MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Nocardia farcinica IFM 10152 chromosome

Total Repeats: 118894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006361	GAC	2	6	4	9	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021965
2	NC_006361	CAG	2	6	103	108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021965
3	NC_006361	GCT	2	6	156	161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021965
4	NC_006361	TCG	2	6	172	177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021965
5	NC_006361	AGG	2	6	185	190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54021965
6	NC_006361	CGC	2	6	276	281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021965
7	NC_006361	CCG	2	6	296	301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021965
8	NC_006361	GCC	2	6	307	312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021965
9	NC_006361	AGG	2	6	392	397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54021965
10	NC_006361	GCC	2	6	436	441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021965
11	NC_006361	GCC	2	6	502	507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021965
12	NC_006361	GAC	2	6	613	618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021965
13	NC_006361	CGA	2	6	623	628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021965
14	NC_006361	CCG	2	6	664	669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021965
15	NC_006361	CGG	2	6	684	689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021965
16	NC_006361	CGC	2	6	746	751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021965
17	NC_006361	CGG	2	6	827	832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021965
18	NC_006361	CGA	3	9	873	881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021965
19	NC_006361	CTC	2	6	957	962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54021965
20	NC_006361	CTG	2	6	1117	1122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021965
21	NC_006361	TCA	2	6	1205	1210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54021965
22	NC_006361	CGA	2	6	1221	1226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021965
23	NC_006361	CGC	2	6	1246	1251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021965
24	NC_006361	CTG	2	6	1270	1275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021965
25	NC_006361	CGA	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021965
26	NC_006361	AGG	2	6	1316	1321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54021965
27	NC_006361	TTC	2	6	1324	1329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54021965
28	NC_006361	CAA	2	6	1356	1361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54021965
29	NC_006361	TCC	2	6	1375	1380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54021965
30	NC_006361	GCC	2	6	1386	1391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021965
31	NC_006361	AGC	2	6	1394	1399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021965
32	NC_006361	GAG	2	6	1411	1416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54021965
33	NC_006361	GCC	2	6	1461	1466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021965
34	NC_006361	AAG	2	6	1498	1503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54021965
35	NC_006361	ACG	2	6	1532	1537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021965
36	NC_006361	GGT	2	6	1656	1661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54021965
37	NC_006361	CCG	2	6	1727	1732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021965
38	NC_006361	GCG	2	6	1926	1931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021965
39	NC_006361	GCC	2	6	2917	2922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021966
40	NC_006361	CGG	2	6	2935	2940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021966
41	NC_006361	TGC	2	6	2943	2948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021966
42	NC_006361	CGC	2	6	3016	3021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021966
43	NC_006361	GCC	2	6	3057	3062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021966
44	NC_006361	GGA	2	6	3178	3183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54021966
45	NC_006361	GCA	2	6	3208	3213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021966
46	NC_006361	GAC	2	6	3281	3286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021966
47	NC_006361	GGT	2	6	3334	3339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54021966
48	NC_006361	GGC	2	6	3343	3348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021966
49	NC_006361	GGC	2	6	3448	3453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021966
50	NC_006361	CTG	2	6	3521	3526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021966
51	NC_006361	CAC	3	9	3550	3558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54021966
52	NC_006361	GCT	2	6	3562	3567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021966
53	NC_006361	CTG	2	6	3722	3727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021966
54	NC_006361	CCG	2	6	3732	3737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021966
55	NC_006361	GAC	2	6	3743	3748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021966
56	NC_006361	TGG	2	6	3825	3830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54021966
57	NC_006361	CAC	2	6	3874	3879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54021966
58	NC_006361	CAG	2	6	3883	3888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021966
59	NC_006361	CTG	2	6	3899	3904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021966
60	NC_006361	GGA	3	9	3913	3921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54021966
61	NC_006361	CGC	2	6	3949	3954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021966
62	NC_006361	CGG	2	6	4226	4231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021967
63	NC_006361	GTT	2	6	4407	4412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54021967
64	NC_006361	GGA	2	6	4419	4424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54021967
65	NC_006361	GCG	2	6	4455	4460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021967
66	NC_006361	CGA	2	6	4470	4475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021967
67	NC_006361	TGC	2	6	4532	4537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021967
68	NC_006361	GCC	2	6	4568	4573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021967
69	NC_006361	CCG	2	6	4586	4591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021967
70	NC_006361	CGC	2	6	4635	4640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021967
71	NC_006361	TGG	2	6	4646	4651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54021967
72	NC_006361	GCC	2	6	4732	4737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021967
73	NC_006361	ACG	3	9	4799	4807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021967
