTGCT	2	10	56330	56339	0 %	60 %	20 %	20 %	88608332
33	NC_007798	AAAAT	2	10	57504	57513	80 %	20 %	0 %	0 %	88608292
34	NC_007798	GCTTT	2	10	59687	59696	0 %	60 %	20 %	20 %	88608814
35	NC_007798	TAGTC	2	10	61223	61232	20 %	40 %	20 %	20 %	88608871
36	NC_007798	AGGTG	2	10	62042	62051	20 %	20 %	60 %	0 %	88608871
37	NC_007798	GATAG	2	10	62319	62328	40 %	20 %	40 %	0 %	88608871
38	NC_007798	GAGGG	2	10	64301	64310	20 %	0 %	80 %	0 %	88608361
39	NC_007798	TTTTC	2	10	65242	65251	0 %	80 %	0 %	20 %	88608091
40	NC_007798	CTCAA	2	10	67269	67278	40 %	20 %	0 %	40 %	88608643
41	NC_007798	AGCAG	2	10	67866	67875	40 %	0 %	40 %	20 %	88608450
42	NC_007798	CAAGA	2	10	68678	68687	60 %	0 %	20 %	20 %	88608483
43	NC_007798	ATGTG	2	10	70004	70013	20 %	40 %	40 %	0 %	88608158
44	NC_007798	CTGTA	2	10	70893	70902	20 %	40 %	20 %	20 %	88608163
45	NC_007798	TTTGC	2	10	77535	77544	0 %	60 %	20 %	20 %	88608578
46	NC_007798	GTTAA	2	10	78007	78016	40 %	40 %	20 %	0 %	88608400
47	NC_007798	TAGAA	2	10	79225	79234	60 %	20 %	20 %	0 %	88608514
48	NC_007798	GTTCT	2	10	79762	79771	0 %	60 %	20 %	20 %	88608610
49	NC_007798	TTCCA	2	10	82509	82518	20 %	40 %	0 %	40 %	88608609
50	NC_007798	AGTTG	2	10	83346	83355	20 %	40 %	40 %	0 %	88608258
51	NC_007798	TGGTA	2	10	85093	85102	20 %	40 %	40 %	0 %	88608727
52	NC_007798	GCTAA	2	10	87150	87159	40 %	20 %	20 %	20 %	88608265
53	NC_007798	CTGTA	2	10	91111	91120	20 %	40 %	20 %	20 %	88608496
54	NC_007798	CTTTT	2	10	95930	95939	0 %	80 %	0 %	20 %	88608018
55	NC_007798	GAGAA	2	10	97911	97920	60 %	0 %	40 %	0 %	88608043
56	NC_007798	AACAT	2	10	98767	98776	60 %	20 %	0 %	20 %	88608043
57	NC_007798	GCGGG	2	10	101935	101944	0 %	0 %	80 %	20 %	88608189
58	NC_007798	TATCT	2	10	103791	103800	20 %	60 %	0 %	20 %	88608134
59	NC_007798	GATCT	2	10	103881	103890	20 %	40 %	20 %	20 %	88608134
60	NC_007798	AGCAT	2	10	104386	104395	40 %	20 %	20 %	20 %	88608134
61	NC_007798	GGTTT	2	10	106005	106014	0 %	60 %	40 %	0 %	88608405
62	NC_007798	GTAGT	2	10	108811	108820	20 %	40 %	40 %	0 %	88608054
63	NC_007798	TGAGG	2	10	112069	112078	20 %	20 %	60 %	0 %	88608320
64	NC_007798	AAAAG	2	10	112297	112306	80 %	0 %	20 %	0 %	88608320
65	NC_007798	ACCAC	2	10	114935	114944	40 %	0 %	0 %	60 %	88608459
66	NC_007798	AACCT	2	10	115052	115061	40 %	20 %	0 %	40 %	88608459
67	NC_007798	AATGG	2	10	116627	116636	40 %	20 %	40 %	0 %	88608752
68	NC_007798	CACAA	2	10	116706	116715	60 %	0 %	0 %	40 %	88608752
69	NC_007798	AAGCA	2	10	116733	116742	60 %	0 %	20 %	20 %	88608752
70	NC_007798	GAGCT	2	10	121719	121728	20 %	20 %	40 %	20 %	88608363
71	NC_007798	TTGGA	2	10	122617	122626	20 %	40 %	40 %	0 %	88607987
72	NC_007798	AGCAC	2	10	123764	123773	40 %	0 %	20 %	40 %	88608169
73	NC_007798	ACACC	2	10	124005	124014	40 %	0 %	0 %	60 %	88608169
74	NC_007798	AGACA	2	10	124399	124408	60 %	0 %	20 %	20 %	88608169
75	NC_007798	TTTCC	2	10	131911	131920	0 %	60 %	0 %	40 %	88608650
76	NC_007798	GTCGA	2	10	136207	136216	20 %	20 %	40 %	20 %	88608539
77	NC_007798	CACTG	2	10	137984	137993	20 %	20 %	20 %	40 %	88608539
78	NC_007798	CTTTC	2	10	139002	139011	0 %	60 %	0 %	40 %	88608112
79	NC_007798	CGTTA	2	10	142359	142368	20 %	40 %	20 %	20 %	88607979
80	NC_007798	TGTAT	2	10	143141	143150	20 %	60 %	20 %	0 %	88608532
81	NC_007798	GTGAT	2	10	145629	145638	20 %	40 %	40 %	0 %	88608110
82	NC_007798	GGCAA	2	10	147375	147384	40 %	0 %	40 %	20 %	88608617
83	NC_007798	TTTGA	2	10	147936	147945	20 %	60 %	20 %	0 %	88608617
84	NC_007798	TTTTG	2	10	151669	151678	0 %	80 %	20 %	0 %	88608654
85	NC_007798	ACTTG	2	10	152959	152968	20 %	40 %	20 %	20 %	88608654
