MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nocardia farcinica IFM 10152 chromosome

Total Repeats: 161482

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006361	GAC	2	6	19690	19695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021982
502	NC_006361	CCG	2	6	19702	19707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021982
503	NC_006361	CACG	2	8	19716	19723	25 %	0 %	25 %	50 %	54021982
504	NC_006361	TGC	2	6	19733	19738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021982
505	NC_006361	TCG	2	6	19817	19822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021982
506	NC_006361	CGC	2	6	19860	19865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021982
507	NC_006361	GCC	2	6	19909	19914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021982
508	NC_006361	CGC	3	9	19920	19928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021982
509	NC_006361	ACA	2	6	20044	20049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54021983
510	NC_006361	CCG	2	6	20056	20061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021983
511	NC_006361	CTCGC	2	10	20097	20106	0 %	20 %	20 %	60 %	54021983
512	NC_006361	CGA	3	9	20165	20173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021983
513	NC_006361	CGGG	2	8	20174	20181	0 %	0 %	75 %	25 %	54021983
514	NC_006361	CGC	3	9	20240	20248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021983
515	NC_006361	CGACC	2	10	20265	20274	20 %	0 %	20 %	60 %	54021983
516	NC_006361	GCG	2	6	20293	20298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021983
517	NC_006361	CGC	3	9	20335	20343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021983
518	NC_006361	CGGGC	2	10	20359	20368	0 %	0 %	60 %	40 %	54021983
519	NC_006361	CGA	2	6	20390	20395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021983
520	NC_006361	CG	4	8	20411	20418	0 %	0 %	50 %	50 %	54021983
521	NC_006361	AGC	2	6	20419	20424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021983
522	NC_006361	CCA	2	6	20453	20458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54021983
523	NC_006361	CGCC	2	8	20483	20490	0 %	0 %	25 %	75 %	54021983
524	NC_006361	GC	3	6	20516	20521	0 %	0 %	50 %	50 %	54021983
525	NC_006361	GCC	2	6	20630	20635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021984
526	NC_006361	GCA	2	6	20644	20649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021984
527	NC_006361	ATC	2	6	20666	20671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54021984
528	NC_006361	GAG	2	6	20672	20677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54021984
529	NC_006361	GAC	2	6	20696	20701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021985
530	NC_006361	GAC	2	6	20704	20709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021985
531	NC_006361	CG	3	6	20744	20749	0 %	0 %	50 %	50 %	54021985
532	NC_006361	CCT	2	6	20789	20794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54021985
533	NC_006361	CGC	2	6	20985	20990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021985
534	NC_006361	CCG	2	6	21032	21037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021985
535	NC_006361	CCG	2	6	21122	21127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021985
536	NC_006361	CCG	2	6	21166	21171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021985
537	NC_006361	AACCCG	2	12	21184	21195	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	54021985
538	NC_006361	AG	4	8	21223	21230	50 %	0 %	50 %	0 %	54021985
539	NC_006361	GC	3	6	21240	21245	0 %	0 %	50 %	50 %	54021985
540	NC_006361	CGC	2	6	21325	21330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021985
541	NC_006361	CCA	2	6	21380	21385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54021985
542	NC_006361	ATC	2	6	21418	21423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54021985
543	NC_006361	ACG	3	9	21425	21433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021985
544	NC_006361	GC	3	6	21435	21440	0 %	0 %	50 %	50 %	54021985
545	NC_006361	GCACCG	2	12	21449	21460	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	54021985
546	NC_006361	CGA	2	6	21470	21475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021985
547	NC_006361	GAC	2	6	21476	21481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021985
548	NC_006361	CGC	3	9	21492	21500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021985
549	NC_006361	CGG	2	6	21549	21554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021985
550	NC_006361	CGC	2	6	21561	21566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021985
551	NC_006361	CGCTGC	2	12	21584	21595	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	54021985
552	NC_006361	CCG	2	6	21599	21604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021985
553	NC_006361	CACC	2	8	21623	21630	25 %	0 %	0 %	75 %	54021985
554	NC_006361	C	6	6	21692	21697	0 %	0 %	0 %	100 %	54021985
555	NC_006361	GGA	2	6	21739	21744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54021985
556	NC_006361	AACC	2	8	21753	21760	50 %	0 %	0 %	50 %	54021985
557	NC_006361	ACG	2	6	21781	21786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021986
558	NC_006361	ACG	2	6	21820	21825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021986
559	NC_006361	CGA	2	6	21836	21841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021986
560	NC_006361	GCC	2	6	21867	21872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021986
561	NC_006361	CGC	3	9	21876	21884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021986
562	NC_006361	GAG	2	6	21930	21935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54021986
563	NC_006361	ACC	2	6	21936	21941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54021986
564	NC_006361	CCG	2	6	21974	21979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021986
565	NC_006361	CGAG	2	8	21980	21987	25 %	0 %	50 %	25 %	54021986
566	NC_006361	CCG	2	6	22029	22034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021987
567	NC_006361	GC	3	6	22036	22041	0 %	0 %	50 %	50 %	54021987
568	NC_006361	CGA	2	6	22105	22110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021987
569	NC_006361	ACC	2	6	22116	22121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54021987
570	NC_006361	ACC	2	6	22124	22129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54021987
571	NC_006361	TCA	2	6	22146	22151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54021987
572	NC_006361	ATG	2	6	22157	22162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54021987
573	NC_006361	ACG	2	6	22190	22195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021987
574	NC_006361	CCGG	2	8	22227	22234	0 %	0 %	50 %	50 %	54021987
575	NC_006361	CGCTG	2	10	22251	22260	0 %	20 %	40 %	40 %	54021987
