MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrosomonas europaea ATCC 19718 chromosome

Total Repeats: 46364

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004757	CAGG	2	8	255	262	25 %	0 %	50 %	25 %	30248032
2	NC_004757	TGC	2	6	365	370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248032
3	NC_004757	CGA	2	6	402	407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248032
4	NC_004757	AG	3	6	511	516	50 %	0 %	50 %	0 %	30248032
5	NC_004757	A	6	6	520	525	100 %	0 %	0 %	0 %	30248032
6	NC_004757	A	6	6	536	541	100 %	0 %	0 %	0 %	30248032
7	NC_004757	AACC	2	8	564	571	50 %	0 %	0 %	50 %	30248032
8	NC_004757	CGTT	2	8	605	612	0 %	50 %	25 %	25 %	30248032
9	NC_004757	GCTGGA	2	12	753	764	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	30248032
10	NC_004757	CTCG	2	8	867	874	0 %	25 %	25 %	50 %	30248032
11	NC_004757	CTG	3	9	877	885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248032
12	NC_004757	GAT	2	6	889	894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248032
13	NC_004757	GAA	2	6	928	933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30248032
14	NC_004757	GAA	2	6	1021	1026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30248032
15	NC_004757	CCT	2	6	1072	1077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	30248032
16	NC_004757	CTG	2	6	1102	1107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248032
17	NC_004757	A	6	6	1108	1113	100 %	0 %	0 %	0 %	30248032
18	NC_004757	A	6	6	1124	1129	100 %	0 %	0 %	0 %	30248032
19	NC_004757	T	6	6	1153	1158	0 %	100 %	0 %	0 %	30248032
20	NC_004757	TC	3	6	1249	1254	0 %	50 %	0 %	50 %	30248032
21	NC_004757	CTG	2	6	1282	1287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248032
22	NC_004757	A	6	6	1325	1330	100 %	0 %	0 %	0 %	30248032
23	NC_004757	TAC	2	6	1342	1347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248032
24	NC_004757	GAA	2	6	1374	1379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30248032
25	NC_004757	CGTC	2	8	1395	1402	0 %	25 %	25 %	50 %	30248032
26	NC_004757	TGG	2	6	1473	1478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248032
27	NC_004757	CAC	2	6	1488	1493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30248032
28	NC_004757	ACCG	2	8	1806	1813	25 %	0 %	25 %	50 %	30248033
29	NC_004757	CTG	2	6	1818	1823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248033
30	NC_004757	GC	3	6	2036	2041	0 %	0 %	50 %	50 %	30248033
31	NC_004757	AGA	2	6	2138	2143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30248033
32	NC_004757	GAT	2	6	2153	2158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248033
33	NC_004757	A	6	6	2211	2216	100 %	0 %	0 %	0 %	30248033
34	NC_004757	CAG	2	6	2247	2252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248033
35	NC_004757	TTA	2	6	2261	2266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30248033
36	NC_004757	TGG	2	6	2311	2316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248033
37	NC_004757	TCGA	2	8	2346	2353	25 %	25 %	25 %	25 %	30248033
38	NC_004757	TCG	2	6	2449	2454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248033
39	NC_004757	TCC	2	6	2593	2598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	30248033
40	NC_004757	CAG	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248033
41	NC_004757	AGG	2	6	2707	2712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	30248033
42	NC_004757	GAA	2	6	2721	2726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30248033
43	NC_004757	AAC	2	6	2796	2801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30248033
44	NC_004757	GTTC	2	8	2824	2831	0 %	50 %	25 %	25 %	30248033
45	NC_004757	AAT	2	6	2908	2913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30248033
46	NC_004757	A	7	7	2988	2994	100 %	0 %	0 %	0 %	30248034
47	NC_004757	TGA	2	6	3146	3151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248034
48	NC_004757	GAT	2	6	3171	3176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248034
49	NC_004757	TCA	2	6	3184	3189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248034
50	NC_004757	GAT	2	6	3255	3260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248034
51	NC_004757	CAG	2	6	3274	3279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248034
52	NC_004757	TGA	2	6	3320	3325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248034
53	NC_004757	CGG	2	6	3344	3349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248034
54	NC_004757	CGC	2	6	3411	3416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30248034
55	NC_004757	GCCA	2	8	3519	3526	25 %	0 %	25 %	50 %	30248034
56	NC_004757	GAA	2	6	3642	3647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30248034
57	NC_004757	TCG	2	6	3679	3684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248034
58	NC_004757	GCA	2	6	3697	3702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248034
59	NC_004757	TGC	2	6	3709	3714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248034
60	NC_004757	T	6	6	3724	3729	0 %	100 %	0 %	0 %	30248034
61	NC_004757	GTGCT	2	10	3801	3810	0 %	40 %	40 %	20 %	30248034
62	NC_004757	CAA	2	6	3815	3820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30248034
