MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nocardia farcinica IFM 10152 plasmid pNF1

Total Repeats: 4082

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006362	ATG	2	6	20002	20007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027669
502	NC_006362	TAC	2	6	20310	20315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027670
503	NC_006362	CGA	2	6	20327	20332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027670
504	NC_006362	AGG	2	6	20380	20385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027670
505	NC_006362	ATC	2	6	20454	20459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027670
506	NC_006362	GGT	2	6	20591	20596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027670
507	NC_006362	CTGCGG	2	12	20663	20674	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	54027670
508	NC_006362	ACG	2	6	20713	20718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027670
509	NC_006362	GC	3	6	20720	20725	0 %	0 %	50 %	50 %	54027670
510	NC_006362	TTC	2	6	20772	20777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54027670
511	NC_006362	GGCAC	2	10	20838	20847	20 %	0 %	40 %	40 %	54027670
512	NC_006362	CGA	2	6	20852	20857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027670
513	NC_006362	GCC	2	6	20867	20872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027670
514	NC_006362	CGC	2	6	20896	20901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027670
515	NC_006362	CGC	2	6	20921	20926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027670
516	NC_006362	TGT	2	6	20947	20952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54027670
517	NC_006362	TCA	2	6	21295	21300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027671
518	NC_006362	CCAT	2	8	21337	21344	25 %	25 %	0 %	50 %	54027671
519	NC_006362	GCA	2	6	21391	21396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027671
520	NC_006362	ACC	2	6	21438	21443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027671
521	NC_006362	CAT	2	6	21479	21484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027671
522	NC_006362	TTG	2	6	21489	21494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54027671
523	NC_006362	ATC	2	6	21567	21572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027671
524	NC_006362	GT	3	6	21613	21618	0 %	50 %	50 %	0 %	54027671
525	NC_006362	GACG	2	8	21703	21710	25 %	0 %	50 %	25 %	54027671
526	NC_006362	CGG	2	6	21712	21717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027671
527	NC_006362	GCG	2	6	21718	21723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027671
528	NC_006362	CCG	2	6	21732	21737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027671
529	NC_006362	CGG	2	6	21775	21780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027671
530	NC_006362	CGA	2	6	21814	21819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027671
531	NC_006362	CGT	2	6	21823	21828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027671
532	NC_006362	TGA	2	6	21844	21849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027671
533	NC_006362	GGT	2	6	21860	21865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027671
534	NC_006362	TGG	2	6	21909	21914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027671
535	NC_006362	GGC	2	6	21947	21952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027671
536	NC_006362	TGA	2	6	21955	21960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027671
537	NC_006362	GGGC	2	8	21984	21991	0 %	0 %	75 %	25 %	54027671
538	NC_006362	TC	3	6	22047	22052	0 %	50 %	0 %	50 %	54027671
539	NC_006362	GCC	2	6	22130	22135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027671
540	NC_006362	GCC	2	6	22145	22150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027671
541	NC_006362	GC	3	6	22176	22181	0 %	0 %	50 %	50 %	54027671
542	NC_006362	GTC	2	6	22232	22237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027671
543	NC_006362	CAC	2	6	22241	22246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027671
544	NC_006362	CGG	2	6	22276	22281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027671
545	NC_006362	GAT	2	6	22289	22294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027671
546	NC_006362	GTGG	2	8	22336	22343	0 %	25 %	75 %	0 %	54027671
547	NC_006362	AAG	2	6	22344	22349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54027671
548	NC_006362	GCC	2	6	22391	22396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027671
549	NC_006362	CGG	2	6	22406	22411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027671
550	NC_006362	GCA	2	6	22510	22515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027671
551	NC_006362	CGC	2	6	22585	22590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027671
552	NC_006362	GC	3	6	22614	22619	0 %	0 %	50 %	50 %	54027671
553	NC_006362	GCC	2	6	22647	22652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027671
554	NC_006362	CGC	2	6	22653	22658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027671
555	NC_006362	CG	3	6	22670	22675	0 %	0 %	50 %	50 %	54027671
556	NC_006362	CGA	2	6	22696	22701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027671
557	NC_006362	GCG	2	6	22743	22748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027671
558	NC_006362	TGG	2	6	24523	24528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027672
559	NC_006362	GC	3	6	24529	24534	0 %	0 %	50 %	50 %	54027672
560	NC_006362	AC	3	6	24571	24576	50 %	0 %	0 %	50 %	54027672
561	NC_006362	CGG	2	6	24650	24655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027672
562	NC_006362	ATC	2	6	24729	24734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027672
563	NC_006362	CCA	2	6	24739	24744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027672
564	NC_006362	GGT	2	6	24803	24808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027672
565	NC_006362	TCG	2	6	24832	24837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027672
566	NC_006362	CG	3	6	24836	24841	0 %	0 %	50 %	50 %	54027672
567	NC_006362	CGG	2	6	24896	24901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027672
568	NC_006362	GCA	2	6	24905	24910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027672
569	NC_006362	CCG	2	6	24914	24919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027672
570	NC_006362	GCT	2	6	24935	24940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027672
