MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nocardia farcinica IFM 10152 chromosome

Total Repeats: 161482

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_006361	CGTAGA	2	12	223478	223489	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54022176
6002	NC_006361	CGA	2	6	223490	223495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022176
6003	NC_006361	CGG	2	6	223505	223510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022176
6004	NC_006361	GAC	2	6	223524	223529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022176
6005	NC_006361	CCT	2	6	223544	223549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54022176
6006	NC_006361	CGG	2	6	223568	223573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022176
6007	NC_006361	CGG	2	6	223617	223622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022177
6008	NC_006361	CGC	2	6	223690	223695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022177
6009	NC_006361	CGC	3	9	223711	223719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022177
6010	NC_006361	GC	4	8	223744	223751	0 %	0 %	50 %	50 %	54022177
6011	NC_006361	CCT	2	6	223765	223770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54022177
6012	NC_006361	CTG	2	6	223775	223780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022177
6013	NC_006361	CTG	2	6	223850	223855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022177
6014	NC_006361	CGG	2	6	223870	223875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022177
6015	NC_006361	CGCTC	2	10	223888	223897	0 %	20 %	20 %	60 %	54022177
6016	NC_006361	ATC	2	6	223907	223912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54022177
6017	NC_006361	CAA	2	6	223948	223953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54022177
6018	NC_006361	GTG	2	6	223954	223959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022177
6019	NC_006361	ACA	2	6	224100	224105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54022177
6020	NC_006361	GAT	2	6	224137	224142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54022177
6021	NC_006361	GGCCGA	2	12	224185	224196	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	54022177
6022	NC_006361	AAC	2	6	224202	224207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54022177
6023	NC_006361	ACC	2	6	224372	224377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54022178
6024	NC_006361	CGC	4	12	224382	224393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022178
6025	NC_006361	TGC	2	6	224438	224443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022178
6026	NC_006361	CGA	2	6	224481	224486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022178
6027	NC_006361	GGT	2	6	224496	224501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022178
6028	NC_006361	GGC	2	6	224511	224516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022178
6029	NC_006361	CGC	2	6	224586	224591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022178
6030	NC_006361	ACC	2	6	224611	224616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54022178
6031	NC_006361	CGA	2	6	224633	224638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022178
6032	NC_006361	GC	4	8	224658	224665	0 %	0 %	50 %	50 %	54022178
6033	NC_006361	CAT	2	6	224706	224711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54022178
6034	NC_006361	CAC	2	6	224721	224726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54022178
6035	NC_006361	GGT	2	6	224742	224747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022178
6036	NC_006361	CGG	2	6	224778	224783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022178
6037	NC_006361	CGG	2	6	224811	224816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022178
6038	NC_006361	CGCC	2	8	224849	224856	0 %	0 %	25 %	75 %	54022178
6039	NC_006361	TCGCCA	2	12	224876	224887	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	54022178
6040	NC_006361	GCC	2	6	224905	224910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022178
6041	NC_006361	GCC	2	6	224938	224943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022178
6042	NC_006361	GCC	2	6	224959	224964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022178
6043	NC_006361	CGT	2	6	224979	224984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022178
6044	NC_006361	GCG	2	6	225083	225088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022178
6045	NC_006361	CGGG	2	8	225089	225096	0 %	0 %	75 %	25 %	54022178
6046	NC_006361	CGG	2	6	225122	225127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022178
6047	NC_006361	GAC	3	9	225157	225165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022178
6048	NC_006361	GC	3	6	225239	225244	0 %	0 %	50 %	50 %	54022178
6049	NC_006361	GAG	2	6	225289	225294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54022178
6050	NC_006361	GAA	3	9	225360	225368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54022178
6051	NC_006361	TGG	2	6	225403	225408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022178
6052	NC_006361	CCTG	2	8	225410	225417	0 %	25 %	25 %	50 %	54022178
6053	NC_006361	GGT	2	6	225429	225434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022178
6054	NC_006361	TCT	2	6	225461	225466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54022178
6055	NC_006361	GAC	2	6	225475	225480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022178
6056	NC_006361	CGG	2	6	225539	225544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022178
6057	NC_006361	ACG	2	6	225575	225580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022178
6058	NC_006361	GC	3	6	225586	225591	0 %	0 %	50 %	50 %	54022178
6059	NC_006361	TCG	2	6	225617	225622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022178
6060	NC_006361	TTC	2	6	225667	225672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54022178
6061	NC_006361	TGG	2	6	225692	225697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022178
6062	NC_006361	CAC	2	6	225720	225725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54022178
6063	NC_006361	CGG	2	6	225774	225779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022178
6064	NC_006361	CGC	2	6	225783	225788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022178
