MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Nitrosococcus oceani ATCC 19707 chromosome

Total Repeats: 7269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007484	GCAA	2	8	261	268	50 %	0 %	25 %	25 %	77163562
2	NC_007484	ATTG	2	8	316	323	25 %	50 %	25 %	0 %	77163562
3	NC_007484	AGGT	2	8	404	411	25 %	25 %	50 %	0 %	77163562
4	NC_007484	CAAT	2	8	558	565	50 %	25 %	0 %	25 %	77163562
5	NC_007484	ATGC	2	8	664	671	25 %	25 %	25 %	25 %	77163562
6	NC_007484	CTTC	2	8	2636	2643	0 %	50 %	0 %	50 %	77163563
7	NC_007484	ATTC	2	8	2687	2694	25 %	50 %	0 %	25 %	77163563
8	NC_007484	AGTA	2	8	3467	3474	50 %	25 %	25 %	0 %	77163563
9	NC_007484	GCCA	2	8	10791	10798	25 %	0 %	25 %	50 %	77163564
10	NC_007484	ACCC	2	8	10902	10909	25 %	0 %	0 %	75 %	77163564
11	NC_007484	GCTT	2	8	11010	11017	0 %	50 %	25 %	25 %	77163564
12	NC_007484	ATTT	2	8	11448	11455	25 %	75 %	0 %	0 %	77163565
13	NC_007484	AATT	2	8	11488	11495	50 %	50 %	0 %	0 %	77163565
14	NC_007484	AACG	2	8	11782	11789	50 %	0 %	25 %	25 %	77163565
15	NC_007484	ACCA	2	8	11959	11966	50 %	0 %	0 %	50 %	77163565
16	NC_007484	TGGA	2	8	12109	12116	25 %	25 %	50 %	0 %	77163565
17	NC_007484	GTAT	2	8	12514	12521	25 %	50 %	25 %	0 %	77163566
18	NC_007484	ACGG	2	8	12664	12671	25 %	0 %	50 %	25 %	77163566
19	NC_007484	TGGC	2	8	13285	13292	0 %	25 %	50 %	25 %	77163566
20	NC_007484	GACT	2	8	13393	13400	25 %	25 %	25 %	25 %	77163566
21	NC_007484	GACG	2	8	13928	13935	25 %	0 %	50 %	25 %	77163566
22	NC_007484	ACGC	2	8	13958	13965	25 %	0 %	25 %	50 %	77163566
23	NC_007484	GCTA	2	8	14931	14938	25 %	25 %	25 %	25 %	77163567
24	NC_007484	GCTA	2	8	14959	14966	25 %	25 %	25 %	25 %	77163567
25	NC_007484	AGTA	2	8	17384	17391	50 %	25 %	25 %	0 %	77163568
26	NC_007484	GGGT	2	8	17568	17575	0 %	25 %	75 %	0 %	77163568
27	NC_007484	GCGG	2	8	18780	18787	0 %	0 %	75 %	25 %	77163569
28	NC_007484	CATA	2	8	19398	19405	50 %	25 %	0 %	25 %	77163570
29	NC_007484	CGTC	2	8	19970	19977	0 %	25 %	25 %	50 %	77163570
30	NC_007484	CCGG	2	8	20327	20334	0 %	0 %	50 %	50 %	77163571
31	NC_007484	GGAT	2	8	20608	20615	25 %	25 %	50 %	0 %	77163571
32	NC_007484	AAAG	2	8	20741	20748	75 %	0 %	25 %	0 %	77163571
33	NC_007484	CAGC	2	8	20821	20828	25 %	0 %	25 %	50 %	77163571
34	NC_007484	TGGC	2	8	20878	20885	0 %	25 %	50 %	25 %	77163571
35	NC_007484	TTGA	2	8	21252	21259	25 %	50 %	25 %	0 %	77163571
36	NC_007484	CTGG	2	8	21309	21316	0 %	25 %	50 %	25 %	77163571
37	NC_007484	ATCG	2	8	21669	21676	25 %	25 %	25 %	25 %	77163571
38	NC_007484	CATG	2	8	21797	21804	25 %	25 %	25 %	25 %	77163571
39	NC_007484	CCGC	2	8	22256	22263	0 %	0 %	25 %	75 %	77163572
40	NC_007484	GCTT	2	8	22392	22399	0 %	50 %	25 %	25 %	77163572
41	NC_007484	CTGC	2	8	22564	22571	0 %	25 %	25 %	50 %	77163572
42	NC_007484	GCCT	2	8	23535	23542	0 %	25 %	25 %	50 %	77163573
43	NC_007484	CAAA	2	8	24235	24242	75 %	0 %	0 %	25 %	77163574
44	NC_007484	AGGC	2	8	25403	25410	25 %	0 %	50 %	25 %	77163574
45	NC_007484	CGGC	2	8	25939	25946	0 %	0 %	50 %	50 %	77163575
46	NC_007484	GTCC	2	8	26236	26243	0 %	25 %	25 %	50 %	77163575
