MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Neisseria meningitidis MC58 chromosome

Total Repeats: 40250

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_003112	TAT	2	6	284134	284139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15676204
5002	NC_003112	CGCGG	2	10	284194	284203	0 %	0 %	60 %	40 %	15676204
5003	NC_003112	GACCT	2	10	284254	284263	20 %	20 %	20 %	40 %	15676204
5004	NC_003112	GCA	2	6	284316	284321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15676204
5005	NC_003112	CTA	2	6	284385	284390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15676204
5006	NC_003112	CAA	2	6	284406	284411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15676204
5007	NC_003112	TCAACC	2	12	284429	284440	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	15676204
5008	NC_003112	GGC	2	6	284461	284466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15676204
5009	NC_003112	GCG	2	6	284470	284475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15676204
5010	NC_003112	GGC	2	6	284476	284481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15676204
5011	NC_003112	GCC	2	6	284651	284656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15676204
5012	NC_003112	GCC	2	6	284666	284671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15676204
5013	NC_003112	GTC	2	6	284674	284679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15676204
5014	NC_003112	GTCC	2	8	284722	284729	0 %	25 %	25 %	50 %	15676204
5015	NC_003112	AAG	2	6	284780	284785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15676204
5016	NC_003112	GCG	2	6	284828	284833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15676204
5017	NC_003112	CGG	2	6	284862	284867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15676204
5018	NC_003112	TCG	2	6	284950	284955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15676204
5019	NC_003112	AGC	2	6	284959	284964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15676204
5020	NC_003112	CCG	3	9	285038	285046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15676204
5021	NC_003112	GAT	2	6	285124	285129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15676204
5022	NC_003112	A	6	6	285157	285162	100 %	0 %	0 %	0 %	15676204
5023	NC_003112	GCA	2	6	285200	285205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15676204
5024	NC_003112	CAG	2	6	285228	285233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15676204
5025	NC_003112	A	6	6	285344	285349	100 %	0 %	0 %	0 %	15676204
5026	NC_003112	CAGC	2	8	285390	285397	25 %	0 %	25 %	50 %	15676204
5027	NC_003112	CGT	2	6	285441	285446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15676204
5028	NC_003112	A	6	6	285472	285477	100 %	0 %	0 %	0 %	15676204
5029	NC_003112	GCT	2	6	285521	285526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15676204
5030	NC_003112	CAG	2	6	285615	285620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15676204
5031	NC_003112	GGAT	2	8	285644	285651	25 %	25 %	50 %	0 %	15676204
5032	NC_003112	CT	3	6	285681	285686	0 %	50 %	0 %	50 %	15676204
5033	NC_003112	CCG	2	6	285689	285694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15676204
5034	NC_003112	CAA	2	6	285699	285704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15676204
5035	NC_003112	ATG	2	6	285816	285821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15676205
5036	NC_003112	TGA	2	6	285835	285840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15676205
5037	NC_003112	GCC	2	6	285843	285848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15676205
5038	NC_003112	GCA	2	6	285858	285863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15676205
5039	NC_003112	CGC	2	6	285875	285880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15676205
5040	NC_003112	GCC	2	6	285969	285974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15676205
5041	NC_003112	CCGCAC	2	12	285991	286002	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	15676205
5042	NC_003112	CAG	2	6	286005	286010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15676205
5043	NC_003112	GCC	2	6	286038	286043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15676205
5044	NC_003112	TCA	2	6	286060	286065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15676205
5045	NC_003112	CGC	2	6	286068	286073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15676205
5046	NC_003112	AAGCCA	2	12	286096	286107	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	15676205
5047	NC_003112	CGC	2	6	286203	286208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15676205
5048	NC_003112	CAAG	2	8	286215	286222	50 %	0 %	25 %	25 %	15676205
5049	NC_003112	CGT	2	6	286241	286246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15676205
5050	NC_003112	A	6	6	286250	286255	100 %	0 %	0 %	0 %	15676205
5051	NC_003112	CGC	2	6	286287	286292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15676205
5052	NC_003112	ACA	2	6	286303	286308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15676205
5053	NC_003112	CAG	2	6	286329	286334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15676205
5054	NC_003112	CGC	2	6	286481	286486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15676205
5055	NC_003112	GC	3	6	286557	286562	0 %	0 %	50 %	50 %	15676205
5056	NC_003112	CGG	2	6	286592	286597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15676205
5057	NC_003112	GAA	2	6	286641	286646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15676205
5058	NC_003112	GC	3	6	286678	286683	0 %	0 %	50 %	50 %	15676205
5059	NC_003112	ATC	2	6	286710	286715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15676205
5060	NC_003112	CAA	2	6	286788	286793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15676205
5061	NC_003112	TGCC	2	8	288381	288388	0 %	25 %	25 %	50 %	15676206
5062	NC_003112	CG	4	8	288511	288518	0 %	0 %	50 %	50 %	15676206
