MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120alpha

Total Repeats: 6858

< Previous1234567891011121314Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_003276	CAT	2	6	121421	121426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233144
2002	NC_003276	CCAG	2	8	121431	121438	25 %	0 %	25 %	50 %	17233144
2003	NC_003276	CAC	3	9	121460	121468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233144
2004	NC_003276	TAA	2	6	121469	121474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233144
2005	NC_003276	CCA	2	6	121489	121494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233144
2006	NC_003276	ATT	2	6	121503	121508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233144
2007	NC_003276	TCA	2	6	121513	121518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233144
2008	NC_003276	CAA	2	6	121547	121552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233144
2009	NC_003276	CAT	2	6	121574	121579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233144
2010	NC_003276	CAC	2	6	121667	121672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233144
2011	NC_003276	CTGCAC	2	12	121685	121696	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	17233144
2012	NC_003276	ATC	2	6	121710	121715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233144
2013	NC_003276	CAT	2	6	121718	121723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233144
2014	NC_003276	ATC	2	6	121737	121742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233144
2015	NC_003276	CAC	2	6	121748	121753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233144
2016	NC_003276	TCT	2	6	121819	121824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233144
2017	NC_003276	CGG	2	6	121844	121849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233144
2018	NC_003276	T	6	6	121885	121890	0 %	100 %	0 %	0 %	17233144
2019	NC_003276	TCT	2	6	122002	122007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233144
2020	NC_003276	GCA	2	6	122029	122034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233144
2021	NC_003276	CCA	2	6	122062	122067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233144
2022	NC_003276	GAG	3	9	122093	122101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17233144
2023	NC_003276	TAA	2	6	122127	122132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233144
2024	NC_003276	AAC	2	6	122160	122165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233144
2025	NC_003276	GAG	2	6	122244	122249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17233144
2026	NC_003276	AAT	2	6	122322	122327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233144
2027	NC_003276	CCAGCC	2	12	122335	122346	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	17233144
2028	NC_003276	TGC	3	9	122349	122357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233144
2029	NC_003276	CTG	3	9	122369	122377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233144
2030	NC_003276	ATC	2	6	122418	122423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233144
2031	NC_003276	ATAA	2	8	122553	122560	75 %	25 %	0 %	0 %	17233144
2032	NC_003276	A	6	6	122565	122570	100 %	0 %	0 %	0 %	17233144
2033	NC_003276	AAGCAG	2	12	122759	122770	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	17233144
2034	NC_003276	ATT	2	6	122808	122813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233144
2035	NC_003276	CAA	2	6	122882	122887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233144
2036	NC_003276	ATC	2	6	122931	122936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233144
2037	NC_003276	TA	3	6	122937	122942	50 %	50 %	0 %	0 %	17233144
2038	NC_003276	CTG	2	6	122945	122950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233144
2039	NC_003276	AGT	2	6	123000	123005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233144
2040	NC_003276	TTA	2	6	123022	123027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233144
2041	NC_003276	A	6	6	123082	123087	100 %	0 %	0 %	0 %	17233144
2042	NC_003276	TTA	2	6	123109	123114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233144
2043	NC_003276	AGA	2	6	123225	123230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233144
2044	NC_003276	TTA	2	6	123232	123237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233144
2045	NC_003276	AG	3	6	123402	123407	50 %	0 %	50 %	0 %	17233144
2046	NC_003276	AAG	2	6	123449	123454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233144
2047	NC_003276	TCA	2	6	123481	123486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233144
2048	NC_003276	AAAAT	2	10	123495	123504	80 %	20 %	0 %	0 %	17233144
2049	NC_003276	TTTGT	2	10	123508	123517	0 %	80 %	20 %	0 %	17233144
2050	NC_003276	TG	3	6	123553	123558	0 %	50 %	50 %	0 %	17233144
2051	NC_003276	TAA	2	6	123620	123625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233144
2052	NC_003276	GCT	2	6	123634	123639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233144
2053	NC_003276	CTG	2	6	123671	123676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233144
2054	NC_003276	CCA	2	6	123742	123747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233144
2055	NC_003276	TGCT	2	8	123768	123775	0 %	50 %	25 %	25 %	17233144
2056	NC_003276	TTG	2	6	123779	123784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233144
2057	NC_003276	AGA	2	6	123813	123818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233144
2058	NC_003276	GTT	2	6	123826	123831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233144
2059	NC_003276	TTG	2	6	123838	123843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233144
2060	NC_003276	ACT	2	6	123900	123905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233144
2061	NC_003276	ATA	2	6	123944	123949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233144
2062	NC_003276	ATT	2	6	123981	123986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233144
2063	NC_003276	GTT	2	6	124091	124096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233144
2064	NC_003276	A	6	6	124115	124120	100 %	0 %	0 %	0 %	17233144
2065	NC_003276	TACT	2	8	124225	124232	25 %	50 %	0 %	25 %	17233144
2066	NC_003276	GTA	2	6	124270	124275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233144
2067	NC_003276	CTG	2	6	124301	124306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233144
2068	NC_003276	CTCAAC	2	12	124371	124382	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	17233144
2069	NC_003276	TTG	2	6	124528	124533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233144
2070	NC_003276	GAA	2	6	124777	124782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233145
2071	NC_003276	ATT	2	6	124803	124808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233145
