MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrosospira multiformis ATCC 25196 chromosome

Total Repeats: 52262

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_007614	CAG	2	6	217289	217294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701338
3502	NC_007614	A	7	7	217303	217309	100 %	0 %	0 %	0 %	82701338
3503	NC_007614	CTG	2	6	217447	217452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701338
3504	NC_007614	TGAA	2	8	217586	217593	50 %	25 %	25 %	0 %	82701338
3505	NC_007614	TGA	3	9	217677	217685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701338
3506	NC_007614	AGG	2	6	217721	217726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82701338
3507	NC_007614	AAGG	2	8	217731	217738	50 %	0 %	50 %	0 %	82701338
3508	NC_007614	CAT	2	6	217750	217755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701338
3509	NC_007614	CAG	2	6	217762	217767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701338
3510	NC_007614	TGC	2	6	217776	217781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701338
3511	NC_007614	A	6	6	217953	217958	100 %	0 %	0 %	0 %	82701338
3512	NC_007614	GC	3	6	218008	218013	0 %	0 %	50 %	50 %	82701338
3513	NC_007614	GAG	2	6	218086	218091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82701338
3514	NC_007614	TAC	2	6	218112	218117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701338
3515	NC_007614	TGC	3	9	218148	218156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701338
3516	NC_007614	GCAAA	2	10	218173	218182	60 %	0 %	20 %	20 %	82701338
3517	NC_007614	GCC	2	6	218210	218215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701338
3518	NC_007614	ATTG	2	8	218235	218242	25 %	50 %	25 %	0 %	82701338
3519	NC_007614	CGG	2	6	218246	218251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701338
3520	NC_007614	GAAA	2	8	218255	218262	75 %	0 %	25 %	0 %	82701338
3521	NC_007614	GAT	3	9	218295	218303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701338
3522	NC_007614	CTG	2	6	218347	218352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701338
3523	NC_007614	GAT	2	6	218359	218364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701338
3524	NC_007614	GAA	2	6	218551	218556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701338
3525	NC_007614	GCA	2	6	218592	218597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701338
3526	NC_007614	CA	3	6	218655	218660	50 %	0 %	0 %	50 %	82701338
3527	NC_007614	AGA	2	6	218716	218721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701338
3528	NC_007614	TTG	3	9	219177	219185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82701339
3529	NC_007614	GAA	2	6	219284	219289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701339
3530	NC_007614	GCG	2	6	219419	219424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701339
3531	NC_007614	CGG	2	6	219432	219437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701339
3532	NC_007614	GCC	2	6	219491	219496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701339
3533	NC_007614	ATGCC	2	10	219588	219597	20 %	20 %	20 %	40 %	82701339
3534	NC_007614	TGA	2	6	219625	219630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701339
3535	NC_007614	GGT	2	6	219643	219648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701339
3536	NC_007614	CTC	2	6	219860	219865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82701340
3537	NC_007614	CGA	2	6	219880	219885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701340
3538	NC_007614	TGG	2	6	219906	219911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701340
3539	NC_007614	AAT	2	6	219982	219987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82701340
3540	NC_007614	ATCTGC	2	12	220005	220016	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	82701340
3541	NC_007614	GCG	2	6	220111	220116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701340
3542	NC_007614	TGCT	2	8	220200	220207	0 %	50 %	25 %	25 %	82701340
3543	NC_007614	AG	3	6	220216	220221	50 %	0 %	50 %	0 %	82701340
3544	NC_007614	CCGG	2	8	220273	220280	0 %	0 %	50 %	50 %	82701340
3545	NC_007614	GAA	2	6	220368	220373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701340
3546	NC_007614	TCC	2	6	220408	220413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82701340
3547	NC_007614	GAGC	2	8	220442	220449	25 %	0 %	50 %	25 %	82701340
3548	NC_007614	GGA	2	6	220570	220575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82701340
3549	NC_007614	CTT	2	6	220645	220650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82701341
3550	NC_007614	ATCG	2	8	220680	220687	25 %	25 %	25 %	25 %	82701341
3551	NC_007614	TGGC	2	8	220719	220726	0 %	25 %	50 %	25 %	82701341
3552	NC_007614	CCG	2	6	220793	220798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701341
3553	NC_007614	GCA	2	6	220826	220831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701341
3554	NC_007614	CGG	2	6	220847	220852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701341
