MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Nocardia farcinica IFM 10152 plasmid pNF1

Total Repeats: 413

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006362	GCTC	2	8	681	688	0 %	25 %	25 %	50 %	54027649
2	NC_006362	GGCC	2	8	716	723	0 %	0 %	50 %	50 %	54027650
3	NC_006362	GACC	2	8	820	827	25 %	0 %	25 %	50 %	54027650
4	NC_006362	CGAG	2	8	1125	1132	25 %	0 %	50 %	25 %	54027650
5	NC_006362	GCGG	2	8	1136	1143	0 %	0 %	75 %	25 %	54027650
6	NC_006362	CATC	2	8	1144	1151	25 %	25 %	0 %	50 %	54027650
7	NC_006362	CGGT	3	12	2421	2432	0 %	25 %	50 %	25 %	54027651
8	NC_006362	GATC	2	8	2564	2571	25 %	25 %	25 %	25 %	54027651
9	NC_006362	AGTG	2	8	3121	3128	25 %	25 %	50 %	0 %	54027652
10	NC_006362	GGGC	2	8	3920	3927	0 %	0 %	75 %	25 %	54027652
11	NC_006362	CCGG	3	12	4457	4468	0 %	0 %	50 %	50 %	54027653
12	NC_006362	TCGG	2	8	5012	5019	0 %	25 %	50 %	25 %	54027654
13	NC_006362	GCCG	2	8	5331	5338	0 %	0 %	50 %	50 %	54027654
14	NC_006362	GCGG	2	8	5461	5468	0 %	0 %	75 %	25 %	54027654
15	NC_006362	GCCG	2	8	6230	6237	0 %	0 %	50 %	50 %	54027655
16	NC_006362	CGGT	2	8	7450	7457	0 %	25 %	50 %	25 %	54027657
17	NC_006362	GGGC	2	8	7610	7617	0 %	0 %	75 %	25 %	54027657
18	NC_006362	TGGT	2	8	8374	8381	0 %	50 %	50 %	0 %	54027657
19	NC_006362	AGGG	2	8	8448	8455	25 %	0 %	75 %	0 %	54027657
20	NC_006362	CCCT	2	8	8473	8480	0 %	25 %	0 %	75 %	54027657
21	NC_006362	CGGG	2	8	8768	8775	0 %	0 %	75 %	25 %	54027658
22	NC_006362	ACCC	2	8	9516	9523	25 %	0 %	0 %	75 %	54027658
23	NC_006362	CTCG	2	8	10693	10700	0 %	25 %	25 %	50 %	54027659
24	NC_006362	CCCA	2	8	12542	12549	25 %	0 %	0 %	75 %	54027664
25	NC_006362	CGCC	2	8	12708	12715	0 %	0 %	25 %	75 %	54027664
26	NC_006362	GCGG	2	8	13679	13686	0 %	0 %	75 %	25 %	54027665
27	NC_006362	GCGG	2	8	13895	13902	0 %	0 %	75 %	25 %	54027665
28	NC_006362	GATC	2	8	13961	13968	25 %	25 %	25 %	25 %	54027665
29	NC_006362	GATC	2	8	14144	14151	25 %	25 %	25 %	25 %	54027665
30	NC_006362	GTGC	2	8	14243	14250	0 %	25 %	50 %	25 %	54027665
31	NC_006362	TGGG	2	8	14686	14693	0 %	25 %	75 %	0 %	54027665
32	NC_006362	ACGA	2	8	14754	14761	50 %	0 %	25 %	25 %	54027665
33	NC_006362	CGGC	2	8	14991	14998	0 %	0 %	50 %	50 %	54027665
34	NC_006362	CGGC	2	8	15323	15330	0 %	0 %	50 %	50 %	54027666
35	NC_006362	GCGG	2	8	15364	15371	0 %	0 %	75 %	25 %	54027666
36	NC_006362	GCCG	2	8	15749	15756	0 %	0 %	50 %	50 %	54027666
37	NC_006362	CCGA	2	8	16142	16149	25 %	0 %	25 %	50 %	54027666
38	NC_006362	GCTG	2	8	16374	16381	0 %	25 %	50 %	25 %	54027667
39	NC_006362	CGGT	2	8	16763	16770	0 %	25 %	50 %	25 %	54027667
40	NC_006362	CTGC	2	8	16878	16885	0 %	25 %	25 %	50 %	54027667
41	NC_006362	ACCG	2	8	17071	17078	25 %	0 %	25 %	50 %	54027667
42	NC_006362	GGGT	2	8	17812	17819	0 %	25 %	75 %	0 %	54027668
43	NC_006362	CCGG	2	8	18501	18508	0 %	0 %	50 %	50 %	54027668
44	NC_006362	CAGC	2	8	18768	18775	25 %	0 %	25 %	50 %	54027669
45	NC_006362	GGCG	2	8	19838	19845	0 %	0 %	75 %	25 %	54027669
46	NC_006362	CCCG	2	8	19982	19989	0 %	0 %	25 %	75 %	54027669
