MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120alpha

Total Repeats: 6858

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_003276	GAGC	2	8	295875	295882	25 %	0 %	50 %	25 %	17233302
5002	NC_003276	AGTT	2	8	295901	295908	25 %	50 %	25 %	0 %	17233302
5003	NC_003276	T	6	6	295907	295912	0 %	100 %	0 %	0 %	17233302
5004	NC_003276	TC	3	6	295943	295948	0 %	50 %	0 %	50 %	17233302
5005	NC_003276	TCGCTT	2	12	296044	296055	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	17233302
5006	NC_003276	AAG	2	6	296113	296118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233302
5007	NC_003276	GA	3	6	296148	296153	50 %	0 %	50 %	0 %	17233302
5008	NC_003276	TCA	2	6	296155	296160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233302
5009	NC_003276	CTAA	2	8	296217	296224	50 %	25 %	0 %	25 %	17233303
5010	NC_003276	GTC	2	6	296241	296246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233303
5011	NC_003276	CAT	2	6	296270	296275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233303
5012	NC_003276	ATT	2	6	296297	296302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233303
5013	NC_003276	GCA	2	6	296356	296361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233303
5014	NC_003276	CCAAA	2	10	296374	296383	60 %	0 %	0 %	40 %	17233303
5015	NC_003276	T	6	6	296390	296395	0 %	100 %	0 %	0 %	17233303
5016	NC_003276	TGG	2	6	296401	296406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233303
5017	NC_003276	TTG	2	6	296440	296445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233303
5018	NC_003276	TA	3	6	296476	296481	50 %	50 %	0 %	0 %	17233303
5019	NC_003276	TAG	2	6	296530	296535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233303
5020	NC_003276	AGG	2	6	296570	296575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17233303
5021	NC_003276	AGG	2	6	296594	296599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17233303
5022	NC_003276	AG	3	6	296600	296605	50 %	0 %	50 %	0 %	17233303
5023	NC_003276	TTTC	2	8	296613	296620	0 %	75 %	0 %	25 %	17233303
5024	NC_003276	TGC	2	6	296697	296702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233304
5025	NC_003276	TCA	2	6	296727	296732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233304
5026	NC_003276	CTG	3	9	296759	296767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233304
5027	NC_003276	CTG	2	6	296806	296811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233304
5028	NC_003276	AATC	2	8	296842	296849	50 %	25 %	0 %	25 %	17233304
5029	NC_003276	CTA	2	6	296874	296879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233304
5030	NC_003276	CTT	2	6	296881	296886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233304
5031	NC_003276	CAA	2	6	296927	296932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233304
5032	NC_003276	AT	3	6	296940	296945	50 %	50 %	0 %	0 %	17233304
5033	NC_003276	TGTT	2	8	296987	296994	0 %	75 %	25 %	0 %	17233304
5034	NC_003276	ACC	2	6	297026	297031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233304
5035	NC_003276	CAT	2	6	297115	297120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233304
5036	NC_003276	TCA	2	6	297144	297149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233304
5037	NC_003276	TGC	2	6	297200	297205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233304
5038	NC_003276	AT	3	6	297252	297257	50 %	50 %	0 %	0 %	17233304
5039	NC_003276	TCA	2	6	297261	297266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233304
5040	NC_003276	ACA	2	6	297273	297278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233304
5041	NC_003276	CAC	2	6	297418	297423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233304
5042	NC_003276	AGG	2	6	297461	297466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17233304
5043	NC_003276	TCA	2	6	297493	297498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233304
5044	NC_003276	TCT	2	6	297601	297606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233305
5045	NC_003276	GAT	2	6	297706	297711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233305
5046	NC_003276	TCC	2	6	297810	297815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17233306
5047	NC_003276	CTG	2	6	297840	297845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233306
5048	NC_003276	GTC	2	6	297912	297917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233306
5049	NC_003276	CTT	2	6	297932	297937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233306
5050	NC_003276	GTA	2	6	298011	298016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233306
5051	NC_003276	GAT	2	6	298026	298031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233306
5052	NC_003276	CTG	2	6	298243	298248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233307
5053	NC_003276	AAG	2	6	298379	298384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233307
5054	NC_003276	AGC	2	6	298394	298399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233307
5055	NC_003276	CTT	2	6	298544	298549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233307
5056	NC_003276	TTG	2	6	298566	298571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233307
5057	NC_003276	CTG	2	6	298575	298580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233307
5058	NC_003276	GTA	2	6	298609	298614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233307
5059	NC_003276	TAA	2	6	298637	298642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233307
5060	NC_003276	CTT	2	6	298718	298723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233307
5061	NC_003276	TGG	2	6	298748	298753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233307
5062	NC_003276	ATG	2	6	298803	298808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233307
5063	NC_003276	TTC	2	6	298857	298862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233307
5064	NC_003276	TGT	2	6	298904	298909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233307
5065	NC_003276	GTG	2	6	298956	298961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233307
5066	NC_003276	GATT	2	8	298964	298971	25 %	50 %	25 %	0 %	17233307
5067	NC_003276	GGT	2	6	298977	298982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233307
5068	NC_003276	TTC	2	6	298986	298991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233307
5069	NC_003276	GGCTTG	2	12	299037	299048	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	17233307
5070	NC_003276	TGA	2	6	299203	299208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233307
5071	NC_003276	GAAA	2	8	299475	299482	75 %	0 %	25 %	0 %	17233308
5072	NC_003276	A	6	6	299536	299541	100 %	0 %	0 %	0 %	17233308
5073	NC_003276	GCAAA	2	10	299551	299560	60 %	0 %	20 %	20 %	17233308
5074	NC_003276	TGG	2	6	299648	299653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233308