3555	NC_007614	GCA	2	6	220856	220861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701341
3556	NC_007614	ATG	2	6	220875	220880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701341
3557	NC_007614	GTT	2	6	220935	220940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82701341
3558	NC_007614	ATT	2	6	221016	221021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82701341
3559	NC_007614	CCAA	2	8	221028	221035	50 %	0 %	0 %	50 %	82701341
3560	NC_007614	CGGG	2	8	221074	221081	0 %	0 %	75 %	25 %	82701341
3561	NC_007614	CCAG	2	8	221108	221115	25 %	0 %	25 %	50 %	82701341
3562	NC_007614	GCC	2	6	221128	221133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701341
3563	NC_007614	GGCA	2	8	221157	221164	25 %	0 %	50 %	25 %	82701341
3564	NC_007614	AAG	2	6	221202	221207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701341
3565	NC_007614	CG	3	6	221492	221497	0 %	0 %	50 %	50 %	82701342
3566	NC_007614	TTC	2	6	221544	221549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82701342
3567	NC_007614	GCC	2	6	221554	221559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701342
3568	NC_007614	CAA	2	6	221570	221575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82701342
3569	NC_007614	CCGG	2	8	221616	221623	0 %	0 %	50 %	50 %	82701342
3570	NC_007614	C	7	7	221738	221744	0 %	0 %	0 %	100 %	82701342
3571	NC_007614	CACG	2	8	221789	221796	25 %	0 %	25 %	50 %	82701342
3572	NC_007614	CGC	2	6	221840	221845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701342
3573	NC_007614	C	8	8	221857	221864	0 %	0 %	0 %	100 %	82701342
3574	NC_007614	AGC	2	6	221890	221895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701342
3575	NC_007614	TAG	2	6	221980	221985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701343
3576	NC_007614	GGT	2	6	222014	222019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701343
3577	NC_007614	CCA	2	6	222025	222030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82701343
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3579	NC_007614	CAAT	2	8	222236	222243	50 %	25 %	0 %	25 %	82701343
3580	NC_007614	GTTC	2	8	222283	222290	0 %	50 %	25 %	25 %	82701343
3581	NC_007614	GCA	2	6	222293	222298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701343
3582	NC_007614	GGC	2	6	222318	222323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701343
3583	NC_007614	CG	3	6	222428	222433	0 %	0 %	50 %	50 %	82701343
3584	NC_007614	TGC	2	6	222436	222441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701343
3585	NC_007614	GCA	2	6	222493	222498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701343
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3588	NC_007614	CAT	2	6	222708	222713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701343
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3591	NC_007614	GC	3	6	223048	223053	0 %	0 %	50 %	50 %	82701344
3592	NC_007614	TCC	2	6	223083	223088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82701344
3593	NC_007614	CAG	2	6	223157	223162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701344
3594	NC_007614	GAG	2	6	223175	223180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82701344
3595	NC_007614	CAG	2	6	223217	223222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701344
3596	NC_007614	T	6	6	223255	223260	0 %	100 %	0 %	0 %	82701344
3597	NC_007614	ATGC	2	8	223391	223398	25 %	25 %	25 %	25 %	82701344
3598	NC_007614	CAG	2	6	223409	223414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701344
3599	NC_007614	GC	3	6	223431	223436	0 %	0 %	50 %	50 %	82701344
3600	NC_007614	CGAT	2	8	223477	223484	25 %	25 %	25 %	25 %	82701344
3601	NC_007614	CCG	2	6	223605	223610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701344
3602	NC_007614	GCCT	2	8	223727	223734	0 %	25 %	25 %	50 %	82701344
3603	NC_007614	CAGCC	2	10	223805	223814	20 %	0 %	20 %	60 %	82701344
3604	NC_007614	CCTT	2	8	223860	223867	0 %	50 %	0 %	50 %	82701344
3605	NC_007614	CGA	2	6	223882	223887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701344
3606	NC_007614	GAT	2	6	223946	223951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701344
3607	NC_007614	TTCGG	2	10	223952	223961	0 %	40 %	40 %	20 %	82701344
3608	NC_007614	C	6	6	223969	223974	0 %	0 %	0 %	100 %	82701344
3609	NC_007614	GC	3	6	224144	224149	0 %	0 %	50 %	50 %	82701344
3610	NC_007614	GCA	2	6	224161	224166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701344
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3618	NC_007614	AG	3	6	224997	225002	50 %	0 %	50 %	0 %	82701345
3619	NC_007614	TGA	2	6	225144	225149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701346
3620	NC_007614	TTTCG	2	10	225193	225202	0 %	60 %	20 %	20 %	82701346
3621	NC_007614	TGC	2	6	225397	225402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701346
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3624	NC_007614	TCC	2	6	225664	225669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82701346