47	NC_006362	CCAT	2	8	21337	21344	25 %	25 %	0 %	50 %	54027671
48	NC_006362	GACG	2	8	21703	21710	25 %	0 %	50 %	25 %	54027671
49	NC_006362	GGGC	2	8	21984	21991	0 %	0 %	75 %	25 %	54027671
50	NC_006362	GTGG	2	8	22336	22343	0 %	25 %	75 %	0 %	54027671
51	NC_006362	TCGC	2	8	25008	25015	0 %	25 %	25 %	50 %	54027672
52	NC_006362	GGCG	2	8	26323	26330	0 %	0 %	75 %	25 %	54027673
53	NC_006362	CTTC	2	8	26472	26479	0 %	50 %	0 %	50 %	54027673
54	NC_006362	CCCG	2	8	26521	26528	0 %	0 %	25 %	75 %	54027673
55	NC_006362	CCAC	2	8	26637	26644	25 %	0 %	0 %	75 %	54027673
56	NC_006362	GGCC	2	8	26752	26759	0 %	0 %	50 %	50 %	54027673
57	NC_006362	CCGC	2	8	26806	26813	0 %	0 %	25 %	75 %	54027673
58	NC_006362	GCCG	2	8	26893	26900	0 %	0 %	50 %	50 %	54027673
59	NC_006362	GAAC	2	8	27645	27652	50 %	0 %	25 %	25 %	54027674
60	NC_006362	AGGC	2	8	28235	28242	25 %	0 %	50 %	25 %	54027675
61	NC_006362	CCAG	2	8	30008	30015	25 %	0 %	25 %	50 %	54027676
62	NC_006362	ACCG	2	8	30297	30304	25 %	0 %	25 %	50 %	54027676
63	NC_006362	GCCC	2	8	30580	30587	0 %	0 %	25 %	75 %	54027676
64	NC_006362	GGGT	2	8	30969	30976	0 %	25 %	75 %	0 %	54027676
65	NC_006362	GGGC	2	8	31004	31011	0 %	0 %	75 %	25 %	54027676
66	NC_006362	CACG	2	8	31609	31616	25 %	0 %	25 %	50 %	54027677
67	NC_006362	CACC	2	8	31707	31714	25 %	0 %	0 %	75 %	54027677
68	NC_006362	AGCC	2	8	32611	32618	25 %	0 %	25 %	50 %	54027678
69	NC_006362	GCGG	2	8	37261	37268	0 %	0 %	75 %	25 %	54027679
70	NC_006362	TGAG	2	8	37271	37278	25 %	25 %	50 %	0 %	54027679
71	NC_006362	GTAG	2	8	37398	37405	25 %	25 %	50 %	0 %	54027679
72	NC_006362	CGAC	2	8	37740	37747	25 %	0 %	25 %	50 %	54027679
73	NC_006362	CGTC	2	8	37769	37776	0 %	25 %	25 %	50 %	54027679
74	NC_006362	GGGC	2	8	37785	37792	0 %	0 %	75 %	25 %	54027679
75	NC_006362	CGGT	2	8	37959	37966	0 %	25 %	50 %	25 %	54027679
76	NC_006362	GCGG	2	8	38158	38165	0 %	0 %	75 %	25 %	54027679
77	NC_006362	GCGA	2	8	38935	38942	25 %	0 %	50 %	25 %	54027679
78	NC_006362	CCGA	2	8	40202	40209	25 %	0 %	25 %	50 %	54027681
79	NC_006362	GTTG	2	8	40650	40657	0 %	50 %	50 %	0 %	54027681
80	NC_006362	CTGG	2	8	41036	41043	0 %	25 %	50 %	25 %	54027681
81	NC_006362	ATCG	2	8	41182	41189	25 %	25 %	25 %	25 %	54027681
82	NC_006362	CGCC	2	8	41505	41512	0 %	0 %	25 %	75 %	54027681
83	NC_006362	GCCC	2	8	41712	41719	0 %	0 %	25 %	75 %	54027681
84	NC_006362	GCTG	2	8	41724	41731	0 %	25 %	50 %	25 %	54027681
85	NC_006362	GGCT	2	8	42730	42737	0 %	25 %	50 %	25 %	54027683
86	NC_006362	CGGT	2	8	42782	42789	0 %	25 %	50 %	25 %	54027683
87	NC_006362	CGCA	2	8	42839	42846	25 %	0 %	25 %	50 %	54027683
88	NC_006362	GTCC	2	8	44055	44062	0 %	25 %	25 %	50 %	54027684
89	NC_006362	CTGT	2	8	44966	44973	0 %	50 %	25 %	25 %	54027685
90	NC_006362	TGGG	2	8	45050	45057	0 %	25 %	75 %	0 %	54027685
91	NC_006362	GGTG	2	8	45165	45172	0 %	25 %	75 %	0 %	54027685
92	NC_006362	CGCA	2	8	45228	45235	25 %	0 %	25 %	50 %	54027685
93	NC_006362	CCCG	2	8	46314	46321	0 %	0 %	25 %	75 %	54027686
94	NC_006362	ACCA	2	8	47471	47478	50 %	0 %	0 %	50 %	54027687
95	NC_006362	CAAC	2	8	47479	47486	50 %	0 %	0 %	50 %	54027687