5063	NC_003112	TCT	2	6	288551	288556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15676206
5064	NC_003112	GGC	2	6	288658	288663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15676206
5065	NC_003112	GCG	2	6	288680	288685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15676206
5066	NC_003112	GTC	2	6	288727	288732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15676206
5067	NC_003112	GCT	2	6	288747	288752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15676206
5068	NC_003112	CGG	2	6	288768	288773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15676206
5069	NC_003112	GCG	2	6	288783	288788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15676206
5070	NC_003112	TGC	2	6	288806	288811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15676206
5071	NC_003112	ATC	3	9	288935	288943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15676206
5072	NC_003112	CGG	2	6	288980	288985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15676206
5073	NC_003112	ACG	2	6	288986	288991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15676206
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5075	NC_003112	CG	3	6	289039	289044	0 %	0 %	50 %	50 %	15676206
5076	NC_003112	CG	3	6	289062	289067	0 %	0 %	50 %	50 %	15676206
5077	NC_003112	TGG	2	6	289115	289120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15676206
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5080	NC_003112	AAAT	2	8	289265	289272	75 %	25 %	0 %	0 %	15676206
5081	NC_003112	GCA	2	6	289332	289337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15676206
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5084	NC_003112	T	7	7	289388	289394	0 %	100 %	0 %	0 %	15676206
5085	NC_003112	CGGCG	2	10	289426	289435	0 %	0 %	60 %	40 %	15676206
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5088	NC_003112	TCG	2	6	289511	289516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15676206
5089	NC_003112	GCC	2	6	289651	289656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15676206
5090	NC_003112	T	7	7	289659	289665	0 %	100 %	0 %	0 %	15676206
5091	NC_003112	CGG	2	6	289698	289703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15676206
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5094	NC_003112	T	6	6	289840	289845	0 %	100 %	0 %	0 %	15676206
5095	NC_003112	GGC	2	6	289855	289860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15676206
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5098	NC_003112	CGGCG	2	10	289930	289939	0 %	0 %	60 %	40 %	15676206
5099	NC_003112	GCC	2	6	289958	289963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15676206
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5101	NC_003112	CGG	2	6	290013	290018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15676206
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5106	NC_003112	T	7	7	290192	290198	0 %	100 %	0 %	0 %	15676206
5107	NC_003112	GAT	2	6	290200	290205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15676206
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5109	NC_003112	A	6	6	290238	290243	100 %	0 %	0 %	0 %	15676206
5110	NC_003112	ATG	2	6	290596	290601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15676207
5111	NC_003112	GCAG	3	12	290608	290619	25 %	0 %	50 %	25 %	15676207
5112	NC_003112	GGCG	2	8	290630	290637	0 %	0 %	75 %	25 %	15676207
5113	NC_003112	CAGT	2	8	290647	290654	25 %	25 %	25 %	25 %	15676207
5114	NC_003112	GC	4	8	290665	290672	0 %	0 %	50 %	50 %	15676207
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5121	NC_003112	GC	3	6	291087	291092	0 %	0 %	50 %	50 %	15676207
5122	NC_003112	TTTG	2	8	291119	291126	0 %	75 %	25 %	0 %	15676207
5123	NC_003112	T	6	6	291336	291341	0 %	100 %	0 %	0 %	15676208
5124	NC_003112	TGA	2	6	291354	291359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15676208
5125	NC_003112	GC	3	6	291362	291367	0 %	0 %	50 %	50 %	15676208
5126	NC_003112	CGC	2	6	291400	291405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15676208
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5165	NC_003112	TGC	2	6	295271	295276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15676209
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5233	NC_003112	CGGT	2	8	299472	299479	0 %	25 %	50 %	25 %	15676212
5234	NC_003112	GCA	2	6	299497	299502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15676212
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5240	NC_003112	CGG	2	6	299704	299709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15676212
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5242	NC_003112	GCGAG	2	10	299767	299776	20 %	0 %	60 %	20 %	15676212
5243	NC_003112	GC	3	6	299804	299809	0 %	0 %	50 %	50 %	15676212
5244	NC_003112	GCCA	2	8	299937	299944	25 %	0 %	25 %	50 %	15676212
5245	NC_003112	GCA	2	6	299989	299994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15676212
5246	NC_003112	C	6	6	300014	300019	0 %	0 %	0 %	100 %	15676212
5247	NC_003112	GGC	2	6	300020	300025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15676212
5248	NC_003112	TCG	2	6	300039	300044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15676212
5249	NC_003112	GTA	2	6	300074	300079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15676212
5250	NC_003112	TTC	2	6	300080	300085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15676212
5251	NC_003112	TTGC	2	8	300168	300175	0 %	50 %	25 %	25 %	15676212
5252	NC_003112	CGG	2	6	300202	300207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15676212
5253	NC_003112	GCC	2	6	300218	300223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15676212
5254	NC_003112	GAC	2	6	300230	300235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15676212
5255	NC_003112	TGC	2	6	300388	300393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15676213
