MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrosomonas europaea ATCC 19718 chromosome

Total Repeats: 46364

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_004757	GCT	2	6	300094	300099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248288
5002	NC_004757	CGA	2	6	300119	300124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248288
5003	NC_004757	CAT	2	6	300230	300235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248288
5004	NC_004757	CTT	2	6	300243	300248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30248288
5005	NC_004757	CTT	2	6	300324	300329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30248288
5006	NC_004757	GCT	2	6	300463	300468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248288
5007	NC_004757	CTT	2	6	300476	300481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30248288
5008	NC_004757	CCT	2	6	300538	300543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	30248288
5009	NC_004757	AAGC	2	8	300639	300646	50 %	0 %	25 %	25 %	30248288
5010	NC_004757	ATG	2	6	300669	300674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248288
5011	NC_004757	AGT	2	6	302199	302204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248289
5012	NC_004757	CAG	2	6	302231	302236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248289
5013	NC_004757	GGC	2	6	302246	302251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248289
5014	NC_004757	TTGA	2	8	302261	302268	25 %	50 %	25 %	0 %	30248289
5015	NC_004757	ATT	2	6	302270	302275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30248289
5016	NC_004757	TGTT	2	8	302340	302347	0 %	75 %	25 %	0 %	30248289
5017	NC_004757	GCG	2	6	302354	302359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248289
5018	NC_004757	TCA	2	6	302373	302378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248289
5019	NC_004757	TTC	2	6	302444	302449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30248289
5020	NC_004757	GCAG	2	8	302461	302468	25 %	0 %	50 %	25 %	30248289
5021	NC_004757	ATTA	2	8	302502	302509	50 %	50 %	0 %	0 %	30248289
5022	NC_004757	GAA	2	6	302936	302941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30248290
5023	NC_004757	GA	3	6	302971	302976	50 %	0 %	50 %	0 %	30248290
5024	NC_004757	TTC	2	6	302980	302985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30248290
5025	NC_004757	CGA	2	6	303000	303005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248290
5026	NC_004757	AC	3	6	303064	303069	50 %	0 %	0 %	50 %	30248290
5027	NC_004757	TGG	2	6	303080	303085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248290
5028	NC_004757	CAC	2	6	303086	303091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30248290
5029	NC_004757	ATC	2	6	303096	303101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248290
5030	NC_004757	T	8	8	303336	303343	0 %	100 %	0 %	0 %	30248291
5031	NC_004757	GC	3	6	303482	303487	0 %	0 %	50 %	50 %	30248291
5032	NC_004757	GGA	2	6	304025	304030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	30248292
5033	NC_004757	GGAAT	2	10	304070	304079	40 %	20 %	40 %	0 %	30248292
5034	NC_004757	TTC	2	6	304106	304111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30248292
5035	NC_004757	TGT	2	6	304160	304165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30248292
5036	NC_004757	AGC	2	6	304174	304179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248292
5037	NC_004757	ATC	2	6	304192	304197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248292
5038	NC_004757	ACC	2	6	304262	304267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30248292
5039	NC_004757	TGC	2	6	304459	304464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248292
5040	NC_004757	AGT	2	6	304468	304473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248292
5041	NC_004757	GTT	2	6	304637	304642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30248293
5042	NC_004757	T	6	6	304641	304646	0 %	100 %	0 %	0 %	30248293
5043	NC_004757	GAT	2	6	304664	304669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248293
5044	NC_004757	ATTC	2	8	304694	304701	25 %	50 %	0 %	25 %	30248293
5045	NC_004757	ATCAC	2	10	304815	304824	40 %	20 %	0 %	40 %	30248293
5046	NC_004757	A	6	6	304916	304921	100 %	0 %	0 %	0 %	30248293
5047	NC_004757	GAT	2	6	305000	305005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248293
5048	NC_004757	GCA	2	6	305015	305020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248293
5049	NC_004757	GAA	2	6	305027	305032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30248293
5050	NC_004757	TAT	2	6	305056	305061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30248293
5051	NC_004757	GCA	2	6	305146	305151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248293
5052	NC_004757	GTG	2	6	305422	305427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248294
5053	NC_004757	ATCT	2	8	305544	305551	25 %	50 %	0 %	25 %	30248294
5054	NC_004757	ATC	2	6	305564	305569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248294
5055	NC_004757	GTC	2	6	305617	305622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248294
5056	NC_004757	GTAT	2	8	305672	305679	25 %	50 %	25 %	0 %	30248294
5057	NC_004757	CCAT	2	8	305692	305699	25 %	25 %	0 %	50 %	30248294
5058	NC_004757	GAA	2	6	305752	305757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30248294
