MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Nitrosospira multiformis ATCC 25196 plasmid 2

Total Repeats: 165

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007616	TTA	2	6	716	721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82703912
2	NC_007616	TGG	2	6	901	906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82703912
3	NC_007616	TTC	2	6	912	917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703912
4	NC_007616	CAA	2	6	1128	1133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82703912
5	NC_007616	TCA	2	6	1260	1265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703912
6	NC_007616	AGG	2	6	1298	1303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82703912
7	NC_007616	TCA	2	6	1577	1582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703912
8	NC_007616	GAA	2	6	1674	1679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82703913
9	NC_007616	ATT	2	6	1774	1779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82703913
10	NC_007616	AGG	2	6	1818	1823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82703913
11	NC_007616	TCG	2	6	1842	1847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703913
12	NC_007616	TGA	2	6	1881	1886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703913
13	NC_007616	CGG	2	6	1936	1941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703913
14	NC_007616	CAA	2	6	2067	2072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82703913
15	NC_007616	TTC	2	6	2285	2290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703913
16	NC_007616	TCA	2	6	2308	2313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703913
17	NC_007616	AGC	2	6	2502	2507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703913
18	NC_007616	CAT	2	6	2640	2645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703914
19	NC_007616	GTT	2	6	3554	3559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703915
20	NC_007616	GCC	2	6	3568	3573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82703915
21	NC_007616	TGA	2	6	3607	3612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703915
22	NC_007616	TCA	2	6	3633	3638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703915
23	NC_007616	AGC	2	6	3900	3905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703915
24	NC_007616	TTG	2	6	3970	3975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703915
25	NC_007616	GCG	2	6	4004	4009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703915
26	NC_007616	GCT	2	6	4174	4179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703915
27	NC_007616	ACG	2	6	4199	4204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703915
28	NC_007616	CAA	2	6	4347	4352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82703916
29	NC_007616	TCT	2	6	4353	4358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703916
30	NC_007616	TGT	2	6	4461	4466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703916
31	NC_007616	ACC	2	6	4490	4495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82703916
32	NC_007616	AAT	2	6	4525	4530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82703916
33	NC_007616	CTT	2	6	4549	4554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703916
34	NC_007616	AAC	2	6	5301	5306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82703917
35	NC_007616	CGA	2	6	5362	5367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703917
36	NC_007616	CAA	2	6	5369	5374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82703917
37	NC_007616	AAG	2	6	5450	5455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82703917
38	NC_007616	AAT	2	6	5543	5548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82703917
39	NC_007616	TTG	2	6	6008	6013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703917
40	NC_007616	GAT	2	6	6038	6043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703917
41	NC_007616	GGT	2	6	6061	6066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82703917
42	NC_007616	GTT	2	6	6096	6101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703918
43	NC_007616	CAG	2	6	6135	6140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703918
44	NC_007616	TCA	2	6	6242	6247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703918
45	NC_007616	CTG	2	6	6291	6296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703918
46	NC_007616	ACG	2	6	6397	6402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703918
47	NC_007616	CTC	2	6	6406	6411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82703918
48	NC_007616	ACG	2	6	6424	6429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703918
49	NC_007616	AAC	2	6	6430	6435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82703918
50	NC_007616	ATC	2	6	6793	6798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703918
51	NC_007616	CAT	2	6	6873	6878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703918
52	NC_007616	CCT	2	6	6879	6884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82703918
53	NC_007616	CTT	2	6	6896	6901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703918
54	NC_007616	CTA	2	6	7002	7007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703918
55	NC_007616	CCA	2	6	7013	7018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82703918
56	NC_007616	CGA	2	6	7044	7049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703918
57	NC_007616	ACC	2	6	7067	7072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82703918
58	NC_007616	GAG	2	6	7106	7111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82703918
59	NC_007616	TAA	2	6	7197	7202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82703918
60	NC_007616	CTG	2	6	7335	7340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703918
61	NC_007616	AAG	2	6	7393	7398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82703918
62	NC_007616	GGA	2	6	7421	7426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82703918
63	NC_007616	GCG	2	6	7519	7524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703918
64	NC_007616	GCG	2	6	7871	7876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703919
65	NC_007616	ATC	2	6	7902	7907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703919
66	NC_007616	TTA	2	6	7929	7934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82703919
67	NC_007616	TGA	2	6	7965	7970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703919
