MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nocardia farcinica IFM 10152 chromosome

Total Repeats: 161482

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_006361	TGC	2	6	131766	131771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022106
3502	NC_006361	CCG	2	6	131809	131814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022106
3503	NC_006361	ACG	2	6	131856	131861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022106
3504	NC_006361	GGTG	2	8	131887	131894	0 %	25 %	75 %	0 %	54022106
3505	NC_006361	CGG	2	6	131901	131906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022106
3506	NC_006361	GTG	2	6	131933	131938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022106
3507	NC_006361	GCT	2	6	131956	131961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022106
3508	NC_006361	GGT	2	6	131979	131984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022106
3509	NC_006361	TGG	2	6	132006	132011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022106
3510	NC_006361	TGT	2	6	132024	132029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54022106
3511	NC_006361	TCG	2	6	132030	132035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022106
3512	NC_006361	TCG	2	6	132045	132050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022106
3513	NC_006361	GCC	2	6	132066	132071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022106
3514	NC_006361	TCG	2	6	132150	132155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022106
3515	NC_006361	GGCCC	2	10	132185	132194	0 %	0 %	40 %	60 %	54022106
3516	NC_006361	GTC	2	6	132233	132238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022106
3517	NC_006361	CGC	2	6	132259	132264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022106
3518	NC_006361	CGC	2	6	132268	132273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022106
3519	NC_006361	GC	3	6	132312	132317	0 %	0 %	50 %	50 %	54022106
3520	NC_006361	CGT	2	6	132345	132350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022106
3521	NC_006361	CGC	2	6	132364	132369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022106
3522	NC_006361	GCC	2	6	132377	132382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022106
3523	NC_006361	GGCTGG	2	12	132463	132474	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	54022107
3524	NC_006361	GC	3	6	132526	132531	0 %	0 %	50 %	50 %	54022107
3525	NC_006361	ACG	2	6	132547	132552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022107
3526	NC_006361	CGC	3	9	132557	132565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022107
3527	NC_006361	TGG	2	6	132589	132594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022107
3528	NC_006361	GGC	3	9	132599	132607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022107
3529	NC_006361	GGC	2	6	132641	132646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022107
3530	NC_006361	GCG	2	6	132650	132655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022107
3531	NC_006361	TGGC	2	8	132680	132687	0 %	25 %	50 %	25 %	54022107
3532	NC_006361	GCT	2	6	132689	132694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022107
3533	NC_006361	CGG	2	6	132695	132700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022107
3534	NC_006361	GTT	2	6	132701	132706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54022107
3535	NC_006361	TTC	2	6	132714	132719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54022107
3536	NC_006361	GGC	2	6	132743	132748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022107
3537	NC_006361	AGC	2	6	132798	132803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022107
3538	NC_006361	GCGG	2	8	132835	132842	0 %	0 %	75 %	25 %	54022107
3539	NC_006361	GGT	2	6	132893	132898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022107
3540	NC_006361	GCCC	2	8	132992	132999	0 %	0 %	25 %	75 %	54022107
3541	NC_006361	GCA	2	6	133022	133027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022107
3542	NC_006361	ACGG	2	8	133036	133043	25 %	0 %	50 %	25 %	54022107
3543	NC_006361	CGG	2	6	133055	133060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022107
3544	NC_006361	CGG	2	6	133069	133074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022107
3545	NC_006361	GTG	3	9	133125	133133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022107
3546	NC_006361	TGC	3	9	133246	133254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022107
3547	NC_006361	CCG	2	6	133315	133320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022107
3548	NC_006361	TC	3	6	133328	133333	0 %	50 %	0 %	50 %	54022107
3549	NC_006361	GCT	2	6	133343	133348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022107
3550	NC_006361	TCG	2	6	133366	133371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022107
3551	NC_006361	GCT	3	9	133533	133541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022108
3552	NC_006361	GGT	2	6	133620	133625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022108
3553	NC_006361	TTC	2	6	133627	133632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54022108
3554	NC_006361	TGGG	2	8	133708	133715	0 %	25 %	75 %	0 %	54022108
3555	NC_006361	GAT	2	6	133797	133802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54022108
3556	NC_006361	CGG	2	6	133806	133811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022108
3557	NC_006361	TGG	2	6	133829	133834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022108
3558	NC_006361	GC	3	6	133849	133854	0 %	0 %	50 %	50 %	54022109
3559	NC_006361	AGC	2	6	133856	133861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022109
3560	NC_006361	CGA	2	6	133890	133895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022109
3561	NC_006361	CGG	2	6	133917	133922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022109
3562	NC_006361	CAGCG	2	10	134015	134024	20 %	0 %	40 %	40 %	54022109
3563	NC_006361	CGG	2	6	134034	134039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022109
3564	NC_006361	CGAGC	2	10	134044	134053	20 %	0 %	40 %	40 %	54022109
3565	NC_006361	CGG	2	6	134115	134120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022109
3566	NC_006361	CGC	2	6	134134	134139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022109
3567	NC_006361	GCG	3	9	134159	134167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022109
3568	NC_006361	GC	3	6	134178	134183	0 %	0 %	50 %	50 %	54022109
3569	NC_006361	CG	3	6	134186	134191	0 %	0 %	50 %	50 %	54022109
3570	NC_006361	CGC	2	6	134220	134225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022109
3571	NC_006361	GC	3	6	134247	134252	0 %	0 %	50 %	50 %	54022109
3572	NC_006361	GCC	2	6	134261	134266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022109
3573	NC_006361	ACG	2	6	134267	134272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022109
3574	NC_006361	ACC	2	6	134333	134338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54022109
3575	NC_006361	GC	3	6	134388	134393	0 %	0 %	50 %	50 %	54022109
