MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrosospira multiformis ATCC 25196 chromosome

Total Repeats: 52262

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007614	TGG	2	6	185468	185473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701310
3002	NC_007614	TGG	2	6	185501	185506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701310
3003	NC_007614	CGC	2	6	185513	185518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701310
3004	NC_007614	CGT	2	6	185540	185545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701310
3005	NC_007614	GTTT	2	8	185551	185558	0 %	75 %	25 %	0 %	82701310
3006	NC_007614	GAT	2	6	185560	185565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701310
3007	NC_007614	CTG	2	6	185573	185578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701310
3008	NC_007614	GGT	2	6	185629	185634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701310
3009	NC_007614	GAG	2	6	185652	185657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82701310
3010	NC_007614	ATTG	2	8	185731	185738	25 %	50 %	25 %	0 %	82701310
3011	NC_007614	TTTA	2	8	185752	185759	25 %	75 %	0 %	0 %	82701310
3012	NC_007614	T	6	6	185812	185817	0 %	100 %	0 %	0 %	82701310
3013	NC_007614	TGGC	2	8	185866	185873	0 %	25 %	50 %	25 %	82701310
3014	NC_007614	GCAG	2	8	185877	185884	25 %	0 %	50 %	25 %	82701310
3015	NC_007614	TGG	2	6	185928	185933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701310
3016	NC_007614	A	7	7	185940	185946	100 %	0 %	0 %	0 %	82701310
3017	NC_007614	AAC	2	6	185979	185984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82701310
3018	NC_007614	TCT	2	6	186041	186046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82701310
3019	NC_007614	CCTG	2	8	186049	186056	0 %	25 %	25 %	50 %	82701310
3020	NC_007614	GCC	2	6	186067	186072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701310
3021	NC_007614	GCC	2	6	186091	186096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701310
3022	NC_007614	AAAG	2	8	186097	186104	75 %	0 %	25 %	0 %	82701310
3023	NC_007614	GGT	2	6	186190	186195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701310
3024	NC_007614	GGC	2	6	186196	186201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701310
3025	NC_007614	GTC	2	6	186320	186325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701310
3026	NC_007614	CAAT	2	8	186549	186556	50 %	25 %	0 %	25 %	82701310
3027	NC_007614	TGG	2	6	186612	186617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701310
3028	NC_007614	CAGC	2	8	186696	186703	25 %	0 %	25 %	50 %	82701310
3029	NC_007614	G	6	6	186775	186780	0 %	0 %	100 %	0 %	82701310
3030	NC_007614	GGA	2	6	186868	186873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82701310
3031	NC_007614	GTG	2	6	186890	186895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701310
3032	NC_007614	TGA	2	6	186915	186920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701310
3033	NC_007614	GGA	2	6	186940	186945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82701310
3034	NC_007614	GCG	2	6	186977	186982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701310
3035	NC_007614	CAAG	2	8	187080	187087	50 %	0 %	25 %	25 %	82701310
3036	NC_007614	C	6	6	187160	187165	0 %	0 %	0 %	100 %	82701310
3037	NC_007614	TCG	2	6	187200	187205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701310
3038	NC_007614	GTG	2	6	187226	187231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701310
3039	NC_007614	GGC	2	6	187298	187303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701310
3040	NC_007614	GGC	2	6	187337	187342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701310
3041	NC_007614	TTGA	2	8	187454	187461	25 %	50 %	25 %	0 %	82701310
3042	NC_007614	GC	3	6	187471	187476	0 %	0 %	50 %	50 %	82701310
3043	NC_007614	GGTCT	2	10	187478	187487	0 %	40 %	40 %	20 %	82701310
3044	NC_007614	CGG	2	6	187527	187532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701310
3045	NC_007614	GAAT	2	8	187534	187541	50 %	25 %	25 %	0 %	82701310
3046	NC_007614	GTACG	2	10	187846	187855	20 %	20 %	40 %	20 %	82701311
3047	NC_007614	GTT	2	6	187861	187866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82701311
3048	NC_007614	GAC	2	6	187894	187899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701311
3049	NC_007614	TGA	2	6	187923	187928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701311
3050	NC_007614	TTC	2	6	188008	188013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82701311
3051	NC_007614	CG	3	6	188109	188114	0 %	0 %	50 %	50 %	82701311
