MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Nitrosospira multiformis ATCC 25196 chromosome

Total Repeats: 1815

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007614	ACGGC	2	10	364	373	20 %	0 %	40 %	40 %	82701136
2	NC_007614	CTTTC	2	10	3778	3787	0 %	60 %	0 %	40 %	82701138
3	NC_007614	CAACG	2	10	3820	3829	40 %	0 %	20 %	40 %	82701138
4	NC_007614	GTGCT	2	10	3994	4003	0 %	40 %	40 %	20 %	82701138
5	NC_007614	CTCGT	2	10	4216	4225	0 %	40 %	20 %	40 %	82701138
6	NC_007614	CATTG	2	10	9356	9365	20 %	40 %	20 %	20 %	82701142
7	NC_007614	TTTTG	2	10	9586	9595	0 %	80 %	20 %	0 %	82701143
8	NC_007614	GCAGC	2	10	10365	10374	20 %	0 %	40 %	40 %	82701143
9	NC_007614	CGCTC	2	10	13979	13988	0 %	20 %	20 %	60 %	82701148
10	NC_007614	TGATC	2	10	14287	14296	20 %	40 %	20 %	20 %	82701148
11	NC_007614	CCGGA	2	10	15946	15955	20 %	0 %	40 %	40 %	82701150
12	NC_007614	CGTTG	2	10	16355	16364	0 %	40 %	40 %	20 %	82701151
13	NC_007614	GTGGC	2	10	17120	17129	0 %	20 %	60 %	20 %	82701152
14	NC_007614	TGGGC	2	10	17192	17201	0 %	20 %	60 %	20 %	82701152
15	NC_007614	CGTCC	2	10	20586	20595	0 %	20 %	20 %	60 %	82701157
16	NC_007614	GCTGC	2	10	21628	21637	0 %	20 %	40 %	40 %	82701157
17	NC_007614	CGCGC	2	10	22147	22156	0 %	0 %	40 %	60 %	82701157
18	NC_007614	CTGTT	2	10	30476	30485	0 %	60 %	20 %	20 %	82701164
19	NC_007614	CGAAA	2	10	31621	31630	60 %	0 %	20 %	20 %	82701165
20	NC_007614	GGAGC	2	10	36657	36666	20 %	0 %	60 %	20 %	82701172
21	NC_007614	CGGTA	2	10	37829	37838	20 %	20 %	40 %	20 %	82701172
22	NC_007614	AGGCA	2	10	39099	39108	40 %	0 %	40 %	20 %	82701172
23	NC_007614	GGCAG	2	10	39361	39370	20 %	0 %	60 %	20 %	82701172
24	NC_007614	CAGCG	2	10	41859	41868	20 %	0 %	40 %	40 %	82701173
25	NC_007614	GCTCC	2	10	42275	42284	0 %	20 %	20 %	60 %	82701174
26	NC_007614	ATGCG	2	10	46355	46364	20 %	20 %	40 %	20 %	82701178
27	NC_007614	CCATG	2	10	46641	46650	20 %	20 %	20 %	40 %	82701178
28	NC_007614	CTGAA	2	10	47762	47771	40 %	20 %	20 %	20 %	82701178
29	NC_007614	CAACA	2	10	57384	57393	60 %	0 %	0 %	40 %	82701185
30	NC_007614	TTCAT	2	10	63598	63607	20 %	60 %	0 %	20 %	82701192
31	NC_007614	TGTGA	2	10	63834	63843	20 %	40 %	40 %	0 %	82701192
32	NC_007614	GCGTG	2	10	64089	64098	0 %	20 %	60 %	20 %	82701192
33	NC_007614	CGCCA	2	10	66390	66399	20 %	0 %	20 %	60 %	82701194
34	NC_007614	GCTCT	2	10	67472	67481	0 %	40 %	20 %	40 %	82701196
35	NC_007614	TTGTT	2	10	69643	69652	0 %	80 %	20 %	0 %	82701199
36	NC_007614	TTAGC	2	10	70890	70899	20 %	40 %	20 %	20 %	82701199
37	NC_007614	ACGGT	2	10	71738	71747	20 %	20 %	40 %	20 %	82701200
38	NC_007614	TATCT	2	10	73190	73199	20 %	60 %	0 %	20 %	82701202
39	NC_007614	TTCAC	2	10	77046	77055	20 %	40 %	0 %	40 %	82701207