5059	NC_004757	GTC	2	6	305830	305835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248294
5060	NC_004757	TTC	2	6	306090	306095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30248294
5061	NC_004757	AAT	2	6	306244	306249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30248295
5062	NC_004757	GGCC	2	8	306358	306365	0 %	0 %	50 %	50 %	30248295
5063	NC_004757	TGC	2	6	306393	306398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248295
5064	NC_004757	ATG	2	6	306612	306617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248295
5065	NC_004757	GAT	2	6	306643	306648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248295
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5068	NC_004757	GTC	2	6	306828	306833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248295
5069	NC_004757	CAA	2	6	306863	306868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30248295
5070	NC_004757	AGAT	2	8	306922	306929	50 %	25 %	25 %	0 %	30248295
5071	NC_004757	CAA	2	6	306983	306988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30248296
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5073	NC_004757	TCA	2	6	307053	307058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248296
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5077	NC_004757	TCA	2	6	307354	307359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248296
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5090	NC_004757	AGC	2	6	308710	308715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248297
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5092	NC_004757	CTG	2	6	308784	308789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248297
5093	NC_004757	GAAT	2	8	308977	308984	50 %	25 %	25 %	0 %	30248298
5094	NC_004757	TGC	2	6	309038	309043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248298
5095	NC_004757	CTGGA	2	10	309045	309054	20 %	20 %	40 %	20 %	30248298
5096	NC_004757	CGA	2	6	309161	309166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248298
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5099	NC_004757	ATGG	2	8	309315	309322	25 %	25 %	50 %	0 %	30248298
5100	NC_004757	GGCG	2	8	309437	309444	0 %	0 %	75 %	25 %	30248298
5101	NC_004757	GAT	2	6	309455	309460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248298
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5103	NC_004757	GATGC	2	10	309621	309630	20 %	20 %	40 %	20 %	30248298
5104	NC_004757	TGGC	2	8	309635	309642	0 %	25 %	50 %	25 %	30248298
5105	NC_004757	TGA	2	6	309653	309658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248298
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5107	NC_004757	GCA	2	6	309753	309758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248298
5108	NC_004757	TTCA	2	8	309804	309811	25 %	50 %	0 %	25 %	30248298
5109	NC_004757	TGA	2	6	309820	309825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248298
5110	NC_004757	AGA	2	6	309959	309964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30248298
5111	NC_004757	GC	3	6	309965	309970	0 %	0 %	50 %	50 %	30248298
5112	NC_004757	CGC	2	6	310027	310032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30248298
5113	NC_004757	GCG	2	6	310114	310119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248298
5114	NC_004757	GAA	2	6	310167	310172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30248298
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5117	NC_004757	AGG	2	6	310216	310221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	30248298
5118	NC_004757	GGCA	2	8	310230	310237	25 %	0 %	50 %	25 %	30248298
5119	NC_004757	GACA	2	8	310239	310246	50 %	0 %	25 %	25 %	30248298
5120	NC_004757	ATG	2	6	310372	310377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248298
5121	NC_004757	GCC	2	6	310378	310383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30248298
5122	NC_004757	ACGAT	2	10	310576	310585	40 %	20 %	20 %	20 %	30248298
5123	NC_004757	TGGCGC	2	12	310634	310645	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	30248298
5124	NC_004757	CA	3	6	310662	310667	50 %	0 %	0 %	50 %	30248298
5125	NC_004757	CGGC	2	8	310839	310846	0 %	0 %	50 %	50 %	30248299
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5130	NC_004757	CGACAT	2	12	311134	311145	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	30248299
5131	NC_004757	ATG	2	6	311181	311186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248299
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5151	NC_004757	GA	3	6	312388	312393	50 %	0 %	50 %	0 %	30248300
5152	NC_004757	GAT	2	6	312529	312534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248300
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5203	NC_004757	GAT	2	6	315733	315738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248305
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5242	NC_004757	GCA	2	6	320192	320197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248309
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5244	NC_004757	TCA	2	6	320213	320218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248309
5245	NC_004757	AAC	2	6	320242	320247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30248309
5246	NC_004757	ATC	2	6	320294	320299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248310
5247	NC_004757	GCA	2	6	320412	320417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248310
