MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nocardia farcinica IFM 10152 chromosome

Total Repeats: 161482

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_006361	GGC	2	6	39663	39668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022015
1002	NC_006361	CAT	2	6	39689	39694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54022015
1003	NC_006361	GCG	3	9	39700	39708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022015
1004	NC_006361	ACG	2	6	39729	39734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022015
1005	NC_006361	AGC	2	6	39756	39761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022015
1006	NC_006361	GGTC	2	8	39779	39786	0 %	25 %	50 %	25 %	54022015
1007	NC_006361	GC	3	6	39790	39795	0 %	0 %	50 %	50 %	54022015
1008	NC_006361	CGG	2	6	39836	39841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022015
1009	NC_006361	GGT	2	6	39891	39896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022015
1010	NC_006361	CGG	3	9	39902	39910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022015
1011	NC_006361	CGG	2	6	39920	39925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022015
1012	NC_006361	CGGTGG	2	12	39947	39958	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	54022015
1013	NC_006361	GGC	2	6	39966	39971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022015
1014	NC_006361	CGG	2	6	39997	40002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022015
1015	NC_006361	GTGG	2	8	40010	40017	0 %	25 %	75 %	0 %	54022015
1016	NC_006361	CAG	3	9	40043	40051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022015
1017	NC_006361	CAC	2	6	40064	40069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54022015
1018	NC_006361	CGT	2	6	40078	40083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022015
1019	NC_006361	CGG	2	6	40091	40096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022015
1020	NC_006361	GCCG	2	8	40160	40167	0 %	0 %	50 %	50 %	54022015
1021	NC_006361	GGC	2	6	40172	40177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022015
1022	NC_006361	CTG	2	6	40203	40208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022015
1023	NC_006361	GTG	2	6	40235	40240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022015
1024	NC_006361	GGC	2	6	40244	40249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022015
1025	NC_006361	GGC	3	9	40262	40270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022015
1026	NC_006361	GCAG	2	8	40279	40286	25 %	0 %	50 %	25 %	54022015
1027	NC_006361	GGC	2	6	40298	40303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022015
1028	NC_006361	GC	3	6	40318	40323	0 %	0 %	50 %	50 %	54022015
1029	NC_006361	CTT	2	6	40328	40333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54022015
1030	NC_006361	CAA	2	6	40337	40342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54022015
1031	NC_006361	G	6	6	40394	40399	0 %	0 %	100 %	0 %	54022015
1032	NC_006361	ACA	2	6	40417	40422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54022015
1033	NC_006361	GGC	2	6	40445	40450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022015
1034	NC_006361	GCG	2	6	40472	40477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022015
1035	NC_006361	CGG	3	9	40499	40507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022015
1036	NC_006361	CGG	2	6	40511	40516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022015
1037	NC_006361	CCA	2	6	40557	40562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54022016
1038	NC_006361	GTC	2	6	40565	40570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022016
1039	NC_006361	CGGGCG	2	12	40611	40622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022016
1040	NC_006361	AAG	2	6	40739	40744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54022016
1041	NC_006361	CGG	2	6	40768	40773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022016
1042	NC_006361	TGGC	2	8	40811	40818	0 %	25 %	50 %	25 %	54022016
1043	NC_006361	CAG	2	6	40904	40909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022016
1044	NC_006361	CGC	2	6	40921	40926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022016
1045	NC_006361	CGA	2	6	40935	40940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022016
1046	NC_006361	TCG	2	6	40989	40994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022016
1047	NC_006361	CGA	2	6	41020	41025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022016
1048	NC_006361	GAA	2	6	41038	41043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54022016
1049	NC_006361	GTG	2	6	41066	41071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022016
1050	NC_006361	CGG	3	9	41152	41160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022016
1051	NC_006361	GAG	2	6	41162	41167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54022016
1052	NC_006361	CGC	2	6	41184	41189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022016