40	NC_007614	CCGCC	2	10	82092	82101	0 %	0 %	20 %	80 %	82701212
41	NC_007614	GGGTT	2	10	82583	82592	0 %	40 %	60 %	0 %	82701213
42	NC_007614	CATTG	2	10	86035	86044	20 %	40 %	20 %	20 %	162139866
43	NC_007614	TACGG	2	10	87338	87347	20 %	20 %	40 %	20 %	82701219
44	NC_007614	TGCAG	2	10	87985	87994	20 %	20 %	40 %	20 %	82701219
45	NC_007614	CTTGA	2	10	88724	88733	20 %	40 %	20 %	20 %	82701219
46	NC_007614	TTCCA	2	10	90242	90251	20 %	40 %	0 %	40 %	82701222
47	NC_007614	CGAAG	2	10	90724	90733	40 %	0 %	40 %	20 %	82701222
48	NC_007614	CGCAG	2	10	90903	90912	20 %	0 %	40 %	40 %	82701223
49	NC_007614	GCCAG	2	10	93328	93337	20 %	0 %	40 %	40 %	82701225
50	NC_007614	TCAGT	2	10	93481	93490	20 %	40 %	20 %	20 %	82701225
51	NC_007614	GACGT	2	10	93701	93710	20 %	20 %	40 %	20 %	82701225
52	NC_007614	TCACG	2	10	93712	93721	20 %	20 %	20 %	40 %	82701225
53	NC_007614	ATCTC	2	10	96725	96734	20 %	40 %	0 %	40 %	82701229
54	NC_007614	GGATG	2	10	109822	109831	20 %	20 %	60 %	0 %	82701239
55	NC_007614	GCAAT	2	10	109862	109871	40 %	20 %	20 %	20 %	82701239
56	NC_007614	ACGGG	2	10	110801	110810	20 %	0 %	60 %	20 %	82701239
57	NC_007614	TTTCG	2	10	111775	111784	0 %	60 %	20 %	20 %	82701240
58	NC_007614	TTGAT	2	10	115034	115043	20 %	60 %	20 %	0 %	82701242
59	NC_007614	CTCAA	2	10	116766	116775	40 %	20 %	0 %	40 %	82701245
60	NC_007614	AAAGA	2	10	116960	116969	80 %	0 %	20 %	0 %	82701245
61	NC_007614	AGCAC	2	10	117134	117143	40 %	0 %	20 %	40 %	82701245
62	NC_007614	TCAAT	2	10	117199	117208	40 %	40 %	0 %	20 %	82701245
63	NC_007614	AAGAT	2	10	117456	117465	60 %	20 %	20 %	0 %	82701245
64	NC_007614	TGCTG	2	10	118212	118221	0 %	40 %	40 %	20 %	82701246
65	NC_007614	TTCGA	2	10	122700	122709	20 %	40 %	20 %	20 %	82701250
66	NC_007614	TCTGA	2	10	124009	124018	20 %	40 %	20 %	20 %	82701253
67	NC_007614	ATTTC	2	10	125046	125055	20 %	60 %	0 %	20 %	82701254
68	NC_007614	AAATG	2	10	125784	125793	60 %	20 %	20 %	0 %	82701254
69	NC_007614	GGAAT	2	10	125969	125978	40 %	20 %	40 %	0 %	82701254
70	NC_007614	AACTT	2	10	128174	128183	40 %	40 %	0 %	20 %	82701256
71	NC_007614	GGAGA	2	10	129361	129370	40 %	0 %	60 %	0 %	82701257
72	NC_007614	GTCAT	2	10	129793	129802	20 %	40 %	20 %	20 %	82701258
73	NC_007614	ACTGG	2	10	132043	132052	20 %	20 %	40 %	20 %	82701261
74	NC_007614	TGGCA	2	10	133230	133239	20 %	20 %	40 %	20 %	82701263
75	NC_007614	ATGGG	2	10	133447	133456	20 %	20 %	60 %	0 %	82701263
76	NC_007614	GCACC	2	10	134233	134242	20 %	0 %	20 %	60 %	82701263
77	NC_007614	GACAA	2	10	134827	134836	60 %	0 %	20 %	20 %	82701264
78	NC_007614	CAGAA	2	10	135549	135558	60 %	0 %	20 %	20 %	82701265
79	NC_007614	GCGCG	2	10	136149	136158	0 %	0 %	60 %	40 %	82701265
80	NC_007614	ACCTC	2	10	138498	138507	20 %	20 %	0 %	60 %	82701268