3052	NC_007614	GAT	2	6	188230	188235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701311
3053	NC_007614	AGG	2	6	188247	188252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82701311
3054	NC_007614	GCC	2	6	188275	188280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701311
3055	NC_007614	CAT	2	6	188314	188319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701311
3056	NC_007614	GCT	2	6	188367	188372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701311
3057	NC_007614	GTT	2	6	188651	188656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82701311
3058	NC_007614	T	7	7	188976	188982	0 %	100 %	0 %	0 %	82701312
3059	NC_007614	TTTA	2	8	188986	188993	25 %	75 %	0 %	0 %	82701312
3060	NC_007614	GCC	2	6	189257	189262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701312
3061	NC_007614	GCA	2	6	189267	189272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701312
3062	NC_007614	GCT	2	6	189283	189288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701312
3063	NC_007614	TCC	2	6	189511	189516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82701312
3064	NC_007614	CGG	2	6	189540	189545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701312
3065	NC_007614	AGTG	2	8	189560	189567	25 %	25 %	50 %	0 %	82701312
3066	NC_007614	CTG	2	6	189589	189594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701313
3067	NC_007614	TGG	2	6	189637	189642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701313
3068	NC_007614	TTG	2	6	189654	189659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82701313
3069	NC_007614	GCC	2	6	189871	189876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701313
3070	NC_007614	CAA	2	6	189911	189916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82701313
3071	NC_007614	TCG	2	6	189943	189948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701313
3072	NC_007614	TTG	2	6	190137	190142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82701313
3073	NC_007614	GCG	2	6	190166	190171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701313
3074	NC_007614	TCT	2	6	190181	190186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82701313
3075	NC_007614	GCG	3	9	190203	190211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701313
3076	NC_007614	CGCGC	2	10	190263	190272	0 %	0 %	40 %	60 %	82701313
3077	NC_007614	GCG	2	6	190288	190293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701313
3078	NC_007614	CACGC	2	10	190350	190359	20 %	0 %	20 %	60 %	82701313
3079	NC_007614	CG	3	6	190459	190464	0 %	0 %	50 %	50 %	82701313
3080	NC_007614	GGC	2	6	190541	190546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701313
3081	NC_007614	TGC	2	6	190577	190582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701313
3082	NC_007614	TAA	2	6	190595	190600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82701313
3083	NC_007614	TGA	2	6	190672	190677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701313
3084	NC_007614	GAT	2	6	190716	190721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701313
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3087	NC_007614	A	7	7	190859	190865	100 %	0 %	0 %	0 %	82701313
3088	NC_007614	TACG	2	8	190923	190930	25 %	25 %	25 %	25 %	82701314
3089	NC_007614	CTT	2	6	190952	190957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82701314
3090	NC_007614	A	6	6	191014	191019	100 %	0 %	0 %	0 %	82701314
3091	NC_007614	GC	3	6	191048	191053	0 %	0 %	50 %	50 %	82701314
3092	NC_007614	TGA	2	6	191140	191145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701314
3093	NC_007614	GCTGC	2	10	191183	191192	0 %	20 %	40 %	40 %	82701314
3094	NC_007614	CTG	2	6	191201	191206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701314
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3096	NC_007614	CCAC	2	8	191288	191295	25 %	0 %	0 %	75 %	82701314
3097	NC_007614	GCGA	2	8	191331	191338	25 %	0 %	50 %	25 %	82701314
3098	NC_007614	CTG	2	6	191361	191366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701314
3099	NC_007614	GCG	2	6	191376	191381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701314
3100	NC_007614	CTG	2	6	191393	191398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701314
3101	NC_007614	GAA	2	6	191568	191573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701314
3102	NC_007614	TGC	2	6	191608	191613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701314
3103	NC_007614	AGG	2	6	191644	191649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82701314
3104	NC_007614	GAT	2	6	191657	191662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701314
