MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444 chromosome

Total Repeats: 2889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007794	GCTCG	2	10	239	248	0 %	20 %	40 %	40 %	87198027
2	NC_007794	CGGCG	2	10	425	434	0 %	0 %	60 %	40 %	87198027
3	NC_007794	GCCGC	2	10	448	457	0 %	0 %	40 %	60 %	87198027
4	NC_007794	GCGCC	2	10	1307	1316	0 %	0 %	40 %	60 %	87198027
5	NC_007794	GTGCG	2	10	2540	2549	0 %	20 %	60 %	20 %	87198029
6	NC_007794	TCGCC	2	10	7820	7829	0 %	20 %	20 %	60 %	87198035
7	NC_007794	ATCGG	2	10	7978	7987	20 %	20 %	40 %	20 %	87198035
8	NC_007794	CCAGG	2	10	8304	8313	20 %	0 %	40 %	40 %	87198035
9	NC_007794	CCCGG	2	10	9260	9269	0 %	0 %	40 %	60 %	87198037
10	NC_007794	GATCG	2	10	10894	10903	20 %	20 %	40 %	20 %	87198040
11	NC_007794	GGCGC	2	10	12478	12487	0 %	0 %	60 %	40 %	87198042
12	NC_007794	CCGAC	2	10	15154	15163	20 %	0 %	20 %	60 %	87198045
13	NC_007794	GCGAT	2	10	15928	15937	20 %	20 %	40 %	20 %	87198046
14	NC_007794	TGCGT	2	10	17291	17300	0 %	40 %	40 %	20 %	87198047
15	NC_007794	TTTCG	2	10	18144	18153	0 %	60 %	20 %	20 %	87198048
16	NC_007794	GCGCC	2	10	20894	20903	0 %	0 %	40 %	60 %	87198049
17	NC_007794	AAGCG	2	10	21213	21222	40 %	0 %	40 %	20 %	87198049
18	NC_007794	GCCTT	2	10	22366	22375	0 %	40 %	20 %	40 %	87198049
19	NC_007794	TGGTC	2	10	26366	26375	0 %	40 %	40 %	20 %	87198050
20	NC_007794	CGGCG	2	10	27648	27657	0 %	0 %	60 %	40 %	87198050
21	NC_007794	GGCGC	2	10	29185	29194	0 %	0 %	60 %	40 %	87198051
22	NC_007794	GTCCA	2	10	29213	29222	20 %	20 %	20 %	40 %	87198051
23	NC_007794	GCCCC	2	10	29524	29533	0 %	0 %	20 %	80 %	87198052
24	NC_007794	GAAGA	2	10	31484	31493	60 %	0 %	40 %	0 %	87198056
25	NC_007794	GGCCT	2	10	34761	34770	0 %	20 %	40 %	40 %	87198059
26	NC_007794	GGCCA	2	10	36661	36670	20 %	0 %	40 %	40 %	87198061
27	NC_007794	GCTCT	2	10	36961	36970	0 %	40 %	20 %	40 %	87198061
28	NC_007794	CGACC	2	10	37194	37203	20 %	0 %	20 %	60 %	87198061
29	NC_007794	GCGCC	2	10	40655	40664	0 %	0 %	40 %	60 %	87198064
30	NC_007794	TCGCC	2	10	41742	41751	0 %	20 %	20 %	60 %	87198065
31	NC_007794	CCAGC	2	10	42688	42697	20 %	0 %	20 %	60 %	87198065
32	NC_007794	CGCAG	2	10	44514	44523	20 %	0 %	40 %	40 %	87198066
33	NC_007794	GCCGC	2	10	44812	44821	0 %	0 %	40 %	60 %	87198066
34	NC_007794	CCTGC	2	10	45058	45067	0 %	20 %	20 %	60 %	87198066
35	NC_007794	CCGCG	2	10	46039	46048	0 %	0 %	40 %	60 %	87198068
36	NC_007794	CGGCG	2	10	46675	46684	0 %	0 %	60 %	40 %	87198069
37	NC_007794	TCGCG	2	10	47354	47363	0 %	20 %	40 %	40 %	87198069
38	NC_007794	CCGCG	2	10	49291	49300	0 %	0 %	40 %	60 %	87198072
39	NC_007794	GCGTG	2	10	49777	49786	0 %	20 %	60 %	20 %	87198072
40	NC_007794	CAGGC	2	10	49921	49930	20 %	0 %	40 %	40 %	87198072
41	NC_007794	CCCCA	2	10	50402	50411	20 %	0 %	0 %	80 %	87198073
42	NC_007794	CCGCG	2	10	50445	50454	0 %	0 %	40 %	60 %	87198073
43	NC_007794	AGGCC	2	10	50688	50697	20 %	0 %	40 %	40 %	87198073
44	NC_007794	GCGCT	2	10	52901	52910	0 %	20 %	40 %	40 %	87198076
45	NC_007794	GGCGA	2	10	53096	53105	20 %	0 %	60 %	20 %	87198076
46	NC_007794	GCGCC	2	10	53284	53293	0 %	0 %	40 %	60 %	87198076