63	NC_004757	TGCG	2	8	3859	3866	0 %	25 %	50 %	25 %	30248034
64	NC_004757	AAT	2	6	3885	3890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30248034
65	NC_004757	A	7	7	3898	3904	100 %	0 %	0 %	0 %	30248034
66	NC_004757	GAT	2	6	3942	3947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248034
67	NC_004757	GTCA	2	8	3974	3981	25 %	25 %	25 %	25 %	30248034
68	NC_004757	TTC	2	6	4001	4006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30248034
69	NC_004757	TCG	2	6	4060	4065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248034
70	NC_004757	CTG	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248034
71	NC_004757	CAA	2	6	4121	4126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30248034
72	NC_004757	ATC	2	6	4128	4133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248034
73	NC_004757	GCC	2	6	4137	4142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30248034
74	NC_004757	GCC	2	6	4155	4160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30248034
75	NC_004757	TGG	2	6	4270	4275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248034
76	NC_004757	GGT	2	6	4290	4295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248034
77	NC_004757	CAT	2	6	4331	4336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248034
78	NC_004757	TCT	2	6	4392	4397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30248034
79	NC_004757	ATC	3	9	4482	4490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248034
80	NC_004757	TGAC	2	8	4492	4499	25 %	25 %	25 %	25 %	30248034
81	NC_004757	TGC	2	6	4531	4536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248034
82	NC_004757	CCT	2	6	4599	4604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	30248034
83	NC_004757	GAT	2	6	4647	4652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248034
84	NC_004757	TGG	2	6	4687	4692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248034
85	NC_004757	AAT	2	6	4716	4721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30248034
86	NC_004757	CCG	2	6	4722	4727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30248034
87	NC_004757	TCT	2	6	4766	4771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30248034
88	NC_004757	GCC	2	6	4798	4803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30248034
89	NC_004757	GATC	2	8	4805	4812	25 %	25 %	25 %	25 %	30248034
90	NC_004757	GCT	2	6	4829	4834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248034
91	NC_004757	TGC	2	6	4883	4888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248034
92	NC_004757	GAT	2	6	4908	4913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248034
93	NC_004757	ACA	2	6	4976	4981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30248034
94	NC_004757	GAT	2	6	5010	5015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248034
95	NC_004757	GTG	2	6	5026	5031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248034
96	NC_004757	CAGG	2	8	5045	5052	25 %	0 %	50 %	25 %	30248034
97	NC_004757	GCT	2	6	5150	5155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248034
98	NC_004757	GAA	2	6	5157	5162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30248034
99	NC_004757	A	6	6	5166	5171	100 %	0 %	0 %	0 %	30248034
100	NC_004757	TGCG	2	8	5263	5270	0 %	25 %	50 %	25 %	30248034
101	NC_004757	TAC	2	6	5306	5311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248034
102	NC_004757	TGCG	2	8	5365	5372	0 %	25 %	50 %	25 %	30248034
103	NC_004757	TGTCA	2	10	5409	5418	20 %	40 %	20 %	20 %	30248035
104	NC_004757	GCTG	2	8	5495	5502	0 %	25 %	50 %	25 %	30248035
105	NC_004757	CGA	2	6	5567	5572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248035
106	NC_004757	GGC	2	6	5589	5594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248035
107	NC_004757	GTT	2	6	5597	5602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30248035
108	NC_004757	ATC	2	6	5662	5667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248035
109	NC_004757	GC	3	6	5695	5700	0 %	0 %	50 %	50 %	30248035
110	NC_004757	TGG	2	6	5770	5775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248035
111	NC_004757	GGC	2	6	5825	5830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248035
112	NC_004757	TCGA	2	8	6061	6068	25 %	25 %	25 %	25 %	30248036
113	NC_004757	CAGA	2	8	6080	6087	50 %	0 %	25 %	25 %	30248036
114	NC_004757	CAG	2	6	6090	6095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248036
115	NC_004757	CGGT	2	8	6118	6125	0 %	25 %	50 %	25 %	30248036
116	NC_004757	AAT	2	6	6177	6182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30248036
117	NC_004757	TCA	2	6	6194	6199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248036
118	NC_004757	TCGT	2	8	6203	6210	0 %	50 %	25 %	25 %	30248036
119	NC_004757	GCCG	2	8	6252	6259	0 %	0 %	50 %	50 %	30248036
120	NC_004757	TTG	2	6	6282	6287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30248036
121	NC_004757	ATTG	2	8	6320	6327	25 %	50 %	25 %	0 %	30248036
122	NC_004757	GGGA	2	8	6385	6392	25 %	0 %	75 %	0 %	30248036
123	NC_004757	TTTTA	2	10	6479	6488	20 %	80 %	0 %	0 %	30248036
124	NC_004757	AGGA	2	8	6490	6497	50 %	0 %	50 %	0 %	30248036
