MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nocardia farcinica IFM 10152 chromosome

Total Repeats: 161482

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_006361	CCG	2	6	599936	599941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022547
16002	NC_006361	GAT	2	6	599994	599999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54022547
16003	NC_006361	GC	3	6	600021	600026	0 %	0 %	50 %	50 %	54022547
16004	NC_006361	CG	3	6	600094	600099	0 %	0 %	50 %	50 %	54022547
16005	NC_006361	GAA	2	6	600150	600155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54022547
16006	NC_006361	CGCGC	2	10	600171	600180	0 %	0 %	40 %	60 %	54022547
16007	NC_006361	CTG	2	6	600187	600192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022547
16008	NC_006361	GCC	3	9	601349	601357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022548
16009	NC_006361	GCC	2	6	601371	601376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022548
16010	NC_006361	GCGT	2	8	601383	601390	0 %	25 %	50 %	25 %	54022548
16011	NC_006361	GTC	2	6	601392	601397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022548
16012	NC_006361	CGC	2	6	601453	601458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022548
16013	NC_006361	CGT	2	6	601459	601464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022548
16014	NC_006361	GC	3	6	601603	601608	0 %	0 %	50 %	50 %	54022548
16015	NC_006361	GAT	2	6	601700	601705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54022548
16016	NC_006361	CTG	2	6	601781	601786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022548
16017	NC_006361	TCG	2	6	601800	601805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022548
16018	NC_006361	GCCC	2	8	601894	601901	0 %	0 %	25 %	75 %	54022548
16019	NC_006361	CGC	3	9	601907	601915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022548
16020	NC_006361	GC	4	8	601914	601921	0 %	0 %	50 %	50 %	54022548
16021	NC_006361	CTC	2	6	601925	601930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54022548
16022	NC_006361	CGGG	2	8	601942	601949	0 %	0 %	75 %	25 %	54022548
16023	NC_006361	TCG	2	6	601965	601970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022548
16024	NC_006361	CG	3	6	601980	601985	0 %	0 %	50 %	50 %	54022548
16025	NC_006361	AGC	2	6	601986	601991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022548
16026	NC_006361	GTC	2	6	602057	602062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022548
16027	NC_006361	GCA	2	6	602083	602088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022548
16028	NC_006361	TTG	2	6	602109	602114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54022548
16029	NC_006361	CGA	2	6	602155	602160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022548
16030	NC_006361	CAC	2	6	602228	602233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54022548
16031	NC_006361	CCT	2	6	602262	602267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54022549
16032	NC_006361	GTC	2	6	602275	602280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022549
16033	NC_006361	GGCC	2	8	602297	602304	0 %	0 %	50 %	50 %	54022549
16034	NC_006361	TGC	2	6	602472	602477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022549
16035	NC_006361	CCGC	2	8	602478	602485	0 %	0 %	25 %	75 %	54022549
16036	NC_006361	GC	3	6	602586	602591	0 %	0 %	50 %	50 %	54022549
16037	NC_006361	ACC	2	6	602619	602624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54022549
16038	NC_006361	CG	3	6	602726	602731	0 %	0 %	50 %	50 %	54022549
16039	NC_006361	TCC	2	6	602732	602737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54022549
16040	NC_006361	CGC	2	6	602766	602771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022549
16041	NC_006361	CAC	2	6	602899	602904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54022549
16042	NC_006361	GTC	2	6	603048	603053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022550
16043	NC_006361	GGT	2	6	603096	603101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022550
16044	NC_006361	CG	3	6	603123	603128	0 %	0 %	50 %	50 %	54022550
16045	NC_006361	CCAGCG	2	12	603134	603145	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	54022550
16046	NC_006361	GGC	2	6	603185	603190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022550
16047	NC_006361	TCG	2	6	603238	603243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022550
16048	NC_006361	GCA	3	9	603260	603268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022550
16049	NC_006361	GGC	2	6	603280	603285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022550
16050	NC_006361	AGC	2	6	603329	603334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022550
16051	NC_006361	GGCCG	2	10	603363	603372	0 %	0 %	60 %	40 %	54022550
16052	NC_006361	TCG	2	6	603406	603411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022550
16053	NC_006361	GTC	2	6	603502	603507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022550