576	NC_006361	GCC	2	6	22268	22273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021987
577	NC_006361	CCG	3	9	22287	22295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021987
578	NC_006361	CGA	2	6	22444	22449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021987
579	NC_006361	CCG	2	6	22464	22469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021987
580	NC_006361	CGC	2	6	22474	22479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021987
581	NC_006361	CTGG	2	8	22531	22538	0 %	25 %	50 %	25 %	54021987
582	NC_006361	CTG	2	6	22547	22552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021987
583	NC_006361	CGT	2	6	22567	22572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021987
584	NC_006361	CGC	2	6	22621	22626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021987
585	NC_006361	CGC	2	6	22633	22638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021987
586	NC_006361	CGC	3	9	22733	22741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021987
587	NC_006361	GCC	2	6	22773	22778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021987
588	NC_006361	CGC	2	6	22867	22872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021987
589	NC_006361	TCG	2	6	22911	22916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021987
590	NC_006361	CCA	2	6	22939	22944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54021987
591	NC_006361	GAG	2	6	22958	22963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54021987
592	NC_006361	CCCG	2	8	22967	22974	0 %	0 %	25 %	75 %	54021987
593	NC_006361	CTG	2	6	23024	23029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021987
594	NC_006361	GAC	2	6	23050	23055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021987
595	NC_006361	GCC	2	6	23067	23072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021987
596	NC_006361	GTTCGG	2	12	23119	23130	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	54021987
597	NC_006361	CGA	3	9	23143	23151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021987
598	NC_006361	CGGCCG	2	12	23155	23166	0 %	0 %	50 %	50 %	54021987
599	NC_006361	GTC	2	6	23183	23188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021987
600	NC_006361	CCA	2	6	23233	23238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54021987
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602	NC_006361	AGC	2	6	23330	23335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021988
603	NC_006361	GC	3	6	23334	23339	0 %	0 %	50 %	50 %	54021988
604	NC_006361	GCC	2	6	23378	23383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021988
605	NC_006361	CGC	3	9	23388	23396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021988
606	NC_006361	GCG	2	6	23429	23434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021988
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608	NC_006361	CGA	2	6	23501	23506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021988
609	NC_006361	CGC	2	6	23523	23528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021988
610	NC_006361	GAA	2	6	23600	23605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54021988
611	NC_006361	GTG	2	6	23651	23656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54021989
612	NC_006361	ACA	2	6	23665	23670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54021989
613	NC_006361	GTC	2	6	23719	23724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021989
614	NC_006361	CGG	2	6	23741	23746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021989
615	NC_006361	GCGA	2	8	23764	23771	25 %	0 %	50 %	25 %	54021989
616	NC_006361	ACC	2	6	24091	24096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54021990
617	NC_006361	GCC	2	6	24112	24117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021990
618	NC_006361	GGC	2	6	24139	24144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54021990
619	NC_006361	ACATCG	2	12	24171	24182	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	54021990
620	NC_006361	GCC	2	6	24342	24347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021990
621	NC_006361	CCGG	2	8	24381	24388	0 %	0 %	50 %	50 %	54021991
622	NC_006361	CGA	2	6	24405	24410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021991
623	NC_006361	TCG	2	6	24431	24436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54021991
624	NC_006361	GCC	2	6	24518	24523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54021991
625	NC_006361	CCA	2	6	24578	24583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54021991
626	NC_006361	GAG	2	6	24601	24606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54021991
627	NC_006361	GGCT	2	8	24631	24638	0 %	25 %	50 %	25 %	54021991
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629	NC_006361	CAG	2	6	24673	24678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54021991
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753	NC_006361	CGG	2	6	29549	29554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022003
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758	NC_006361	GC	3	6	29839	29844	0 %	0 %	50 %	50 %	54022003
759	NC_006361	CGA	2	6	29845	29850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022003
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761	NC_006361	GGC	2	6	29907	29912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022003
762	NC_006361	GAC	2	6	29958	29963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022003
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773	NC_006361	CGG	2	6	30334	30339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022004
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788	NC_006361	GGT	2	6	30878	30883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022005
789	NC_006361	CGA	2	6	30908	30913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022005
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791	NC_006361	GGCG	2	8	31118	31125	0 %	0 %	75 %	25 %	54022005
792	NC_006361	CGCAG	2	10	31163	31172	20 %	0 %	40 %	40 %	54022005
793	NC_006361	CGC	2	6	31246	31251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022005
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877	NC_006361	TCG	2	6	34095	34100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022009
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879	NC_006361	ACT	2	6	34155	34160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54022009
880	NC_006361	CCG	2	6	34179	34184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022009
881	NC_006361	TCG	3	9	34197	34205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022009
882	NC_006361	GCG	2	6	34212	34217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022009
883	NC_006361	ACGG	2	8	34292	34299	25 %	0 %	50 %	25 %	54022009
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