96	NC_006362	TGAA	2	8	48286	48293	50 %	25 %	25 %	0 %	54027688
97	NC_006362	GGGC	2	8	48319	48326	0 %	0 %	75 %	25 %	54027688
98	NC_006362	CGAC	2	8	48666	48673	25 %	0 %	25 %	50 %	54027689
99	NC_006362	GCTC	2	8	48850	48857	0 %	25 %	25 %	50 %	54027689
100	NC_006362	CCGC	2	8	49055	49062	0 %	0 %	25 %	75 %	54027690
101	NC_006362	GTGC	2	8	50682	50689	0 %	25 %	50 %	25 %	54027692
102	NC_006362	CGAG	2	8	50826	50833	25 %	0 %	50 %	25 %	54027692
103	NC_006362	CACG	2	8	50868	50875	25 %	0 %	25 %	50 %	54027692
104	NC_006362	CGAG	2	8	51088	51095	25 %	0 %	50 %	25 %	54027692
105	NC_006362	GACC	2	8	51213	51220	25 %	0 %	25 %	50 %	54027692
106	NC_006362	CGGG	2	8	52384	52391	0 %	0 %	75 %	25 %	54027694
107	NC_006362	TGAT	2	8	52660	52667	25 %	50 %	25 %	0 %	54027694
108	NC_006362	GGCG	2	8	53095	53102	0 %	0 %	75 %	25 %	54027695
109	NC_006362	GGCT	2	8	53238	53245	0 %	25 %	50 %	25 %	54027695
110	NC_006362	GATC	2	8	53774	53781	25 %	25 %	25 %	25 %	54027696
111	NC_006362	GGTC	2	8	54320	54327	0 %	25 %	50 %	25 %	54027696
112	NC_006362	GGGC	2	8	54874	54881	0 %	0 %	75 %	25 %	54027697
113	NC_006362	CAGC	2	8	54971	54978	25 %	0 %	25 %	50 %	54027697
114	NC_006362	GGGT	2	8	55439	55446	0 %	25 %	75 %	0 %	54027698
115	NC_006362	AGAT	2	8	56668	56675	50 %	25 %	25 %	0 %	54027699
116	NC_006362	CGAT	2	8	57101	57108	25 %	25 %	25 %	25 %	54027699
117	NC_006362	CACC	2	8	57915	57922	25 %	0 %	0 %	75 %	54027701
118	NC_006362	CAGC	2	8	58650	58657	25 %	0 %	25 %	50 %	54027701
119	NC_006362	AGCG	2	8	58716	58723	25 %	0 %	50 %	25 %	54027701
120	NC_006362	GGCC	2	8	59781	59788	0 %	0 %	50 %	50 %	54027703
121	NC_006362	TCAG	2	8	60107	60114	25 %	25 %	25 %	25 %	54027703
122	NC_006362	CTGC	2	8	60328	60335	0 %	25 %	25 %	50 %	54027703
123	NC_006362	TGGC	2	8	60352	60359	0 %	25 %	50 %	25 %	54027703
124	NC_006362	CGGT	2	8	60875	60882	0 %	25 %	50 %	25 %	54027703
125	NC_006362	GAGC	2	8	61296	61303	25 %	0 %	50 %	25 %	54027703
126	NC_006362	CATC	2	8	61726	61733	25 %	25 %	0 %	50 %	54027703
127	NC_006362	TGGG	2	8	62173	62180	0 %	25 %	75 %	0 %	54027704
128	NC_006362	GCCG	2	8	62382	62389	0 %	0 %	50 %	50 %	54027704
129	NC_006362	ATCT	2	8	62524	62531	25 %	50 %	0 %	25 %	54027704
130	NC_006362	CGAT	2	8	63876	63883	25 %	25 %	25 %	25 %	54027705
131	NC_006362	CCAG	2	8	65106	65113	25 %	0 %	25 %	50 %	54027706
132	NC_006362	CTGC	2	8	66126	66133	0 %	25 %	25 %	50 %	54027707
133	NC_006362	GCCC	2	8	66255	66262	0 %	0 %	25 %	75 %	54027707
134	NC_006362	GCAC	2	8	66465	66472	25 %	0 %	25 %	50 %	54027707
135	NC_006362	TCGG	2	8	66649	66656	0 %	25 %	50 %	25 %	54027707
136	NC_006362	TATC	2	8	66798	66805	25 %	50 %	0 %	25 %	54027707
137	NC_006362	GCAC	2	8	66886	66893	25 %	0 %	25 %	50 %	54027707
138	NC_006362	GGCC	2	8	67655	67662	0 %	0 %	50 %	50 %	54027708
139	NC_006362	TTGC	2	8	68157	68164	0 %	50 %	25 %	25 %	54027708
140	NC_006362	CAGT	2	8	68446	68453	25 %	25 %	25 %	25 %	54027708
141	NC_006362	ATGA	2	8	68643	68650	50 %	25 %	25 %	0 %	54027709
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.