5248	NC_004757	CGC	2	6	320464	320469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30248310
5249	NC_004757	TGC	2	6	320491	320496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248310
5250	NC_004757	TGCC	2	8	320513	320520	0 %	25 %	25 %	50 %	30248310
5251	NC_004757	GGAT	2	8	320521	320528	25 %	25 %	50 %	0 %	30248310
5252	NC_004757	T	7	7	320886	320892	0 %	100 %	0 %	0 %	30248311
5253	NC_004757	CTG	2	6	320902	320907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248311
5254	NC_004757	TGGC	2	8	320914	320921	0 %	25 %	50 %	25 %	30248311
5255	NC_004757	GCC	2	6	320956	320961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30248311
5256	NC_004757	TGA	2	6	320973	320978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248311
5257	NC_004757	GAG	2	6	321067	321072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	30248311
5258	NC_004757	GAG	2	6	321076	321081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	30248311
5259	NC_004757	AGC	2	6	321140	321145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248311
5260	NC_004757	GCA	3	9	321153	321161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248311
5261	NC_004757	GCT	2	6	321171	321176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248311
5262	NC_004757	GCCA	2	8	321223	321230	25 %	0 %	25 %	50 %	30248311
5263	NC_004757	TGCG	2	8	321233	321240	0 %	25 %	50 %	25 %	30248311
5264	NC_004757	ATG	2	6	321404	321409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248311
5265	NC_004757	ACA	2	6	321446	321451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30248311
5266	NC_004757	GGC	2	6	321469	321474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248311
5267	NC_004757	GCTT	2	8	321522	321529	0 %	50 %	25 %	25 %	30248311
5268	NC_004757	GCAG	2	8	321535	321542	25 %	0 %	50 %	25 %	30248311
5269	NC_004757	GC	3	6	321546	321551	0 %	0 %	50 %	50 %	30248311
5270	NC_004757	GTG	2	6	321572	321577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248311
5271	NC_004757	AGGCCG	2	12	321656	321667	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	30248311
5272	NC_004757	TACC	2	8	321690	321697	25 %	25 %	0 %	50 %	30248311
5273	NC_004757	CAG	2	6	321703	321708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248311
5274	NC_004757	CG	3	6	321752	321757	0 %	0 %	50 %	50 %	30248311
5275	NC_004757	GTG	2	6	321772	321777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248311
5276	NC_004757	ATG	2	6	321910	321915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248311
5277	NC_004757	GTT	2	6	321970	321975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30248311
5278	NC_004757	CGA	2	6	322002	322007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248311
5279	NC_004757	GCA	2	6	322019	322024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248311
5280	NC_004757	TGC	2	6	322067	322072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248311
5281	NC_004757	TCA	2	6	322121	322126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248311
5282	NC_004757	CGGTG	2	10	322173	322182	0 %	20 %	60 %	20 %	30248311
5283	NC_004757	TCA	2	6	322193	322198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248311
5284	NC_004757	GCT	2	6	322269	322274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248311
5285	NC_004757	TGC	2	6	322286	322291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248311
5286	NC_004757	TGG	2	6	322303	322308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248311
5287	NC_004757	CG	3	6	322318	322323	0 %	0 %	50 %	50 %	30248311
5288	NC_004757	TGGC	2	8	322397	322404	0 %	25 %	50 %	25 %	30248311
5289	NC_004757	CTG	2	6	322528	322533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248311
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5291	NC_004757	CTG	2	6	322609	322614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248311
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5295	NC_004757	CGCTGC	2	12	322703	322714	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	30248311
5296	NC_004757	CATC	2	8	322719	322726	25 %	25 %	0 %	50 %	30248311
5297	NC_004757	CTT	2	6	322955	322960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30248312
5298	NC_004757	TCA	2	6	322969	322974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248312
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5300	NC_004757	ACT	2	6	323039	323044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248312
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5302	NC_004757	AGAA	2	8	323057	323064	75 %	0 %	25 %	0 %	30248312
5303	NC_004757	TGT	2	6	323094	323099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30248312
5304	NC_004757	CTT	2	6	323265	323270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30248312
5305	NC_004757	AAG	2	6	323342	323347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30248312
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5307	NC_004757	ATCGAG	2	12	323366	323377	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	30248312
5308	NC_004757	AGC	2	6	323406	323411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248312
5309	NC_004757	ATG	2	6	323412	323417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248312
5310	NC_004757	TGA	2	6	323464	323469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248312
5311	NC_004757	GT	3	6	323594	323599	0 %	50 %	50 %	0 %	30248312
5312	NC_004757	A	8	8	323615	323622	100 %	0 %	0 %	0 %	30248312
