MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120epsilon

Total Repeats: 652

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003270	AAT	2	6	28344	28349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227485
502	NC_003270	TAAA	2	8	28368	28375	75 %	25 %	0 %	0 %	17227485
503	NC_003270	TAT	2	6	28377	28382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17227485
504	NC_003270	AATT	2	8	28386	28393	50 %	50 %	0 %	0 %	17227485
505	NC_003270	CAA	2	6	28455	28460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227485
506	NC_003270	GTT	2	6	28462	28467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227485
507	NC_003270	GGA	2	6	28480	28485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17227485
508	NC_003270	GAT	2	6	28488	28493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227485
509	NC_003270	TAC	2	6	28499	28504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227485
510	NC_003270	TCA	2	6	28714	28719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227485
511	NC_003270	T	7	7	28727	28733	0 %	100 %	0 %	0 %	17227485
512	NC_003270	TTC	2	6	28746	28751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227485
513	NC_003270	CTT	2	6	28784	28789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227485
514	NC_003270	ATA	2	6	28837	28842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227485
515	NC_003270	TAA	2	6	28857	28862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227485
516	NC_003270	ATA	2	6	28889	28894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227485
517	NC_003270	ATA	2	6	28906	28911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227485
518	NC_003270	TAT	2	6	28914	28919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17227485
519	NC_003270	AAT	2	6	28927	28932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227485
520	NC_003270	A	8	8	29005	29012	100 %	0 %	0 %	0 %	17227485
521	NC_003270	GTA	2	6	29018	29023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227485
522	NC_003270	A	6	6	29053	29058	100 %	0 %	0 %	0 %	17227485
523	NC_003270	ATT	2	6	29106	29111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17227485
524	NC_003270	CGA	2	6	29115	29120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227485
525	NC_003270	TAT	2	6	29123	29128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17227485
526	NC_003270	TTG	3	9	29199	29207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227485
527	NC_003270	AATATC	2	12	29208	29219	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	17227485
528	NC_003270	TGCT	2	8	29964	29971	0 %	50 %	25 %	25 %	17227486
529	NC_003270	TTCAG	2	10	29980	29989	20 %	40 %	20 %	20 %	17227486
530	NC_003270	TGA	2	6	30094	30099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227486
531	NC_003270	ATA	2	6	30115	30120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227486
532	NC_003270	CTG	2	6	30635	30640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227487
533	NC_003270	AAC	2	6	30658	30663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227487
534	NC_003270	CTTCAT	2	12	30674	30685	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	17227487
535	NC_003270	GCA	2	6	30739	30744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227487
536	NC_003270	CTT	2	6	31313	31318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227488
537	NC_003270	ATA	2	6	31357	31362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227488
538	NC_003270	TGC	2	6	31412	31417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227488
539	NC_003270	ATA	2	6	31491	31496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227488
540	NC_003270	TAAT	2	8	31550	31557	50 %	50 %	0 %	0 %	17227488
541	NC_003270	TAG	2	6	31576	31581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227488
542	NC_003270	TAA	2	6	31599	31604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227488
543	NC_003270	CCA	2	6	31645	31650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17227488
544	NC_003270	AGA	2	6	31675	31680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227488
545	NC_003270	TAA	2	6	31699	31704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227488
546	NC_003270	TTA	2	6	31710	31715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17227488
547	NC_003270	TAA	2	6	31807	31812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227488
548	NC_003270	TAC	2	6	31879	31884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227488
549	NC_003270	AAAT	2	8	31937	31944	75 %	25 %	0 %	0 %	17227488
550	NC_003270	A	7	7	31964	31970	100 %	0 %	0 %	0 %	17227488
551	NC_003270	ATTT	2	8	31987	31994	25 %	75 %	0 %	0 %	17227488
552	NC_003270	A	6	6	32020	32025	100 %	0 %	0 %	0 %	17227488
553	NC_003270	GAT	2	6	32065	32070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227488
554	NC_003270	TGA	2	6	32098	32103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227488
555	NC_003270	GAA	2	6	32116	32121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227488
556	NC_003270	ATC	2	6	32135	32140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227488
557	NC_003270	A	6	6	32159	32164	100 %	0 %	0 %	0 %	17227488
558	NC_003270	GAGC	2	8	32244	32251	25 %	0 %	50 %	25 %	17227488
559	NC_003270	TA	3	6	32277	32282	50 %	50 %	0 %	0 %	17227488
560	NC_003270	ACCA	2	8	32396	32403	50 %	0 %	0 %	50 %	17227488
561	NC_003270	AT	3	6	32408	32413	50 %	50 %	0 %	0 %	17227488
562	NC_003270	TAA	2	6	32539	32544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227488
563	NC_003270	CAC	2	6	32611	32616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17227488
564	NC_003270	AG	3	6	32903	32908	50 %	0 %	50 %	0 %	17227488
565	NC_003270	ATA	2	6	32918	32923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227488
566	NC_003270	GAA	2	6	33427	33432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227489
567	NC_003270	TCC	2	6	33435	33440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17227489
568	NC_003270	TGA	2	6	33510	33515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227489
569	NC_003270	CAGC	2	8	33571	33578	25 %	0 %	25 %	50 %	17227489
570	NC_003270	GAT	2	6	33600	33605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227489
571	NC_003270	GATT	2	8	33669	33676	25 %	50 %	25 %	0 %	17227489
572	NC_003270	ATTA	2	8	33750	33757	50 %	50 %	0 %	0 %	17227489
573	NC_003270	ACT	2	6	33816	33821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227489
