MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120alpha

Total Repeats: 387

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003276	TA	3	6	1382	1387	50 %	50 %	0 %	0 %	17233019
2	NC_003276	TC	3	6	1562	1567	0 %	50 %	0 %	50 %	17233019
3	NC_003276	TC	3	6	1633	1638	0 %	50 %	0 %	50 %	17233019
4	NC_003276	CT	3	6	1747	1752	0 %	50 %	0 %	50 %	17233020
5	NC_003276	GA	3	6	1941	1946	50 %	0 %	50 %	0 %	17233020
6	NC_003276	AT	3	6	2572	2577	50 %	50 %	0 %	0 %	17233021
7	NC_003276	GT	3	6	2947	2952	0 %	50 %	50 %	0 %	17233021
8	NC_003276	TA	3	6	3043	3048	50 %	50 %	0 %	0 %	17233021
9	NC_003276	GA	3	6	3991	3996	50 %	0 %	50 %	0 %	17233023
10	NC_003276	AT	3	6	5634	5639	50 %	50 %	0 %	0 %	17233025
11	NC_003276	GA	3	6	8316	8321	50 %	0 %	50 %	0 %	17233028
12	NC_003276	CA	3	6	8968	8973	50 %	0 %	0 %	50 %	17233028
13	NC_003276	GA	3	6	12412	12417	50 %	0 %	50 %	0 %	17233031
14	NC_003276	TA	3	6	14402	14407	50 %	50 %	0 %	0 %	17233033
15	NC_003276	AG	3	6	14804	14809	50 %	0 %	50 %	0 %	17233035
16	NC_003276	AT	3	6	15769	15774	50 %	50 %	0 %	0 %	17233036
17	NC_003276	TA	4	8	15950	15957	50 %	50 %	0 %	0 %	17233036
18	NC_003276	AT	5	10	16353	16362	50 %	50 %	0 %	0 %	17233037
19	NC_003276	TG	3	6	17938	17943	0 %	50 %	50 %	0 %	17233039
20	NC_003276	GA	3	6	17970	17975	50 %	0 %	50 %	0 %	17233039
21	NC_003276	TA	3	6	19137	19142	50 %	50 %	0 %	0 %	17233040
22	NC_003276	GA	3	6	20185	20190	50 %	0 %	50 %	0 %	17233040
23	NC_003276	TA	3	6	22047	22052	50 %	50 %	0 %	0 %	17233042
24	NC_003276	TC	3	6	22355	22360	0 %	50 %	0 %	50 %	17233042
25	NC_003276	TC	3	6	22971	22976	0 %	50 %	0 %	50 %	17233042
26	NC_003276	TG	3	6	25058	25063	0 %	50 %	50 %	0 %	17233043
27	NC_003276	CA	3	6	26467	26472	50 %	0 %	0 %	50 %	17233044
28	NC_003276	GT	3	6	27319	27324	0 %	50 %	50 %	0 %	17233045
29	NC_003276	TA	3	6	35259	35264	50 %	50 %	0 %	0 %	17233054
30	NC_003276	AT	3	6	35785	35790	50 %	50 %	0 %	0 %	17233055
31	NC_003276	TG	3	6	38416	38421	0 %	50 %	50 %	0 %	17233061
32	NC_003276	TC	3	6	38636	38641	0 %	50 %	0 %	50 %	17233062
33	NC_003276	AT	4	8	39082	39089	50 %	50 %	0 %	0 %	17233062
34	NC_003276	CT	3	6	39315	39320	0 %	50 %	0 %	50 %	17233062
35	NC_003276	AG	4	8	39851	39858	50 %	0 %	50 %	0 %	17233062
36	NC_003276	CT	3	6	40354	40359	0 %	50 %	0 %	50 %	17233063
37	NC_003276	AT	3	6	40649	40654	50 %	50 %	0 %	0 %	17233064
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39	NC_003276	AT	3	6	41654	41659	50 %	50 %	0 %	0 %	17233065
40	NC_003276	AG	3	6	41676	41681	50 %	0 %	50 %	0 %	17233065
41	NC_003276	AG	3	6	44537	44542	50 %	0 %	50 %	0 %	17233070
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43	NC_003276	GA	3	6	46564	46569	50 %	0 %	50 %	0 %	17233074
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50	NC_003276	GT	4	8	56348	56355	0 %	50 %	50 %	0 %	17233087
51	NC_003276	TG	3	6	56560	56565	0 %	50 %	50 %	0 %	17233087
52	NC_003276	AG	3	6	58553	58558	50 %	0 %	50 %	0 %	17233088
53	NC_003276	AT	3	6	58943	58948	50 %	50 %	0 %	0 %	17233088
54	NC_003276	TC	3	6	59779	59784	0 %	50 %	0 %	50 %	17233088
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63	NC_003276	AG	3	6	74844	74849	50 %	0 %	50 %	0 %	17233103
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70	NC_003276	AT	3	6	81272	81277	50 %	50 %	0 %	0 %	17233107
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121	NC_003276	AC	3	6	127593	127598	50 %	0 %	0 %	50 %	17233145
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125	NC_003276	TA	3	6	130022	130027	50 %	50 %	0 %	0 %	17233146
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.