MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nocardia farcinica IFM 10152 plasmid pNF1

Total Repeats: 4082

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_006362	ACG	3	9	139055	139063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027761
3002	NC_006362	GCGCG	2	10	139066	139075	0 %	0 %	60 %	40 %	54027761
3003	NC_006362	AGC	2	6	139088	139093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027761
3004	NC_006362	GGT	2	6	139117	139122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027761
3005	NC_006362	CGG	2	6	139167	139172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027761
3006	NC_006362	GCCG	2	8	139191	139198	0 %	0 %	50 %	50 %	54027761
3007	NC_006362	TGCGG	2	10	139249	139258	0 %	20 %	60 %	20 %	54027761
3008	NC_006362	GTT	2	6	139271	139276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54027761
3009	NC_006362	GCG	2	6	139298	139303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027761
3010	NC_006362	GTC	2	6	139342	139347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027761
3011	NC_006362	TGG	2	6	139395	139400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027761
3012	NC_006362	GGGC	2	8	139410	139417	0 %	0 %	75 %	25 %	54027761
3013	NC_006362	CGA	2	6	139434	139439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027761
3014	NC_006362	CGG	2	6	139503	139508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027761
3015	NC_006362	AGAT	2	8	139511	139518	50 %	25 %	25 %	0 %	54027761
3016	NC_006362	CGG	2	6	139533	139538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027761
3017	NC_006362	CAG	2	6	139606	139611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027761
3018	NC_006362	CGG	2	6	139630	139635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027761
3019	NC_006362	GAG	2	6	139666	139671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027761
3020	NC_006362	CTG	2	6	139672	139677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027761
3021	NC_006362	CAG	2	6	139681	139686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027761
3022	NC_006362	CGA	2	6	139719	139724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027761
3023	NC_006362	CGC	2	6	139728	139733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027761
3024	NC_006362	CTC	2	6	139777	139782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027761
3025	NC_006362	GGC	3	9	139954	139962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027761
3026	NC_006362	CG	3	6	139971	139976	0 %	0 %	50 %	50 %	54027761
3027	NC_006362	CCGG	2	8	139993	140000	0 %	0 %	50 %	50 %	54027761
3028	NC_006362	GCG	2	6	140020	140025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027761
3029	NC_006362	CCG	2	6	140045	140050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027761
3030	NC_006362	GCGG	2	8	140064	140071	0 %	0 %	75 %	25 %	54027761
3031	NC_006362	CAGC	2	8	140080	140087	25 %	0 %	25 %	50 %	54027761
3032	NC_006362	GTC	2	6	140113	140118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027761
3033	NC_006362	ACG	2	6	140216	140221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027761
3034	NC_006362	CGG	3	9	140277	140285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027761
3035	NC_006362	TCG	2	6	140291	140296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027761
3036	NC_006362	CGG	2	6	140307	140312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027761
3037	NC_006362	GCC	2	6	140332	140337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027761
3038	NC_006362	GGCG	2	8	140343	140350	0 %	0 %	75 %	25 %	54027761
3039	NC_006362	CAG	2	6	140374	140379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027761
3040	NC_006362	GCA	2	6	140421	140426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027761
3041	NC_006362	GTGCCG	2	12	140438	140449	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	54027761
3042	NC_006362	CCAG	2	8	140466	140473	25 %	0 %	25 %	50 %	54027761
3043	NC_006362	TCGCCG	2	12	140501	140512	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	54027761
3044	NC_006362	CGA	3	9	140520	140528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027761
3045	NC_006362	GCC	2	6	140587	140592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027761
3046	NC_006362	GGT	2	6	140595	140600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027761
3047	NC_006362	GC	3	6	140655	140660	0 %	0 %	50 %	50 %	54027761
3048	NC_006362	GC	3	6	140665	140670	0 %	0 %	50 %	50 %	54027761
3049	NC_006362	GCC	2	6	140761	140766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027761
3050	NC_006362	GGCCGG	2	12	140863	140874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027761
3051	NC_006362	GCGCG	2	10	140957	140966	0 %	0 %	60 %	40 %	54027761
3052	NC_006362	CGG	3	9	140979	140987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027761
3053	NC_006362	GCC	2	6	141002	141007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027761
3054	NC_006362	GGT	2	6	141028	141033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027761
3055	NC_006362	CGC	2	6	141072	141077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027762
3056	NC_006362	CGA	2	6	141125	141130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027762
3057	NC_006362	GCTCGG	2	12	141152	141163	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	54027762
3058	NC_006362	TGG	2	6	141226	141231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027762
3059	NC_006362	CCGCT	2	10	141266	141275	0 %	20 %	20 %	60 %	54027762
