MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120alpha

Total Repeats: 6858

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003276	TCATT	2	10	28789	28798	20 %	60 %	0 %	20 %	17233046
502	NC_003276	AGT	2	6	29012	29017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233046
503	NC_003276	TGA	2	6	29059	29064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233046
504	NC_003276	ATA	2	6	29067	29072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233046
505	NC_003276	TCT	2	6	29130	29135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233046
506	NC_003276	TTG	2	6	29185	29190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233046
507	NC_003276	GCT	2	6	29232	29237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233046
508	NC_003276	TTCA	2	8	29240	29247	25 %	50 %	0 %	25 %	17233046
509	NC_003276	TGA	2	6	29266	29271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233046
510	NC_003276	GAC	2	6	29288	29293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233046
511	NC_003276	GCT	2	6	29345	29350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233046
512	NC_003276	TCA	2	6	29352	29357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233046
513	NC_003276	TGA	3	9	29404	29412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233046
514	NC_003276	GAA	2	6	29444	29449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233046
515	NC_003276	ACC	2	6	29487	29492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233046
516	NC_003276	TCG	2	6	29595	29600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233046
517	NC_003276	CGC	2	6	29689	29694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233046
518	NC_003276	CAG	2	6	29720	29725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233046
519	NC_003276	TCT	2	6	29795	29800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233046
520	NC_003276	ATA	2	6	29802	29807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233046
521	NC_003276	AAGCC	2	10	29842	29851	40 %	0 %	20 %	40 %	17233046
522	NC_003276	AACCA	2	10	29852	29861	60 %	0 %	0 %	40 %	17233046
523	NC_003276	GAA	2	6	29951	29956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233046
524	NC_003276	CTT	2	6	30023	30028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233046
525	NC_003276	CCA	2	6	30037	30042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233046
526	NC_003276	ATC	2	6	30047	30052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233046
527	NC_003276	AAT	2	6	30075	30080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233046
528	NC_003276	TAC	2	6	30085	30090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233046
529	NC_003276	CAGC	2	8	30096	30103	25 %	0 %	25 %	50 %	17233046
530	NC_003276	GCG	2	6	30125	30130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233046
531	NC_003276	GAT	2	6	30185	30190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233046
532	NC_003276	ATA	2	6	30307	30312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233046
533	NC_003276	GCC	2	6	30318	30323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233046
534	NC_003276	TTC	2	6	30324	30329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233046
535	NC_003276	TGA	2	6	30409	30414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233046
536	NC_003276	G	6	6	30509	30514	0 %	0 %	100 %	0 %	17233046
537	NC_003276	GAA	2	6	30540	30545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233046
538	NC_003276	GAAT	2	8	30573	30580	50 %	25 %	25 %	0 %	17233046
539	NC_003276	CTG	2	6	30604	30609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233046
540	NC_003276	CTG	2	6	30621	30626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233046
541	NC_003276	TGT	2	6	30627	30632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233046
542	NC_003276	CCA	2	6	30716	30721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233046
543	NC_003276	CCGT	2	8	30767	30774	0 %	25 %	25 %	50 %	17233046
544	NC_003276	TCT	2	6	30779	30784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233046
545	NC_003276	ACA	2	6	30805	30810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233046
546	NC_003276	TCA	2	6	30867	30872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233046
547	NC_003276	ATG	2	6	30899	30904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233046
548	NC_003276	TCAA	2	8	31044	31051	50 %	25 %	0 %	25 %	17233047
549	NC_003276	T	7	7	31142	31148	0 %	100 %	0 %	0 %	17233047
550	NC_003276	TTG	2	6	31322	31327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233047
551	NC_003276	GCA	2	6	31347	31352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233047
552	NC_003276	AGT	2	6	31353	31358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233047
553	NC_003276	TGAA	2	8	31444	31451	50 %	25 %	25 %	0 %	17233047
554	NC_003276	CTTG	2	8	31464	31471	0 %	50 %	25 %	25 %	17233047
555	NC_003276	ATG	2	6	31515	31520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233047
556	NC_003276	GGCT	2	8	31690	31697	0 %	25 %	50 %	25 %	17233047
557	NC_003276	GAT	2	6	31745	31750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233047
558	NC_003276	CTTC	2	8	31859	31866	0 %	50 %	0 %	50 %	17233048
559	NC_003276	CAT	2	6	31887	31892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233048
560	NC_003276	TAAA	2	8	31929	31936	75 %	25 %	0 %	0 %	17233048
561	NC_003276	CAC	2	6	31943	31948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233048
562	NC_003276	GGC	2	6	31986	31991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233048
563	NC_003276	TAG	2	6	32048	32053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233048
564	NC_003276	CAT	2	6	32102	32107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233048
