MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120alpha

Total Repeats: 6858

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_003276	ATTG	2	8	177888	177895	25 %	50 %	25 %	0 %	17233194
3002	NC_003276	AAC	2	6	177908	177913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233194
3003	NC_003276	TAA	3	9	177950	177958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233194
3004	NC_003276	CTA	2	6	177961	177966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233194
3005	NC_003276	TGA	2	6	177980	177985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233194
3006	NC_003276	TAA	2	6	177986	177991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233194
3007	NC_003276	ATA	2	6	178039	178044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233194
3008	NC_003276	AAAG	2	8	178143	178150	75 %	0 %	25 %	0 %	17233194
3009	NC_003276	GT	3	6	178175	178180	0 %	50 %	50 %	0 %	17233194
3010	NC_003276	CGTT	2	8	178184	178191	0 %	50 %	25 %	25 %	17233194
3011	NC_003276	GTAT	2	8	178224	178231	25 %	50 %	25 %	0 %	17233194
3012	NC_003276	TA	3	6	178271	178276	50 %	50 %	0 %	0 %	17233194
3013	NC_003276	CCAAA	2	10	178288	178297	60 %	0 %	0 %	40 %	17233194
3014	NC_003276	CTT	2	6	178324	178329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233194
3015	NC_003276	T	6	6	178346	178351	0 %	100 %	0 %	0 %	17233194
3016	NC_003276	CTA	2	6	178402	178407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233194
3017	NC_003276	ATT	2	6	178436	178441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233194
3018	NC_003276	ATTC	2	8	178444	178451	25 %	50 %	0 %	25 %	17233194
3019	NC_003276	AAG	2	6	178826	178831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233195
3020	NC_003276	GAC	2	6	178859	178864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233195
3021	NC_003276	ACG	2	6	179226	179231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233195
3022	NC_003276	A	6	6	179244	179249	100 %	0 %	0 %	0 %	17233195
3023	NC_003276	TGATT	2	10	179267	179276	20 %	60 %	20 %	0 %	17233195
3024	NC_003276	TTGC	2	8	179342	179349	0 %	50 %	25 %	25 %	17233195
3025	NC_003276	CCA	2	6	179355	179360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233195
3026	NC_003276	T	6	6	179478	179483	0 %	100 %	0 %	0 %	17233195
3027	NC_003276	ATC	2	6	179518	179523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233195
3028	NC_003276	TTGA	2	8	179556	179563	25 %	50 %	25 %	0 %	17233195
3029	NC_003276	GTT	2	6	179605	179610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233195
3030	NC_003276	CAAG	2	8	180079	180086	50 %	0 %	25 %	25 %	17233196
3031	NC_003276	AGA	2	6	180185	180190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233196
3032	NC_003276	TGT	2	6	180193	180198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233196
3033	NC_003276	TCA	2	6	180542	180547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233197
3034	NC_003276	GTT	2	6	180614	180619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233197
3035	NC_003276	GCA	2	6	180857	180862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233198
3036	NC_003276	TTC	2	6	180900	180905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233198
3037	NC_003276	AAT	2	6	181002	181007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233198
3038	NC_003276	TCT	2	6	181018	181023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233198
3039	NC_003276	AAT	2	6	181046	181051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233198
3040	NC_003276	CCA	2	6	181112	181117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233198
3041	NC_003276	TGA	2	6	181130	181135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233198
3042	NC_003276	TAA	2	6	181147	181152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233198
3043	NC_003276	AGC	2	6	181156	181161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233198
3044	NC_003276	TAC	2	6	181189	181194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233198
3045	NC_003276	TTG	2	6	181207	181212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233198
3046	NC_003276	A	6	6	181408	181413	100 %	0 %	0 %	0 %	17233199
3047	NC_003276	GAC	2	6	181481	181486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233199
3048	NC_003276	TGT	2	6	181530	181535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233199
3049	NC_003276	ATC	2	6	181551	181556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233199
3050	NC_003276	TCT	2	6	181561	181566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233199
3051	NC_003276	TCT	2	6	181606	181611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233199
3052	NC_003276	TTG	2	6	181708	181713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233199
3053	NC_003276	TTA	2	6	181946	181951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233200
3054	NC_003276	GAA	2	6	181976	181981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233200
3055	NC_003276	T	6	6	182014	182019	0 %	100 %	0 %	0 %	17233200
3056	NC_003276	AATT	2	8	182163	182170	50 %	50 %	0 %	0 %	17233200
3057	NC_003276	GTA	2	6	182186	182191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233200
3058	NC_003276	TGA	2	6	182248	182253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233200
3059	NC_003276	CTA	2	6	182322	182327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233200
3060	NC_003276	AAT	2	6	182350	182355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233200
3061	NC_003276	GA	3	6	182442	182447	50 %	0 %	50 %	0 %	17233200
3062	NC_003276	CTA	2	6	182733	182738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233201
3063	NC_003276	GCA	2	6	182939	182944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233201
3064	NC_003276	TAG	2	6	182945	182950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233201