5313	NC_004757	GCA	3	9	323647	323655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248312
5314	NC_004757	CTG	2	6	323680	323685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248313
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5317	NC_004757	GC	3	6	323941	323946	0 %	0 %	50 %	50 %	30248313
5318	NC_004757	ACC	2	6	324054	324059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30248313
5319	NC_004757	GC	3	6	324109	324114	0 %	0 %	50 %	50 %	30248313
5320	NC_004757	CAG	2	6	324115	324120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248313
5321	NC_004757	GCA	2	6	324172	324177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248313
5322	NC_004757	ATG	2	6	324347	324352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248313
5323	NC_004757	AGG	2	6	324389	324394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	30248313
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5325	NC_004757	GAT	2	6	324427	324432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248313
5326	NC_004757	CGG	2	6	324530	324535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248313
5327	NC_004757	GTC	2	6	324634	324639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248313
5328	NC_004757	CAT	2	6	324654	324659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248313
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5330	NC_004757	GCT	2	6	324768	324773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248313
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5332	NC_004757	GGC	2	6	324822	324827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248313
5333	NC_004757	CTG	2	6	324847	324852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248313
5334	NC_004757	TCA	2	6	324869	324874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248313
5335	NC_004757	ATGACG	2	12	324931	324942	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	30248313
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5339	NC_004757	CTG	3	9	325114	325122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248313
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5346	NC_004757	CTG	2	6	325523	325528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248314
5347	NC_004757	TCA	2	6	325756	325761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248314
5348	NC_004757	TGA	2	6	325788	325793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248314
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5350	NC_004757	GAA	2	6	326075	326080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30248314
5351	NC_004757	CTG	2	6	326085	326090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248314
5352	NC_004757	GCA	2	6	326093	326098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248314
5353	NC_004757	ATT	2	6	326122	326127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30248314
5354	NC_004757	GCC	2	6	326334	326339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30248315
5355	NC_004757	GCGCT	2	10	326454	326463	0 %	20 %	40 %	40 %	30248315
5356	NC_004757	GC	3	6	326520	326525	0 %	0 %	50 %	50 %	30248315
5357	NC_004757	CAG	2	6	326606	326611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248315
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5359	NC_004757	TTC	2	6	326771	326776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30248315
5360	NC_004757	TAGGAT	2	12	326782	326793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248315
5361	NC_004757	ACG	2	6	326814	326819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248315
5362	NC_004757	GCA	3	9	326830	326838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248315
5363	NC_004757	AGA	2	6	326842	326847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30248315
5364	NC_004757	GGT	2	6	326915	326920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248315
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5366	NC_004757	CAT	2	6	326966	326971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248315
5367	NC_004757	TCC	2	6	326991	326996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	30248315
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5383	NC_004757	GAG	2	6	327772	327777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	30248315
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5395	NC_004757	GTC	2	6	328157	328162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248315
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5472	NC_004757	ATG	2	6	332281	332286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248320
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5478	NC_004757	TGG	2	6	332628	332633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248321
5479	NC_004757	CGTT	2	8	332651	332658	0 %	50 %	25 %	25 %	30248321
5480	NC_004757	AGC	2	6	332662	332667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248321
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5482	NC_004757	GGC	2	6	332725	332730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248321
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5484	NC_004757	ACCGTC	2	12	332771	332782	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	30248321
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5486	NC_004757	GCG	2	6	332885	332890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248321
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