81	NC_007614	TCGGT	2	10	142464	142473	0 %	40 %	40 %	20 %	82701271
82	NC_007614	GGAAA	2	10	142474	142483	60 %	0 %	40 %	0 %	82701271
83	NC_007614	GCTCA	2	10	143126	143135	20 %	20 %	20 %	40 %	82701272
84	NC_007614	CGAAT	2	10	147906	147915	40 %	20 %	20 %	20 %	82701276
85	NC_007614	TGCGC	2	10	151392	151401	0 %	20 %	40 %	40 %	82701278
86	NC_007614	GCGAG	2	10	156400	156409	20 %	0 %	60 %	20 %	82701283
87	NC_007614	AAATC	2	10	157585	157594	60 %	20 %	0 %	20 %	82701284
88	NC_007614	CGGAT	2	10	158331	158340	20 %	20 %	40 %	20 %	82701285
89	NC_007614	TCCAG	2	10	158729	158738	20 %	20 %	20 %	40 %	82701285
90	NC_007614	GGTAA	2	10	159572	159581	40 %	20 %	40 %	0 %	82701285
91	NC_007614	GATAG	2	10	159602	159611	40 %	20 %	40 %	0 %	82701285
92	NC_007614	ATTTT	2	10	161832	161841	20 %	80 %	0 %	0 %	82701287
93	NC_007614	GATGT	2	10	162655	162664	20 %	40 %	40 %	0 %	82701289
94	NC_007614	GGTCA	2	10	166269	166278	20 %	20 %	40 %	20 %	82701292
95	NC_007614	GAATC	2	10	170540	170549	40 %	20 %	20 %	20 %	82701296
96	NC_007614	ATCCA	2	10	171992	172001	40 %	20 %	0 %	40 %	82701298
97	NC_007614	GCACA	2	10	172165	172174	40 %	0 %	20 %	40 %	82701298
98	NC_007614	CGAGA	2	10	173600	173609	40 %	0 %	40 %	20 %	82701300
99	NC_007614	GACTG	2	10	174360	174369	20 %	20 %	40 %	20 %	82701301
100	NC_007614	CGGAT	2	10	177382	177391	20 %	20 %	40 %	20 %	82701304
101	NC_007614	GGGCG	2	10	181825	181834	0 %	0 %	80 %	20 %	82701307
102	NC_007614	GGATT	2	10	184135	184144	20 %	40 %	40 %	0 %	82701309
103	NC_007614	TTTGA	2	10	184558	184567	20 %	60 %	20 %	0 %	82701309
104	NC_007614	CTTGC	2	10	185303	185312	0 %	40 %	20 %	40 %	82701310
105	NC_007614	GGTCT	2	10	187478	187487	0 %	40 %	40 %	20 %	82701310
106	NC_007614	GTACG	2	10	187846	187855	20 %	20 %	40 %	20 %	82701311
107	NC_007614	CGCGC	2	10	190263	190272	0 %	0 %	40 %	60 %	82701313
108	NC_007614	CACGC	2	10	190350	190359	20 %	0 %	20 %	60 %	82701313
109	NC_007614	GCTGC	2	10	191183	191192	0 %	20 %	40 %	40 %	82701314
110	NC_007614	CGGGT	2	10	192136	192145	0 %	20 %	60 %	20 %	82701314
111	NC_007614	GTCAT	2	10	192497	192506	20 %	40 %	20 %	20 %	82701315
112	NC_007614	CGGGC	2	10	192671	192680	0 %	0 %	60 %	40 %	82701315
113	NC_007614	GCAGA	2	10	195542	195551	40 %	0 %	40 %	20 %	82701317
114	NC_007614	CGGCA	2	10	195766	195775	20 %	0 %	40 %	40 %	82701317
115	NC_007614	GCCGC	2	10	197264	197273	0 %	0 %	40 %	60 %	82701318
116	NC_007614	GTGTC	2	10	199395	199404	0 %	40 %	40 %	20 %	82701322
117	NC_007614	CGGAC	2	10	200419	200428	20 %	0 %	40 %	40 %	82701324
118	NC_007614	GATCC	2	10	203890	203899	20 %	20 %	20 %	40 %	82701327
119	NC_007614	ATCCA	2	10	205709	205718	40 %	20 %	0 %	40 %	82701330
120	NC_007614	GGAGA	2	10	212578	212587	40 %	0 %	60 %	0 %	82701336
