MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Neorickettsia sennetsu str. Miyayama chromosome

Total Repeats: 15492

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_007798	GTTG	2	8	180810	180817	0 %	50 %	50 %	0 %	88608758
3003	NC_007798	AGGG	2	8	180881	180888	25 %	0 %	75 %	0 %	88608758
3004	NC_007798	CT	3	6	180902	180907	0 %	50 %	0 %	50 %	88608758
3005	NC_007798	TGG	2	6	180930	180935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88608758
3006	NC_007798	CTG	2	6	180944	180949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88608758
3007	NC_007798	TGA	2	6	180976	180981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608758
3008	NC_007798	TGC	2	6	181017	181022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88608758
3009	NC_007798	AGAA	2	8	181074	181081	75 %	0 %	25 %	0 %	88608758
3010	NC_007798	A	6	6	181114	181119	100 %	0 %	0 %	0 %	88608758
3011	NC_007798	TTGA	2	8	181178	181185	25 %	50 %	25 %	0 %	88608758
3012	NC_007798	AGA	2	6	181188	181193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608758
3013	NC_007798	TAT	2	6	181194	181199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88608758
3014	NC_007798	AGAC	2	8	181206	181213	50 %	0 %	25 %	25 %	88608758
3015	NC_007798	TC	3	6	181227	181232	0 %	50 %	0 %	50 %	88608758
3016	NC_007798	AGAC	2	8	181246	181253	50 %	0 %	25 %	25 %	88608758
3017	NC_007798	A	6	6	181298	181303	100 %	0 %	0 %	0 %	88608758
3018	NC_007798	CTT	2	6	181367	181372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88608758
3019	NC_007798	GAA	2	6	181402	181407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608758
3020	NC_007798	TGCT	2	8	181434	181441	0 %	50 %	25 %	25 %	88608758
3021	NC_007798	CTG	2	6	181446	181451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88608758
3022	NC_007798	GA	4	8	181459	181466	50 %	0 %	50 %	0 %	88608758
3023	NC_007798	CTT	2	6	181705	181710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88608877
3024	NC_007798	TCA	2	6	181730	181735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88608877
3025	NC_007798	TGA	2	6	181754	181759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608877
3026	NC_007798	AAG	2	6	181841	181846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608583
3027	NC_007798	GAA	2	6	181882	181887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608583
3028	NC_007798	GCT	2	6	182051	182056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88608583
3029	NC_007798	AGCC	2	8	182099	182106	25 %	0 %	25 %	50 %	88608583
3030	NC_007798	CAAAGC	2	12	182131	182142	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	88608583
3031	NC_007798	TTTA	2	8	182183	182190	25 %	75 %	0 %	0 %	88608710
3032	NC_007798	GAG	2	6	182215	182220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88608710
3033	NC_007798	CAG	2	6	182293	182298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88608710
3034	NC_007798	AAC	2	6	182312	182317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88608710
3035	NC_007798	CTG	2	6	182411	182416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88608710
3036	NC_007798	AGA	2	6	182547	182552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608710
3037	NC_007798	AGGT	2	8	182633	182640	25 %	25 %	50 %	0 %	88608710
3038	NC_007798	TACG	2	8	182648	182655	25 %	25 %	25 %	25 %	88608710
3039	NC_007798	TCT	2	6	182662	182667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88608710
3040	NC_007798	GGA	2	6	182685	182690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88608710
3041	NC_007798	GCC	2	6	182697	182702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	88608710
3042	NC_007798	T	6	6	182711	182716	0 %	100 %	0 %	0 %	88608710
3043	NC_007798	TTTC	2	8	182835	182842	0 %	75 %	0 %	25 %	88608710
3044	NC_007798	ATGAGA	2	12	182869	182880	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	88608710
3045	NC_007798	TGGTA	2	10	182964	182973	20 %	40 %	40 %	0 %	88608710
3046	NC_007798	CTT	2	6	183223	183228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88608285
3047	NC_007798	GCT	2	6	183410	183415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88608285
3048	NC_007798	ATG	2	6	183423	183428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608285
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3050	NC_007798	ATG	2	6	183459	183464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608285
