MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Nocardia farcinica IFM 10152 plasmid pNF2

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006363	GCCGCG	2	12	1926	1937	0 %	0 %	50 %	50 %	54027812
2	NC_006363	GTCCAG	2	12	3324	3335	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	54027812
3	NC_006363	CCATTC	2	12	4622	4633	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	54027814
4	NC_006363	CGGGAT	2	12	6884	6895	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	54027820
5	NC_006363	CGCTCG	2	12	7250	7261	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	54027821
6	NC_006363	CGGGTT	2	12	8106	8117	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	54027821
7	NC_006363	ACCTCG	2	12	8734	8745	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	54027821
8	NC_006363	GTTCGA	2	12	9008	9019	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	54027822
9	NC_006363	GCGGGT	2	12	10630	10641	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	54027823
10	NC_006363	CCGGCA	2	12	12711	12722	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	54027823
11	NC_006363	GCGGGC	2	12	13231	13242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027824
12	NC_006363	GGCCGA	2	12	13379	13390	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	54027824
13	NC_006363	CACCGC	2	12	14909	14920	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	54027824
14	NC_006363	CCGAGA	2	12	17074	17085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027828
15	NC_006363	CGCCAA	2	12	18463	18474	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	54027830
16	NC_006363	CGCAAG	2	12	18614	18625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027830
17	NC_006363	GACATC	2	12	19127	19138	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	54027830
18	NC_006363	TGAGCA	2	12	20133	20144	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54027831
19	NC_006363	GGTGCC	2	12	21523	21534	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	54027831
20	NC_006363	GGCCTG	2	12	23791	23802	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	54027831
21	NC_006363	GTCGAA	2	12	24640	24651	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54027833
22	NC_006363	CGATCG	2	12	25184	25195	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	54027834
23	NC_006363	TCGCCA	2	12	25943	25954	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	54027834
24	NC_006363	CGACCT	2	12	27115	27126	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	54027836
25	NC_006363	TGCCGG	2	12	31697	31708	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	54027841
26	NC_006363	GCGGTC	2	12	33103	33114	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	54027842
27	NC_006363	GCTGGT	2	12	33513	33524	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	54027842
28	NC_006363	GCGCGA	2	12	35187	35198	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	54027845
29	NC_006363	TCGGTC	2	12	35899	35910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027846
30	NC_006363	CGACAT	2	12	36215	36226	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	54027847
31	NC_006363	CGACAC	3	18	36242	36259	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	54027847
32	NC_006363	CACCTA	2	12	37390	37401	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	54027848
33	NC_006363	CGGGTG	2	12	37799	37810	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	54027848
34	NC_006363	CGCCCG	2	12	37989	38000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027848
35	NC_006363	CTCGAC	2	12	38435	38446	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	54027848
36	NC_006363	TCGCCC	2	12	39999	40010	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	54027849
37	NC_006363	ACACCG	2	12	40425	40436	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	54027849
38	NC_006363	GCGCTC	2	12	42427	42438	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	54027851
39	NC_006363	CGCCTA	2	12	46620	46631	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	54027854
40	NC_006363	CGCCTA	2	12	46746	46757	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	54027854
41	NC_006363	CGCCTA	2	12	46872	46883	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	54027854
42	NC_006363	TCGCTT	2	12	46997	47008	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	54027854
43	NC_006363	CGAAGC	2	12	53168	53179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027862
44	NC_006363	AAGACC	2	12	53719	53730	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	54027863
45	NC_006363	GGAGCG	2	12	56740	56751	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	54027866
46	NC_006363	TGCGCG	2	12	58241	58252	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	54027867
47	NC_006363	TCGATG	2	12	61617	61628	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	54027872
48	NC_006363	ATGGCG	2	12	63490	63501	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	54027876
49	NC_006363	CAGGGC	2	12	64527	64538	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	54027876
50	NC_006363	CCCGGC	2	12	65127	65138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027876
51	NC_006363	ACCAGC	2	12	65179	65190	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	54027876
52	NC_006363	CTGATC	2	12	65491	65502	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	54027877
53	NC_006363	TCCACC	2	12	68804	68815	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	54027882
54	NC_006363	GAGCCA	2	12	70059	70070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027885
55	NC_006363	GAGGGT	2	12	70284	70295	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	54027885
56	NC_006363	GGTCGA	2	12	70774	70785	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	54027886
57	NC_006363	GATCCG	2	12	72010	72021	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	54027887
58	NC_006363	TCGCGT	2	12	75378	75389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027891
59	NC_006363	CGGGGT	2	12	75542	75553	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	54027891
60	NC_006363	GCGAAC	2	12	76902	76913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027894
61	NC_006363	CTCGAC	2	12	78093	78104	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	54027895
62	NC_006363	GTTGGT	2	12	81253	81264	0 %	50 %	50 %	0 %	54027899
63	NC_006363	GATGTG	2	12	82414	82425	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	54027899
64	NC_006363	CGATCG	2	12	84195	84206	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	54027901

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.