574	NC_003270	AAC	2	6	33836	33841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227489
575	NC_003270	AT	3	6	33857	33862	50 %	50 %	0 %	0 %	17227489
576	NC_003270	TTTA	2	8	34076	34083	25 %	75 %	0 %	0 %	17227489
577	NC_003270	ACT	2	6	34282	34287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227489
578	NC_003270	TGA	2	6	34326	34331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227489
579	NC_003270	CTCAC	2	10	34335	34344	20 %	20 %	0 %	60 %	17227489
580	NC_003270	GTT	2	6	34393	34398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227489
581	NC_003270	A	7	7	34424	34430	100 %	0 %	0 %	0 %	17227489
582	NC_003270	CCT	2	6	34431	34436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17227489
583	NC_003270	GCAA	2	8	34548	34555	50 %	0 %	25 %	25 %	17227489
584	NC_003270	GATTT	2	10	34568	34577	20 %	60 %	20 %	0 %	17227489
585	NC_003270	GCA	2	6	34599	34604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227489
586	NC_003270	GAA	3	9	34647	34655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227489
587	NC_003270	CG	3	6	34757	34762	0 %	0 %	50 %	50 %	17227489
588	NC_003270	A	6	6	34820	34825	100 %	0 %	0 %	0 %	17227489
589	NC_003270	TC	3	6	34877	34882	0 %	50 %	0 %	50 %	17227489
590	NC_003270	CTG	2	6	34958	34963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227489
591	NC_003270	CTC	2	6	35025	35030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17227489
592	NC_003270	GC	3	6	35059	35064	0 %	0 %	50 %	50 %	17227489
593	NC_003270	ATG	2	6	35227	35232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227490
594	NC_003270	GACT	2	8	35257	35264	25 %	25 %	25 %	25 %	17227490
595	NC_003270	GAT	2	6	35265	35270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227490
596	NC_003270	C	6	6	35392	35397	0 %	0 %	0 %	100 %	17227490
597	NC_003270	TCA	2	6	35447	35452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227490
598	NC_003270	GTTGG	2	10	35481	35490	0 %	40 %	60 %	0 %	17227490
599	NC_003270	CTGAA	2	10	35530	35539	40 %	20 %	20 %	20 %	17227490
600	NC_003270	TGG	2	6	35946	35951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17227491
601	NC_003270	ACA	3	9	35962	35970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227491
602	NC_003270	TCG	2	6	36000	36005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227491
603	NC_003270	AAC	2	6	36048	36053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227491
604	NC_003270	A	6	6	36083	36088	100 %	0 %	0 %	0 %	17227491
605	NC_003270	GTCTGA	2	12	36108	36119	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	17227491
606	NC_003270	ACCCAT	2	12	36123	36134	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	17227491
607	NC_003270	AAG	2	6	36236	36241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227491
608	NC_003270	ATTTT	2	10	36269	36278	20 %	80 %	0 %	0 %	17227491
609	NC_003270	C	7	7	36288	36294	0 %	0 %	0 %	100 %	17227491
610	NC_003270	TGA	2	6	36642	36647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227491
611	NC_003270	GCCA	2	8	36691	36698	25 %	0 %	25 %	50 %	17227492
612	NC_003270	ACC	2	6	36699	36704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17227492
613	NC_003270	GAT	2	6	36748	36753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227492
614	NC_003270	CTA	2	6	36767	36772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227492
615	NC_003270	ATT	2	6	36790	36795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17227492
616	NC_003270	TGG	2	6	36848	36853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17227492
617	NC_003270	AGTC	2	8	36854	36861	25 %	25 %	25 %	25 %	17227492
618	NC_003270	TCC	2	6	36875	36880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17227492
619	NC_003270	AAG	2	6	36953	36958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227492
620	NC_003270	GA	3	6	36989	36994	50 %	0 %	50 %	0 %	17227492
621	NC_003270	AGA	2	6	37062	37067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227492
622	NC_003270	AGT	2	6	37203	37208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227492
623	NC_003270	AGA	2	6	37287	37292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227492
624	NC_003270	AAAAT	2	10	37351	37360	80 %	20 %	0 %	0 %	17227492
625	NC_003270	GAACT	2	10	37373	37382	40 %	20 %	20 %	20 %	17227492
626	NC_003270	CAG	2	6	37429	37434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227492
627	NC_003270	AAC	2	6	37445	37450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227492
628	NC_003270	CCA	2	6	37465	37470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17227492
629	NC_003270	TAC	2	6	37488	37493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227492
630	NC_003270	TTG	2	6	37558	37563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227492
631	NC_003270	TGA	2	6	37587	37592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227492
632	NC_003270	AGC	2	6	37671	37676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227493
633	NC_003270	GAA	2	6	37724	37729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227493
634	NC_003270	AGA	2	6	37747	37752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227493
635	NC_003270	TTG	2	6	37754	37759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227493
636	NC_003270	A	6	6	37807	37812	100 %	0 %	0 %	0 %	17227493
637	NC_003270	CTT	2	6	37845	37850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227494
638	NC_003270	TGG	2	6	37899	37904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17227494
639	NC_003270	TTG	2	6	37994	37999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227494
640	NC_003270	ATC	2	6	38036	38041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227494
641	NC_003270	GCA	2	6	38074	38079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227494
642	NC_003270	GCCTCT	2	12	38450	38461	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	17227495
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644	NC_003270	CCCAG	2	10	38566	38575	20 %	0 %	20 %	60 %	17227495
645	NC_003270	GTCA	2	8	38656	38663	25 %	25 %	25 %	25 %	17227495
646	NC_003270	T	6	6	38677	38682	0 %	100 %	0 %	0 %	17227495
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649	NC_003270	ACT	2	6	39173	39178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227496
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652	NC_003270	TGT	2	6	39305	39310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227496

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