16054	NC_006361	CG	3	6	603527	603532	0 %	0 %	50 %	50 %	54022550
16055	NC_006361	GAC	2	6	603534	603539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022550
16056	NC_006361	GCC	2	6	603585	603590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022550
16057	NC_006361	GCG	2	6	603599	603604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022550
16058	NC_006361	CGG	2	6	603704	603709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022550
16059	NC_006361	AGA	2	6	603725	603730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54022550
16060	NC_006361	CAG	2	6	603750	603755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022550
16061	NC_006361	AGGTCG	2	12	603841	603852	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	54022550
16062	NC_006361	CCG	2	6	603860	603865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022550
16063	NC_006361	CCG	2	6	603867	603872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022550
16064	NC_006361	GCTG	2	8	603893	603900	0 %	25 %	50 %	25 %	54022550
16065	NC_006361	CAGC	2	8	603912	603919	25 %	0 %	25 %	50 %	54022550
16066	NC_006361	CGC	2	6	603929	603934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022550
16067	NC_006361	GCA	2	6	603944	603949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022550
16068	NC_006361	GC	3	6	603994	603999	0 %	0 %	50 %	50 %	54022550
16069	NC_006361	GAG	2	6	604083	604088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54022550
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16072	NC_006361	CGA	2	6	604353	604358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022551
16073	NC_006361	TGC	2	6	604367	604372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022551
16074	NC_006361	GTGACG	2	12	604406	604417	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	54022551
16075	NC_006361	AGCG	2	8	604537	604544	25 %	0 %	50 %	25 %	54022551
16076	NC_006361	ATG	2	6	604552	604557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54022551
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16079	NC_006361	TGG	2	6	604661	604666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022551
16080	NC_006361	GC	4	8	604693	604700	0 %	0 %	50 %	50 %	54022551
16081	NC_006361	GGT	2	6	604713	604718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022551
16082	NC_006361	TCGA	2	8	604738	604745	25 %	25 %	25 %	25 %	54022551
16083	NC_006361	CGA	2	6	604799	604804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022551
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16085	NC_006361	CGA	2	6	604842	604847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022551
16086	NC_006361	GTG	2	6	604900	604905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022551
16087	NC_006361	CGCC	2	8	604934	604941	0 %	0 %	25 %	75 %	54022551
16088	NC_006361	TGC	2	6	604952	604957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022551
16089	NC_006361	GC	4	8	604971	604978	0 %	0 %	50 %	50 %	54022551
16090	NC_006361	CGAAG	2	10	604986	604995	40 %	0 %	40 %	20 %	54022551
16091	NC_006361	CCG	2	6	605033	605038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022551
16092	NC_006361	GAG	2	6	605140	605145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54022551
16093	NC_006361	ATC	2	6	605146	605151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54022551
16094	NC_006361	TCG	2	6	605156	605161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022551
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16097	NC_006361	AACG	2	8	605528	605535	50 %	0 %	25 %	25 %	54022552
16098	NC_006361	TTC	2	6	605555	605560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54022552
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16100	NC_006361	TTC	2	6	605705	605710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54022552
16101	NC_006361	CTGG	2	8	605785	605792	0 %	25 %	50 %	25 %	54022552
16102	NC_006361	TCG	2	6	605826	605831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022552
16103	NC_006361	GCA	2	6	605848	605853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022552
16104	NC_006361	CAA	2	6	605923	605928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54022552
16105	NC_006361	GGC	2	6	605938	605943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022552
16106	NC_006361	TTCC	2	8	605965	605972	0 %	50 %	0 %	50 %	54022552
16107	NC_006361	TGG	2	6	606008	606013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022552
16108	NC_006361	CG	3	6	606025	606030	0 %	0 %	50 %	50 %	54022552
16109	NC_006361	GCG	2	6	606046	606051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022552
16110	NC_006361	GC	3	6	606059	606064	0 %	0 %	50 %	50 %	54022552
16111	NC_006361	GGC	2	6	606072	606077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022552
16112	NC_006361	CCG	2	6	606078	606083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022552
16113	NC_006361	CG	3	6	606086	606091	0 %	0 %	50 %	50 %	54022552
16114	NC_006361	GTG	2	6	606125	606130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022552