86	NC_007798	TGAGG	2	10	153873	153882	20 %	20 %	60 %	0 %	88608028
87	NC_007798	TTGAC	2	10	155084	155093	20 %	40 %	20 %	20 %	88608740
88	NC_007798	TGATT	2	10	156134	156143	20 %	60 %	20 %	0 %	88608740
89	NC_007798	GCCAG	2	10	158424	158433	20 %	0 %	40 %	40 %	88608349
90	NC_007798	CAGAT	2	10	159300	159309	40 %	20 %	20 %	20 %	88608349
91	NC_007798	TTTCT	2	10	162108	162117	0 %	80 %	0 %	20 %	88608540
92	NC_007798	TTTCT	2	10	165389	165398	0 %	80 %	0 %	20 %	88608791
93	NC_007798	GTTAA	2	10	166418	166427	40 %	40 %	20 %	0 %	88608592
94	NC_007798	GTCTG	2	10	168165	168174	0 %	40 %	40 %	20 %	88608156
95	NC_007798	TGGGT	2	10	169268	169277	0 %	40 %	60 %	0 %	88608256
96	NC_007798	TAAAT	2	10	169406	169415	60 %	40 %	0 %	0 %	88608256
97	NC_007798	AAATT	2	10	169756	169765	60 %	40 %	0 %	0 %	88608256
98	NC_007798	CTGTC	2	10	169769	169778	0 %	40 %	20 %	40 %	88608256
99	NC_007798	GGTAG	2	10	169791	169800	20 %	20 %	60 %	0 %	88608256
100	NC_007798	AAGTA	2	10	173882	173891	60 %	20 %	20 %	0 %	88608861
101	NC_007798	TTGGT	2	10	174625	174634	0 %	60 %	40 %	0 %	88608231
102	NC_007798	CTTTT	2	10	177102	177111	0 %	80 %	0 %	20 %	88608465
103	NC_007798	TGAAA	2	10	177871	177880	60 %	20 %	20 %	0 %	88608821
104	NC_007798	CTTGT	2	10	179490	179499	0 %	60 %	20 %	20 %	88607971
105	NC_007798	TGGTA	2	10	182964	182973	20 %	40 %	40 %	0 %	88608710
106	NC_007798	CAGAT	2	10	183814	183823	40 %	20 %	20 %	20 %	88608618
107	NC_007798	TCCCT	2	10	184250	184259	0 %	40 %	0 %	60 %	88608618
108	NC_007798	GGAGA	2	10	185805	185814	40 %	0 %	60 %	0 %	88608790
109	NC_007798	TTAGT	2	10	189131	189140	20 %	60 %	20 %	0 %	88608549
110	NC_007798	CTCTG	2	10	189240	189249	0 %	40 %	20 %	40 %	88608549
111	NC_007798	GGGCT	2	10	191588	191597	0 %	20 %	60 %	20 %	88608367
112	NC_007798	TATGT	2	10	193851	193860	20 %	60 %	20 %	0 %	88608564
113	NC_007798	AAATA	2	10	203299	203308	80 %	20 %	0 %	0 %	88607961
114	NC_007798	GGCAT	2	10	203591	203600	20 %	20 %	40 %	20 %	88607961
115	NC_007798	ACTAA	2	10	203943	203952	60 %	20 %	0 %	20 %	88607961
116	NC_007798	TTCTT	2	10	205358	205367	0 %	80 %	0 %	20 %	88608484
117	NC_007798	TTGGA	2	10	205750	205759	20 %	40 %	40 %	0 %	88608484
118	NC_007798	GCCCA	2	10	206497	206506	20 %	0 %	20 %	60 %	88608614
119	NC_007798	CTATT	2	10	209544	209553	20 %	60 %	0 %	20 %	88608856
120	NC_007798	AATTT	2	10	211702	211711	40 %	60 %	0 %	0 %	88608284
121	NC_007798	AAGTT	2	10	213586	213595	40 %	40 %	20 %	0 %	88608589
122	NC_007798	AAGCT	2	10	219155	219164	40 %	20 %	20 %	20 %	88608343
123	NC_007798	TTTTG	2	10	219565	219574	0 %	80 %	20 %	0 %	88608456
124	NC_007798	GAGAT	2	10	220450	220459	40 %	20 %	40 %	0 %	88608587
125	NC_007798	TTTCT	2	10	221901	221910	0 %	80 %	0 %	20 %	88608511
126	NC_007798	AGGTA	2	10	226186	226195	40 %	20 %	40 %	0 %	88608825
127	NC_007798	GTTGA	2	10	226460	226469	20 %	40 %	40 %	0 %	88608825
128	NC_007798	AAGAT	2	10	226954	226963	60 %	20 %	20 %	0 %	88608387
129	NC_007798	TGAAG	2	10	227772	227781	40 %	20 %	40 %	0 %	88608356
130	NC_007798	TAAGG	2	10	228780	228789	40 %	20 %	40 %	0 %	88608754
131	NC_007798	AATGA	2	10	229221	229230	60 %	20 %	20 %	0 %	88608021
132	NC_007798	TTAAA	2	10	229578	229587	60 %	40 %	0 %	0 %	88608830
133	NC_007798	TGGTG	2	10	230990	230999	0 %	40 %	60 %	0 %	88608312
134	NC_007798	TTATT	2	10	233641	233650	20 %	80 %	0 %	0 %	88608542
135	NC_007798	TCCAA	2	10	235377	235386	40 %	20 %	0 %	40 %	88608270
136	NC_007798	GCTGC	2	10	235395	235404	0 %	20 %	40 %	40 %	88608270
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