MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Nocardia farcinica IFM 10152 plasmid pNF2

Total Repeats: 1579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006363	TGT	2	6	26	31	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54027810
2	NC_006363	GAC	2	6	60	65	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027810
3	NC_006363	CGT	2	6	97	102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027810
4	NC_006363	GTG	2	6	112	117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027810
5	NC_006363	AGG	2	6	164	169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027810
6	NC_006363	ATC	2	6	283	288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027810
7	NC_006363	CGG	2	6	294	299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027810
8	NC_006363	AGC	2	6	302	307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027810
9	NC_006363	GCC	2	6	409	414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027810
10	NC_006363	CGA	2	6	420	425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027810
11	NC_006363	TGC	2	6	452	457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027810
12	NC_006363	AGG	2	6	494	499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027810
13	NC_006363	TGG	2	6	524	529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027810
14	NC_006363	ACG	2	6	614	619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027810
15	NC_006363	ACG	2	6	656	661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027810
16	NC_006363	GCA	2	6	689	694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027810
17	NC_006363	CCG	2	6	784	789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027811
18	NC_006363	GCA	2	6	834	839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027811
19	NC_006363	CGC	2	6	947	952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027811
20	NC_006363	GAG	2	6	960	965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027811
21	NC_006363	TCC	2	6	973	978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027811
22	NC_006363	ACC	2	6	1018	1023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027811
23	NC_006363	CGA	2	6	1025	1030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027811
24	NC_006363	CGT	2	6	1055	1060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027811
25	NC_006363	CCG	2	6	1073	1078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027811
26	NC_006363	AAG	2	6	1098	1103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54027811
27	NC_006363	ATC	2	6	1170	1175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027811
28	NC_006363	ACC	2	6	1183	1188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027811
29	NC_006363	GCC	2	6	1255	1260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027811
30	NC_006363	GCT	2	6	1316	1321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027811
31	NC_006363	GCC	2	6	1416	1421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027811
32	NC_006363	CCG	2	6	1476	1481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027811
33	NC_006363	CCA	3	9	1507	1515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027811
34	NC_006363	CGC	2	6	1531	1536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027811
35	NC_006363	CGA	2	6	1547	1552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027811
36	NC_006363	CGT	2	6	1553	1558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027811
37	NC_006363	AGC	2	6	1561	1566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027811
38	NC_006363	AGC	2	6	1573	1578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027811
39	NC_006363	GCT	2	6	1589	1594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027811
40	NC_006363	CGA	2	6	1595	1600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027811
41	NC_006363	GTC	2	6	1602	1607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027811
42	NC_006363	TCG	3	9	1726	1734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027812
43	NC_006363	TCG	2	6	1780	1785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027812
44	NC_006363	GGT	2	6	1865	1870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027812
45	NC_006363	GTC	2	6	1893	1898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027812
46	NC_006363	TGA	2	6	1940	1945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027812
47	NC_006363	CGA	2	6	2042	2047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027812
48	NC_006363	CGT	2	6	2090	2095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027812
49	NC_006363	AGC	2	6	2284	2289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027812
50	NC_006363	ACG	2	6	2297	2302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027812
51	NC_006363	CGG	3	9	2345	2353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027812
52	NC_006363	CGG	3	9	2366	2374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027812
53	NC_006363	GGA	2	6	2550	2555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027812
54	NC_006363	GCC	2	6	2722	2727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027812
55	NC_006363	CGG	2	6	2732	2737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027812
56	NC_006363	CGG	2	6	2771	2776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027812
57	NC_006363	CCG	2	6	2882	2887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027812
58	NC_006363	GCC	2	6	2914	2919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027812
59	NC_006363	TCC	2	6	3016	3021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027812
60	NC_006363	GCA	2	6	3146	3151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027812
61	NC_006363	GAA	2	6	3192	3197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54027812
62	NC_006363	GAG	2	6	3201	3206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027812
63	NC_006363	GGC	2	6	3209	3214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027812
64	NC_006363	ACC	2	6	3241	3246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027812
65	NC_006363	GGC	2	6	3282	3287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027812
66	NC_006363	CCG	2	6	3377	3382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027812
67	NC_006363	CGG	2	6	3393	3398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027812
68	NC_006363	GTG	2	6	3430	3435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027812
69	NC_006363	TGG	2	6	3437	3442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027812
70	NC_006363	GGC	2	6	3532	3537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027812
71	NC_006363	GCT	2	6	3748	3753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027813
72	NC_006363	CGA	2	6	3760	3765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027813
73	NC_006363	TCC	2	6	3772	3777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027813
74	NC_006363	GAA	2	6	3812	3817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54027813
75	NC_006363	CGC	2	6	3837	3842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027813
76	NC_006363	GCC	2	6	3861	3866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027813
77	NC_006363	CGT	2	6	3906	3911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027813
78	NC_006363	CGC	2	6	3963	3968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027814
79	NC_006363	GTA	2	6	4112	4117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027814
80	NC_006363	CAT	2	6	4169	4174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027814
81	NC_006363	AGC	2	6	4221	4226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027814
82	NC_006363	GCG	2	6	4765	4770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027815
83	NC_006363	GAT	2	6	4795	4800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027815
84	NC_006363	CGA	3	9	4809	4817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027815
85	NC_006363	TCG	2	6	4850	4855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027815
86	NC_006363	CGT	2	6	4858	4863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027815
87	NC_006363	TGG	2	6	5081	5086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027815
88	NC_006363	AGC	2	6	5123	5128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027815
89	NC_006363	GCA	2	6	5244	5249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027815
90	NC_006363	GGT	2	6	5326	5331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027815
91	NC_006363	GCG	2	6	5410	5415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027815