121	NC_007614	CGCGC	2	10	212924	212933	0 %	0 %	40 %	60 %	82701336
122	NC_007614	GCCGT	2	10	214637	214646	0 %	20 %	40 %	40 %	82701337
123	NC_007614	CTCTC	2	10	214987	214996	0 %	40 %	0 %	60 %	82701337
124	NC_007614	ACTGA	2	10	217180	217189	40 %	20 %	20 %	20 %	82701338
125	NC_007614	GCAAA	2	10	218173	218182	60 %	0 %	20 %	20 %	82701338
126	NC_007614	ATGCC	2	10	219588	219597	20 %	20 %	20 %	40 %	82701339
127	NC_007614	CAGCC	2	10	223805	223814	20 %	0 %	20 %	60 %	82701344
128	NC_007614	TTCGG	2	10	223952	223961	0 %	40 %	40 %	20 %	82701344
129	NC_007614	TTTCG	2	10	225193	225202	0 %	60 %	20 %	20 %	82701346
130	NC_007614	TGATT	2	10	226574	226583	20 %	60 %	20 %	0 %	82701347
131	NC_007614	CGGAG	2	10	226708	226717	20 %	0 %	60 %	20 %	82701347
132	NC_007614	TGCCG	2	10	226900	226909	0 %	20 %	40 %	40 %	82701347
133	NC_007614	CCAGC	2	10	227337	227346	20 %	0 %	20 %	60 %	82701348
134	NC_007614	CGCTG	2	10	229320	229329	0 %	20 %	40 %	40 %	82701349
135	NC_007614	ATGCC	2	10	230536	230545	20 %	20 %	20 %	40 %	82701350
136	NC_007614	CAGAC	2	10	232913	232922	40 %	0 %	20 %	40 %	82701351
137	NC_007614	GGACG	2	10	233375	233384	20 %	0 %	60 %	20 %	82701352
138	NC_007614	CGCTG	2	10	234996	235005	0 %	20 %	40 %	40 %	82701354
139	NC_007614	CGCGG	2	10	235736	235745	0 %	0 %	60 %	40 %	82701355
140	NC_007614	CGGGC	2	10	235847	235856	0 %	0 %	60 %	40 %	82701355
141	NC_007614	ACCGG	2	10	235923	235932	20 %	0 %	40 %	40 %	82701355
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143	NC_007614	CCAAA	2	10	239704	239713	60 %	0 %	0 %	40 %	82701359
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145	NC_007614	CTGCG	2	10	243366	243375	0 %	20 %	40 %	40 %	82701362
146	NC_007614	ACCTG	2	10	244541	244550	20 %	20 %	20 %	40 %	82701364
147	NC_007614	GCCGC	2	10	246331	246340	0 %	0 %	40 %	60 %	82701365
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149	NC_007614	ATTGC	2	10	251765	251774	20 %	40 %	20 %	20 %	82701370
150	NC_007614	GCCTT	2	10	251797	251806	0 %	40 %	20 %	40 %	82701370
151	NC_007614	AGGGA	2	10	252071	252080	40 %	0 %	60 %	0 %	82701370
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153	NC_007614	GCATC	2	10	255868	255877	20 %	20 %	20 %	40 %	82701373
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156	NC_007614	CAAAC	2	10	261019	261028	60 %	0 %	0 %	40 %	82701377
157	NC_007614	TATTG	2	10	266784	266793	20 %	60 %	20 %	0 %	82701383
158	NC_007614	ATCGC	2	10	277823	277832	20 %	20 %	20 %	40 %	82701391
159	NC_007614	GGATG	2	10	277935	277944	20 %	20 %	60 %	0 %	82701391
160	NC_007614	GGAAA	2	10	279529	279538	60 %	0 %	40 %	0 %	82701392
161	NC_007614	TGCTG	2	10	279941	279950	0 %	40 %	40 %	20 %	82701393