3060	NC_006362	CTG	2	6	141279	141284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027762
3061	NC_006362	GGC	2	6	141285	141290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027762
3062	NC_006362	GGC	2	6	141309	141314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027762
3063	NC_006362	GCC	2	6	141348	141353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027762
3064	NC_006362	TGG	2	6	141361	141366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027762
3065	NC_006362	GCG	2	6	141381	141386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027762
3066	NC_006362	GCG	2	6	141409	141414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027762
3067	NC_006362	CCG	2	6	141447	141452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027762
3068	NC_006362	GCA	2	6	141494	141499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027762
3069	NC_006362	CGG	2	6	141540	141545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027763
3070	NC_006362	GCC	2	6	141547	141552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027763
3071	NC_006362	GCGCC	2	10	141559	141568	0 %	0 %	40 %	60 %	54027763
3072	NC_006362	AAC	2	6	141581	141586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54027763
3073	NC_006362	GCG	2	6	141599	141604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027763
3074	NC_006362	AGG	2	6	141605	141610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027763
3075	NC_006362	CG	3	6	141616	141621	0 %	0 %	50 %	50 %	54027763
3076	NC_006362	GCGCG	2	10	141696	141705	0 %	0 %	60 %	40 %	54027763
3077	NC_006362	GGC	2	6	141763	141768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027763
3078	NC_006362	CAC	2	6	141783	141788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027763
3079	NC_006362	TCA	2	6	141861	141866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027763
3080	NC_006362	GTC	2	6	141937	141942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027763
3081	NC_006362	ACG	2	6	141983	141988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027763
3082	NC_006362	CCA	2	6	142035	142040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027763
3083	NC_006362	CAG	2	6	142130	142135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027764
3084	NC_006362	AGC	2	6	142275	142280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027764
3085	NC_006362	TGC	2	6	142281	142286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027764
3086	NC_006362	CG	3	6	142313	142318	0 %	0 %	50 %	50 %	54027764
3087	NC_006362	CGGC	2	8	142324	142331	0 %	0 %	50 %	50 %	54027764
3088	NC_006362	GCA	2	6	142363	142368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027764
3089	NC_006362	CGG	2	6	142391	142396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027764
3090	NC_006362	CG	3	6	142398	142403	0 %	0 %	50 %	50 %	54027764
3091	NC_006362	TG	3	6	142407	142412	0 %	50 %	50 %	0 %	54027764
3092	NC_006362	CAG	2	6	142439	142444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027764
3093	NC_006362	TG	3	6	142562	142567	0 %	50 %	50 %	0 %	54027764
3094	NC_006362	GGC	2	6	142570	142575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027764
3095	NC_006362	GCG	2	6	142619	142624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027764
3096	NC_006362	GCC	2	6	142695	142700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027764
3097	NC_006362	CCG	2	6	142731	142736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027764
3098	NC_006362	GCG	2	6	142843	142848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027765
3099	NC_006362	GGT	2	6	142898	142903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027765
3100	NC_006362	CCG	2	6	142919	142924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027765
3101	NC_006362	CGG	2	6	142925	142930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027765
3102	NC_006362	GGC	2	6	142938	142943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027765
3103	NC_006362	GCC	2	6	142957	142962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027765
3104	NC_006362	GC	3	6	142998	143003	0 %	0 %	50 %	50 %	54027765
3105	NC_006362	CCA	2	6	143012	143017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027765
3106	NC_006362	CGC	2	6	143039	143044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027765
3107	NC_006362	CGC	2	6	143078	143083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027765
3108	NC_006362	CGG	2	6	143126	143131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027765
3109	NC_006362	CG	3	6	143132	143137	0 %	0 %	50 %	50 %	54027765
3110	NC_006362	CTC	2	6	143181	143186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027765
3111	NC_006362	CGCC	2	8	143198	143205	0 %	0 %	25 %	75 %	54027765
3112	NC_006362	GCA	2	6	143219	143224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027765
3113	NC_006362	GCC	2	6	143253	143258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027765
3114	NC_006362	GTG	2	6	143330	143335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027765
3115	NC_006362	CAC	2	6	143339	143344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027765
3116	NC_006362	TCG	2	6	143386	143391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027765
3117	NC_006362	GTCGAT	2	12	143427	143438	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	54027765
3118	NC_006362	AGC	2	6	143488	143493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027765
3119	NC_006362	ACCG	2	8	143496	143503	25 %	0 %	25 %	50 %	54027765
3120	NC_006362	GTGGC	2	10	143512	143521	0 %	20 %	60 %	20 %	54027765