1053	NC_006361	GGCG	2	8	41197	41204	0 %	0 %	75 %	25 %	54022016
1054	NC_006361	ACCC	2	8	41222	41229	25 %	0 %	0 %	75 %	54022016
1055	NC_006361	CG	3	6	41242	41247	0 %	0 %	50 %	50 %	54022016
1056	NC_006361	GGT	2	6	41307	41312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022016
1057	NC_006361	GTC	2	6	41332	41337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022016
1058	NC_006361	GGC	2	6	41366	41371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022016
1059	NC_006361	TCG	2	6	41411	41416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022016
1060	NC_006361	GC	3	6	41449	41454	0 %	0 %	50 %	50 %	54022017
1061	NC_006361	GGAT	2	8	41456	41463	25 %	25 %	50 %	0 %	54022017
1062	NC_006361	CGC	2	6	41491	41496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022017
1063	NC_006361	CCTG	2	8	41504	41511	0 %	25 %	25 %	50 %	54022017
1064	NC_006361	GAG	2	6	41548	41553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54022017
1065	NC_006361	TCG	2	6	41563	41568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022017
1066	NC_006361	GCGG	2	8	41596	41603	0 %	0 %	75 %	25 %	54022017
1067	NC_006361	CTT	2	6	41649	41654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54022017
1068	NC_006361	CGA	2	6	41670	41675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022017
1069	NC_006361	CG	3	6	41734	41739	0 %	0 %	50 %	50 %	54022017
1070	NC_006361	GCT	2	6	41742	41747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022017
1071	NC_006361	CGA	2	6	41751	41756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022017
1072	NC_006361	AGC	2	6	41798	41803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022017
1073	NC_006361	ATCGGC	2	12	41872	41883	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	54022017
1074	NC_006361	CTA	2	6	41907	41912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54022017
1075	NC_006361	GCA	2	6	41931	41936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022017
1076	NC_006361	CACGA	2	10	42031	42040	40 %	0 %	20 %	40 %	54022017
1077	NC_006361	GGCG	2	8	42047	42054	0 %	0 %	75 %	25 %	54022017
1078	NC_006361	CG	3	6	42060	42065	0 %	0 %	50 %	50 %	54022017
1079	NC_006361	CGC	2	6	42096	42101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022017
1080	NC_006361	GCG	2	6	42110	42115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022017
1081	NC_006361	TTC	2	6	42133	42138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54022017
1082	NC_006361	AGC	2	6	42155	42160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022017
1083	NC_006361	TAC	2	6	42172	42177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54022017
1084	NC_006361	GTG	2	6	42196	42201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022017
1085	NC_006361	GCT	2	6	42246	42251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022017
1086	NC_006361	GAG	2	6	42274	42279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54022017
1087	NC_006361	CGA	2	6	42285	42290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022017
1088	NC_006361	CAC	2	6	42291	42296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54022017
1089	NC_006361	CGC	2	6	42318	42323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022017
1090	NC_006361	GTC	2	6	42469	42474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022017
1091	NC_006361	GGC	2	6	42475	42480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022017
1092	NC_006361	GCG	2	6	42502	42507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022017
1093	NC_006361	AGC	2	6	42524	42529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022017
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1095	NC_006361	CGA	2	6	42594	42599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022017
1096	NC_006361	CGC	2	6	42643	42648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022017
1097	NC_006361	GGCC	2	8	42720	42727	0 %	0 %	50 %	50 %	54022017
1098	NC_006361	CGG	2	6	42729	42734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022017
1099	NC_006361	AAG	2	6	42763	42768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54022017
1100	NC_006361	CCA	2	6	42822	42827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54022017
1101	NC_006361	CTG	2	6	42853	42858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022017
1102	NC_006361	CGA	2	6	42891	42896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022017
1103	NC_006361	CAC	2	6	42900	42905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54022017
1104	NC_006361	CGC	2	6	42906	42911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022017
1105	NC_006361	CGA	2	6	42942	42947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022017
1106	NC_006361	GGA	2	6	42948	42953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54022017
1107	NC_006361	AGC	2	6	43004	43009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022017