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170	NC_007614	GGCTA	2	10	291276	291285	20 %	20 %	40 %	20 %	82701404
171	NC_007614	GGCCT	2	10	292199	292208	0 %	20 %	40 %	40 %	82701404
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177	NC_007614	GCCAT	2	10	301419	301428	20 %	20 %	20 %	40 %	82701412
178	NC_007614	ACGGA	2	10	302204	302213	40 %	0 %	40 %	20 %	82701413
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201	NC_007614	AGGGT	2	10	340053	340062	20 %	20 %	60 %	0 %	82701449
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250	NC_007614	CGCGC	2	10	414835	414844	0 %	0 %	40 %	60 %	82701512
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254	NC_007614	TTTTC	2	10	425447	425456	0 %	80 %	0 %	20 %	82701520
255	NC_007614	TTCAG	2	10	426689	426698	20 %	40 %	20 %	20 %	82701521
256	NC_007614	TCGAC	2	10	427517	427526	20 %	20 %	20 %	40 %	82701522
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258	NC_007614	GAAAT	2	10	430457	430466	60 %	20 %	20 %	0 %	82701523
259	NC_007614	CTGAT	2	10	432119	432128	20 %	40 %	20 %	20 %	82701524
260	NC_007614	TGTCG	2	10	438075	438084	0 %	40 %	40 %	20 %	82701530
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262	NC_007614	GTATC	2	10	440747	440756	20 %	40 %	20 %	20 %	82701531
263	NC_007614	GAGTC	2	10	440761	440770	20 %	20 %	40 %	20 %	82701531
264	NC_007614	CATTG	2	10	446283	446292	20 %	40 %	20 %	20 %	82701537
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266	NC_007614	TACTG	2	10	446424	446433	20 %	40 %	20 %	20 %	82701537
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268	NC_007614	GATGG	2	10	447909	447918	20 %	20 %	60 %	0 %	82701538
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378	NC_007614	CTGGG	2	10	652487	652496	0 %	20 %	60 %	20 %	82701699
379	NC_007614	GATTG	2	10	653090	653099	20 %	40 %	40 %	0 %	82701700
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382	NC_007614	TTCCA	2	10	659976	659985	20 %	40 %	0 %	40 %	82701708
383	NC_007614	CCCTG	2	10	661439	661448	0 %	20 %	20 %	60 %	82701710
384	NC_007614	AGCAA	2	10	664631	664640	60 %	0 %	20 %	20 %	82701713
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386	NC_007614	CACAG	2	10	666744	666753	40 %	0 %	20 %	40 %	82701716
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388	NC_007614	CATCG	2	10	667566	667575	20 %	20 %	20 %	40 %	82701717
389	NC_007614	TCTGT	2	10	670044	670053	0 %	60 %	20 %	20 %	82701719
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393	NC_007614	CCTGG	2	10	687831	687840	0 %	20 %	40 %	40 %	82701738
394	NC_007614	CTTGC	2	10	689103	689112	0 %	40 %	20 %	40 %	82701740
395	NC_007614	TTCAT	2	10	690024	690033	20 %	60 %	0 %	20 %	82701741
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