47	NC_007484	TGCC	2	8	26432	26439	0 %	25 %	25 %	50 %	77163575
48	NC_007484	TCCT	2	8	26994	27001	0 %	50 %	0 %	50 %	77163575
49	NC_007484	TAGA	2	8	27285	27292	50 %	25 %	25 %	0 %	77163575
50	NC_007484	GATA	2	8	27644	27651	50 %	25 %	25 %	0 %	77163575
51	NC_007484	TCAA	2	8	28171	28178	50 %	25 %	0 %	25 %	77163576
52	NC_007484	AGCA	2	8	28320	28327	50 %	0 %	25 %	25 %	77163576
53	NC_007484	CTTT	2	8	28847	28854	0 %	75 %	0 %	25 %	77163577
54	NC_007484	TCGC	2	8	30592	30599	0 %	25 %	25 %	50 %	77163578
55	NC_007484	GTAA	2	8	31578	31585	50 %	25 %	25 %	0 %	77163578
56	NC_007484	CATC	2	8	31976	31983	25 %	25 %	0 %	50 %	77163578
57	NC_007484	ACCA	2	8	32708	32715	50 %	0 %	0 %	50 %	77163579
58	NC_007484	TTGC	2	8	32747	32754	0 %	50 %	25 %	25 %	77163579
59	NC_007484	ATCA	2	8	32828	32835	50 %	25 %	0 %	25 %	77163579
60	NC_007484	GCTT	2	8	33676	33683	0 %	50 %	25 %	25 %	77163580
61	NC_007484	TCTT	2	8	33834	33841	0 %	75 %	0 %	25 %	77163581
62	NC_007484	TAAT	2	8	34250	34257	50 %	50 %	0 %	0 %	77163582
63	NC_007484	TTAC	2	8	34435	34442	25 %	50 %	0 %	25 %	77163582
64	NC_007484	GGAG	2	8	35128	35135	25 %	0 %	75 %	0 %	77163582
65	NC_007484	GGCA	2	8	35238	35245	25 %	0 %	50 %	25 %	77163582
66	NC_007484	GGCA	2	8	35446	35453	25 %	0 %	50 %	25 %	77163583
67	NC_007484	CGTC	2	8	35465	35472	0 %	25 %	25 %	50 %	77163583
68	NC_007484	GGTA	2	8	35492	35499	25 %	25 %	50 %	0 %	77163583
69	NC_007484	AATT	2	8	36746	36753	50 %	50 %	0 %	0 %	77163584
70	NC_007484	TGCT	2	8	37353	37360	0 %	50 %	25 %	25 %	77163584
71	NC_007484	TCAG	2	8	38159	38166	25 %	25 %	25 %	25 %	77163586
72	NC_007484	GCTG	2	8	38284	38291	0 %	25 %	50 %	25 %	77163586
73	NC_007484	AGAC	2	8	38327	38334	50 %	0 %	25 %	25 %	77163586
74	NC_007484	TAAA	2	8	38398	38405	75 %	25 %	0 %	0 %	77163586
75	NC_007484	TTGG	2	8	39318	39325	0 %	50 %	50 %	0 %	77163588
76	NC_007484	TGTT	2	8	39363	39370	0 %	75 %	25 %	0 %	77163588
77	NC_007484	AATT	2	8	41445	41452	50 %	50 %	0 %	0 %	77163591
78	NC_007484	AAGC	2	8	41475	41482	50 %	0 %	25 %	25 %	77163591
79	NC_007484	CCCT	2	8	41897	41904	0 %	25 %	0 %	75 %	77163591
80	NC_007484	GGCG	2	8	42327	42334	0 %	0 %	75 %	25 %	77163591
81	NC_007484	TGGA	2	8	42525	42532	25 %	25 %	50 %	0 %	77163591
82	NC_007484	GAAA	2	8	42669	42676	75 %	0 %	25 %	0 %	77163591
83	NC_007484	TGAC	2	8	42951	42958	25 %	25 %	25 %	25 %	77163591
84	NC_007484	CCTT	2	8	43046	43053	0 %	50 %	0 %	50 %	77163591
85	NC_007484	TTGC	2	8	43076	43083	0 %	50 %	25 %	25 %	77163591
86	NC_007484	AAAT	2	8	43097	43104	75 %	25 %	0 %	0 %	77163591
87	NC_007484	GTCA	2	8	43237	43244	25 %	25 %	25 %	25 %	77163592
88	NC_007484	TATC	2	8	43284	43291	25 %	50 %	0 %	25 %	77163592
89	NC_007484	GATC	2	8	43328	43335	25 %	25 %	25 %	25 %	77163592
90	NC_007484	TGGA	2	8	43486	43493	25 %	25 %	50 %	0 %	77163592
91	NC_007484	GTAT	2	8	43522	43529	25 %	50 %	25 %	0 %	77163592
92	NC_007484	TAGA	2	8	43825	43832	50 %	25 %	25 %	0 %	77163592
93	NC_007484	AACC	2	8	44096	44103	50 %	0 %	0 %	50 %	77163592
94	NC_007484	CTAT	2	8	44259	44266	25 %	50 %	0 %	25 %	77163592
