MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nocardia farcinica IFM 10152 plasmid pNF2

Total Repeats: 2084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_006363	CCG	2	6	62949	62954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027875
1502	NC_006363	GAC	2	6	62965	62970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027875
1503	NC_006363	ATC	2	6	62996	63001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027875
1504	NC_006363	GCG	2	6	63031	63036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027875
1505	NC_006363	TCG	2	6	63068	63073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027875
1506	NC_006363	TGG	2	6	63081	63086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027875
1507	NC_006363	GTG	2	6	63159	63164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027876
1508	NC_006363	TGG	2	6	63176	63181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027876
1509	NC_006363	GCA	2	6	63182	63187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027876
1510	NC_006363	CCA	2	6	63210	63215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027876
1511	NC_006363	GCA	2	6	63236	63241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027876
1512	NC_006363	GAT	2	6	63300	63305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027876
1513	NC_006363	GAA	2	6	63348	63353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54027876
1514	NC_006363	CCA	2	6	63359	63364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027876
1515	NC_006363	CCG	2	6	63368	63373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027876
1516	NC_006363	CGG	2	6	63374	63379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027876
1517	NC_006363	GCG	2	6	63421	63426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027876
1518	NC_006363	CAG	2	6	63468	63473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027876
1519	NC_006363	ATGGCG	2	12	63490	63501	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	54027876
1520	NC_006363	ATC	2	6	63505	63510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027876
1521	NC_006363	GAA	3	9	63513	63521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54027876
1522	NC_006363	CAA	2	6	63687	63692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54027876
1523	NC_006363	GAT	2	6	63711	63716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027876
1524	NC_006363	CAC	2	6	63720	63725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027876
1525	NC_006363	GTC	2	6	63738	63743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027876
1526	NC_006363	TTG	2	6	63750	63755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54027876
1527	NC_006363	CCG	3	9	63770	63778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027876
1528	NC_006363	ACC	2	6	63787	63792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027876
1529	NC_006363	CGG	2	6	63797	63802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027876
1530	NC_006363	GC	3	6	63811	63816	0 %	0 %	50 %	50 %	54027876
1531	NC_006363	TGCGG	2	10	63841	63850	0 %	20 %	60 %	20 %	54027876
1532	NC_006363	CAT	2	6	63876	63881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027876
1533	NC_006363	CGG	3	9	63899	63907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027876
1534	NC_006363	GC	4	8	63943	63950	0 %	0 %	50 %	50 %	54027876
1535	NC_006363	GCC	2	6	63964	63969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027876
1536	NC_006363	CGG	2	6	63974	63979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027876
1537	NC_006363	TGA	2	6	63986	63991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027876
1538	NC_006363	ACG	2	6	64072	64077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027876
1539	NC_006363	CG	3	6	64192	64197	0 %	0 %	50 %	50 %	54027876
1540	NC_006363	TGC	2	6	64213	64218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027876
1541	NC_006363	GGC	2	6	64220	64225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027876
1542	NC_006363	GC	3	6	64224	64229	0 %	0 %	50 %	50 %	54027876
1543	NC_006363	GCG	3	9	64240	64248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027876
1544	NC_006363	GC	3	6	64265	64270	0 %	0 %	50 %	50 %	54027876
1545	NC_006363	CGG	2	6	64277	64282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027876
1546	NC_006363	GCA	2	6	64283	64288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027876
1547	NC_006363	ACC	2	6	64315	64320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027876
1548	NC_006363	CGG	2	6	64352	64357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027876
1549	NC_006363	CCG	2	6	64376	64381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027876
1550	NC_006363	CGCGG	2	10	64452	64461	0 %	0 %	60 %	40 %	54027876
1551	NC_006363	GC	3	6	64494	64499	0 %	0 %	50 %	50 %	54027876
1552	NC_006363	CAGGGC	2	12	64527	64538	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	54027876
1553	NC_006363	CAT	2	6	64542	64547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027876
1554	NC_006363	CAG	2	6	64590	64595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027876
1555	NC_006363	CCA	2	6	64616	64621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027876
1556	NC_006363	CAG	3	9	64635	64643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027876
1557	NC_006363	ATC	2	6	64726	64731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027876
1558	NC_006363	CGT	2	6	64733	64738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027876
1559	NC_006363	GGC	2	6	64743	64748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027876
1560	NC_006363	TCG	2	6	64834	64839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027876
1561	NC_006363	GT	3	6	64894	64899	0 %	50 %	50 %	0 %	54027876
1562	NC_006363	CCG	2	6	64970	64975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027876
1563	NC_006363	CAC	2	6	65037	65042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027876
1564	NC_006363	GAG	2	6	65056	65061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027876
