MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrosospira multiformis ATCC 25196 chromosome

Total Repeats: 52262

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007614	GCC	2	6	246429	246434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701365
4002	NC_007614	GGTG	2	8	246497	246504	0 %	25 %	75 %	0 %	82701365
4003	NC_007614	GCT	2	6	246523	246528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701365
4004	NC_007614	TTG	2	6	246583	246588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82701365
4005	NC_007614	TGC	2	6	247310	247315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701366
4006	NC_007614	GCC	2	6	247371	247376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701366
4007	NC_007614	GC	3	6	247380	247385	0 %	0 %	50 %	50 %	82701366
4008	NC_007614	TCC	2	6	247452	247457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82701366
4009	NC_007614	GGA	2	6	247537	247542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82701366
4010	NC_007614	CGC	2	6	247758	247763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701367
4011	NC_007614	TTGT	2	8	247832	247839	0 %	75 %	25 %	0 %	82701367
4012	NC_007614	TCA	2	6	247861	247866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701367
4013	NC_007614	TCA	2	6	247878	247883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701367
4014	NC_007614	GGC	2	6	247907	247912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701367
4015	NC_007614	CAAA	2	8	247939	247946	75 %	0 %	0 %	25 %	82701367
4016	NC_007614	ATA	2	6	247961	247966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82701367
4017	NC_007614	CCA	2	6	247972	247977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82701367
4018	NC_007614	GAC	2	6	248018	248023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701367
4019	NC_007614	CAT	2	6	248045	248050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701367
4020	NC_007614	ATA	2	6	248060	248065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82701367
4021	NC_007614	GCA	2	6	248110	248115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701367
4022	NC_007614	CAA	2	6	248233	248238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82701367
4023	NC_007614	TCC	2	6	248277	248282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82701367
4024	NC_007614	ATCT	2	8	248324	248331	25 %	50 %	0 %	25 %	82701367
4025	NC_007614	TTC	2	6	248367	248372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82701367
4026	NC_007614	GCCT	2	8	248410	248417	0 %	25 %	25 %	50 %	82701367
4027	NC_007614	AGC	2	6	248574	248579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701367
4028	NC_007614	GGC	2	6	248593	248598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701367
4029	NC_007614	CAG	2	6	248609	248614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701367
4030	NC_007614	TTA	2	6	248628	248633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82701367
4031	NC_007614	ATCC	2	8	248654	248661	25 %	25 %	0 %	50 %	82701367
4032	NC_007614	ATA	2	6	248672	248677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82701367
4033	NC_007614	ATCA	2	8	248816	248823	50 %	25 %	0 %	25 %	82701367
4034	NC_007614	GCTG	2	8	249130	249137	0 %	25 %	50 %	25 %	82701368
4035	NC_007614	GAA	2	6	249185	249190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701368
4036	NC_007614	CAG	3	9	249257	249265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701368
4037	NC_007614	CCT	2	6	249271	249276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82701368
4038	NC_007614	AC	3	6	249285	249290	50 %	0 %	0 %	50 %	82701368
4039	NC_007614	TGA	2	6	249316	249321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701368
4040	NC_007614	CCA	2	6	249350	249355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82701369
4041	NC_007614	CGC	2	6	249392	249397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701369
4042	NC_007614	TGGG	2	8	249445	249452	0 %	25 %	75 %	0 %	82701369
4043	NC_007614	GAG	2	6	249510	249515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82701369
4044	NC_007614	TGC	2	6	249527	249532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701369
4045	NC_007614	TCAT	2	8	249547	249554	25 %	50 %	0 %	25 %	82701369
4046	NC_007614	ACG	2	6	249571	249576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701369
4047	NC_007614	GCG	2	6	249762	249767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701369
4048	NC_007614	CG	3	6	249772	249777	0 %	0 %	50 %	50 %	82701369
4049	NC_007614	CGA	2	6	249986	249991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701369
4050	NC_007614	GCC	2	6	250017	250022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701369
4051	NC_007614	CCTA	2	8	250062	250069	25 %	25 %	0 %	50 %	82701369
4052	NC_007614	GGA	2	6	250109	250114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82701369
4053	NC_007614	GCG	2	6	250118	250123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701369