47	NC_007794	CTTTT	2	10	53693	53702	0 %	80 %	0 %	20 %	87198076
48	NC_007794	CGCGG	2	10	55449	55458	0 %	0 %	60 %	40 %	87198079
49	NC_007794	AGGCG	2	10	58281	58290	20 %	0 %	60 %	20 %	87198082
50	NC_007794	CCGGG	2	10	58368	58377	0 %	0 %	60 %	40 %	87198082
51	NC_007794	AGGCG	2	10	58512	58521	20 %	0 %	60 %	20 %	87198082
52	NC_007794	CGGCG	2	10	59016	59025	0 %	0 %	60 %	40 %	87198082
53	NC_007794	CGAAG	2	10	60325	60334	40 %	0 %	40 %	20 %	87198085
54	NC_007794	GGCCA	2	10	64234	64243	20 %	0 %	40 %	40 %	87198089
55	NC_007794	CGATG	2	10	64518	64527	20 %	20 %	40 %	20 %	87198089
56	NC_007794	CATCC	2	10	65754	65763	20 %	20 %	0 %	60 %	87198090
57	NC_007794	GTCCA	2	10	66624	66633	20 %	20 %	20 %	40 %	87198092
58	NC_007794	GCGCT	2	10	69023	69032	0 %	20 %	40 %	40 %	87198093
59	NC_007794	GCACC	2	10	70251	70260	20 %	0 %	20 %	60 %	87198094
60	NC_007794	GCGCG	2	10	70726	70735	0 %	0 %	60 %	40 %	87198094
61	NC_007794	TGGCG	2	10	72403	72412	0 %	20 %	60 %	20 %	87198096
62	NC_007794	CATCG	2	10	73824	73833	20 %	20 %	20 %	40 %	87198099
63	NC_007794	GGCAC	2	10	74409	74418	20 %	0 %	40 %	40 %	87198099
64	NC_007794	CGGTC	2	10	74916	74925	0 %	20 %	40 %	40 %	87198100
65	NC_007794	GGATG	2	10	75170	75179	20 %	20 %	60 %	0 %	87198100
66	NC_007794	AGCTG	2	10	77175	77184	20 %	20 %	40 %	20 %	87198101
67	NC_007794	GACCA	2	10	77893	77902	40 %	0 %	20 %	40 %	87198102
68	NC_007794	CAAGC	2	10	81597	81606	40 %	0 %	20 %	40 %	87198104
69	NC_007794	TCTGC	2	10	81923	81932	0 %	40 %	20 %	40 %	87198105
70	NC_007794	GGCGC	2	10	82231	82240	0 %	0 %	60 %	40 %	87198105
71	NC_007794	GATCG	2	10	82416	82425	20 %	20 %	40 %	20 %	87198105
72	NC_007794	ATCGC	2	10	84176	84185	20 %	20 %	20 %	40 %	87198106
73	NC_007794	AGATC	2	10	85923	85932	40 %	20 %	20 %	20 %	87198108
74	NC_007794	TTGCC	2	10	86299	86308	0 %	40 %	20 %	40 %	87198109
75	NC_007794	GCGCG	2	10	86948	86957	0 %	0 %	60 %	40 %	87198110
76	NC_007794	CATCG	2	10	87129	87138	20 %	20 %	20 %	40 %	87198110
77	NC_007794	GCGCC	2	10	87404	87413	0 %	0 %	40 %	60 %	87198110
78	NC_007794	CATGG	2	10	89614	89623	20 %	20 %	40 %	20 %	87198112
79	NC_007794	CCCGC	2	10	93635	93644	0 %	0 %	20 %	80 %	87198116
80	NC_007794	ATCGC	2	10	96306	96315	20 %	20 %	20 %	40 %	87198119
81	NC_007794	GCCTT	2	10	97291	97300	0 %	40 %	20 %	40 %	87198121
82	NC_007794	GGACC	2	10	99504	99513	20 %	0 %	40 %	40 %	87198123
83	NC_007794	GTGGG	2	10	100196	100205	0 %	20 %	80 %	0 %	87198124
84	NC_007794	GGCGA	2	10	101062	101071	20 %	0 %	60 %	20 %	87198124
85	NC_007794	GACGC	2	10	103144	103153	20 %	0 %	40 %	40 %	87198126
86	NC_007794	CCACG	2	10	103298	103307	20 %	0 %	20 %	60 %	87198126
87	NC_007794	CATCG	2	10	104533	104542	20 %	20 %	20 %	40 %	87198127
88	NC_007794	CACCG	2	10	107179	107188	20 %	0 %	20 %	60 %	87198130
89	NC_007794	CGGGA	2	10	107384	107393	20 %	0 %	60 %	20 %	87198130
90	NC_007794	CGCCC	2	10	107755	107764	0 %	0 %	20 %	80 %	87198131
91	NC_007794	GGACC	2	10	108812	108821	20 %	0 %	40 %	40 %	87198131
92	NC_007794	TCAAC	2	10	108933	108942	40 %	20 %	0 %	40 %	87198131