3105	NC_007614	CGTG	2	8	191707	191714	0 %	25 %	50 %	25 %	82701314
3106	NC_007614	TCG	2	6	191721	191726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701314
3107	NC_007614	TGC	2	6	191736	191741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701314
3108	NC_007614	GCA	2	6	191821	191826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701314
3109	NC_007614	TTC	2	6	191916	191921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82701314
3110	NC_007614	GCC	3	9	191978	191986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701314
3111	NC_007614	GCA	2	6	192016	192021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701314
3112	NC_007614	CA	3	6	192125	192130	50 %	0 %	0 %	50 %	82701314
3113	NC_007614	CGGGT	2	10	192136	192145	0 %	20 %	60 %	20 %	82701314
3114	NC_007614	GACG	2	8	192156	192163	25 %	0 %	50 %	25 %	82701314
3115	NC_007614	TGG	2	6	192165	192170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701314
3116	NC_007614	GCA	2	6	192401	192406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701315
3117	NC_007614	GA	3	6	192419	192424	50 %	0 %	50 %	0 %	82701315
3118	NC_007614	AAG	2	6	192434	192439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701315
3119	NC_007614	GTCAT	2	10	192497	192506	20 %	40 %	20 %	20 %	82701315
3120	NC_007614	GCA	2	6	192540	192545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701315
3121	NC_007614	GA	3	6	192594	192599	50 %	0 %	50 %	0 %	82701315
3122	NC_007614	GGCC	2	8	192606	192613	0 %	0 %	50 %	50 %	82701315
3123	NC_007614	GGC	3	9	192636	192644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701315
3124	NC_007614	CGGGC	2	10	192671	192680	0 %	0 %	60 %	40 %	82701315
3125	NC_007614	GC	3	6	192714	192719	0 %	0 %	50 %	50 %	82701315
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3231	NC_007614	CGA	2	6	199980	199985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701323
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3238	NC_007614	GC	3	6	200305	200310	0 %	0 %	50 %	50 %	82701324
3239	NC_007614	ACG	2	6	200413	200418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701324
3240	NC_007614	CGGAC	2	10	200419	200428	20 %	0 %	40 %	40 %	82701324
3241	NC_007614	TCGA	2	8	200472	200479	25 %	25 %	25 %	25 %	82701324
3242	NC_007614	AGA	2	6	200506	200511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701324
3243	NC_007614	GAT	2	6	200586	200591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701324
3244	NC_007614	AGG	2	6	200671	200676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82701324
3245	NC_007614	TGA	2	6	200734	200739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701324
3246	NC_007614	GATCCT	2	12	200754	200765	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	82701324
3247	NC_007614	GCT	2	6	200792	200797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701324
3248	NC_007614	GCA	2	6	200993	200998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701325
3249	NC_007614	GCA	2	6	201014	201019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701325
3250	NC_007614	CGTT	2	8	201145	201152	0 %	50 %	25 %	25 %	82701325
3251	NC_007614	GCT	2	6	201159	201164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701325
3252	NC_007614	TTG	2	6	201280	201285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82701325
3253	NC_007614	GCG	2	6	201286	201291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701325
3254	NC_007614	CTG	2	6	201297	201302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701325
3255	NC_007614	ATC	2	6	201369	201374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701325
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3260	NC_007614	TGC	2	6	201589	201594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701325
3261	NC_007614	CTG	2	6	201633	201638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701325
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3264	NC_007614	GTA	2	6	201906	201911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701326
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3267	NC_007614	GTC	2	6	202077	202082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701326
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3273	NC_007614	CGT	2	6	202322	202327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701326
3274	NC_007614	ACA	2	6	202337	202342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82701326
3275	NC_007614	CCA	2	6	202352	202357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82701326