6065	NC_006361	GGC	2	6	225792	225797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022178
6066	NC_006361	GC	3	6	225810	225815	0 %	0 %	50 %	50 %	54022178
6067	NC_006361	CCG	2	6	225853	225858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022178
6068	NC_006361	GCG	2	6	225882	225887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022178
6069	NC_006361	GGCG	3	12	225884	225895	0 %	0 %	75 %	25 %	54022178
6070	NC_006361	CGAGC	2	10	225897	225906	20 %	0 %	40 %	40 %	54022178
6071	NC_006361	GCT	2	6	225912	225917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022178
6072	NC_006361	GCGG	2	8	225930	225937	0 %	0 %	75 %	25 %	54022178
6073	NC_006361	GGA	2	6	225987	225992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54022178
6074	NC_006361	TGG	2	6	226000	226005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022178
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6077	NC_006361	GC	4	8	226081	226088	0 %	0 %	50 %	50 %	54022178
6078	NC_006361	CTG	3	9	226096	226104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022178
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6080	NC_006361	GCCC	2	8	226143	226150	0 %	0 %	25 %	75 %	54022178
6081	NC_006361	CGC	2	6	226167	226172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022178
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6094	NC_006361	GCCC	2	8	226654	226661	0 %	0 %	25 %	75 %	54022179
6095	NC_006361	GGCA	2	8	226682	226689	25 %	0 %	50 %	25 %	54022179
6096	NC_006361	CAG	2	6	226699	226704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022179
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6105	NC_006361	GCCC	2	8	226896	226903	0 %	0 %	25 %	75 %	54022179
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6120	NC_006361	CTT	2	6	227644	227649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54022180
6121	NC_006361	CGG	2	6	227652	227657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022180
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6123	NC_006361	CAG	2	6	227692	227697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022180
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6236	NC_006361	GAC	2	6	231932	231937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022184
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6240	NC_006361	CAT	2	6	232007	232012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54022184
6241	NC_006361	ACG	2	6	232303	232308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022185
6242	NC_006361	CG	3	6	232399	232404	0 %	0 %	50 %	50 %	54022185
6243	NC_006361	CGT	2	6	232429	232434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022185
6244	NC_006361	CAA	2	6	232451	232456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54022185
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6246	NC_006361	GC	3	6	232461	232466	0 %	0 %	50 %	50 %	54022185
6247	NC_006361	GCC	2	6	232473	232478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022185
6248	NC_006361	GCC	2	6	232488	232493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022185
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6251	NC_006361	GTC	2	6	232536	232541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022185
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6271	NC_006361	CGC	2	6	233321	233326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022185
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6276	NC_006361	ACG	2	6	233445	233450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022185
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6352	NC_006361	GC	3	6	235928	235933	0 %	0 %	50 %	50 %	54022188
6353	NC_006361	CCA	2	6	235946	235951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54022188
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6355	NC_006361	TGC	2	6	236026	236031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022188
6356	NC_006361	GAGC	2	8	236063	236070	25 %	0 %	50 %	25 %	54022188
6357	NC_006361	TCC	2	6	236088	236093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54022188
6358	NC_006361	GCA	2	6	236095	236100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022188
6359	NC_006361	CACC	2	8	236105	236112	25 %	0 %	0 %	75 %	54022188
6360	NC_006361	CCG	2	6	236144	236149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022188
6361	NC_006361	CGA	2	6	236162	236167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022188
6362	NC_006361	AGGC	2	8	236197	236204	25 %	0 %	50 %	25 %	54022188
6363	NC_006361	GCC	2	6	236223	236228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022188
6364	NC_006361	CCG	2	6	236249	236254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022188
6365	NC_006361	CGC	2	6	236288	236293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022188
6366	NC_006361	CGA	2	6	236318	236323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022188
6367	NC_006361	TGG	2	6	236563	236568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022189
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6369	NC_006361	CTG	2	6	236607	236612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022189
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6489	NC_006361	CTG	2	6	242214	242219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022194
6490	NC_006361	CGG	2	6	242222	242227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022194
6491	NC_006361	GC	3	6	242234	242239	0 %	0 %	50 %	50 %	54022194
6492	NC_006361	GC	3	6	242301	242306	0 %	0 %	50 %	50 %	54022194
6493	NC_006361	CAG	2	6	242313	242318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022194
6494	NC_006361	GGTG	2	8	242348	242355	0 %	25 %	75 %	0 %	54022194
6495	NC_006361	ACG	2	6	242356	242361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022194
6496	NC_006361	GGC	2	6	242391	242396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022194
6497	NC_006361	AGC	2	6	242434	242439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022194
6498	NC_006361	CGC	2	6	242451	242456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022194
6499	NC_006361	GTG	2	6	242470	242475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022194
6500	NC_006361	ACG	2	6	242545	242550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022195

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