MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Nocardia farcinica IFM 10152 plasmid pNF1

Total Repeats: 4082

Go To Repeat Summary Page

< Previous 1 2 3 4 5 6 7 89Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_006362	GAC	2	6	178366	178371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027806
4002	NC_006362	TCA	2	6	178373	178378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027806
4003	NC_006362	ACC	2	6	178409	178414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027806
4004	NC_006362	CGA	2	6	178458	178463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027806
4005	NC_006362	CTC	2	6	178465	178470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027806
4006	NC_006362	TCG	2	6	178508	178513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027806
4007	NC_006362	GCC	3	9	178565	178573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027806
4008	NC_006362	TCG	2	6	178580	178585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027806
4009	NC_006362	GCC	2	6	178588	178593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027806
4010	NC_006362	ACG	3	9	178646	178654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027806
4011	NC_006362	TCG	2	6	178682	178687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027806
4012	NC_006362	CTT	2	6	178722	178727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54027806
4013	NC_006362	GGC	2	6	178756	178761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027806
4014	NC_006362	GCTG	2	8	178868	178875	0 %	25 %	50 %	25 %	54027806
4015	NC_006362	CGAA	2	8	178878	178885	50 %	0 %	25 %	25 %	54027806
4016	NC_006362	CT	3	6	178890	178895	0 %	50 %	0 %	50 %	54027806
4017	NC_006362	GGAC	2	8	178896	178903	25 %	0 %	50 %	25 %	54027806
4018	NC_006362	CA	3	6	178999	179004	50 %	0 %	0 %	50 %	54027806
4019	NC_006362	ACC	2	6	179090	179095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027806
4020	NC_006362	GCCC	2	8	179651	179658	0 %	0 %	25 %	75 %	54027807
4021	NC_006362	GTC	2	6	179661	179666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027807
4022	NC_006362	GTT	2	6	179673	179678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54027807
4023	NC_006362	CGT	2	6	179771	179776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027807
4024	NC_006362	ACGCC	2	10	179804	179813	20 %	0 %	20 %	60 %	54027807
4025	NC_006362	GAA	2	6	179843	179848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54027807
4026	NC_006362	AACCC	2	10	179872	179881	40 %	0 %	0 %	60 %	54027807
4027	NC_006362	TGC	2	6	179913	179918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027807
4028	NC_006362	CGG	2	6	180002	180007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027807
4029	NC_006362	ACC	2	6	180038	180043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027807
4030	NC_006362	TGA	2	6	180146	180151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027807
4031	NC_006362	GCG	2	6	180196	180201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027807
4032	NC_006362	GGC	2	6	180207	180212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027807
4033	NC_006362	CTTG	2	8	180216	180223	0 %	50 %	25 %	25 %	54027807
4034	NC_006362	TCC	2	6	180231	180236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027807
4035	NC_006362	CGC	2	6	181195	181200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027808
4036	NC_006362	TC	3	6	181212	181217	0 %	50 %	0 %	50 %	54027808
4037	NC_006362	TGG	2	6	181262	181267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027808
4038	NC_006362	TCG	2	6	181351	181356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027808
4039	NC_006362	CCGG	2	8	181399	181406	0 %	0 %	50 %	50 %	54027808
4040	NC_006362	GGA	2	6	181454	181459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027808
4041	NC_006362	CGA	2	6	181508	181513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027808
4042	NC_006362	CGG	2	6	181520	181525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027808
4043	NC_006362	CGC	2	6	181541	181546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027808
4044	NC_006362	CGC	2	6	181565	181570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027808
4045	NC_006362	CGG	2	6	181580	181585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027808
4046	NC_006362	ACGCTG	2	12	181587	181598	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	54027808
4047	NC_006362	GC	3	6	181650	181655	0 %	0 %	50 %	50 %	54027808
4048	NC_006362	CGG	2	6	181656	181661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027808
4049	NC_006362	CG	3	6	181712	181717	0 %	0 %	50 %	50 %	54027808
4050	NC_006362	CCG	2	6	181745	181750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027808
4051	NC_006362	CTG	2	6	181762	181767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027808
4052	NC_006362	GGC	2	6	181828	181833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027808
4053	NC_006362	CAC	2	6	181856	181861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027808
4054	NC_006362	TG	3	6	181862	181867	0 %	50 %	50 %	0 %	54027808
4055	NC_006362	GCG	2	6	181946	181951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027808
4056	NC_006362	CG	3	6	181950	181955	0 %	0 %	50 %	50 %	54027808
4057	NC_006362	GGCG	2	8	181988	181995	0 %	0 %	75 %	25 %	54027808
4058	NC_006362	GCC	2	6	182021	182026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027808
4059	NC_006362	CG	3	6	182066	182071	0 %	0 %	50 %	50 %	54027808
4060	NC_006362	CGC	2	6	182075	182080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027808
4061	NC_006362	AGC	2	6	182099	182104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027808
4062	NC_006362	GCC	2	6	182131	182136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027808
4063	NC_006362	ACG	2	6	182138	182143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027808
4064	NC_006362	CTG	3	9	182160	182168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027808
4065	NC_006362	C	6	6	182416	182421	0 %	0 %	0 %	100 %	54027808
4066	NC_006362	CCTC	2	8	182430	182437	0 %	25 %	0 %	75 %	54027808
4067	NC_006362	CG	3	6	182442	182447	0 %	0 %	50 %	50 %	54027808
4068	NC_006362	CTC	2	6	182457	182462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027808
4069	NC_006362	CCG	2	6	182474	182479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027808
4070	NC_006362	CCA	2	6	182486	182491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027808
4071	NC_006362	GAC	2	6	182517	182522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027808
4072	NC_006362	AGC	2	6	182547	182552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027808
4073	NC_006362	CAG	2	6	182592	182597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027808
4074	NC_006362	TGG	2	6	182601	182606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027808
4075	NC_006362	CGA	2	6	182621	182626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027808
4076	NC_006362	AGG	2	6	182629	182634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027808
4077	NC_006362	GC	3	6	182651	182656	0 %	0 %	50 %	50 %	54027808
4078	NC_006362	CGG	2	6	182712	182717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027808
4079	NC_006362	GCC	3	9	182745	182753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027808
4080	NC_006362	CGAC	2	8	182767	182774	25 %	0 %	25 %	50 %	54027808
4081	NC_006362	GCT	2	6	182787	182792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027808
4082	NC_006362	GCT	2	6	182871	182876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027808

< Previous 1 2 3 4 5 6 7 89Next >