571	NC_006362	GTG	2	6	24959	24964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027672
572	NC_006362	TCGC	2	8	25008	25015	0 %	25 %	25 %	50 %	54027672
573	NC_006362	AGC	2	6	25030	25035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027672
574	NC_006362	CGG	2	6	25073	25078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027672
575	NC_006362	CG	3	6	25094	25099	0 %	0 %	50 %	50 %	54027672
576	NC_006362	TGC	2	6	25102	25107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027672
577	NC_006362	CCA	2	6	25156	25161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027672
578	NC_006362	ACG	2	6	25234	25239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027672
579	NC_006362	CGA	2	6	25244	25249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027672
580	NC_006362	CGG	2	6	25319	25324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027672
581	NC_006362	TCG	2	6	25348	25353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027672
582	NC_006362	CGG	2	6	25396	25401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027672
583	NC_006362	GAG	2	6	25458	25463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027672
584	NC_006362	CCG	2	6	25485	25490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027672
585	NC_006362	CCG	2	6	25516	25521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027672
586	NC_006362	GTG	2	6	25527	25532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027672
587	NC_006362	CAC	2	6	25550	25555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027672
588	NC_006362	CGT	2	6	25556	25561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027672
589	NC_006362	TGA	2	6	25650	25655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027673
590	NC_006362	GGC	2	6	25735	25740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027673
591	NC_006362	CAG	2	6	25781	25786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027673
592	NC_006362	CGG	2	6	25801	25806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027673
593	NC_006362	CGGCT	2	10	25820	25829	0 %	20 %	40 %	40 %	54027673
594	NC_006362	TCG	2	6	25842	25847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027673
595	NC_006362	CGG	2	6	25867	25872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027673
596	NC_006362	GCT	2	6	25879	25884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027673
597	NC_006362	CTG	2	6	25910	25915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027673
598	NC_006362	GCC	2	6	25979	25984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027673
599	NC_006362	TCT	2	6	26028	26033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54027673
600	NC_006362	CCG	2	6	26100	26105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027673
601	NC_006362	CGG	2	6	26112	26117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027673
602	NC_006362	GTT	2	6	26146	26151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54027673
603	NC_006362	CGG	2	6	26165	26170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027673
604	NC_006362	CCG	2	6	26181	26186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027673
605	NC_006362	CGA	2	6	26203	26208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027673
606	NC_006362	CCG	2	6	26230	26235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027673
607	NC_006362	GGCG	2	8	26323	26330	0 %	0 %	75 %	25 %	54027673
608	NC_006362	CAGGCG	2	12	26333	26344	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	54027673
609	NC_006362	TCG	3	9	26445	26453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027673
610	NC_006362	CTTC	2	8	26472	26479	0 %	50 %	0 %	50 %	54027673
611	NC_006362	GTC	2	6	26492	26497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027673
612	NC_006362	CCGGAT	2	12	26498	26509	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	54027673
613	NC_006362	CCCG	2	8	26521	26528	0 %	0 %	25 %	75 %	54027673
614	NC_006362	GCC	2	6	26531	26536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027673
615	NC_006362	CGG	2	6	26550	26555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027673
616	NC_006362	CGG	2	6	26577	26582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027673
617	NC_006362	CGT	2	6	26605	26610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027673
618	NC_006362	TCG	2	6	26631	26636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027673
619	NC_006362	CCAC	2	8	26637	26644	25 %	0 %	0 %	75 %	54027673
620	NC_006362	ACA	2	6	26655	26660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54027673
621	NC_006362	TGTCGG	2	12	26665	26676	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	54027673
622	NC_006362	GCC	2	6	26717	26722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027673
623	NC_006362	CGC	2	6	26725	26730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027673
624	NC_006362	GGCC	2	8	26752	26759	0 %	0 %	50 %	50 %	54027673
625	NC_006362	CGC	2	6	26779	26784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027673
626	NC_006362	CCGC	2	8	26806	26813	0 %	0 %	25 %	75 %	54027673
627	NC_006362	AC	3	6	26875	26880	50 %	0 %	0 %	50 %	54027673
628	NC_006362	GCCG	2	8	26893	26900	0 %	0 %	50 %	50 %	54027673
629	NC_006362	AGC	2	6	26901	26906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027673
630	NC_006362	CGA	2	6	26937	26942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027673
631	NC_006362	CGC	2	6	26950	26955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027673
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633	NC_006362	CGG	2	6	27126	27131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027674
634	NC_006362	GCT	2	6	27135	27140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027674
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663	NC_006362	CGG	2	6	29084	29089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027676
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748	NC_006362	ACC	2	6	31789	31794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027677
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752	NC_006362	CCA	2	6	31866	31871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027677
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999	NC_006362	CGGGC	2	10	46833	46842	0 %	0 %	60 %	40 %	54027687
1000	NC_006362	GTC	2	6	46859	46864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027687

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