74	NC_006361	GAG	2	6	4819	4824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54021967
75	NC_006361	ATC	2	6	4825	4830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54021967
76	NC_006361	CGA	2	6	4899	4904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021967
77	NC_006361	CCT	2	6	4991	4996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54021967
78	NC_006361	GCA	2	6	5009	5014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021967
79	NC_006361	TGC	3	9	5030	5038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021967
80	NC_006361	CGA	2	6	5040	5045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021967
81	NC_006361	GCC	2	6	5086	5091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021967
82	NC_006361	GGC	2	6	5094	5099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021967
83	NC_006361	CGG	2	6	5126	5131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021967
84	NC_006361	GGA	2	6	5136	5141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54021967
85	NC_006361	CCG	2	6	5727	5732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021968
86	NC_006361	CCG	2	6	5753	5758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021968
87	NC_006361	GGA	2	6	5765	5770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54021968
88	NC_006361	GCC	3	9	5778	5786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021968
89	NC_006361	GGT	2	6	5847	5852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54021968
90	NC_006361	GCT	2	6	5903	5908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021968
91	NC_006361	GGA	2	6	6002	6007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54021968
92	NC_006361	CGC	2	6	6011	6016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021968
93	NC_006361	CGC	2	6	6059	6064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021968
94	NC_006361	CTG	2	6	6096	6101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021968
95	NC_006361	GTG	2	6	6147	6152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54021968
96	NC_006361	CAG	2	6	6362	6367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021969
97	NC_006361	CGT	2	6	6422	6427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021969
98	NC_006361	CCG	2	6	6428	6433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021969
99	NC_006361	CGC	2	6	6473	6478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021969
100	NC_006361	GCC	2	6	6479	6484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021969
101	NC_006361	CTG	2	6	6489	6494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021969
102	NC_006361	CGC	2	6	6536	6541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021969
103	NC_006361	CGC	2	6	6617	6622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021969
104	NC_006361	GCC	2	6	6642	6647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021969
105	NC_006361	GTC	2	6	6672	6677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021969
106	NC_006361	GGT	2	6	6734	6739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54021969
107	NC_006361	GCG	2	6	6850	6855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021969
108	NC_006361	GCT	2	6	6929	6934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021969
109	NC_006361	CGC	2	6	6939	6944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021969
110	NC_006361	CTT	2	6	6962	6967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54021969
111	NC_006361	CGC	2	6	6995	7000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021969
112	NC_006361	CCG	2	6	7012	7017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021969
113	NC_006361	CAA	2	6	7025	7030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54021969
114	NC_006361	GGT	2	6	7142	7147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54021969
115	NC_006361	GAG	2	6	7152	7157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54021969
116	NC_006361	CGC	2	6	7213	7218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021969
117	NC_006361	CCG	2	6	7249	7254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021969
118	NC_006361	CGA	2	6	7620	7625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021970
119	NC_006361	CCT	2	6	7635	7640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54021970
120	NC_006361	CAC	2	6	7721	7726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54021970
121	NC_006361	GTC	2	6	7739	7744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021970
122	NC_006361	CGA	2	6	7756	7761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021970
123	NC_006361	CCT	2	6	7798	7803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54021970
124	NC_006361	CGG	2	6	7810	7815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021970
125	NC_006361	GTC	2	6	7823	7828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021970
126	NC_006361	GAC	2	6	7829	7834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021970
127	NC_006361	GTC	2	6	7886	7891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021970
128	NC_006361	GGC	2	6	7910	7915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021970
129	NC_006361	CGG	2	6	7945	7950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021970
130	NC_006361	GTG	2	6	7973	7978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54021970
131	NC_006361	AGG	2	6	8046	8051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54021970
132	NC_006361	CAC	2	6	8098	8103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54021970
133	NC_006361	ACC	3	9	8138	8146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54021970
134	NC_006361	CGG	2	6	8168	8173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021970
135	NC_006361	CGA	2	6	8251	8256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021970
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137	NC_006361	CGG	2	6	8353	8358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021970
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141	NC_006361	GGT	2	6	8569	8574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54021970
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385	NC_006361	CGA	2	6	20390	20395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021983
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393	NC_006361	GAC	2	6	20704	20709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021985
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497	NC_006361	CGG	2	6	25742	25747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021994
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499	NC_006361	CCG	2	6	26265	26270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021996
500	NC_006361	CCG	2	6	26277	26282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021996

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