MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Nitrosococcus oceani ATCC 19707 chromosome

Total Repeats: 1849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007484	ATCAT	2	10	10623	10632	40 %	40 %	0 %	20 %	77163564
2	NC_007484	CTCAT	2	10	12461	12470	20 %	40 %	0 %	40 %	77163566
3	NC_007484	ACTCC	2	10	13140	13149	20 %	20 %	0 %	60 %	77163566
4	NC_007484	TGCAA	2	10	13202	13211	40 %	20 %	20 %	20 %	77163566
5	NC_007484	TTATC	2	10	14229	14238	20 %	60 %	0 %	20 %	77163566
6	NC_007484	CATAC	2	10	18588	18597	40 %	20 %	0 %	40 %	77163569
7	NC_007484	GGGTT	2	10	22997	23006	0 %	40 %	60 %	0 %	77163572
8	NC_007484	AGAGG	2	10	25644	25653	40 %	0 %	60 %	0 %	77163574
9	NC_007484	TTTGG	2	10	26943	26952	0 %	60 %	40 %	0 %	77163575
10	NC_007484	TCCAT	2	10	31448	31457	20 %	40 %	0 %	40 %	77163578
11	NC_007484	CAAAG	2	10	33118	33127	60 %	0 %	20 %	20 %	77163579
12	NC_007484	CTACT	2	10	34368	34377	20 %	40 %	0 %	40 %	77163582
13	NC_007484	ACGGG	2	10	35736	35745	20 %	0 %	60 %	20 %	77163583
14	NC_007484	GGCAT	2	10	36919	36928	20 %	20 %	40 %	20 %	77163584
15	NC_007484	GCAGC	2	10	37952	37961	20 %	0 %	40 %	40 %	77163585
16	NC_007484	GAGCA	2	10	43059	43068	40 %	0 %	40 %	20 %	77163591
17	NC_007484	ACGAT	2	10	53575	53584	40 %	20 %	20 %	20 %	77163602
18	NC_007484	ATCGT	2	10	53788	53797	20 %	40 %	20 %	20 %	77163602
19	NC_007484	GGTTA	2	10	54073	54082	20 %	40 %	40 %	0 %	77163603
20	NC_007484	CAAAT	2	10	54143	54152	60 %	20 %	0 %	20 %	77163603
21	NC_007484	CGGCC	2	10	57787	57796	0 %	0 %	40 %	60 %	77163603
22	NC_007484	GCGAG	2	10	57937	57946	20 %	0 %	60 %	20 %	77163604
23	NC_007484	CGGTG	2	10	58810	58819	0 %	20 %	60 %	20 %	77163604
24	NC_007484	CCAGA	2	10	60015	60024	40 %	0 %	20 %	40 %	77163606
25	NC_007484	CACGC	2	10	61330	61339	20 %	0 %	20 %	60 %	77163606
26	NC_007484	AAGTC	2	10	61472	61481	40 %	20 %	20 %	20 %	77163606
27	NC_007484	CATTT	2	10	63848	63857	20 %	60 %	0 %	20 %	77163608
28	NC_007484	TTCAG	2	10	64123	64132	20 %	40 %	20 %	20 %	77163609
29	NC_007484	CTCAG	2	10	66571	66580	20 %	20 %	20 %	40 %	77163610
30	NC_007484	TATCT	2	10	68088	68097	20 %	60 %	0 %	20 %	77163611
31	NC_007484	TTGCT	2	10	68747	68756	0 %	60 %	20 %	20 %	77163611
32	NC_007484	GCTCG	2	10	69132	69141	0 %	20 %	40 %	40 %	77163611
33	NC_007484	CGGCG	2	10	69851	69860	0 %	0 %	60 %	40 %	77163612
34	NC_007484	TTCCA	2	10	70183	70192	20 %	40 %	0 %	40 %	77163612
35	NC_007484	GTTCC	2	10	73641	73650	0 %	40 %	20 %	40 %	77163615
36	NC_007484	AGCAC	2	10	76966	76975	40 %	0 %	20 %	40 %	77163618
37	NC_007484	TGGTA	2	10	78375	78384	20 %	40 %	40 %	0 %	77163619
38	NC_007484	GTTGA	2	10	81266	81275	20 %	40 %	40 %	0 %	77163620
39	NC_007484	CCCTG	2	10	81317	81326	0 %	20 %	20 %	60 %	77163620
40	NC_007484	CATCA	2	10	83691	83700	40 %	20 %	0 %	40 %	77163620
41	NC_007484	CGGCT	2	10	84406	84415	0 %	20 %	40 %	40 %	77163620
42	NC_007484	TTGAT	2	10	84745	84754	20 %	60 %	20 %	0 %	77163620
43	NC_007484	CCCGG	2	10	85304	85313	0 %	0 %	40 %	60 %	77163621
44	NC_007484	CGGTT	2	10	89671	89680	0 %	40 %	40 %	20 %	77163626
45	NC_007484	CAATG	2	10	92554	92563	40 %	20 %	20 %	20 %	77163629