16115	NC_006361	AGC	3	9	606165	606173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022552
16116	NC_006361	CGG	2	6	606189	606194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022552
16117	NC_006361	GACC	2	8	606214	606221	25 %	0 %	25 %	50 %	54022552
16118	NC_006361	GCAC	2	8	606246	606253	25 %	0 %	25 %	50 %	54022552
16119	NC_006361	AAC	2	6	606254	606259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54022552
16120	NC_006361	CACC	2	8	606271	606278	25 %	0 %	0 %	75 %	54022552
16121	NC_006361	TGC	2	6	606297	606302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022552
16122	NC_006361	GCA	2	6	606358	606363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022552
16123	NC_006361	CG	3	6	606431	606436	0 %	0 %	50 %	50 %	54022552
16124	NC_006361	TGC	2	6	606462	606467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022552
16125	NC_006361	GCGG	2	8	606498	606505	0 %	0 %	75 %	25 %	54022552
16126	NC_006361	CTG	2	6	606539	606544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022552
16127	NC_006361	GCAG	2	8	606600	606607	25 %	0 %	50 %	25 %	54022552
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16134	NC_006361	CGA	2	6	606820	606825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022552
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16162	NC_006361	GC	3	6	607994	607999	0 %	0 %	50 %	50 %	54022554
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16242	NC_006361	GCC	2	6	610393	610398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022555
16243	NC_006361	CGG	2	6	610403	610408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022555
16244	NC_006361	GC	3	6	610419	610424	0 %	0 %	50 %	50 %	54022555
16245	NC_006361	CGC	2	6	610470	610475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022555
16246	NC_006361	GC	3	6	610519	610524	0 %	0 %	50 %	50 %	54022555
16247	NC_006361	GTC	2	6	610532	610537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022555
16248	NC_006361	CGC	2	6	610545	610550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022555
16249	NC_006361	GGA	2	6	610551	610556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54022555
16250	NC_006361	GCC	3	9	610561	610569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022555
16251	NC_006361	GCC	2	6	610588	610593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022555
16252	NC_006361	CGC	2	6	610595	610600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022555
16253	NC_006361	GCT	2	6	610629	610634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022555
16254	NC_006361	CGT	2	6	610641	610646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022555
16255	NC_006361	CGG	3	9	610659	610667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022555
16256	NC_006361	CGG	2	6	610674	610679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022555
16257	NC_006361	TGC	3	9	610709	610717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022555
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16261	NC_006361	GCC	2	6	610871	610876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022555
16262	NC_006361	CGT	2	6	610884	610889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022555
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16264	NC_006361	GCT	2	6	610917	610922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022555
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16268	NC_006361	GC	3	6	611058	611063	0 %	0 %	50 %	50 %	54022555
16269	NC_006361	TCGG	2	8	611071	611078	0 %	25 %	50 %	25 %	54022555
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16272	NC_006361	CGC	3	9	611161	611169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022555
16273	NC_006361	CG	3	6	611182	611187	0 %	0 %	50 %	50 %	54022555
16274	NC_006361	TGC	3	9	611207	611215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022555
16275	NC_006361	CGA	2	6	611217	611222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022555
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16277	NC_006361	CTG	2	6	611260	611265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022555
16278	NC_006361	CG	3	6	611266	611271	0 %	0 %	50 %	50 %	54022555
16279	NC_006361	GTG	2	6	611311	611316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022555
16280	NC_006361	CACC	2	8	611325	611332	25 %	0 %	0 %	75 %	54022555
16281	NC_006361	ACC	2	6	611345	611350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54022555
16282	NC_006361	CGT	3	9	611358	611366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022555
16283	NC_006361	C	6	6	611429	611434	0 %	0 %	0 %	100 %	54022555
16284	NC_006361	CCT	2	6	611453	611458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54022555
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16291	NC_006361	GTC	2	6	612103	612108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022557
16292	NC_006361	GGCG	2	8	612155	612162	0 %	0 %	75 %	25 %	54022558