4054	NC_007614	GAA	2	6	250210	250215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701369
4055	NC_007614	TGC	2	6	250332	250337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701370
4056	NC_007614	TCC	2	6	250403	250408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82701370
4057	NC_007614	CCA	2	6	250489	250494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82701370
4058	NC_007614	GACGG	2	10	250516	250525	20 %	0 %	60 %	20 %	82701370
4059	NC_007614	GCG	2	6	250554	250559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701370
4060	NC_007614	CCG	2	6	250576	250581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701370
4061	NC_007614	AAG	2	6	250676	250681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701370
4062	NC_007614	AAT	2	6	250745	250750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82701370
4063	NC_007614	CTG	2	6	250772	250777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701370
4064	NC_007614	CAA	2	6	250828	250833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82701370
4065	NC_007614	CG	3	6	250873	250878	0 %	0 %	50 %	50 %	82701370
4066	NC_007614	GC	3	6	250879	250884	0 %	0 %	50 %	50 %	82701370
4067	NC_007614	GGT	2	6	250903	250908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701370
4068	NC_007614	GAG	2	6	250940	250945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82701370
4069	NC_007614	CAA	2	6	251050	251055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82701370
4070	NC_007614	GGC	2	6	251119	251124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701370
4071	NC_007614	CAT	2	6	251179	251184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701370
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4073	NC_007614	GGC	2	6	251245	251250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701370
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4076	NC_007614	GC	3	6	251440	251445	0 %	0 %	50 %	50 %	82701370
4077	NC_007614	ATG	2	6	251463	251468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701370
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4083	NC_007614	ATTGC	2	10	251765	251774	20 %	40 %	20 %	20 %	82701370
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4089	NC_007614	GGA	2	6	251917	251922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82701370
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4092	NC_007614	GGCG	2	8	252287	252294	0 %	0 %	75 %	25 %	82701371
4093	NC_007614	ATGT	2	8	252321	252328	25 %	50 %	25 %	0 %	82701371
4094	NC_007614	GCT	2	6	252425	252430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701371
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4102	NC_007614	TTC	2	6	254449	254454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82701372
4103	NC_007614	TGA	2	6	254466	254471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701372
4104	NC_007614	CAG	2	6	254510	254515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701372
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4106	NC_007614	GCA	2	6	254559	254564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701372
4107	NC_007614	GCG	2	6	254590	254595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701372
4108	NC_007614	CAT	2	6	254631	254636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701372
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4123	NC_007614	C	6	6	255606	255611	0 %	0 %	0 %	100 %	82701373
4124	NC_007614	CTG	2	6	255632	255637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701373
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4128	NC_007614	CAT	2	6	255691	255696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701373
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4358	NC_007614	CCTC	2	8	271211	271218	0 %	25 %	0 %	75 %	82701385
4359	NC_007614	AAATGA	2	12	271222	271233	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	82701385
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4362	NC_007614	ATC	2	6	271710	271715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701386
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4368	NC_007614	AAG	3	9	272022	272030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701386
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4373	NC_007614	TTA	2	6	272199	272204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82701386
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4482	NC_007614	ATTT	2	8	279580	279587	25 %	75 %	0 %	0 %	82701392
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4496	NC_007614	GGAA	2	8	280145	280152	50 %	0 %	50 %	0 %	82701393
4497	NC_007614	CATT	2	8	280166	280173	25 %	50 %	0 %	25 %	82701393
4498	NC_007614	TGA	2	6	280186	280191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701393
4499	NC_007614	GGA	2	6	280223	280228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82701393
4500	NC_007614	GAT	2	6	280340	280345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701393

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