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3641	NC_007614	CGGAG	2	10	226708	226717	20 %	0 %	60 %	20 %	82701347
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3657	NC_007614	CGG	2	6	227438	227443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701348
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3728	NC_007614	GTAC	2	8	231369	231376	25 %	25 %	25 %	25 %	82701350
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3742	NC_007614	CG	3	6	232182	232187	0 %	0 %	50 %	50 %	82701351
3743	NC_007614	GGA	2	6	232206	232211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82701351
3744	NC_007614	GAA	2	6	232249	232254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701351
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3746	NC_007614	CG	3	6	232352	232357	0 %	0 %	50 %	50 %	82701351
3747	NC_007614	TCA	2	6	232367	232372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701351
3748	NC_007614	GC	5	10	232376	232385	0 %	0 %	50 %	50 %	82701351
3749	NC_007614	CAT	2	6	232500	232505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701351
3750	NC_007614	G	6	6	232527	232532	0 %	0 %	100 %	0 %	82701351
3751	NC_007614	GGA	2	6	232557	232562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82701351
3752	NC_007614	ATA	2	6	232579	232584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82701351
3753	NC_007614	CAT	2	6	232614	232619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701351
3754	NC_007614	GTT	2	6	232815	232820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82701351
3755	NC_007614	TGG	2	6	232838	232843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701351
3756	NC_007614	CAGAC	2	10	232913	232922	40 %	0 %	20 %	40 %	82701351
3757	NC_007614	ATG	2	6	232942	232947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701351
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3760	NC_007614	TTG	2	6	233064	233069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82701352
3761	NC_007614	GAAA	2	8	233091	233098	75 %	0 %	25 %	0 %	82701352
3762	NC_007614	GAT	2	6	233135	233140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701352
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3765	NC_007614	TG	3	6	233509	233514	0 %	50 %	50 %	0 %	82701353
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3770	NC_007614	GTC	2	6	233869	233874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701354
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3772	NC_007614	GAT	2	6	233922	233927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701354
3773	NC_007614	GAT	2	6	233932	233937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701354
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3778	NC_007614	GGC	2	6	234247	234252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701354
3779	NC_007614	CGT	2	6	234300	234305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701354
3780	NC_007614	CGC	2	6	234322	234327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701354
3781	NC_007614	GAGCTG	2	12	234430	234441	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	82701354
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3785	NC_007614	CAAA	2	8	234921	234928	75 %	0 %	0 %	25 %	82701354
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3857	NC_007614	CGG	2	6	238254	238259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701357
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3862	NC_007614	AGCC	2	8	238576	238583	25 %	0 %	25 %	50 %	82701357
3863	NC_007614	TGG	2	6	238605	238610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701357
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3865	NC_007614	GA	3	6	238690	238695	50 %	0 %	50 %	0 %	82701357
3866	NC_007614	GGGT	2	8	238715	238722	0 %	25 %	75 %	0 %	82701357
3867	NC_007614	CAGC	2	8	238741	238748	25 %	0 %	25 %	50 %	82701357
3868	NC_007614	CAT	2	6	238765	238770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701357
3869	NC_007614	GTAATC	2	12	238848	238859	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	82701358
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3871	NC_007614	ACC	2	6	239000	239005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82701358
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3994	NC_007614	GCG	2	6	246129	246134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701365
3995	NC_007614	GCAT	2	8	246242	246249	25 %	25 %	25 %	25 %	82701365
3996	NC_007614	CGT	2	6	246272	246277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701365
3997	NC_007614	AAT	2	6	246284	246289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82701365
3998	NC_007614	GCA	2	6	246322	246327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701365
3999	NC_007614	GCCGC	2	10	246331	246340	0 %	0 %	40 %	60 %	82701365
4000	NC_007614	GAA	2	6	246373	246378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701365

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