MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nocardia farcinica IFM 10152 plasmid pNF1

Total Repeats: 4082

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_006362	CGC	3	9	158958	158966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027787
3502	NC_006362	CCT	2	6	159022	159027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027787
3503	NC_006362	TGG	2	6	159028	159033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027787
3504	NC_006362	TCG	2	6	159036	159041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027787
3505	NC_006362	CCTG	2	8	159115	159122	0 %	25 %	25 %	50 %	54027787
3506	NC_006362	CAG	2	6	159125	159130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027787
3507	NC_006362	CTT	2	6	159140	159145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54027787
3508	NC_006362	GGT	2	6	159203	159208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027787
3509	NC_006362	GCG	2	6	159230	159235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027787
3510	NC_006362	CGT	2	6	159349	159354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027787
3511	NC_006362	TCG	2	6	159477	159482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027787
3512	NC_006362	GCC	2	6	159512	159517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027787
3513	NC_006362	GGC	2	6	159527	159532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027787
3514	NC_006362	CGC	2	6	159566	159571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027787
3515	NC_006362	CGG	2	6	159583	159588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027787
3516	NC_006362	CCT	2	6	159598	159603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027787
3517	NC_006362	TCA	2	6	159607	159612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027787
3518	NC_006362	TCT	2	6	159676	159681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54027787
3519	NC_006362	GCT	2	6	159691	159696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027787
3520	NC_006362	CGG	2	6	159707	159712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027787
3521	NC_006362	TTC	2	6	159731	159736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54027787
3522	NC_006362	AC	3	6	159775	159780	50 %	0 %	0 %	50 %	54027787
3523	NC_006362	CGG	2	6	159793	159798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027787
3524	NC_006362	CGG	2	6	159834	159839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027787
3525	NC_006362	ATCCA	2	10	159888	159897	40 %	20 %	0 %	40 %	54027787
3526	NC_006362	CAG	2	6	159950	159955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027787
3527	NC_006362	GAA	2	6	159974	159979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54027787
3528	NC_006362	CGC	3	9	160003	160011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027787
3529	NC_006362	CTT	2	6	160040	160045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54027787
3530	NC_006362	GTG	2	6	160059	160064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027787
3531	NC_006362	CCA	3	9	160082	160090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027787
3532	NC_006362	GCG	2	6	160098	160103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027787
3533	NC_006362	CTGG	2	8	160112	160119	0 %	25 %	50 %	25 %	54027787
3534	NC_006362	GACCGC	2	12	160232	160243	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	54027787
3535	NC_006362	TTG	2	6	160251	160256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54027787
3536	NC_006362	CAT	2	6	160268	160273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027787
3537	NC_006362	AGG	2	6	160294	160299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027787
3538	NC_006362	GGC	2	6	160321	160326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027787
3539	NC_006362	GCG	2	6	160333	160338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027787
3540	NC_006362	TCGA	2	8	160371	160378	25 %	25 %	25 %	25 %	54027787
3541	NC_006362	GC	3	6	160380	160385	0 %	0 %	50 %	50 %	54027787
3542	NC_006362	CAG	2	6	160402	160407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027787
3543	NC_006362	CTT	2	6	160409	160414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54027787
3544	NC_006362	GCA	2	6	160447	160452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027787
3545	NC_006362	TCGG	2	8	160467	160474	0 %	25 %	50 %	25 %	54027787
3546	NC_006362	CAC	2	6	160487	160492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027787
3547	NC_006362	CAG	2	6	160520	160525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027787
3548	NC_006362	CCA	2	6	160531	160536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027787
3549	NC_006362	ACG	2	6	160552	160557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027787
3550	NC_006362	CGA	2	6	160600	160605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027787
3551	NC_006362	CAC	2	6	160678	160683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027788
3552	NC_006362	CAC	2	6	160687	160692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027788
3553	NC_006362	AGC	3	9	160715	160723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027788
3554	NC_006362	CCGC	2	8	160725	160732	0 %	0 %	25 %	75 %	54027788
3555	NC_006362	CGG	2	6	160737	160742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027788
3556	NC_006362	CGA	3	9	160773	160781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027788
3557	NC_006362	GC	3	6	160792	160797	0 %	0 %	50 %	50 %	54027788
3558	NC_006362	GCC	3	9	160805	160813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027788
3559	NC_006362	GC	3	6	160857	160862	0 %	0 %	50 %	50 %	54027788
3560	NC_006362	GCG	2	6	160868	160873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027788
3561	NC_006362	GCA	2	6	160896	160901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027788
3562	NC_006362	ACC	2	6	160913	160918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027788
3563	NC_006362	CGGC	2	8	160941	160948	0 %	0 %	50 %	50 %	54027788
3564	NC_006362	GCG	2	6	161065	161070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027788
3565	NC_006362	GCC	2	6	161081	161086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027788
3566	NC_006362	CAG	2	6	161104	161109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027788
3567	NC_006362	GCC	2	6	161135	161140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027788
3568	NC_006362	GTCGGC	2	12	161179	161190	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	54027788
3569	NC_006362	CAG	2	6	161209	161214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027788
3570	NC_006362	AGT	2	6	161227	161232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027788
3571	NC_006362	CAC	2	6	161276	161281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027788
3572	NC_006362	GGTC	2	8	161304	161311	0 %	25 %	50 %	25 %	54027788