16293	NC_006361	CGA	2	6	612191	612196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022558
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16313	NC_006361	GCA	2	6	612677	612682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022558
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16343	NC_006361	CTT	2	6	613837	613842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54022561
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16347	NC_006361	GTAGGC	2	12	613897	613908	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	54022561
16348	NC_006361	GTT	3	9	613918	613926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54022561
16349	NC_006361	GCC	2	6	613927	613932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022561
16350	NC_006361	TCG	3	9	613946	613954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022561
16351	NC_006361	CG	3	6	613965	613970	0 %	0 %	50 %	50 %	54022561
16352	NC_006361	CTG	3	9	613990	613998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022561
16353	NC_006361	TTC	2	6	614036	614041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54022561
16354	NC_006361	TCG	2	6	614096	614101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022561
16355	NC_006361	CGA	2	6	614106	614111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022561
16356	NC_006361	GAGC	2	8	614171	614178	25 %	0 %	50 %	25 %	54022561
16357	NC_006361	CGG	2	6	614231	614236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022562
16358	NC_006361	CGC	2	6	614304	614309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022562
16359	NC_006361	CGA	2	6	614339	614344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022562
16360	NC_006361	CAG	2	6	614367	614372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022562
16361	NC_006361	GCG	2	6	614417	614422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022562
16362	NC_006361	GCG	2	6	614470	614475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022562
16363	NC_006361	AGACC	2	10	614477	614486	40 %	0 %	20 %	40 %	54022562
16364	NC_006361	CGGCC	2	10	614502	614511	0 %	0 %	40 %	60 %	54022562
16365	NC_006361	GC	3	6	614513	614518	0 %	0 %	50 %	50 %	54022562
16366	NC_006361	CGG	2	6	614555	614560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022562
16367	NC_006361	CGG	3	9	614576	614584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022562
16368	NC_006361	ACCAGC	2	12	614593	614604	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	54022562
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16370	NC_006361	CGA	2	6	614624	614629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022562
16371	NC_006361	CGG	2	6	614675	614680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022562
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16374	NC_006361	GTC	2	6	615075	615080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022563
16375	NC_006361	GTCGAT	2	12	615125	615136	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	54022563
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16434	NC_006361	GAC	2	6	617097	617102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022565
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16479	NC_006361	GCG	2	6	618686	618691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022567
16480	NC_006361	ACA	2	6	618740	618745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54022567
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16482	NC_006361	CGC	2	6	618864	618869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022567
16483	NC_006361	CGA	2	6	618894	618899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022567
16484	NC_006361	ACC	2	6	618907	618912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54022567
16485	NC_006361	GCG	2	6	618947	618952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022567
16486	NC_006361	GCG	2	6	618965	618970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022567
16487	NC_006361	CGG	2	6	618984	618989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022567
16488	NC_006361	GGCCG	2	10	619119	619128	0 %	0 %	60 %	40 %	54022567
16489	NC_006361	ATG	2	6	619261	619266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54022567
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16491	NC_006361	CGG	2	6	619340	619345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022567
16492	NC_006361	GGA	2	6	619368	619373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54022567
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16495	NC_006361	GC	3	6	619588	619593	0 %	0 %	50 %	50 %	54022568
16496	NC_006361	CCG	3	9	619620	619628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022568
16497	NC_006361	TCG	2	6	619638	619643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022568
16498	NC_006361	CTG	2	6	619670	619675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022568
16499	NC_006361	CG	3	6	619679	619684	0 %	0 %	50 %	50 %	54022568
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