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3278	NC_007614	AT	3	6	202679	202684	50 %	50 %	0 %	0 %	82701327
3279	NC_007614	CCGC	2	8	202773	202780	0 %	0 %	25 %	75 %	82701327
3280	NC_007614	CAG	2	6	202897	202902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701327
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3283	NC_007614	TCGC	2	8	202992	202999	0 %	25 %	25 %	50 %	82701327
3284	NC_007614	GCA	2	6	203009	203014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701327
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3286	NC_007614	ATC	2	6	203114	203119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701327
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3289	NC_007614	TAA	2	6	203331	203336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82701327
3290	NC_007614	ACG	2	6	203387	203392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701327
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3323	NC_007614	CTGG	2	8	205952	205959	0 %	25 %	50 %	25 %	82701330
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3352	NC_007614	AGG	2	6	207979	207984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82701334
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3357	NC_007614	CCTT	2	8	208287	208294	0 %	50 %	0 %	50 %	82701334
3358	NC_007614	TC	3	6	208768	208773	0 %	50 %	0 %	50 %	82701335
3359	NC_007614	CTG	2	6	208792	208797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701335
3360	NC_007614	CCAT	2	8	208874	208881	25 %	25 %	0 %	50 %	82701335
3361	NC_007614	CAT	2	6	208914	208919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701335
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3363	NC_007614	GCT	2	6	209016	209021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701335
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3365	NC_007614	T	6	6	209104	209109	0 %	100 %	0 %	0 %	82701335
3366	NC_007614	G	6	6	209253	209258	0 %	0 %	100 %	0 %	82701335
3367	NC_007614	TCG	2	6	209348	209353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701335
3368	NC_007614	TGCCTT	2	12	209373	209384	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	82701335
3369	NC_007614	TGGC	3	12	209397	209408	0 %	25 %	50 %	25 %	82701335
3370	NC_007614	GGT	2	6	209427	209432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701335
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3372	NC_007614	GC	3	6	209555	209560	0 %	0 %	50 %	50 %	82701335
3373	NC_007614	TGC	2	6	209561	209566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701335
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3403	NC_007614	TGCG	2	8	211369	211376	0 %	25 %	50 %	25 %	82701336
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3478	NC_007614	A	6	6	215788	215793	100 %	0 %	0 %	0 %	82701338
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3481	NC_007614	CAGGAA	2	12	216124	216135	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	82701338
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3483	NC_007614	AGAA	2	8	216167	216174	75 %	0 %	25 %	0 %	82701338
3484	NC_007614	GAG	2	6	216246	216251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82701338
3485	NC_007614	CAG	2	6	216269	216274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701338
3486	NC_007614	CGACAT	2	12	216294	216305	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	82701338
3487	NC_007614	ACA	2	6	216393	216398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82701338
3488	NC_007614	TCCT	2	8	216437	216444	0 %	50 %	0 %	50 %	82701338
3489	NC_007614	AGC	2	6	216494	216499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701338
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3491	NC_007614	GCT	2	6	216529	216534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701338
3492	NC_007614	TCA	2	6	216542	216547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701338
3493	NC_007614	AG	3	6	216649	216654	50 %	0 %	50 %	0 %	82701338
3494	NC_007614	AAC	2	6	216776	216781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82701338
3495	NC_007614	A	7	7	216816	216822	100 %	0 %	0 %	0 %	82701338
3496	NC_007614	CAA	2	6	216863	216868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82701338
3497	NC_007614	CTGC	2	8	216878	216885	0 %	25 %	25 %	50 %	82701338
3498	NC_007614	CAA	2	6	216940	216945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82701338
3499	NC_007614	A	7	7	217039	217045	100 %	0 %	0 %	0 %	82701338
3500	NC_007614	ACTGA	2	10	217180	217189	40 %	20 %	20 %	20 %	82701338

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