93	NC_007794	ACACC	2	10	113166	113175	40 %	0 %	0 %	60 %	87198134
94	NC_007794	CTTCG	2	10	113260	113269	0 %	40 %	20 %	40 %	87198134
95	NC_007794	GCGCG	2	10	114141	114150	0 %	0 %	60 %	40 %	87198136
96	NC_007794	GGAAC	2	10	115964	115973	40 %	0 %	40 %	20 %	87198139
97	NC_007794	TGTCA	2	10	117427	117436	20 %	40 %	20 %	20 %	87198141
98	NC_007794	GAACG	2	10	118605	118614	40 %	0 %	40 %	20 %	87198142
99	NC_007794	CTCGA	2	10	122589	122598	20 %	20 %	20 %	40 %	87198146
100	NC_007794	CGGCG	2	10	122702	122711	0 %	0 %	60 %	40 %	87198146
101	NC_007794	CGATG	2	10	122978	122987	20 %	20 %	40 %	20 %	87198146
102	NC_007794	CATCG	2	10	124268	124277	20 %	20 %	20 %	40 %	87198147
103	NC_007794	GCACA	2	10	125046	125055	40 %	0 %	20 %	40 %	87198147
104	NC_007794	TCGGC	2	10	125393	125402	0 %	20 %	40 %	40 %	87198147
105	NC_007794	CGCGC	2	10	126997	127006	0 %	0 %	40 %	60 %	87198150
106	NC_007794	CGAAG	2	10	127016	127025	40 %	0 %	40 %	20 %	87198150
107	NC_007794	GCCCC	2	10	127559	127568	0 %	0 %	20 %	80 %	87198151
108	NC_007794	TCGAT	2	10	128610	128619	20 %	40 %	20 %	20 %	87198152
109	NC_007794	GCTCT	2	10	130897	130906	0 %	40 %	20 %	40 %	87198153
110	NC_007794	GTGGC	2	10	131697	131706	0 %	20 %	60 %	20 %	87198154
111	NC_007794	GCCGT	2	10	132129	132138	0 %	20 %	40 %	40 %	87198155
112	NC_007794	CGAAC	2	10	132333	132342	40 %	0 %	20 %	40 %	87198155
113	NC_007794	TCCTG	2	10	133710	133719	0 %	40 %	20 %	40 %	87198156
114	NC_007794	CGCCT	2	10	134220	134229	0 %	20 %	20 %	60 %	87198157
115	NC_007794	GCGCC	2	10	134855	134864	0 %	0 %	40 %	60 %	87198158
116	NC_007794	ACCTC	2	10	136899	136908	20 %	20 %	0 %	60 %	87198159
117	NC_007794	GTCCA	2	10	137569	137578	20 %	20 %	20 %	40 %	87198160
118	NC_007794	GCGGG	2	10	137855	137864	0 %	0 %	80 %	20 %	87198161
119	NC_007794	GACGG	2	10	138207	138216	20 %	0 %	60 %	20 %	87198161
120	NC_007794	ACGAG	2	10	140260	140269	40 %	0 %	40 %	20 %	87198162
121	NC_007794	CGGCG	2	10	143439	143448	0 %	0 %	60 %	40 %	87198167
122	NC_007794	TCCGA	2	10	145783	145792	20 %	20 %	20 %	40 %	87198169
123	NC_007794	GCAAG	2	10	145921	145930	40 %	0 %	40 %	20 %	87198169
124	NC_007794	CCGGA	2	10	146133	146142	20 %	0 %	40 %	40 %	87198170
125	NC_007794	TTCGA	2	10	148320	148329	20 %	40 %	20 %	20 %	87198173
126	NC_007794	CTTCA	2	10	149481	149490	20 %	40 %	0 %	40 %	87198174
127	NC_007794	CGCGG	2	10	150160	150169	0 %	0 %	60 %	40 %	87198176
128	NC_007794	CGATG	2	10	153278	153287	20 %	20 %	40 %	20 %	87198179
129	NC_007794	GGGCA	2	10	155393	155402	20 %	0 %	60 %	20 %	87198183
130	NC_007794	CGTTC	2	10	155414	155423	0 %	40 %	20 %	40 %	87198183
131	NC_007794	GCCAC	2	10	155583	155592	20 %	0 %	20 %	60 %	87198183
132	NC_007794	GTCCG	2	10	158746	158755	0 %	20 %	40 %	40 %	87198187
133	NC_007794	CCGAC	2	10	159153	159162	20 %	0 %	20 %	60 %	87198187
134	NC_007794	CGTCC	2	10	160567	160576	0 %	20 %	20 %	60 %	87198188
135	NC_007794	GCGCC	2	10	162374	162383	0 %	0 %	40 %	60 %	87198189
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137	NC_007794	GTCTG	2	10	162873	162882	0 %	40 %	40 %	20 %	87198189
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