1108	NC_006361	GAGG	2	8	43052	43059	25 %	0 %	75 %	0 %	54022017
1109	NC_006361	CGA	3	9	43111	43119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022018
1110	NC_006361	CGG	2	6	43152	43157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022018
1111	NC_006361	CGG	2	6	43161	43166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022018
1112	NC_006361	CG	3	6	43209	43214	0 %	0 %	50 %	50 %	54022018
1113	NC_006361	GAT	2	6	43219	43224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54022018
1114	NC_006361	CGGCCT	2	12	43276	43287	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	54022018
1115	NC_006361	CGA	2	6	43288	43293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022018
1116	NC_006361	GTG	2	6	43303	43308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022018
1117	NC_006361	CGA	3	9	43318	43326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022018
1118	NC_006361	GATG	2	8	43330	43337	25 %	25 %	50 %	0 %	54022018
1119	NC_006361	CCGC	2	8	43391	43398	0 %	0 %	25 %	75 %	54022018
1120	NC_006361	CGC	2	6	43414	43419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022018
1121	NC_006361	GAC	2	6	43420	43425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022018
1122	NC_006361	CCA	2	6	43426	43431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54022018
1123	NC_006361	CGA	2	6	43458	43463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022018
1124	NC_006361	GCCCG	2	10	43471	43480	0 %	0 %	40 %	60 %	54022018
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1126	NC_006361	CCA	2	6	43578	43583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54022018
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1252	NC_006361	CTG	2	6	48365	48370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022025
1253	NC_006361	TCGGC	2	10	48384	48393	0 %	20 %	40 %	40 %	54022025
1254	NC_006361	GGC	2	6	48426	48431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022025
1255	NC_006361	GCC	2	6	48471	48476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022025
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1257	NC_006361	GCGCG	2	10	48589	48598	0 %	0 %	60 %	40 %	54022025
1258	NC_006361	CGA	2	6	48610	48615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022025
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1260	NC_006361	ACGGG	2	10	48666	48675	20 %	0 %	60 %	20 %	54022025
1261	NC_006361	GTC	2	6	48720	48725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022026
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1265	NC_006361	CGT	2	6	48860	48865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022026
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1283	NC_006361	GACTG	2	10	49488	49497	20 %	20 %	40 %	20 %	54022026
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1291	NC_006361	CCG	2	6	49705	49710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022026
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1346	NC_006361	TCAGC	2	10	51727	51736	20 %	20 %	20 %	40 %	54022031
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1352	NC_006361	CTG	2	6	52122	52127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022032
1353	NC_006361	GCACT	2	10	52134	52143	20 %	20 %	20 %	40 %	54022032
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1355	NC_006361	GTC	2	6	52260	52265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022032
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1357	NC_006361	CGT	2	6	52283	52288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022032
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1362	NC_006361	CG	4	8	52493	52500	0 %	0 %	50 %	50 %	54022032
1363	NC_006361	ATCA	2	8	52536	52543	50 %	25 %	0 %	25 %	54022032
1364	NC_006361	CAC	2	6	52556	52561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54022032
1365	NC_006361	AGG	2	6	52570	52575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54022032
1366	NC_006361	CACCG	2	10	52624	52633	20 %	0 %	20 %	60 %	54022033
1367	NC_006361	CGG	2	6	52641	52646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022033
1368	NC_006361	GCA	2	6	52665	52670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022033
1369	NC_006361	CGA	2	6	52698	52703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022033
1370	NC_006361	GCAGC	2	10	52709	52718	20 %	0 %	40 %	40 %	54022033
1371	NC_006361	CGCC	2	8	52722	52729	0 %	0 %	25 %	75 %	54022033
1372	NC_006361	CGGC	2	8	52760	52767	0 %	0 %	50 %	50 %	54022033
1373	NC_006361	CGA	2	6	52796	52801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022033
1374	NC_006361	TGC	2	6	52820	52825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022033
1375	NC_006361	CGCGC	2	10	52867	52876	0 %	0 %	40 %	60 %	54022033
1376	NC_006361	CG	3	6	52892	52897	0 %	0 %	50 %	50 %	54022033
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