2072	NC_003276	GGGCA	2	10	124859	124868	20 %	0 %	60 %	20 %	17233145
2073	NC_003276	A	6	6	124977	124982	100 %	0 %	0 %	0 %	17233145
2074	NC_003276	GCT	2	6	125008	125013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233145
2075	NC_003276	ATCC	2	8	125030	125037	25 %	25 %	0 %	50 %	17233145
2076	NC_003276	GCT	2	6	125175	125180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233145
2077	NC_003276	CTT	2	6	125282	125287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233145
2078	NC_003276	CAA	2	6	125329	125334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233145
2079	NC_003276	ACA	2	6	125338	125343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233145
2080	NC_003276	GCT	2	6	125402	125407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233145
2081	NC_003276	TGT	2	6	125495	125500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233145
2082	NC_003276	GCC	2	6	125569	125574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233145
2083	NC_003276	GGT	2	6	125707	125712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233145
2084	NC_003276	GCT	2	6	125734	125739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233145
2085	NC_003276	TCT	2	6	125820	125825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233145
2086	NC_003276	AAC	3	9	125858	125866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233145
2087	NC_003276	AG	3	6	125890	125895	50 %	0 %	50 %	0 %	17233145
2088	NC_003276	CA	3	6	126015	126020	50 %	0 %	0 %	50 %	17233145
2089	NC_003276	ACAG	2	8	126046	126053	50 %	0 %	25 %	25 %	17233145
2090	NC_003276	AAT	2	6	126078	126083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233145
2091	NC_003276	CAC	2	6	126092	126097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233145
2092	NC_003276	TCA	2	6	126216	126221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233145
2093	NC_003276	GATT	2	8	126242	126249	25 %	50 %	25 %	0 %	17233145
2094	NC_003276	AAAGT	2	10	126260	126269	60 %	20 %	20 %	0 %	17233145
2095	NC_003276	TGG	2	6	126288	126293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233145
2096	NC_003276	TTA	2	6	126301	126306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233145
2097	NC_003276	TTA	2	6	126310	126315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233145
2098	NC_003276	ACAA	2	8	126414	126421	75 %	0 %	0 %	25 %	17233145
2099	NC_003276	TGC	2	6	126441	126446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233145
2100	NC_003276	TGG	2	6	126453	126458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233145
2101	NC_003276	GATG	2	8	126484	126491	25 %	25 %	50 %	0 %	17233145
2102	NC_003276	TAAT	2	8	126521	126528	50 %	50 %	0 %	0 %	17233145
2103	NC_003276	ATA	2	6	126575	126580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233145
2104	NC_003276	ACT	2	6	126667	126672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233145
2105	NC_003276	AC	3	6	126699	126704	50 %	0 %	0 %	50 %	17233145
2106	NC_003276	CTG	2	6	126745	126750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233145
2107	NC_003276	TAG	2	6	126753	126758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233145
2108	NC_003276	ATG	2	6	126827	126832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233145
2109	NC_003276	ATAC	2	8	127042	127049	50 %	25 %	0 %	25 %	17233145
2110	NC_003276	GT	3	6	127056	127061	0 %	50 %	50 %	0 %	17233145
2111	NC_003276	AC	3	6	127077	127082	50 %	0 %	0 %	50 %	17233145
2112	NC_003276	GTT	2	6	127087	127092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233145
2113	NC_003276	ATTT	2	8	127247	127254	25 %	75 %	0 %	0 %	17233145
2114	NC_003276	GTG	3	9	127259	127267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233145
2115	NC_003276	TAC	2	6	127472	127477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233145
2116	NC_003276	TTGC	2	8	127528	127535	0 %	50 %	25 %	25 %	17233145
2117	NC_003276	AC	3	6	127593	127598	50 %	0 %	0 %	50 %	17233145
2118	NC_003276	CATGGT	2	12	127603	127614	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	17233145
2119	NC_003276	TGA	2	6	127644	127649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233145
2120	NC_003276	TCT	2	6	127702	127707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233145
2121	NC_003276	CT	3	6	127781	127786	0 %	50 %	0 %	50 %	17233145
2122	NC_003276	AGT	2	6	127789	127794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233145
2123	NC_003276	TGG	2	6	127917	127922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233145
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2246	NC_003276	ATC	2	6	132834	132839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233146
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2374	NC_003276	CAG	2	6	138724	138729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233149
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2376	NC_003276	ATC	2	6	138743	138748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233149
2377	NC_003276	AAC	2	6	138752	138757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233149
2378	NC_003276	TGC	2	6	138771	138776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233149
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2479	NC_003276	TGAC	2	8	145435	145442	25 %	25 %	25 %	25 %	17233155
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2482	NC_003276	TAC	2	6	146088	146093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233156
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2487	NC_003276	CCA	2	6	146341	146346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233157
2488	NC_003276	CTAT	2	8	146355	146362	25 %	50 %	0 %	25 %	17233157
2489	NC_003276	A	6	6	146367	146372	100 %	0 %	0 %	0 %	17233157
2490	NC_003276	GTG	2	6	146384	146389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233157
2491	NC_003276	GAAA	2	8	146421	146428	75 %	0 %	25 %	0 %	17233157
2492	NC_003276	A	6	6	146426	146431	100 %	0 %	0 %	0 %	17233157
2493	NC_003276	CAT	2	6	146553	146558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233157
2494	NC_003276	GCA	2	6	146602	146607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233157
2495	NC_003276	ATT	2	6	146638	146643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233157
2496	NC_003276	GCT	2	6	146644	146649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233157
2497	NC_003276	ATG	2	6	146687	146692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233157
2498	NC_003276	CAA	2	6	146696	146701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233157
2499	NC_003276	TCAA	2	8	146763	146770	50 %	25 %	0 %	25 %	17233157
2500	NC_003276	GTAA	2	8	146932	146939	50 %	25 %	25 %	0 %	17233157

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