MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Nocardia farcinica IFM 10152 plasmid pNF2

Total Repeats: 2084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006363	TTCG	2	8	20428	20435	0 %	50 %	25 %	25 %	54027831
502	NC_006363	AGT	2	6	20460	20465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027831
503	NC_006363	AGT	2	6	20538	20543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027831
504	NC_006363	GTC	2	6	20564	20569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
505	NC_006363	TGGC	2	8	20634	20641	0 %	25 %	50 %	25 %	54027831
506	NC_006363	TCG	2	6	20654	20659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
507	NC_006363	GTTG	2	8	20664	20671	0 %	50 %	50 %	0 %	54027831
508	NC_006363	GAT	2	6	20737	20742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027831
509	NC_006363	GTA	2	6	20785	20790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027831
510	NC_006363	GCC	2	6	20875	20880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027831
511	NC_006363	GTTG	2	8	20910	20917	0 %	50 %	50 %	0 %	54027831
512	NC_006363	TCG	2	6	20951	20956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
513	NC_006363	CGG	2	6	20979	20984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
514	NC_006363	GCC	2	6	21001	21006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027831
515	NC_006363	CGA	2	6	21021	21026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027831
516	NC_006363	TTG	2	6	21032	21037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54027831
517	NC_006363	CGGT	2	8	21044	21051	0 %	25 %	50 %	25 %	54027831
518	NC_006363	GTTC	2	8	21097	21104	0 %	50 %	25 %	25 %	54027831
519	NC_006363	GCG	2	6	21116	21121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
520	NC_006363	CCGA	2	8	21194	21201	25 %	0 %	25 %	50 %	54027831
521	NC_006363	GAC	2	6	21220	21225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027831
522	NC_006363	CGTT	2	8	21257	21264	0 %	50 %	25 %	25 %	54027831
523	NC_006363	ATC	2	6	21278	21283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027831
524	NC_006363	CGG	2	6	21357	21362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
525	NC_006363	CTT	2	6	21366	21371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54027831
526	NC_006363	GGT	2	6	21391	21396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027831
527	NC_006363	GAG	2	6	21427	21432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027831
528	NC_006363	TGA	2	6	21489	21494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027831
529	NC_006363	GGTGCC	2	12	21523	21534	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	54027831
530	NC_006363	CGG	2	6	21606	21611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
531	NC_006363	GGA	2	6	21615	21620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027831
532	NC_006363	CGA	2	6	21627	21632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027831
533	NC_006363	GAA	2	6	21691	21696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54027831
534	NC_006363	CGG	2	6	21735	21740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
535	NC_006363	CGG	2	6	21750	21755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
536	NC_006363	TGA	2	6	22056	22061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027831
537	NC_006363	CGG	2	6	22086	22091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
538	NC_006363	CGA	2	6	22128	22133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027831
539	NC_006363	GC	3	6	22135	22140	0 %	0 %	50 %	50 %	54027831
540	NC_006363	AAC	2	6	22172	22177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54027831
541	NC_006363	CTG	2	6	22183	22188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
542	NC_006363	TGGT	2	8	22244	22251	0 %	50 %	50 %	0 %	54027831
543	NC_006363	GTC	2	6	22276	22281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
544	NC_006363	GCCC	2	8	22299	22306	0 %	0 %	25 %	75 %	54027831
545	NC_006363	GCT	2	6	22345	22350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
546	NC_006363	GTC	2	6	22390	22395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
547	NC_006363	GC	3	6	22400	22405	0 %	0 %	50 %	50 %	54027831
548	NC_006363	ACC	2	6	22427	22432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027831
549	NC_006363	CGG	2	6	22476	22481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
550	NC_006363	GAT	2	6	22498	22503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027831
551	NC_006363	CCCG	2	8	22539	22546	0 %	0 %	25 %	75 %	54027831
552	NC_006363	ACG	2	6	22556	22561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027831
553	NC_006363	CGA	2	6	22563	22568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027831
554	NC_006363	GTG	2	6	22735	22740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027831
555	NC_006363	TCG	2	6	22764	22769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
556	NC_006363	CGT	2	6	22785	22790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
557	NC_006363	AGC	2	6	22805	22810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027831
558	NC_006363	CCA	2	6	22824	22829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027831
559	NC_006363	GGC	2	6	22861	22866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
560	NC_006363	CGC	2	6	22892	22897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027831
561	NC_006363	CGG	2	6	22900	22905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
562	NC_006363	CGG	2	6	22912	22917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
563	NC_006363	ACCCC	2	10	22920	22929	20 %	0 %	0 %	80 %	54027831
564	NC_006363	CAG	2	6	22967	22972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027831
565	NC_006363	CAT	2	6	22989	22994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027831
566	NC_006363	CTG	3	9	23026	23034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
567	NC_006363	GCG	2	6	23042	23047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
568	NC_006363	TCG	2	6	23057	23062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
569	NC_006363	TCG	2	6	23156	23161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
570	NC_006363	CGA	2	6	23167	23172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027831
571	NC_006363	CGG	2	6	23178	23183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
572	NC_006363	CGG	2	6	23190	23195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
573	NC_006363	TCG	2	6	23213	23218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
574	NC_006363	GCC	2	6	23247	23252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027831