46	NC_007484	GCAGC	2	10	96056	96065	20 %	0 %	40 %	40 %	77163633
47	NC_007484	TTGAG	2	10	97894	97903	20 %	40 %	40 %	0 %	77163635
48	NC_007484	GGAAA	2	10	100763	100772	60 %	0 %	40 %	0 %	77163637
49	NC_007484	TACGG	2	10	102119	102128	20 %	20 %	40 %	20 %	77163638
50	NC_007484	GTGGG	2	10	103046	103055	0 %	20 %	80 %	0 %	77163639
51	NC_007484	CATAG	2	10	106300	106309	40 %	20 %	20 %	20 %	77163642
52	NC_007484	CCCCA	2	10	106721	106730	20 %	0 %	0 %	80 %	77163642
53	NC_007484	CAGGA	2	10	107290	107299	40 %	0 %	40 %	20 %	77163643
54	NC_007484	CCATG	2	10	107778	107787	20 %	20 %	20 %	40 %	77163643
55	NC_007484	CGCTC	2	10	109536	109545	0 %	20 %	20 %	60 %	77163645
56	NC_007484	CGAGG	2	10	110663	110672	20 %	0 %	60 %	20 %	77163646
57	NC_007484	GGCGC	2	10	118088	118097	0 %	0 %	60 %	40 %	77163651
58	NC_007484	ATCGG	2	10	118389	118398	20 %	20 %	40 %	20 %	77163651
59	NC_007484	CTTTC	2	10	124501	124510	0 %	60 %	0 %	40 %	77163654
60	NC_007484	GATGC	2	10	128057	128066	20 %	20 %	40 %	20 %	77163657
61	NC_007484	GCATG	2	10	130588	130597	20 %	20 %	40 %	20 %	77163660
62	NC_007484	TAAAT	2	10	132205	132214	60 %	40 %	0 %	0 %	77163662
63	NC_007484	TTCCA	2	10	133515	133524	20 %	40 %	0 %	40 %	77163664
64	NC_007484	CTAAA	2	10	138661	138670	60 %	20 %	0 %	20 %	77163665
65	NC_007484	CTTGA	2	10	138779	138788	20 %	40 %	20 %	20 %	77163665
66	NC_007484	TCCAT	2	10	139144	139153	20 %	40 %	0 %	40 %	77163665
67	NC_007484	CATTT	2	10	139400	139409	20 %	60 %	0 %	20 %	77163666
68	NC_007484	ATAGT	2	10	140229	140238	40 %	40 %	20 %	0 %	77163666
69	NC_007484	TCTTT	2	10	140740	140749	0 %	80 %	0 %	20 %	77163666
70	NC_007484	GTAGC	2	10	140862	140871	20 %	20 %	40 %	20 %	77163666
71	NC_007484	ACAGC	2	10	143827	143836	40 %	0 %	20 %	40 %	77163670
72	NC_007484	AGACG	2	10	144722	144731	40 %	0 %	40 %	20 %	77163671
73	NC_007484	AACGG	2	10	144806	144815	40 %	0 %	40 %	20 %	77163671
74	NC_007484	ACTTA	2	10	148158	148167	40 %	40 %	0 %	20 %	77163673
75	NC_007484	GCAGG	2	10	148771	148780	20 %	0 %	60 %	20 %	77163673
76	NC_007484	ATGGG	2	10	149226	149235	20 %	20 %	60 %	0 %	77163674
77	NC_007484	GTTCC	2	10	149314	149323	0 %	40 %	20 %	40 %	77163674
78	NC_007484	GCTCT	2	10	151168	151177	0 %	40 %	20 %	40 %	77163676
79	NC_007484	GAGTG	2	10	151873	151882	20 %	20 %	60 %	0 %	77163677
80	NC_007484	TATTT	2	10	154704	154713	20 %	80 %	0 %	0 %	77163682
81	NC_007484	CAGGC	2	10	154948	154957	20 %	0 %	40 %	40 %	77163682
82	NC_007484	TTCTG	2	10	155575	155584	0 %	60 %	20 %	20 %	77163682
83	NC_007484	CGATG	2	10	158116	158125	20 %	20 %	40 %	20 %	77163685
84	NC_007484	GTTTT	2	10	159096	159105	0 %	80 %	20 %	0 %	77163686
85	NC_007484	TTGGG	2	10	159542	159551	0 %	40 %	60 %	0 %	77163687
86	NC_007484	ATCAG	2	10	163684	163693	40 %	20 %	20 %	20 %	77163691
87	NC_007484	GACCG	2	10	164067	164076	20 %	0 %	40 %	40 %	77163691
88	NC_007484	GTCCT	2	10	165979	165988	0 %	40 %	20 %	40 %	77163691
89	NC_007484	GCTTT	2	10	168434	168443	0 %	60 %	20 %	20 %	77163694
90	NC_007484	TATCT	2	10	169442	169451	20 %	60 %	0 %	20 %	77163695
91	NC_007484	TGGGT	2	10	170737	170746	0 %	40 %	60 %	0 %	77163696