3065	NC_003276	CCA	2	6	182987	182992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233201
3066	NC_003276	T	6	6	183027	183032	0 %	100 %	0 %	0 %	17233201
3067	NC_003276	CTGG	2	8	183041	183048	0 %	25 %	50 %	25 %	17233201
3068	NC_003276	GAA	2	6	183049	183054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233201
3069	NC_003276	TAA	2	6	183097	183102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233201
3070	NC_003276	T	6	6	183139	183144	0 %	100 %	0 %	0 %	17233201
3071	NC_003276	ACGC	2	8	183215	183222	25 %	0 %	25 %	50 %	17233201
3072	NC_003276	AT	3	6	183242	183247	50 %	50 %	0 %	0 %	17233201
3073	NC_003276	TCC	2	6	183307	183312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17233201
3074	NC_003276	TC	3	6	183323	183328	0 %	50 %	0 %	50 %	17233201
3075	NC_003276	ATTG	2	8	183382	183389	25 %	50 %	25 %	0 %	17233201
3076	NC_003276	TGA	2	6	183420	183425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233201
3077	NC_003276	TGTTAT	2	12	183482	183493	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	17233201
3078	NC_003276	TCA	2	6	183532	183537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233201
3079	NC_003276	TAAC	2	8	183539	183546	50 %	25 %	0 %	25 %	17233201
3080	NC_003276	GAT	2	6	183571	183576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233201
3081	NC_003276	GCT	2	6	183605	183610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233201
3082	NC_003276	TCT	2	6	183625	183630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233201
3083	NC_003276	GGT	2	6	183708	183713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233201
3084	NC_003276	GCA	2	6	183949	183954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233201
3085	NC_003276	ACC	2	6	183955	183960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233201
3086	NC_003276	TG	3	6	184051	184056	0 %	50 %	50 %	0 %	17233201
3087	NC_003276	TAA	2	6	184090	184095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233201
3088	NC_003276	GCG	2	6	184130	184135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233201
3089	NC_003276	CAATC	2	10	184410	184419	40 %	20 %	0 %	40 %	17233202
3090	NC_003276	TAT	2	6	184423	184428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233202
3091	NC_003276	CTGA	2	8	184543	184550	25 %	25 %	25 %	25 %	17233202
3092	NC_003276	AAC	2	6	184633	184638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233202
3093	NC_003276	GAT	2	6	184663	184668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233202
3094	NC_003276	TGG	2	6	184948	184953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233203
3095	NC_003276	GAG	2	6	184999	185004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17233203
3096	NC_003276	CTT	2	6	185115	185120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233203
3097	NC_003276	GCA	2	6	185159	185164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233203
3098	NC_003276	TGAT	2	8	185241	185248	25 %	50 %	25 %	0 %	17233203
3099	NC_003276	AAT	2	6	185252	185257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233203
3100	NC_003276	TGCT	2	8	185260	185267	0 %	50 %	25 %	25 %	17233203
3101	NC_003276	TGG	2	6	185334	185339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233203
3102	NC_003276	GCA	2	6	185360	185365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233203
3103	NC_003276	GGTA	2	8	185380	185387	25 %	25 %	50 %	0 %	17233203
3104	NC_003276	AAT	2	6	185426	185431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233203
3105	NC_003276	CGC	2	6	185489	185494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233203
3106	NC_003276	T	6	6	185502	185507	0 %	100 %	0 %	0 %	17233203
3107	NC_003276	GGC	2	6	185554	185559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233203
3108	NC_003276	CCAG	2	8	185574	185581	25 %	0 %	25 %	50 %	17233203
3109	NC_003276	ATCT	2	8	185608	185615	25 %	50 %	0 %	25 %	17233203
3110	NC_003276	ATC	2	6	185621	185626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233203
3111	NC_003276	TTA	2	6	185663	185668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233203
3112	NC_003276	CGCA	2	8	185707	185714	25 %	0 %	25 %	50 %	17233203
3113	NC_003276	CATT	2	8	185786	185793	25 %	50 %	0 %	25 %	17233203
3114	NC_003276	ATC	2	6	185815	185820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233203
3115	NC_003276	CTGG	2	8	185877	185884	0 %	25 %	50 %	25 %	17233203
3116	NC_003276	GCG	2	6	185903	185908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233203
3117	NC_003276	CAAC	2	8	185914	185921	50 %	0 %	0 %	50 %	17233203
3118	NC_003276	GGAA	2	8	185931	185938	50 %	0 %	50 %	0 %	17233203
3119	NC_003276	TGC	2	6	185966	185971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233203
3120	NC_003276	GCA	2	6	186003	186008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233203
3121	NC_003276	TTAAT	2	10	186018	186027	40 %	60 %	0 %	0 %	17233203
3122	NC_003276	GTT	2	6	186033	186038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233203
3123	NC_003276	TTGCT	2	10	186085	186094	0 %	60 %	20 %	20 %	17233203
3124	NC_003276	GTAG	2	8	186118	186125	25 %	25 %	50 %	0 %	17233203
3125	NC_003276	CCG	2	6	186321	186326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233203
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3375	NC_003276	TAC	2	6	202303	202308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233212
3376	NC_003276	TGC	2	6	202340	202345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233212
3377	NC_003276	CCG	2	6	202402	202407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233212
3378	NC_003276	AGC	2	6	202437	202442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233212
3379	NC_003276	CTT	2	6	202479	202484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233212
3380	NC_003276	CAT	2	6	202523	202528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233212