125	NC_004757	A	6	6	6497	6502	100 %	0 %	0 %	0 %	30248036
126	NC_004757	CGG	2	6	6513	6518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248036
127	NC_004757	GAAT	2	8	6623	6630	50 %	25 %	25 %	0 %	30248036
128	NC_004757	GTA	2	6	7359	7364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248037
129	NC_004757	T	6	6	7442	7447	0 %	100 %	0 %	0 %	30248037
130	NC_004757	GATC	2	8	7451	7458	25 %	25 %	25 %	25 %	30248037
131	NC_004757	TG	4	8	7483	7490	0 %	50 %	50 %	0 %	30248037
132	NC_004757	GAT	2	6	7524	7529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248037
133	NC_004757	ATC	2	6	7593	7598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248037
134	NC_004757	A	6	6	7602	7607	100 %	0 %	0 %	0 %	30248037
135	NC_004757	AAT	2	6	7713	7718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30248038
136	NC_004757	GTT	2	6	7738	7743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30248038
137	NC_004757	TTTTG	2	10	7751	7760	0 %	80 %	20 %	0 %	30248038
138	NC_004757	CAT	2	6	7947	7952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248038
139	NC_004757	CTT	2	6	7998	8003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30248038
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141	NC_004757	TCA	2	6	8117	8122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248039
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143	NC_004757	T	7	7	8132	8138	0 %	100 %	0 %	0 %	30248039
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163	NC_004757	T	6	6	9303	9308	0 %	100 %	0 %	0 %	30248039
164	NC_004757	TTCT	2	8	9315	9322	0 %	75 %	0 %	25 %	30248039
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168	NC_004757	GAT	3	9	9411	9419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248039
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172	NC_004757	CAC	2	6	9662	9667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30248039
173	NC_004757	CGAAAC	2	12	9749	9760	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	30248039
174	NC_004757	AT	3	6	9800	9805	50 %	50 %	0 %	0 %	30248039
175	NC_004757	CTG	2	6	9867	9872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248039
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249	NC_004757	GATC	2	8	13580	13587	25 %	25 %	25 %	25 %	30248041
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267	NC_004757	T	6	6	14412	14417	0 %	100 %	0 %	0 %	30248041
268	NC_004757	GTT	2	6	14507	14512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30248041
269	NC_004757	GAT	2	6	14516	14521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248041
270	NC_004757	CG	3	6	14528	14533	0 %	0 %	50 %	50 %	30248041
271	NC_004757	ACGG	2	8	14554	14561	25 %	0 %	50 %	25 %	30248041
272	NC_004757	GGC	2	6	14810	14815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248042
273	NC_004757	TG	3	6	14835	14840	0 %	50 %	50 %	0 %	30248042
274	NC_004757	TGTC	2	8	14848	14855	0 %	50 %	25 %	25 %	30248042
275	NC_004757	GGCA	2	8	14872	14879	25 %	0 %	50 %	25 %	30248042
276	NC_004757	GCA	2	6	14910	14915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248042
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282	NC_004757	CTG	2	6	15313	15318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248042
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286	NC_004757	ATG	2	6	15541	15546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248043
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299	NC_004757	CTTG	2	8	16171	16178	0 %	50 %	25 %	25 %	30248043
300	NC_004757	CTGA	2	8	16219	16226	25 %	25 %	25 %	25 %	30248043
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380	NC_004757	TCA	2	6	20714	20719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248048
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384	NC_004757	GCTG	2	8	20858	20865	0 %	25 %	50 %	25 %	30248048
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387	NC_004757	CAAT	2	8	20983	20990	50 %	25 %	0 %	25 %	30248048
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391	NC_004757	CTG	2	6	21213	21218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248048
392	NC_004757	TCC	2	6	21222	21227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	30248048
393	NC_004757	GTC	2	6	21258	21263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248048
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396	NC_004757	TGG	2	6	21555	21560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248049
397	NC_004757	GAT	2	6	21570	21575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248049
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399	NC_004757	TGT	2	6	21736	21741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30248049
400	NC_004757	GTT	2	6	21803	21808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30248049
401	NC_004757	CGGT	2	8	21868	21875	0 %	25 %	50 %	25 %	30248049
402	NC_004757	AGT	2	6	21877	21882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248049
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500	NC_004757	GCG	2	6	27455	27460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248051

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