68	NC_007616	GCT	2	6	7996	8001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703919
69	NC_007616	CGG	2	6	8035	8040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703919
70	NC_007616	ATG	2	6	8061	8066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703919
71	NC_007616	GCT	2	6	8128	8133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703920
72	NC_007616	CCG	2	6	8137	8142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82703920
73	NC_007616	TGG	2	6	8174	8179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82703920
74	NC_007616	ACG	2	6	8209	8214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703920
75	NC_007616	GGC	2	6	8283	8288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703920
76	NC_007616	CTG	2	6	8441	8446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703920
77	NC_007616	TAC	2	6	8523	8528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703920
78	NC_007616	GTT	3	9	8647	8655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703920
79	NC_007616	GAT	2	6	8679	8684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703920
80	NC_007616	TTG	2	6	9271	9276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703921
81	NC_007616	CGA	2	6	9458	9463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703921
82	NC_007616	GCG	2	6	9593	9598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703921
83	NC_007616	GAG	2	6	9676	9681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82703921
84	NC_007616	GTT	2	6	9718	9723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703921
85	NC_007616	ATT	2	6	9824	9829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82703921
86	NC_007616	CGG	2	6	9853	9858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703921
87	NC_007616	CAG	2	6	9942	9947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703921
88	NC_007616	TAT	2	6	10150	10155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82703921
89	NC_007616	ATT	2	6	10372	10377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82703922
90	NC_007616	GTT	2	6	10408	10413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703922
91	NC_007616	CTT	2	6	10477	10482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703922
92	NC_007616	CGG	2	6	10502	10507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703922
93	NC_007616	GCC	2	6	10520	10525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82703922
94	NC_007616	TCT	2	6	10550	10555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703922
95	NC_007616	CTG	2	6	10558	10563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703922
96	NC_007616	CTT	2	6	10771	10776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703922
97	NC_007616	GAA	2	6	10777	10782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82703922
98	NC_007616	CTT	2	6	10785	10790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703922
99	NC_007616	GCA	2	6	10820	10825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703922
100	NC_007616	GAT	2	6	10875	10880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703922
101	NC_007616	TCG	2	6	10911	10916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703922
102	NC_007616	AAG	2	6	11003	11008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82703922
103	NC_007616	TCT	2	6	11027	11032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703922
104	NC_007616	TCC	2	6	11222	11227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82703922
105	NC_007616	GCC	3	9	11345	11353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82703922
106	NC_007616	TGC	2	6	11393	11398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703922
107	NC_007616	CTT	2	6	11403	11408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703922
108	NC_007616	ACG	2	6	11416	11421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703922
109	NC_007616	CTT	2	6	11431	11436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703922
110	NC_007616	GTC	2	6	11536	11541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703922
111	NC_007616	GAT	2	6	11587	11592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703922
112	NC_007616	CAT	2	6	11686	11691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703922
113	NC_007616	CGG	2	6	11746	11751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703922
114	NC_007616	CTT	2	6	11787	11792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703922
115	NC_007616	CGG	2	6	11799	11804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703922
116	NC_007616	TGC	2	6	11807	11812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703922
117	NC_007616	GCC	2	6	11834	11839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82703922
118	NC_007616	GTC	2	6	11848	11853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703922
119	NC_007616	ATG	2	6	11921	11926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703922
120	NC_007616	AGC	2	6	12144	12149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703923
121	NC_007616	GCG	3	9	12171	12179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703923
122	NC_007616	TGG	2	6	12227	12232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82703923
123	NC_007616	TCA	2	6	13390	13395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703924
124	NC_007616	TAA	2	6	13420	13425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82703924
125	NC_007616	ACG	2	6	13534	13539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703924
126	NC_007616	CGG	2	6	13567	13572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703924
127	NC_007616	AGA	2	6	13631	13636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82703924
128	NC_007616	ATA	2	6	13651	13656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82703924
129	NC_007616	CTG	2	6	13855	13860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703925
130	NC_007616	CTG	2	6	13912	13917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703925
131	NC_007616	CGA	2	6	14076	14081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703925
132	NC_007616	CCG	2	6	14111	14116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82703925
133	NC_007616	TCG	2	6	14138	14143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703925
134	NC_007616	GAC	2	6	14176	14181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703925
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.