5075	NC_003276	AGT	2	6	299684	299689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233308
5076	NC_003276	TGA	2	6	299690	299695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233308
5077	NC_003276	TAG	2	6	299714	299719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233308
5078	NC_003276	GCA	2	6	299757	299762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233308
5079	NC_003276	AGT	2	6	299835	299840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233309
5080	NC_003276	CTG	2	6	299919	299924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233309
5081	NC_003276	AACC	2	8	299932	299939	50 %	0 %	0 %	50 %	17233309
5082	NC_003276	CGAAA	2	10	299978	299987	60 %	0 %	20 %	20 %	17233309
5083	NC_003276	AT	3	6	300027	300032	50 %	50 %	0 %	0 %	17233310
5084	NC_003276	CAG	2	6	300056	300061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233310
5085	NC_003276	TACT	2	8	300110	300117	25 %	50 %	0 %	25 %	17233310
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5087	NC_003276	ATC	2	6	300176	300181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233310
5088	NC_003276	CAG	2	6	300228	300233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233310
5089	NC_003276	GAA	2	6	300262	300267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233310
5090	NC_003276	ACT	2	6	300337	300342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233310
5091	NC_003276	AGC	2	6	300827	300832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233311
5092	NC_003276	ATT	2	6	300843	300848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233311
5093	NC_003276	CTA	2	6	300854	300859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233311
5094	NC_003276	TGC	2	6	300941	300946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233311
5095	NC_003276	AAC	2	6	300994	300999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233311
5096	NC_003276	C	6	6	301014	301019	0 %	0 %	0 %	100 %	17233311
5097	NC_003276	T	6	6	301027	301032	0 %	100 %	0 %	0 %	17233311
5098	NC_003276	GGA	2	6	301124	301129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17233311
5099	NC_003276	TCAG	2	8	301315	301322	25 %	25 %	25 %	25 %	17233311
5100	NC_003276	TGG	2	6	301342	301347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233311
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5102	NC_003276	CTG	2	6	301413	301418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233311
5103	NC_003276	ACT	2	6	301421	301426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233311
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5105	NC_003276	CAAAT	2	10	301912	301921	60 %	20 %	0 %	20 %	17233311
5106	NC_003276	CTG	2	6	301941	301946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233311
5107	NC_003276	ATGG	2	8	301995	302002	25 %	25 %	50 %	0 %	17233311
5108	NC_003276	TGG	2	6	302023	302028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233311
5109	NC_003276	CAG	2	6	302055	302060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233311
5110	NC_003276	TAG	2	6	302074	302079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233311
5111	NC_003276	TAC	2	6	302087	302092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233311
5112	NC_003276	GAT	2	6	302127	302132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233311
5113	NC_003276	GAG	2	6	302217	302222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17233311
5114	NC_003276	ATTG	2	8	302321	302328	25 %	50 %	25 %	0 %	17233311
5115	NC_003276	GTTG	2	8	302369	302376	0 %	50 %	50 %	0 %	17233311
5116	NC_003276	AAG	2	6	302468	302473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233311
5117	NC_003276	TGTC	2	8	302502	302509	0 %	50 %	25 %	25 %	17233311
5118	NC_003276	G	6	6	302538	302543	0 %	0 %	100 %	0 %	17233311
5119	NC_003276	AGC	2	6	302590	302595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233311
5120	NC_003276	G	6	6	302648	302653	0 %	0 %	100 %	0 %	17233311
5121	NC_003276	ATG	2	6	302656	302661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233311
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5370	NC_003276	TACCG	2	10	319569	319578	20 %	20 %	20 %	40 %	17233320
5371	NC_003276	ACA	2	6	319579	319584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233320
5372	NC_003276	CGG	2	6	319595	319600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233320
5373	NC_003276	TGA	2	6	319635	319640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233320
5374	NC_003276	TTA	2	6	319694	319699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233320
5375	NC_003276	ATG	2	6	319730	319735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233320
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5394	NC_003276	ATT	2	6	320639	320644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233320
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5404	NC_003276	A	6	6	321212	321217	100 %	0 %	0 %	0 %	17233320
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5481	NC_003276	CAAC	2	8	324633	324640	50 %	0 %	0 %	50 %	17233320
5482	NC_003276	TCAG	2	8	324716	324723	25 %	25 %	25 %	25 %	17233320
5483	NC_003276	GGA	2	6	324724	324729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17233320
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5485	NC_003276	ATT	2	6	324830	324835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233320
5486	NC_003276	TG	3	6	324918	324923	0 %	50 %	50 %	0 %	17233320
5487	NC_003276	ACA	2	6	324925	324930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233320
5488	NC_003276	GTC	2	6	324953	324958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233320
5489	NC_003276	ACC	2	6	325012	325017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233320
5490	NC_003276	GGC	2	6	325039	325044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233320
5491	NC_003276	CAG	2	6	325091	325096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233320
5492	NC_003276	TTG	2	6	325211	325216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233320
5493	NC_003276	ATT	2	6	325240	325245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233320
5494	NC_003276	TAACT	2	10	325254	325263	40 %	40 %	0 %	20 %	17233320
5495	NC_003276	CGC	2	6	325296	325301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233320
5496	NC_003276	GTGCAG	2	12	325331	325342	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	17233320
5497	NC_003276	TGT	2	6	325407	325412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233320
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5499	NC_003276	ATC	2	6	325446	325451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233320
5500	NC_003276	A	6	6	325472	325477	100 %	0 %	0 %	0 %	17233320

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