3576	NC_006361	CGG	2	6	134439	134444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022109
3577	NC_006361	TGA	2	6	134532	134537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54022110
3578	NC_006361	GCT	2	6	134566	134571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022110
3579	NC_006361	CGT	2	6	134575	134580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022110
3580	NC_006361	GCC	4	12	134603	134614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022110
3581	NC_006361	AGC	2	6	134661	134666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022110
3582	NC_006361	CGGG	2	8	134671	134678	0 %	0 %	75 %	25 %	54022110
3583	NC_006361	TGC	2	6	134685	134690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022110
3584	NC_006361	GTCC	2	8	134702	134709	0 %	25 %	25 %	50 %	54022110
3585	NC_006361	CGC	2	6	134791	134796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022110
3586	NC_006361	CA	3	6	134925	134930	50 %	0 %	0 %	50 %	54022110
3587	NC_006361	TGC	3	9	134937	134945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022110
3588	NC_006361	GGC	2	6	134962	134967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022110
3589	NC_006361	CCGC	3	12	135003	135014	0 %	0 %	25 %	75 %	54022110
3590	NC_006361	GCG	2	6	135020	135025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022110
3591	NC_006361	CCG	2	6	135121	135126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022110
3592	NC_006361	CGA	2	6	135127	135132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022110
3593	NC_006361	CGGGC	2	10	135165	135174	0 %	0 %	60 %	40 %	54022110
3594	NC_006361	CCA	2	6	135193	135198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54022110
3595	NC_006361	GGC	2	6	135271	135276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022110
3596	NC_006361	GCT	2	6	135280	135285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022110
3597	NC_006361	CAC	2	6	135301	135306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54022110
3598	NC_006361	CGCGCT	2	12	135370	135381	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	54022110
3599	NC_006361	CCG	3	9	135402	135410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022110
3600	NC_006361	GTG	2	6	135544	135549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022111
3601	NC_006361	GCG	2	6	135597	135602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022111
3602	NC_006361	TCG	2	6	135640	135645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022111
3603	NC_006361	TCG	2	6	135685	135690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022111
3604	NC_006361	GAA	2	6	135702	135707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54022111
3605	NC_006361	GCC	2	6	135729	135734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022111
3606	NC_006361	GCA	2	6	135800	135805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022111
3607	NC_006361	GTAGCG	2	12	135840	135851	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	54022111
3608	NC_006361	GCCCTC	2	12	135852	135863	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	54022111
3609	NC_006361	GC	4	8	135869	135876	0 %	0 %	50 %	50 %	54022111
3610	NC_006361	ACC	2	6	135877	135882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54022111
3611	NC_006361	CAC	2	6	135900	135905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54022111
3612	NC_006361	GGC	2	6	136089	136094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022111
3613	NC_006361	ATC	2	6	136177	136182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54022111
3614	NC_006361	TCG	2	6	136255	136260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022111
3615	NC_006361	GTC	2	6	136266	136271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022111
3616	NC_006361	CGG	2	6	136305	136310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022111
3617	NC_006361	CCG	2	6	136313	136318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022111
3618	NC_006361	CAC	2	6	136323	136328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54022111
3619	NC_006361	GC	3	6	136359	136364	0 %	0 %	50 %	50 %	54022111
3620	NC_006361	GCA	2	6	136463	136468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022111
3621	NC_006361	GCA	2	6	136499	136504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022111
3622	NC_006361	CCGG	2	8	136517	136524	0 %	0 %	50 %	50 %	54022111
3623	NC_006361	CGT	2	6	136526	136531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022111
3624	NC_006361	GGT	2	6	136545	136550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022111
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3661	NC_006361	GCGG	2	8	137977	137984	0 %	0 %	75 %	25 %	54022112
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3728	NC_006361	CG	3	6	140363	140368	0 %	0 %	50 %	50 %	54022115
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3743	NC_006361	CGG	2	6	140970	140975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022115
3744	NC_006361	G	6	6	140974	140979	0 %	0 %	100 %	0 %	54022115
3745	NC_006361	GCG	2	6	141003	141008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022115
3746	NC_006361	GCGG	2	8	141038	141045	0 %	0 %	75 %	25 %	54022115
3747	NC_006361	TCC	3	9	141053	141061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54022115
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3750	NC_006361	TGGC	2	8	141146	141153	0 %	25 %	50 %	25 %	54022115
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3754	NC_006361	CGA	2	6	141258	141263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022115
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3777	NC_006361	GC	4	8	142275	142282	0 %	0 %	50 %	50 %	54022116
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3988	NC_006361	AGC	2	6	149851	149856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022124
3989	NC_006361	GC	4	8	149855	149862	0 %	0 %	50 %	50 %	54022124
3990	NC_006361	CGC	2	6	149865	149870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022124
3991	NC_006361	GCCC	2	8	149871	149878	0 %	0 %	25 %	75 %	54022124
3992	NC_006361	GGT	2	6	149922	149927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022124
3993	NC_006361	CGG	2	6	149936	149941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022124
3994	NC_006361	GGGT	2	8	149995	150002	0 %	25 %	75 %	0 %	54022124
3995	NC_006361	CCG	2	6	150017	150022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022124
3996	NC_006361	CCAGC	2	10	150048	150057	20 %	0 %	20 %	60 %	54022124
3997	NC_006361	TCG	2	6	150092	150097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022124
3998	NC_006361	GC	3	6	150143	150148	0 %	0 %	50 %	50 %	54022124
3999	NC_006361	CAC	3	9	150153	150161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54022124
4000	NC_006361	CCATCG	2	12	150218	150229	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	54022124

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