3121	NC_006362	CGC	2	6	143535	143540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027765
3122	NC_006362	CCG	2	6	143549	143554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027765
3123	NC_006362	GC	3	6	143573	143578	0 %	0 %	50 %	50 %	54027765
3124	NC_006362	CGG	2	6	143648	143653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027765
3125	NC_006362	CGA	2	6	143729	143734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027765
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3128	NC_006362	CCG	2	6	143822	143827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027765
3129	NC_006362	CGG	2	6	143834	143839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027765
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3241	NC_006362	GGCA	2	8	148527	148534	25 %	0 %	50 %	25 %	54027773
3242	NC_006362	CG	3	6	148592	148597	0 %	0 %	50 %	50 %	54027773
3243	NC_006362	CAATCG	2	12	148616	148627	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	54027773
3244	NC_006362	GCC	2	6	148677	148682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027774
3245	NC_006362	CCCG	2	8	148709	148716	0 %	0 %	25 %	75 %	54027774
3246	NC_006362	CCCG	2	8	148729	148736	0 %	0 %	25 %	75 %	54027774
3247	NC_006362	GATCG	2	10	148754	148763	20 %	20 %	40 %	20 %	54027774
3248	NC_006362	TCG	2	6	148773	148778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027774
3249	NC_006362	AGC	2	6	148830	148835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027774
3250	NC_006362	GCCG	2	8	148874	148881	0 %	0 %	50 %	50 %	54027774
3251	NC_006362	GCC	2	6	148908	148913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027774
3252	NC_006362	CGG	2	6	149069	149074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027774
3253	NC_006362	GCG	2	6	149114	149119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027774
3254	NC_006362	GCG	3	9	149136	149144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027774
3255	NC_006362	CGGA	2	8	149174	149181	25 %	0 %	50 %	25 %	54027774
3256	NC_006362	CAG	2	6	149198	149203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027774
3257	NC_006362	GTC	2	6	149213	149218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027774
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3259	NC_006362	GGGTCG	2	12	149239	149250	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	54027774
3260	NC_006362	TGA	2	6	149254	149259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027774
3261	NC_006362	GGC	2	6	149315	149320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027774
3262	NC_006362	CAC	2	6	149336	149341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027774
3263	NC_006362	CCT	2	6	149392	149397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027774
3264	NC_006362	ACG	2	6	149443	149448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027774
3265	NC_006362	CGT	2	6	149492	149497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027775
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3270	NC_006362	CG	3	6	149646	149651	0 %	0 %	50 %	50 %	54027775
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3273	NC_006362	GCG	2	6	149797	149802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027775
3274	NC_006362	GCA	2	6	149819	149824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027775
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3276	NC_006362	CGA	2	6	149892	149897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027775
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3278	NC_006362	C	6	6	150073	150078	0 %	0 %	0 %	100 %	54027775
3279	NC_006362	GCGCC	2	10	150096	150105	0 %	0 %	40 %	60 %	54027775
3280	NC_006362	CGA	2	6	150121	150126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027775
3281	NC_006362	GC	3	6	150147	150152	0 %	0 %	50 %	50 %	54027775
3282	NC_006362	CGG	2	6	150260	150265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027775
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3286	NC_006362	CCG	2	6	150375	150380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027775
3287	NC_006362	TCA	2	6	150394	150399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027775
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3368	NC_006362	G	6	6	153691	153696	0 %	0 %	100 %	0 %	54027781
3369	NC_006362	CCAC	2	8	153698	153705	25 %	0 %	0 %	75 %	54027781
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3371	NC_006362	ATC	2	6	153788	153793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027782
3372	NC_006362	CTC	2	6	153871	153876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027782
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3374	NC_006362	CTG	2	6	153892	153897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027782
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3494	NC_006362	GCG	2	6	158719	158724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027786
3495	NC_006362	TCG	2	6	158767	158772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027786
3496	NC_006362	ACA	2	6	158825	158830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54027786
3497	NC_006362	CGA	2	6	158852	158857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027786
3498	NC_006362	TTC	2	6	158892	158897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54027786
3499	NC_006362	CGC	2	6	158927	158932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027786
3500	NC_006362	TCG	2	6	158949	158954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027787

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