MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrosomonas europaea ATCC 19718 chromosome

Total Repeats: 46364

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_004757	AGGG	2	8	178524	178531	25 %	0 %	75 %	0 %	30248179
3002	NC_004757	TCC	2	6	178537	178542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	30248179
3003	NC_004757	CCG	2	6	178591	178596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30248179
3004	NC_004757	GAA	2	6	178709	178714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30248179
3005	NC_004757	CGG	2	6	178718	178723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248179
3006	NC_004757	GCC	4	12	178731	178742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30248179
3007	NC_004757	AAG	2	6	178751	178756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30248179
3008	NC_004757	TGG	2	6	178977	178982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248180
3009	NC_004757	TTG	2	6	179021	179026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30248180
3010	NC_004757	ACGGAA	2	12	179111	179122	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	30248180
3011	NC_004757	A	7	7	179182	179188	100 %	0 %	0 %	0 %	30248180
3012	NC_004757	GCG	2	6	179192	179197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248180
3013	NC_004757	CAC	2	6	179251	179256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30248181
3014	NC_004757	GGC	2	6	179262	179267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248181
3015	NC_004757	CCG	2	6	179323	179328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30248181
3016	NC_004757	GCTGC	2	10	179490	179499	0 %	20 %	40 %	40 %	30248181
3017	NC_004757	CGA	2	6	179522	179527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248181
3018	NC_004757	TCT	2	6	179562	179567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30248181
3019	NC_004757	GGC	2	6	179586	179591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248181
3020	NC_004757	CGA	2	6	179634	179639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248181
3021	NC_004757	GGCT	2	8	179641	179648	0 %	25 %	50 %	25 %	30248181
3022	NC_004757	CGC	2	6	179754	179759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30248181
3023	NC_004757	CAT	2	6	179785	179790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248181
3024	NC_004757	CAA	2	6	179839	179844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30248181
3025	NC_004757	TTG	2	6	179880	179885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30248181
3026	NC_004757	TAC	2	6	179952	179957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248181
3027	NC_004757	CA	3	6	179961	179966	50 %	0 %	0 %	50 %	30248181
3028	NC_004757	TCT	2	6	179999	180004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30248181
3029	NC_004757	TCA	2	6	180688	180693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248182
3030	NC_004757	TC	3	6	180704	180709	0 %	50 %	0 %	50 %	30248182
3031	NC_004757	TCC	2	6	180758	180763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	30248182
3032	NC_004757	AAGG	2	8	180897	180904	50 %	0 %	50 %	0 %	30248182
3033	NC_004757	TCT	2	6	180926	180931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30248182
3034	NC_004757	CCGT	2	8	180947	180954	0 %	25 %	25 %	50 %	30248182
3035	NC_004757	TGCA	2	8	181039	181046	25 %	25 %	25 %	25 %	30248182
3036	NC_004757	CG	3	6	181069	181074	0 %	0 %	50 %	50 %	30248182
3037	NC_004757	A	6	6	181091	181096	100 %	0 %	0 %	0 %	30248182
3038	NC_004757	GCT	2	6	181137	181142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248182
3039	NC_004757	CTCAAT	2	12	181158	181169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248182
3040	NC_004757	ATGT	2	8	181284	181291	25 %	50 %	25 %	0 %	30248182
3041	NC_004757	TGA	2	6	181304	181309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248182
3042	NC_004757	TATT	2	8	181364	181371	25 %	75 %	0 %	0 %	30248182
3043	NC_004757	TGA	2	6	181391	181396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248182
3044	NC_004757	TTC	2	6	181428	181433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30248182
3045	NC_004757	CCG	2	6	181640	181645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30248182
3046	NC_004757	GTC	2	6	181660	181665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248182
3047	NC_004757	ACA	2	6	181704	181709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30248182
3048	NC_004757	GTC	3	9	181716	181724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248182
3049	NC_004757	AGA	2	6	181735	181740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30248182
3050	NC_004757	GAT	2	6	181754	181759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248182
3051	NC_004757	CTC	2	6	181801	181806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	30248182
3052	NC_004757	TTC	2	6	181861	181866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30248183
3053	NC_004757	TC	3	6	181893	181898	0 %	50 %	0 %	50 %	30248183
3054	NC_004757	GCG	2	6	181912	181917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248183
3055	NC_004757	GCT	2	6	181935	181940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248183
3056	NC_004757	GTG	2	6	181963	181968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248183
3057	NC_004757	GC	3	6	181986	181991	0 %	0 %	50 %	50 %	30248183
3058	NC_004757	GAA	2	6	182047	182052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30248183
3059	NC_004757	GCT	2	6	182158	182163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248183
3060	NC_004757	ACG	2	6	182210	182215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248183
3061	NC_004757	CA	3	6	182235	182240	50 %	0 %	0 %	50 %	30248183
3062	NC_004757	TCTT	2	8	182274	182281	0 %	75 %	0 %	25 %	30248183
3063	NC_004757	ATGCG	2	10	182399	182408	20 %	20 %	40 %	20 %	30248183
3064	NC_004757	CG	3	6	182436	182441	0 %	0 %	50 %	50 %	30248183
3065	NC_004757	CAGC	2	8	182450	182457	25 %	0 %	25 %	50 %	30248183
3066	NC_004757	GTG	2	6	182461	182466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248183
3067	NC_004757	GCGG	2	8	182564	182571	0 %	0 %	75 %	25 %	30248183
3068	NC_004757	CGA	2	6	182616	182621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248183
3069	NC_004757	GCA	2	6	182708	182713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248183
3070	NC_004757	CT	3	6	182748	182753	0 %	50 %	0 %	50 %	30248183