1565	NC_006363	CCG	2	6	65065	65070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027876
1566	NC_006363	TGC	2	6	65074	65079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027876
1567	NC_006363	CT	3	6	65088	65093	0 %	50 %	0 %	50 %	54027876
1568	NC_006363	GC	3	6	65095	65100	0 %	0 %	50 %	50 %	54027876
1569	NC_006363	CCCGGC	2	12	65127	65138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027876
1570	NC_006363	AC	3	6	65150	65155	50 %	0 %	0 %	50 %	54027876
1571	NC_006363	CGGCG	2	10	65157	65166	0 %	0 %	60 %	40 %	54027876
1572	NC_006363	ACCAGC	2	12	65179	65190	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	54027876
1573	NC_006363	GCC	2	6	65277	65282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027876
1574	NC_006363	GCG	2	6	65284	65289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027876
1575	NC_006363	GTCTC	2	10	65300	65309	0 %	40 %	20 %	40 %	54027876
1576	NC_006363	TCG	2	6	65432	65437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027877
1577	NC_006363	CGGGC	2	10	65456	65465	0 %	0 %	60 %	40 %	54027877
1578	NC_006363	CAT	2	6	65472	65477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027877
1579	NC_006363	CTGATC	2	12	65491	65502	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	54027877
1580	NC_006363	CGC	2	6	65508	65513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027877
1581	NC_006363	CGG	2	6	65517	65522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027877
1582	NC_006363	TCG	2	6	65537	65542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027877
1583	NC_006363	CTGC	2	8	65586	65593	0 %	25 %	25 %	50 %	54027877
1584	NC_006363	CGC	2	6	65632	65637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027877
1585	NC_006363	GCT	2	6	65813	65818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027878
1586	NC_006363	CCG	3	9	65821	65829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027878
1587	NC_006363	ACG	2	6	65881	65886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027878
1588	NC_006363	ACG	2	6	65890	65895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027878
1589	NC_006363	GCC	2	6	65898	65903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027878
1590	NC_006363	GAT	2	6	65915	65920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027878
1591	NC_006363	TCGC	2	8	65924	65931	0 %	25 %	25 %	50 %	54027878
1592	NC_006363	GCC	2	6	65932	65937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027878
1593	NC_006363	CGC	2	6	65951	65956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027878
1594	NC_006363	CGG	2	6	65969	65974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027878
1595	NC_006363	GAT	2	6	66033	66038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027878
1596	NC_006363	AGG	2	6	66049	66054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027878
1597	NC_006363	CGA	3	9	66122	66130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027878
1598	NC_006363	CGG	2	6	66167	66172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027878
1599	NC_006363	CGG	2	6	66176	66181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027878
1600	NC_006363	TCG	4	12	66190	66201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027878
1601	NC_006363	AAC	2	6	66235	66240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54027878
1602	NC_006363	CCCG	2	8	66241	66248	0 %	0 %	25 %	75 %	54027878
1603	NC_006363	CCG	2	6	66283	66288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027878
1604	NC_006363	ACC	2	6	66291	66296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027878
1605	NC_006363	CCG	2	6	66333	66338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027878
1606	NC_006363	GCC	2	6	66348	66353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027878
1607	NC_006363	GAG	2	6	66357	66362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027878
1608	NC_006363	ACC	2	6	66407	66412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027879
1609	NC_006363	GCG	2	6	66423	66428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027879
1610	NC_006363	CCGT	2	8	66441	66448	0 %	25 %	25 %	50 %	54027879
1611	NC_006363	CGA	2	6	66463	66468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027879
1612	NC_006363	AGCA	2	8	66492	66499	50 %	0 %	25 %	25 %	54027879
1613	NC_006363	TGG	2	6	66509	66514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027879
1614	NC_006363	GACC	2	8	66531	66538	25 %	0 %	25 %	50 %	54027879
1615	NC_006363	CGT	2	6	66789	66794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027880
1616	NC_006363	CCG	2	6	66807	66812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027880
1617	NC_006363	CGC	2	6	66817	66822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027880
1618	NC_006363	TGG	2	6	66823	66828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027880
1619	NC_006363	GCT	2	6	66934	66939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027880
1620	NC_006363	CGT	2	6	66956	66961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027880
1621	NC_006363	GC	3	6	67319	67324	0 %	0 %	50 %	50 %	54027881
1622	NC_006363	TCG	2	6	67327	67332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027881
1623	NC_006363	GGC	2	6	67335	67340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027881
1624	NC_006363	GGT	2	6	67470	67475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027881
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1626	NC_006363	AGC	2	6	67513	67518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027881
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1744	NC_006363	GCC	2	6	72821	72826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027887
1745	NC_006363	CCT	2	6	72849	72854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027887
1746	NC_006363	CCCAG	2	10	72855	72864	20 %	0 %	20 %	60 %	54027887
1747	NC_006363	CAT	2	6	72922	72927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027887
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1750	NC_006363	GACC	2	8	73031	73038	25 %	0 %	25 %	50 %	54027888
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