MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Natronomonas pharaonis DSM 2160 plasmid PL131

Total Repeats: 2251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_007427	CAGT	2	8	89914	89921	25 %	25 %	25 %	25 %	76803458
1502	NC_007427	GCC	2	6	89943	89948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803458
1503	NC_007427	CCG	2	6	89984	89989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803458
1504	NC_007427	GCG	2	6	89990	89995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803458
1505	NC_007427	CGG	2	6	90051	90056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803458
1506	NC_007427	CGT	2	6	90057	90062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803458
1507	NC_007427	TCG	2	6	90080	90085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803458
1508	NC_007427	GAA	2	6	90100	90105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76803458
1509	NC_007427	TGGGAC	2	12	90166	90177	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	76803458
1510	NC_007427	CGA	2	6	90186	90191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803458
1511	NC_007427	GGC	2	6	90266	90271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803458
1512	NC_007427	GCC	2	6	90307	90312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803458
1513	NC_007427	TGG	2	6	90375	90380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76803458
1514	NC_007427	GTC	2	6	90412	90417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803458
1515	NC_007427	CGA	2	6	90471	90476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803458
1516	NC_007427	A	6	6	90478	90483	100 %	0 %	0 %	0 %	76803458
1517	NC_007427	CAA	2	6	90569	90574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76803458
1518	NC_007427	GAA	2	6	90588	90593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76803458
1519	NC_007427	CCGC	2	8	90645	90652	0 %	0 %	25 %	75 %	76803458
1520	NC_007427	CGT	2	6	90678	90683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803458
1521	NC_007427	CGA	2	6	90714	90719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803458
1522	NC_007427	TAT	2	6	90744	90749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76803458
1523	NC_007427	GGGC	2	8	90800	90807	0 %	0 %	75 %	25 %	76803458
1524	NC_007427	GAT	2	6	90808	90813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803458
1525	NC_007427	GGAA	2	8	90854	90861	50 %	0 %	50 %	0 %	76803458
1526	NC_007427	CAG	2	6	90865	90870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803458
1527	NC_007427	GTC	2	6	90913	90918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803458
1528	NC_007427	ACC	2	6	90998	91003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	76803458
1529	NC_007427	ATGC	2	8	91033	91040	25 %	25 %	25 %	25 %	76803458
1530	NC_007427	TCG	2	6	91043	91048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803458
1531	NC_007427	TC	3	6	91107	91112	0 %	50 %	0 %	50 %	76803458
1532	NC_007427	CTG	2	6	91128	91133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803458
1533	NC_007427	GGT	2	6	91182	91187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76803458
1534	NC_007427	CGG	2	6	91251	91256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803458
1535	NC_007427	CGA	2	6	91314	91319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803458
1536	NC_007427	GAC	2	6	91336	91341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803458
1537	NC_007427	CCG	2	6	91376	91381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803458
1538	NC_007427	CGG	3	9	91464	91472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803458
1539	NC_007427	ACA	2	6	91510	91515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76803458
1540	NC_007427	ACG	2	6	91957	91962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803459
1541	NC_007427	ATCC	2	8	92244	92251	25 %	25 %	0 %	50 %	76803459
1542	NC_007427	GCT	2	6	92282	92287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803459
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1545	NC_007427	GAG	2	6	92445	92450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76803459
1546	NC_007427	GCC	2	6	92451	92456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803459
1547	NC_007427	AAG	2	6	92458	92463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76803459
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1549	NC_007427	CGG	2	6	92492	92497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803459
1550	NC_007427	AGA	2	6	92774	92779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76803459
1551	NC_007427	AT	3	6	92792	92797	50 %	50 %	0 %	0 %	76803459
1552	NC_007427	CCG	2	6	92816	92821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803459
1553	NC_007427	CGAT	2	8	92836	92843	25 %	25 %	25 %	25 %	76803459
1554	NC_007427	AGCA	2	8	92872	92879	50 %	0 %	25 %	25 %	76803459
1555	NC_007427	GAC	2	6	92911	92916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803459
1556	NC_007427	GCG	2	6	92920	92925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803459
1557	NC_007427	CTTCGA	2	12	92975	92986	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	76803459
1558	NC_007427	CCGA	2	8	93019	93026	25 %	0 %	25 %	50 %	76803459