92	NC_007484	ATTTG	2	10	170943	170952	20 %	60 %	20 %	0 %	77163696
93	NC_007484	CCGAA	2	10	171739	171748	40 %	0 %	20 %	40 %	77163696
94	NC_007484	GGGTT	2	10	172756	172765	0 %	40 %	60 %	0 %	77163697
95	NC_007484	GATGG	2	10	173963	173972	20 %	20 %	60 %	0 %	77163698
96	NC_007484	CCTAG	2	10	175520	175529	20 %	20 %	20 %	40 %	77163698
97	NC_007484	AATAG	2	10	175885	175894	60 %	20 %	20 %	0 %	77163698
98	NC_007484	TTCTT	2	10	179729	179738	0 %	80 %	0 %	20 %	77163701
99	NC_007484	CATTA	2	10	179749	179758	40 %	40 %	0 %	20 %	77163701
100	NC_007484	CTGCT	2	10	181237	181246	0 %	40 %	20 %	40 %	77163702
101	NC_007484	CTTAT	2	10	181738	181747	20 %	60 %	0 %	20 %	77163702
102	NC_007484	GATTG	2	10	183700	183709	20 %	40 %	40 %	0 %	77163703
103	NC_007484	GTTGG	2	10	183811	183820	0 %	40 %	60 %	0 %	77163703
104	NC_007484	CCAGG	2	10	187823	187832	20 %	0 %	40 %	40 %	77163708
105	NC_007484	AATTC	2	10	188123	188132	40 %	40 %	0 %	20 %	77163708
106	NC_007484	ATGAA	2	10	188650	188659	60 %	20 %	20 %	0 %	77163709
107	NC_007484	TCGAT	2	10	189775	189784	20 %	40 %	20 %	20 %	77163709
108	NC_007484	TTGCC	2	10	193180	193189	0 %	40 %	20 %	40 %	77163711
109	NC_007484	AAACC	2	10	194120	194129	60 %	0 %	0 %	40 %	77163712
110	NC_007484	GTCCC	2	10	194510	194519	0 %	20 %	20 %	60 %	77163712
111	NC_007484	TCTAA	2	10	194580	194589	40 %	40 %	0 %	20 %	77163712
112	NC_007484	TAGCT	2	10	195465	195474	20 %	40 %	20 %	20 %	77163713
113	NC_007484	GGTAA	2	10	200459	200468	40 %	20 %	40 %	0 %	77163718
114	NC_007484	TGGAC	2	10	200541	200550	20 %	20 %	40 %	20 %	77163718
115	NC_007484	AGGGG	2	10	201856	201865	20 %	0 %	80 %	0 %	77163720
116	NC_007484	TCCAG	2	10	204744	204753	20 %	20 %	20 %	40 %	77163723
117	NC_007484	TAAAT	2	10	205141	205150	60 %	40 %	0 %	0 %	77163723
118	NC_007484	ATGGC	2	10	211554	211563	20 %	20 %	40 %	20 %	77163731
119	NC_007484	AGCCC	2	10	212798	212807	20 %	0 %	20 %	60 %	77163732
120	NC_007484	CAGGC	2	10	213428	213437	20 %	0 %	40 %	40 %	77163732
121	NC_007484	CGGTA	2	10	214964	214973	20 %	20 %	40 %	20 %	77163733
122	NC_007484	TTTAT	2	10	220369	220378	20 %	80 %	0 %	0 %	77163737
123	NC_007484	TGAGT	2	10	223417	223426	20 %	40 %	40 %	0 %	77163738
124	NC_007484	ACTGG	2	10	225786	225795	20 %	20 %	40 %	20 %	77163740
125	NC_007484	GTAAG	2	10	225876	225885	40 %	20 %	40 %	0 %	77163740
126	NC_007484	TCGTT	2	10	228186	228195	0 %	60 %	20 %	20 %	77163741
127	NC_007484	AGTTG	2	10	228786	228795	20 %	40 %	40 %	0 %	77163742
128	NC_007484	GTTGA	2	10	229852	229861	20 %	40 %	40 %	0 %	77163742
129	NC_007484	AAATG	2	10	229983	229992	60 %	20 %	20 %	0 %	77163742
130	NC_007484	CGGGG	2	10	235774	235783	0 %	0 %	80 %	20 %	77163746
131	NC_007484	CTTGG	2	10	237735	237744	0 %	40 %	40 %	20 %	77163747
132	NC_007484	AGGAT	2	10	239223	239232	40 %	20 %	40 %	0 %	77163749
133	NC_007484	CCAGA	2	10	244038	244047	40 %	0 %	20 %	40 %	77163755
134	NC_007484	GGATC	2	10	245982	245991	20 %	20 %	40 %	20 %	77163758
135	NC_007484	GTGGG	2	10	253850	253859	0 %	20 %	80 %	0 %	77163764
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