92	NC_006363	GCG	2	6	5477	5482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027815
93	NC_006363	CCT	2	6	5520	5525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027815
94	NC_006363	GCT	2	6	5789	5794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027816
95	NC_006363	GCG	2	6	5928	5933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027816
96	NC_006363	GGT	2	6	6004	6009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027817
97	NC_006363	GGT	2	6	6013	6018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027817
98	NC_006363	CAC	2	6	6050	6055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027817
99	NC_006363	TGG	2	6	6077	6082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027817
100	NC_006363	GTC	2	6	6102	6107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027817
101	NC_006363	CAG	2	6	6158	6163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027817
102	NC_006363	GCC	2	6	6182	6187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027817
103	NC_006363	CGG	2	6	6204	6209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027817
104	NC_006363	GTG	2	6	6265	6270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027818
105	NC_006363	CGG	2	6	6300	6305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027818
106	NC_006363	GCT	2	6	6336	6341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027818
107	NC_006363	TGC	2	6	6386	6391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027818
108	NC_006363	CAC	3	9	6471	6479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027818
109	NC_006363	AGC	2	6	6503	6508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027818
110	NC_006363	CCG	2	6	6539	6544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027819
111	NC_006363	TTC	2	6	6579	6584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54027819
112	NC_006363	CAG	2	6	6600	6605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027819
113	NC_006363	CGG	2	6	6609	6614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027819
114	NC_006363	GCG	2	6	6639	6644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027819
115	NC_006363	CGT	2	6	6713	6718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027819
116	NC_006363	CCA	2	6	6740	6745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027819
117	NC_006363	GCC	2	6	6774	6779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027819
118	NC_006363	GTC	2	6	6789	6794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027819
119	NC_006363	CGC	2	6	6797	6802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027819
120	NC_006363	GCC	2	6	6828	6833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027819
121	NC_006363	GCC	2	6	6839	6844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027820
122	NC_006363	CCG	2	6	6852	6857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027820
123	NC_006363	GTG	2	6	6860	6865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027820
124	NC_006363	GTC	2	6	6920	6925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027820
125	NC_006363	CAC	2	6	6985	6990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027820
126	NC_006363	ACG	2	6	7035	7040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027820
127	NC_006363	CGT	2	6	7051	7056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027820
128	NC_006363	TCA	2	6	7068	7073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027820
129	NC_006363	CGG	2	6	7161	7166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027821
130	NC_006363	GGC	2	6	7176	7181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027821
131	NC_006363	CGG	2	6	7308	7313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027821
132	NC_006363	GCC	2	6	7382	7387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027821
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260	NC_006363	GTC	2	6	13317	13322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027824
261	NC_006363	GCA	2	6	13370	13375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027824
262	NC_006363	CGC	2	6	13400	13405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027824
263	NC_006363	CGC	3	9	13484	13492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027824
264	NC_006363	GCA	2	6	13499	13504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027824
265	NC_006363	AGC	2	6	13513	13518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027824
266	NC_006363	GCC	2	6	13596	13601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027824
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268	NC_006363	GTG	2	6	13704	13709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027824
269	NC_006363	ACG	2	6	13729	13734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027824
270	NC_006363	GAG	2	6	13791	13796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027824
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280	NC_006363	GCC	2	6	14304	14309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027824
281	NC_006363	CGA	2	6	14411	14416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027824
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283	NC_006363	CGA	2	6	14609	14614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027824
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285	NC_006363	GCG	2	6	14752	14757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027824
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288	NC_006363	CGA	2	6	14813	14818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027824
289	NC_006363	CGC	2	6	14832	14837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027824
290	NC_006363	GCC	2	6	14838	14843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027824
291	NC_006363	CAC	2	6	14876	14881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027824
292	NC_006363	CCT	2	6	14926	14931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027824
293	NC_006363	CAG	2	6	14946	14951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027824
294	NC_006363	TCG	2	6	14991	14996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027825
295	NC_006363	GCT	2	6	14998	15003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027825
296	NC_006363	CTA	2	6	15061	15066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027825
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299	NC_006363	CAC	2	6	15175	15180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027825
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301	NC_006363	CCA	2	6	15255	15260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027825
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365	NC_006363	CGG	4	12	19292	19303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027830
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370	NC_006363	CGG	2	6	19701	19706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
371	NC_006363	GGC	2	6	19773	19778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
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373	NC_006363	TCT	2	6	19839	19844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54027831
374	NC_006363	GCG	2	6	19853	19858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
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380	NC_006363	GAA	2	6	20080	20085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54027831
381	NC_006363	ACC	2	6	20089	20094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027831
382	NC_006363	CGG	2	6	20421	20426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
383	NC_006363	AGT	2	6	20460	20465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027831
384	NC_006363	AGT	2	6	20538	20543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027831
385	NC_006363	GTC	2	6	20564	20569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
386	NC_006363	TCG	2	6	20654	20659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
387	NC_006363	GAT	2	6	20737	20742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027831
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496	NC_006363	CGC	3	9	26195	26203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027835
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498	NC_006363	GCT	2	6	26276	26281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027835
499	NC_006363	GCG	2	6	26302	26307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027835
500	NC_006363	CTG	2	6	26334	26339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027835

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