565	NC_003276	AAT	2	6	32118	32123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233048
566	NC_003276	CAA	2	6	32131	32136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233048
567	NC_003276	CCCCA	2	10	32231	32240	20 %	0 %	0 %	80 %	17233048
568	NC_003276	GAT	2	6	32444	32449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233049
569	NC_003276	A	7	7	32458	32464	100 %	0 %	0 %	0 %	17233049
570	NC_003276	TCT	2	6	32473	32478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233049
571	NC_003276	AGT	2	6	32546	32551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233049
572	NC_003276	CTG	2	6	32612	32617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233049
573	NC_003276	GCG	2	6	32629	32634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233049
574	NC_003276	TAG	2	6	32639	32644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233049
575	NC_003276	CCA	2	6	32699	32704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233049
576	NC_003276	TCG	2	6	32782	32787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233049
577	NC_003276	CTG	2	6	32859	32864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233049
578	NC_003276	TGT	2	6	32876	32881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233049
579	NC_003276	TAG	2	6	33122	33127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233049
580	NC_003276	TAA	2	6	33129	33134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233049
581	NC_003276	TTG	2	6	33147	33152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233049
582	NC_003276	GATT	2	8	33261	33268	25 %	50 %	25 %	0 %	17233050
583	NC_003276	ATC	2	6	33270	33275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233050
584	NC_003276	TCT	2	6	33280	33285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233050
585	NC_003276	CTC	2	6	33291	33296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17233050
586	NC_003276	TTC	2	6	33347	33352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233050
587	NC_003276	AGC	2	6	33429	33434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233050
588	NC_003276	TTCT	2	8	33479	33486	0 %	75 %	0 %	25 %	17233050
589	NC_003276	CTT	2	6	33500	33505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233050
590	NC_003276	TCA	2	6	33527	33532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233050
591	NC_003276	ACCA	2	8	33757	33764	50 %	0 %	0 %	50 %	17233051
592	NC_003276	TAT	2	6	34230	34235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233052
593	NC_003276	CAA	2	6	34244	34249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233052
594	NC_003276	CAAG	2	8	34254	34261	50 %	0 %	25 %	25 %	17233052
595	NC_003276	ATC	2	6	34294	34299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233052
596	NC_003276	TAG	2	6	34586	34591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233052
597	NC_003276	TCG	2	6	34595	34600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233052
598	NC_003276	TGC	2	6	34671	34676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233052
599	NC_003276	CAG	2	6	34851	34856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233053
600	NC_003276	TGA	2	6	34860	34865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233053
601	NC_003276	CAGG	2	8	34918	34925	25 %	0 %	50 %	25 %	17233053
602	NC_003276	GAA	2	6	35059	35064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233053
603	NC_003276	GCG	2	6	35079	35084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233053
604	NC_003276	TAA	2	6	35088	35093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233053
605	NC_003276	AAT	2	6	35119	35124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233054
606	NC_003276	A	6	6	35139	35144	100 %	0 %	0 %	0 %	17233054
607	NC_003276	TAT	2	6	35145	35150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233054
608	NC_003276	AGT	2	6	35204	35209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233054
609	NC_003276	TA	3	6	35259	35264	50 %	50 %	0 %	0 %	17233054
610	NC_003276	GAT	2	6	35267	35272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233054
611	NC_003276	ATT	2	6	35278	35283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233054
612	NC_003276	CAT	2	6	35286	35291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233054
613	NC_003276	AAG	2	6	35319	35324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233054
614	NC_003276	CGTT	2	8	35384	35391	0 %	50 %	25 %	25 %	17233054
615	NC_003276	AT	3	6	35785	35790	50 %	50 %	0 %	0 %	17233055
616	NC_003276	GCG	2	6	35845	35850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233055
617	NC_003276	TGG	2	6	35854	35859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233055
618	NC_003276	TAC	2	6	35954	35959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233055
619	NC_003276	TAT	2	6	36014	36019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233056
620	NC_003276	TTAA	2	8	36160	36167	50 %	50 %	0 %	0 %	17233056
621	NC_003276	TGA	2	6	36213	36218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233056
622	NC_003276	GTT	2	6	36237	36242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233056
623	NC_003276	TAA	2	6	36244	36249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233056
624	NC_003276	A	7	7	36297	36303	100 %	0 %	0 %	0 %	17233057
625	NC_003276	A	6	6	36312	36317	100 %	0 %	0 %	0 %	17233057
626	NC_003276	CAA	2	6	36344	36349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233057
627	NC_003276	CAA	2	6	36385	36390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233057
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629	NC_003276	AGTG	2	8	36438	36445	25 %	25 %	50 %	0 %	17233057
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