3381	NC_003276	ATT	2	6	202545	202550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233212
3382	NC_003276	CAC	3	9	202556	202564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233212
3383	NC_003276	AACA	2	8	202565	202572	75 %	0 %	0 %	25 %	17233212
3384	NC_003276	ACC	2	6	202731	202736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233212
3385	NC_003276	GTT	2	6	202738	202743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233212
3386	NC_003276	CTG	2	6	202762	202767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233212
3387	NC_003276	TGCT	2	8	202772	202779	0 %	50 %	25 %	25 %	17233212
3388	NC_003276	GCTC	2	8	202804	202811	0 %	25 %	25 %	50 %	17233212
3389	NC_003276	GTA	2	6	202823	202828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233212
3390	NC_003276	GAT	2	6	202833	202838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233212
3391	NC_003276	TTC	2	6	202847	202852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233212
3392	NC_003276	GGC	2	6	202938	202943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233212
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3397	NC_003276	GCT	2	6	203135	203140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233212
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3403	NC_003276	AGTCA	2	10	203321	203330	40 %	20 %	20 %	20 %	17233212
3404	NC_003276	ATC	2	6	203342	203347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233212
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3406	NC_003276	CCA	2	6	203475	203480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233212
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3413	NC_003276	GTA	2	6	204304	204309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233213
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3433	NC_003276	TTC	2	6	205289	205294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233214
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3441	NC_003276	CCCA	2	8	206939	206946	25 %	0 %	0 %	75 %	17233215
3442	NC_003276	A	7	7	206946	206952	100 %	0 %	0 %	0 %	17233215
3443	NC_003276	CCAA	2	8	207113	207120	50 %	0 %	0 %	50 %	17233215
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3448	NC_003276	A	6	6	207315	207320	100 %	0 %	0 %	0 %	17233215
3449	NC_003276	TAC	2	6	207341	207346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233215
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3451	NC_003276	TGA	2	6	207457	207462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233215
3452	NC_003276	CGA	2	6	207578	207583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233215
3453	NC_003276	GAT	2	6	207653	207658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233215
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3455	NC_003276	GAA	2	6	207705	207710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233215
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3459	NC_003276	TACCC	2	10	207940	207949	20 %	20 %	0 %	60 %	17233215
3460	NC_003276	TTACC	2	10	207985	207994	20 %	40 %	0 %	40 %	17233215
3461	NC_003276	TTG	2	6	208177	208182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233215
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3464	NC_003276	GAC	2	6	208328	208333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233215
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3467	NC_003276	ACA	2	6	208516	208521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233215
3468	NC_003276	TGA	2	6	208652	208657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233216
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3470	NC_003276	CT	3	6	208683	208688	0 %	50 %	0 %	50 %	17233216
3471	NC_003276	AAGA	2	8	208733	208740	75 %	0 %	25 %	0 %	17233216
3472	NC_003276	AACAT	2	10	208778	208787	60 %	20 %	0 %	20 %	17233216
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3475	NC_003276	T	6	6	209010	209015	0 %	100 %	0 %	0 %	17233216
3476	NC_003276	CAA	2	6	209152	209157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233216
3477	NC_003276	GCA	2	6	209424	209429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233216
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3479	NC_003276	AATC	2	8	209661	209668	50 %	25 %	0 %	25 %	17233216
3480	NC_003276	TGA	2	6	209685	209690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233216
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3483	NC_003276	CA	3	6	209988	209993	50 %	0 %	0 %	50 %	17233216
3484	NC_003276	GCC	2	6	210034	210039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233216
3485	NC_003276	TA	4	8	210237	210244	50 %	50 %	0 %	0 %	17233216
3486	NC_003276	TGC	2	6	210317	210322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233217
3487	NC_003276	ATCA	2	8	210362	210369	50 %	25 %	0 %	25 %	17233217
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3490	NC_003276	AAC	2	6	210444	210449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233217
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3492	NC_003276	GGT	2	6	210641	210646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233217
3493	NC_003276	GCG	2	6	210811	210816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233217
3494	NC_003276	AAGT	2	8	210827	210834	50 %	25 %	25 %	0 %	17233217
3495	NC_003276	GTG	2	6	210869	210874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233218
3496	NC_003276	GCTT	2	8	210923	210930	0 %	50 %	25 %	25 %	17233218
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3498	NC_003276	A	6	6	210967	210972	100 %	0 %	0 %	0 %	17233218
3499	NC_003276	AG	3	6	211015	211020	50 %	0 %	50 %	0 %	17233218
3500	NC_003276	CAA	2	6	211024	211029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233218

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