1559	NC_007427	TCG	2	6	93034	93039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803459
1560	NC_007427	TGAC	2	8	93040	93047	25 %	25 %	25 %	25 %	76803459
1561	NC_007427	AC	3	6	93106	93111	50 %	0 %	0 %	50 %	76803460
1562	NC_007427	GCG	2	6	93123	93128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803460
1563	NC_007427	AACAGC	2	12	93129	93140	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	76803460
1564	NC_007427	TCA	2	6	93141	93146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803460
1565	NC_007427	GAC	2	6	93178	93183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803460
1566	NC_007427	GCGG	2	8	93307	93314	0 %	0 %	75 %	25 %	76803460
1567	NC_007427	CAG	2	6	93323	93328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803460
1568	NC_007427	CTA	2	6	93333	93338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803460
1569	NC_007427	CAC	2	6	93346	93351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	76803460
1570	NC_007427	GCT	2	6	93397	93402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803460
1571	NC_007427	CGA	3	9	93420	93428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803460
1572	NC_007427	CGA	2	6	93496	93501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803460
1573	NC_007427	ACGG	2	8	93532	93539	25 %	0 %	50 %	25 %	76803460
1574	NC_007427	G	6	6	93725	93730	0 %	0 %	100 %	0 %	76803460
1575	NC_007427	ATCG	2	8	93787	93794	25 %	25 %	25 %	25 %	76803460
1576	NC_007427	GGT	2	6	93814	93819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76803460
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1578	NC_007427	TCGA	2	8	93935	93942	25 %	25 %	25 %	25 %	76803460
1579	NC_007427	TAC	2	6	93978	93983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803460
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1581	NC_007427	CGA	2	6	94071	94076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803460
1582	NC_007427	TGAC	2	8	94137	94144	25 %	25 %	25 %	25 %	76803460
1583	NC_007427	CAG	3	9	94149	94157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803460
1584	NC_007427	CAT	2	6	94216	94221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803460
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1587	NC_007427	CGT	2	6	94525	94530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803460
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1589	NC_007427	TGA	2	6	94600	94605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803460
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1593	NC_007427	ACC	2	6	95886	95891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	76803461
1594	NC_007427	TTC	2	6	95903	95908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76803461
1595	NC_007427	TCC	2	6	96000	96005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803461
1596	NC_007427	CGA	2	6	96038	96043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803461
1597	NC_007427	GGAT	2	8	96047	96054	25 %	25 %	50 %	0 %	76803461
1598	NC_007427	CGT	2	6	96089	96094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803461
1599	NC_007427	CGA	2	6	96095	96100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803461
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1602	NC_007427	TCA	2	6	96223	96228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803461
1603	NC_007427	CAA	2	6	96242	96247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76803461
1604	NC_007427	GCC	2	6	96354	96359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803461
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1611	NC_007427	CG	3	6	96636	96641	0 %	0 %	50 %	50 %	76803461
1612	NC_007427	GTTC	2	8	96646	96653	0 %	50 %	25 %	25 %	76803461
1613	NC_007427	CGA	2	6	96674	96679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803461
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1619	NC_007427	GCA	2	6	96856	96861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803461
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1621	NC_007427	CTGT	2	8	96959	96966	0 %	50 %	25 %	25 %	76803461
1622	NC_007427	GCC	2	6	96984	96989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803461
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1626	NC_007427	ACGT	2	8	97083	97090	25 %	25 %	25 %	25 %	76803461
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1992	NC_007427	ACGG	2	8	115705	115712	25 %	0 %	50 %	25 %	76803480
1993	NC_007427	GGA	2	6	115738	115743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76803480
1994	NC_007427	CGC	2	6	115760	115765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803480
1995	NC_007427	GTC	2	6	115772	115777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803480
1996	NC_007427	CA	3	6	115787	115792	50 %	0 %	0 %	50 %	76803480
1997	NC_007427	GGT	2	6	115810	115815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76803480
1998	NC_007427	TGG	2	6	115872	115877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76803480
1999	NC_007427	ACG	2	6	115880	115885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803480
2000	NC_007427	CGAG	2	8	116234	116241	25 %	0 %	50 %	25 %	76803481

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