3573	NC_006362	TGA	2	6	161316	161321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027788
3574	NC_006362	TGC	2	6	161414	161419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027789
3575	NC_006362	CTC	2	6	161424	161429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027789
3576	NC_006362	CGTC	2	8	161430	161437	0 %	25 %	25 %	50 %	54027789
3577	NC_006362	TTC	2	6	161483	161488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54027789
3578	NC_006362	CGG	2	6	161585	161590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027789
3579	NC_006362	CCG	2	6	161676	161681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027789
3580	NC_006362	GC	3	6	161699	161704	0 %	0 %	50 %	50 %	54027789
3581	NC_006362	CTTGGC	2	12	161714	161725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027789
3582	NC_006362	GTGC	2	8	161768	161775	0 %	25 %	50 %	25 %	54027789
3583	NC_006362	CCA	2	6	161833	161838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027789
3584	NC_006362	CG	3	6	161849	161854	0 %	0 %	50 %	50 %	54027789
3585	NC_006362	GC	3	6	161859	161864	0 %	0 %	50 %	50 %	54027789
3586	NC_006362	CGG	2	6	161905	161910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027789
3587	NC_006362	GGCC	2	8	161929	161936	0 %	0 %	50 %	50 %	54027789
3588	NC_006362	CCACGC	2	12	161939	161950	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	54027789
3589	NC_006362	CAT	2	6	161954	161959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027789
3590	NC_006362	CGG	2	6	161962	161967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027789
3591	NC_006362	CCA	2	6	161968	161973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027789
3592	NC_006362	CGT	2	6	161974	161979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027789
3593	NC_006362	GA	3	6	162002	162007	50 %	0 %	50 %	0 %	54027789
3594	NC_006362	TCGA	2	8	162033	162040	25 %	25 %	25 %	25 %	54027789
3595	NC_006362	CGA	2	6	162047	162052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027789
3596	NC_006362	CA	3	6	162082	162087	50 %	0 %	0 %	50 %	54027789
3597	NC_006362	ACA	3	9	162085	162093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54027789
3598	NC_006362	CGG	2	6	162123	162128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027789
3599	NC_006362	TACTCG	2	12	162129	162140	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	54027789
3600	NC_006362	CG	4	8	162142	162149	0 %	0 %	50 %	50 %	54027789
3601	NC_006362	CGG	2	6	162167	162172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027789
3602	NC_006362	GAT	2	6	162223	162228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027789
3603	NC_006362	CGT	2	6	162241	162246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027789
3604	NC_006362	CAG	3	9	162269	162277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027789
3605	NC_006362	CGA	2	6	162307	162312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027789
3606	NC_006362	CAG	2	6	162329	162334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027789
3607	NC_006362	GCCG	2	8	162343	162350	0 %	0 %	50 %	50 %	54027789
3608	NC_006362	GCG	2	6	162390	162395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027789
3609	NC_006362	CGCGC	2	10	162401	162410	0 %	0 %	40 %	60 %	54027789
3610	NC_006362	CGA	2	6	162544	162549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027789
3611	NC_006362	GCA	2	6	162569	162574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027789
3612	NC_006362	CGA	2	6	162637	162642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027789
3613	NC_006362	GGC	2	6	162688	162693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027789
3614	NC_006362	GTG	3	9	162759	162767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027789
3615	NC_006362	CCG	2	6	162807	162812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027789
3616	NC_006362	CG	3	6	162831	162836	0 %	0 %	50 %	50 %	54027789
3617	NC_006362	TCG	2	6	162903	162908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027789
3618	NC_006362	CG	3	6	162996	163001	0 %	0 %	50 %	50 %	54027789
3619	NC_006362	GGT	2	6	163028	163033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027789
3620	NC_006362	GCCA	2	8	163037	163044	25 %	0 %	25 %	50 %	54027790
3621	NC_006362	GCG	2	6	163052	163057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027790
3622	NC_006362	CGG	2	6	163071	163076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027790
3623	NC_006362	CGG	2	6	163113	163118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027790
3624	NC_006362	CGC	2	6	163125	163130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027790
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3731	NC_006362	CGG	2	6	166764	166769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027792
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3736	NC_006362	GATCA	2	10	167090	167099	40 %	20 %	20 %	20 %	54027793
3737	NC_006362	CTG	2	6	167100	167105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027793
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3740	NC_006362	CGG	2	6	167227	167232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027793
3741	NC_006362	GC	3	6	167345	167350	0 %	0 %	50 %	50 %	54027793
3742	NC_006362	G	6	6	167410	167415	0 %	0 %	100 %	0 %	54027793
3743	NC_006362	GCCG	2	8	167426	167433	0 %	0 %	50 %	50 %	54027793
3744	NC_006362	TGCGG	2	10	167517	167526	0 %	20 %	60 %	20 %	54027793
3745	NC_006362	CGG	2	6	167545	167550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027793
3746	NC_006362	GTC	2	6	167598	167603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027793
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3749	NC_006362	CCG	2	6	167655	167660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027793
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3990	NC_006362	CAC	2	6	178077	178082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027806
3991	NC_006362	CTC	2	6	178093	178098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027806
3992	NC_006362	ATC	2	6	178168	178173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027806
3993	NC_006362	CGC	2	6	178236	178241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027806
3994	NC_006362	TGC	2	6	178244	178249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027806
3995	NC_006362	GCAACA	2	12	178271	178282	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	54027806
3996	NC_006362	GCC	2	6	178284	178289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027806
3997	NC_006362	CTT	2	6	178290	178295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54027806
3998	NC_006362	AGA	2	6	178298	178303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54027806
3999	NC_006362	CG	3	6	178315	178320	0 %	0 %	50 %	50 %	54027806
4000	NC_006362	GTC	2	6	178360	178365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027806

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