3071	NC_004757	GAA	2	6	182785	182790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30248183
3072	NC_004757	GCA	2	6	182794	182799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248183
3073	NC_004757	TCC	2	6	182805	182810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	30248183
3074	NC_004757	GGT	2	6	182826	182831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248183
3075	NC_004757	TGG	2	6	182912	182917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248183
3076	NC_004757	GC	3	6	182940	182945	0 %	0 %	50 %	50 %	30248183
3077	NC_004757	ACATTG	2	12	183028	183039	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	30248183
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3079	NC_004757	GAT	2	6	183073	183078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248183
3080	NC_004757	GTC	2	6	183085	183090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248183
3081	NC_004757	AAG	2	6	183158	183163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30248183
3082	NC_004757	ATC	2	6	183175	183180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248183
3083	NC_004757	CCA	2	6	183281	183286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30248183
3084	NC_004757	GCA	2	6	183328	183333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248183
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3086	NC_004757	TAG	2	6	183663	183668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248183
3087	NC_004757	CAGT	2	8	183718	183725	25 %	25 %	25 %	25 %	30248183
3088	NC_004757	CTG	2	6	183788	183793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248183
3089	NC_004757	CTGA	2	8	183823	183830	25 %	25 %	25 %	25 %	30248183
3090	NC_004757	TCCA	2	8	183864	183871	25 %	25 %	0 %	50 %	30248183
3091	NC_004757	CAAAGC	2	12	184059	184070	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	30248183
3092	NC_004757	TTCT	2	8	184122	184129	0 %	75 %	0 %	25 %	30248183
3093	NC_004757	TATC	2	8	184158	184165	25 %	50 %	0 %	25 %	30248183
3094	NC_004757	CAA	2	6	184215	184220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30248183
3095	NC_004757	GAG	2	6	184241	184246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	30248183
3096	NC_004757	CTGAT	2	10	184331	184340	20 %	40 %	20 %	20 %	30248183
3097	NC_004757	CTC	2	6	184365	184370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	30248183
3098	NC_004757	CAG	2	6	184456	184461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248183
3099	NC_004757	GCTG	2	8	184524	184531	0 %	25 %	50 %	25 %	30248183
3100	NC_004757	GTAT	2	8	184582	184589	25 %	50 %	25 %	0 %	30248183
3101	NC_004757	TGC	2	6	184593	184598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248183
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3103	NC_004757	AT	3	6	184634	184639	50 %	50 %	0 %	0 %	30248183
3104	NC_004757	TCG	2	6	184655	184660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248183
3105	NC_004757	CAAGG	2	10	184726	184735	40 %	0 %	40 %	20 %	30248183
3106	NC_004757	GCT	2	6	184747	184752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248183
3107	NC_004757	TACGC	2	10	184856	184865	20 %	20 %	20 %	40 %	30248183
3108	NC_004757	CGG	2	6	185093	185098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248184
3109	NC_004757	ATG	2	6	185179	185184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248184
3110	NC_004757	CAG	2	6	185229	185234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248184
3111	NC_004757	GTA	3	9	185244	185252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248184
3112	NC_004757	TCT	2	6	185272	185277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30248184
3113	NC_004757	GGC	2	6	185307	185312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248184
3114	NC_004757	AGC	2	6	185358	185363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248184
3115	NC_004757	TGAA	2	8	185374	185381	50 %	25 %	25 %	0 %	30248184
3116	NC_004757	CAC	2	6	185453	185458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30248184
3117	NC_004757	TAA	2	6	185525	185530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30248184
3118	NC_004757	GCG	2	6	185535	185540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248184
3119	NC_004757	AGC	2	6	185572	185577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248184
3120	NC_004757	TGG	2	6	185594	185599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248184
3121	NC_004757	TGG	2	6	185639	185644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248184
3122	NC_004757	CAGC	2	8	185645	185652	25 %	0 %	25 %	50 %	30248184
3123	NC_004757	CAG	2	6	185666	185671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248184
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3152	NC_004757	TGC	2	6	187278	187283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248185
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3368	NC_004757	GCT	2	6	197281	197286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248187
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3488	NC_004757	GAT	2	6	205654	205659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248192
3489	NC_004757	TTC	2	6	205663	205668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30248192
3490	NC_004757	CTCA	2	8	205681	205688	25 %	25 %	0 %	50 %	30248192
3491	NC_004757	CAG	2	6	205788	205793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248192
3492	NC_004757	CGA	2	6	205794	205799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248192
3493	NC_004757	AAT	2	6	205860	205865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30248192
3494	NC_004757	TAT	2	6	205914	205919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30248192
3495	NC_004757	CAACG	2	10	205984	205993	40 %	0 %	20 %	40 %	30248192
3496	NC_004757	TCT	2	6	206016	206021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30248192
3497	NC_004757	CGATAT	2	12	206103	206114	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	30248192
3498	NC_004757	TGG	2	6	206166	206171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248192
3499	NC_004757	AGA	2	6	206183	206188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30248192
3500	NC_004757	ACG	2	6	206282	206287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248192

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