3051	NC_007798	AGT	2	6	183536	183541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608285
3052	NC_007798	GAG	2	6	183554	183559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88608285
3053	NC_007798	A	6	6	183579	183584	100 %	0 %	0 %	0 %	88608285
3054	NC_007798	TGA	2	6	183586	183591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608285
3055	NC_007798	G	10	10	183592	183601	0 %	0 %	100 %	0 %	88608285
3056	NC_007798	T	6	6	183609	183614	0 %	100 %	0 %	0 %	88608285
3057	NC_007798	ATT	2	6	183654	183659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88608618
3058	NC_007798	TAG	2	6	183671	183676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608618
3059	NC_007798	TGC	2	6	183722	183727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88608618
3060	NC_007798	AAAT	2	8	183758	183765	75 %	25 %	0 %	0 %	88608618
3061	NC_007798	CTA	2	6	183791	183796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88608618
3062	NC_007798	CAGAT	2	10	183814	183823	40 %	20 %	20 %	20 %	88608618
3063	NC_007798	TC	3	6	183960	183965	0 %	50 %	0 %	50 %	88608618
3064	NC_007798	AGA	2	6	184044	184049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608618
3065	NC_007798	AAG	2	6	184092	184097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608618
3066	NC_007798	TA	3	6	184143	184148	50 %	50 %	0 %	0 %	88608618
3067	NC_007798	TTAT	2	8	184190	184197	25 %	75 %	0 %	0 %	88608618
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3069	NC_007798	ACA	2	6	184281	184286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88608618
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3072	NC_007798	AAAT	2	8	184351	184358	75 %	25 %	0 %	0 %	88608618
3073	NC_007798	GGT	2	6	184383	184388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88608618
3074	NC_007798	ATGC	2	8	184395	184402	25 %	25 %	25 %	25 %	88608618
3075	NC_007798	GCT	2	6	184407	184412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88608618
3076	NC_007798	TAC	2	6	184439	184444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88608618
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3078	NC_007798	CT	3	6	184527	184532	0 %	50 %	0 %	50 %	88608618
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3084	NC_007798	CAAG	2	8	184819	184826	50 %	0 %	25 %	25 %	88608618
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3092	NC_007798	TGTA	2	8	185719	185726	25 %	50 %	25 %	0 %	88608790
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3095	NC_007798	GGAGA	2	10	185805	185814	40 %	0 %	60 %	0 %	88608790
3096	NC_007798	GCA	2	6	185834	185839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88608790
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3101	NC_007798	TA	3	6	186283	186288	50 %	50 %	0 %	0 %	88608549
3102	NC_007798	ATA	2	6	186307	186312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88608549
3103	NC_007798	GA	3	6	186313	186318	50 %	0 %	50 %	0 %	88608549
3104	NC_007798	AAG	2	6	186474	186479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88608549
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3106	NC_007798	TGG	2	6	186612	186617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88608549
3107	NC_007798	AAT	2	6	186667	186672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88608549
3108	NC_007798	CAGT	2	8	186689	186696	25 %	25 %	25 %	25 %	88608549
3109	NC_007798	AGTC	2	8	186713	186720	25 %	25 %	25 %	25 %	88608549
3110	NC_007798	GTT	2	6	186748	186753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88608549
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3113	NC_007798	ACC	2	6	186922	186927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	88608549
3114	NC_007798	GGT	2	6	186928	186933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88608549
3115	NC_007798	ATC	2	6	187008	187013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88608549
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3119	NC_007798	CT	3	6	187207	187212	0 %	50 %	0 %	50 %	88608549
3120	NC_007798	GA	3	6	187354	187359	50 %	0 %	50 %	0 %	88608549
3121	NC_007798	CT	3	6	187368	187373	0 %	50 %	0 %	50 %	88608549
3122	NC_007798	TGA	2	6	187479	187484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88608549
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3500	NC_007798	CTC	2	6	208262	208267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88607959

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