575	NC_006363	CGT	2	6	23274	23279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
576	NC_006363	GGT	2	6	23326	23331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027831
577	NC_006363	GC	3	6	23388	23393	0 %	0 %	50 %	50 %	54027831
578	NC_006363	CGG	2	6	23400	23405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
579	NC_006363	GGT	2	6	23419	23424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027831
580	NC_006363	ACC	2	6	23429	23434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027831
581	NC_006363	CGC	2	6	23443	23448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027831
582	NC_006363	GGC	3	9	23451	23459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
583	NC_006363	CAGC	2	8	23472	23479	25 %	0 %	25 %	50 %	54027831
584	NC_006363	CCG	2	6	23481	23486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027831
585	NC_006363	CGT	2	6	23511	23516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
586	NC_006363	CAG	2	6	23623	23628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027831
587	NC_006363	CG	3	6	23657	23662	0 %	0 %	50 %	50 %	54027831
588	NC_006363	GCC	2	6	23665	23670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027831
589	NC_006363	CGG	2	6	23679	23684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
590	NC_006363	CGG	2	6	23760	23765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
591	NC_006363	GGCCTG	2	12	23791	23802	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	54027831
592	NC_006363	CGGT	2	8	23969	23976	0 %	25 %	50 %	25 %	54027831
593	NC_006363	GAT	2	6	23983	23988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027831
594	NC_006363	CTT	2	6	24007	24012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54027831
595	NC_006363	GAA	2	6	24025	24030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54027831
596	NC_006363	GATC	2	8	24126	24133	25 %	25 %	25 %	25 %	54027831
597	NC_006363	CTG	2	6	24193	24198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
598	NC_006363	GTG	2	6	24451	24456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027832
599	NC_006363	CAG	2	6	24469	24474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027832
600	NC_006363	TCC	2	6	24476	24481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027832
601	NC_006363	GTCGAA	2	12	24640	24651	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54027833
602	NC_006363	TGG	2	6	24654	24659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027833
603	NC_006363	CG	3	6	24795	24800	0 %	0 %	50 %	50 %	54027833
604	NC_006363	TGC	2	6	24879	24884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027833
605	NC_006363	GCT	2	6	24895	24900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027833
606	NC_006363	CGC	2	6	24911	24916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027833
607	NC_006363	TAC	2	6	24929	24934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027833
608	NC_006363	CGT	2	6	24937	24942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027833
609	NC_006363	ACC	2	6	25024	25029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027834
610	NC_006363	CCG	2	6	25037	25042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027834
611	NC_006363	GCC	2	6	25102	25107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027834
612	NC_006363	CTG	2	6	25111	25116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027834
613	NC_006363	CGG	2	6	25154	25159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027834
614	NC_006363	CGATCG	2	12	25184	25195	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	54027834
615	NC_006363	GCT	2	6	25197	25202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027834
616	NC_006363	ATG	2	6	25207	25212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027834
617	NC_006363	CTG	3	9	25288	25296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027834
618	NC_006363	CTGGC	2	10	25330	25339	0 %	20 %	40 %	40 %	54027834
619	NC_006363	TGC	3	9	25340	25348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027834
620	NC_006363	ATC	2	6	25378	25383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027834
621	NC_006363	TCA	2	6	25412	25417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027834
622	NC_006363	GCG	2	6	25436	25441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027834
623	NC_006363	GCC	3	9	25450	25458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027834
624	NC_006363	GGCT	2	8	25537	25544	0 %	25 %	50 %	25 %	54027834
625	NC_006363	GCT	2	6	25620	25625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027834
626	NC_006363	CGC	2	6	25642	25647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027834
627	NC_006363	GCT	2	6	25725	25730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027834
628	NC_006363	CAT	2	6	25830	25835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027834
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632	NC_006363	CAA	2	6	25917	25922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54027834
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653	NC_006363	CAC	2	6	26519	26524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027835
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755	NC_006363	CCG	2	6	30354	30359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027840
756	NC_006363	TGC	2	6	30393	30398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027840
757	NC_006363	TTG	2	6	30419	30424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54027840
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760	NC_006363	CGA	2	6	30537	30542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027840
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789	NC_006363	CGG	2	6	31912	31917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027841
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873	NC_006363	CA	3	6	34748	34753	50 %	0 %	0 %	50 %	54027844
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878	NC_006363	ACC	2	6	35032	35037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027845
879	NC_006363	GGCC	2	8	35049	35056	0 %	0 %	50 %	50 %	54027845
880	NC_006363	CGC	3	9	35070	35078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027845
881	NC_006363	CCG	2	6	35084	35089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027845
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883	NC_006363	ACG	2	6	35125	35130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027845
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