95	NC_007484	GGCA	2	8	44473	44480	25 %	0 %	50 %	25 %	77163592
96	NC_007484	ATTG	2	8	45850	45857	25 %	50 %	25 %	0 %	77163593
97	NC_007484	CTTT	2	8	46123	46130	0 %	75 %	0 %	25 %	77163593
98	NC_007484	AAGC	2	8	46400	46407	50 %	0 %	25 %	25 %	77163593
99	NC_007484	CCGC	2	8	46560	46567	0 %	0 %	25 %	75 %	77163593
100	NC_007484	AAGC	2	8	47108	47115	50 %	0 %	25 %	25 %	77163594
101	NC_007484	ATTA	2	8	47151	47158	50 %	50 %	0 %	0 %	77163594
102	NC_007484	AAAG	2	8	47737	47744	75 %	0 %	25 %	0 %	77163596
103	NC_007484	GGAA	2	8	48950	48957	50 %	0 %	50 %	0 %	77163597
104	NC_007484	ACTC	2	8	49278	49285	25 %	25 %	0 %	50 %	77163598
105	NC_007484	GGCT	2	8	49956	49963	0 %	25 %	50 %	25 %	77163599
106	NC_007484	CCTG	2	8	50300	50307	0 %	25 %	25 %	50 %	77163600
107	NC_007484	GGTG	2	8	50407	50414	0 %	25 %	75 %	0 %	77163600
108	NC_007484	CCAG	2	8	51137	51144	25 %	0 %	25 %	50 %	77163600
109	NC_007484	TGCG	2	8	51394	51401	0 %	25 %	50 %	25 %	77163600
110	NC_007484	GGCC	2	8	52475	52482	0 %	0 %	50 %	50 %	77163601
111	NC_007484	CGAG	2	8	53728	53735	25 %	0 %	50 %	25 %	77163602
112	NC_007484	ATGG	2	8	54015	54022	25 %	25 %	50 %	0 %	77163602
113	NC_007484	AGGG	2	8	54133	54140	25 %	0 %	75 %	0 %	77163603
114	NC_007484	GTCG	2	8	54184	54191	0 %	25 %	50 %	25 %	77163603
115	NC_007484	CTAC	2	8	54691	54698	25 %	25 %	0 %	50 %	77163603
116	NC_007484	TTCA	2	8	55817	55824	25 %	50 %	0 %	25 %	77163603
117	NC_007484	GTGA	2	8	55859	55866	25 %	25 %	50 %	0 %	77163603
118	NC_007484	GCCA	2	8	56870	56877	25 %	0 %	25 %	50 %	77163603
119	NC_007484	TGCC	2	8	57087	57094	0 %	25 %	25 %	50 %	77163603
120	NC_007484	CCAG	2	8	57177	57184	25 %	0 %	25 %	50 %	77163603
121	NC_007484	GAAG	2	8	57712	57719	50 %	0 %	50 %	0 %	77163603
122	NC_007484	ACGG	2	8	58028	58035	25 %	0 %	50 %	25 %	77163604
123	NC_007484	TGCA	2	8	58083	58090	25 %	25 %	25 %	25 %	77163604
124	NC_007484	TGCT	2	8	58449	58456	0 %	50 %	25 %	25 %	77163604
125	NC_007484	GAAA	2	8	59343	59350	75 %	0 %	25 %	0 %	77163604
126	NC_007484	GATG	2	8	59667	59674	25 %	25 %	50 %	0 %	77163605
127	NC_007484	CAAG	2	8	59749	59756	50 %	0 %	25 %	25 %	77163605
128	NC_007484	ACTG	2	8	59794	59801	25 %	25 %	25 %	25 %	77163605
129	NC_007484	AAAG	2	8	59929	59936	75 %	0 %	25 %	0 %	77163605
130	NC_007484	CGAG	2	8	60765	60772	25 %	0 %	50 %	25 %	77163606
131	NC_007484	TGGA	2	8	60777	60784	25 %	25 %	50 %	0 %	77163606
132	NC_007484	TGTC	2	8	60855	60862	0 %	50 %	25 %	25 %	77163606
133	NC_007484	TCCA	2	8	61402	61409	25 %	25 %	0 %	50 %	77163606
134	NC_007484	AGTA	2	8	61632	61639	50 %	25 %	25 %	0 %	77163606
135	NC_007484	TAAA	2	8	61856	61863	75 %	25 %	0 %	0 %	77163606
136	NC_007484	GGCG	2	8	62580	62587	0 %	0 %	75 %	25 %	77163606
137	NC_007484	TTGG	2	8	62916	62923	0 %	50 %	50 %	0 %	77163607
138	NC_007484	AGTA	2	8	63051	63058	50 %	25 %	25 %	0 %	77163607
139	NC_007484	TCAG	2	8	63092	63099	25 %	25 %	25 %	25 %	77163607
140	NC_007484	GACA	2	8	63108	63115	50 %	0 %	25 %	25 %	77163607
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