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5257	NC_003112	CGG	2	6	300510	300515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15676213
5258	NC_003112	TGC	2	6	300521	300526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15676213
5259	NC_003112	CGG	2	6	300549	300554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15676213
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5261	NC_003112	GTTT	2	8	300594	300601	0 %	75 %	25 %	0 %	15676213
5262	NC_003112	CGG	2	6	300672	300677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15676213
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5267	NC_003112	TCG	2	6	300923	300928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15676214
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5269	NC_003112	CTT	2	6	300950	300955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15676214
5270	NC_003112	CGT	2	6	301044	301049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15676214
5271	NC_003112	ACCG	2	8	301068	301075	25 %	0 %	25 %	50 %	15676214
5272	NC_003112	GTC	2	6	301138	301143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15676214
5273	NC_003112	GAC	2	6	301233	301238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15676214
5274	NC_003112	GCG	2	6	301294	301299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15676214
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5277	NC_003112	CGG	2	6	301356	301361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15676214
5278	NC_003112	GGC	2	6	301371	301376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15676214
5279	NC_003112	TCATT	2	10	301626	301635	20 %	60 %	0 %	20 %	15676215
5280	NC_003112	TTA	2	6	301641	301646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15676215
5281	NC_003112	ATT	2	6	301656	301661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15676215
5282	NC_003112	CTTC	2	8	301663	301670	0 %	50 %	0 %	50 %	15676215
5283	NC_003112	TGC	2	6	301676	301681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15676215
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5286	NC_003112	TCA	2	6	301816	301821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15676215
5287	NC_003112	CGC	2	6	301828	301833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15676215
5288	NC_003112	ACGA	2	8	301878	301885	50 %	0 %	25 %	25 %	15676215
5289	NC_003112	CGG	3	9	302096	302104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15676215
5290	NC_003112	TCA	2	6	302107	302112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15676215
5291	NC_003112	CAAA	2	8	302138	302145	75 %	0 %	0 %	25 %	15676215
5292	NC_003112	GC	3	6	302255	302260	0 %	0 %	50 %	50 %	15676215
5293	NC_003112	CGG	2	6	302551	302556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15676215
5294	NC_003112	GCAG	2	8	302580	302587	25 %	0 %	50 %	25 %	15676215
5295	NC_003112	GCA	2	6	302624	302629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15676215
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5303	NC_003112	GCA	2	6	302968	302973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15676215
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5322	NC_003112	CAG	2	6	304023	304028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15676216
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5324	NC_003112	TGA	2	6	304163	304168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15676216
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5330	NC_003112	A	6	6	304329	304334	100 %	0 %	0 %	0 %	15676216
5331	NC_003112	CGG	2	6	304436	304441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15676216
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5334	NC_003112	TTG	2	6	304962	304967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15676217
5335	NC_003112	GGCT	2	8	305045	305052	0 %	25 %	50 %	25 %	15676217
5336	NC_003112	GCAGG	2	10	305057	305066	20 %	0 %	60 %	20 %	15676217
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5342	NC_003112	T	6	6	305405	305410	0 %	100 %	0 %	0 %	15676217
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5345	NC_003112	GCATC	2	10	305567	305576	20 %	20 %	20 %	40 %	15676217
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5349	NC_003112	T	6	6	305697	305702	0 %	100 %	0 %	0 %	15676217
5350	NC_003112	CGG	2	6	305714	305719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15676217
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5352	NC_003112	A	6	6	305761	305766	100 %	0 %	0 %	0 %	15676217
5353	NC_003112	CGG	2	6	305828	305833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15676217
5354	NC_003112	ACC	2	6	305836	305841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15676217
5355	NC_003112	TCT	2	6	305852	305857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15676217
5356	NC_003112	GGCG	2	8	305873	305880	0 %	0 %	75 %	25 %	15676217
5357	NC_003112	GTC	3	9	305893	305901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15676217
5358	NC_003112	ACG	2	6	305932	305937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15676217
5359	NC_003112	GCGG	2	8	305938	305945	0 %	0 %	75 %	25 %	15676217
5360	NC_003112	GTTTT	2	10	305965	305974	0 %	80 %	20 %	0 %	15676217
5361	NC_003112	TTG	2	6	306001	306006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15676217
5362	NC_003112	GTT	2	6	306078	306083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15676217
5363	NC_003112	GAC	2	6	306096	306101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15676217
5364	NC_003112	CCA	2	6	306454	306459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15676218
5365	NC_003112	CGG	2	6	306484	306489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15676218
5366	NC_003112	CAG	2	6	306528	306533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15676218
5367	NC_003112	ATC	2	6	306636	306641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15676218
5368	NC_003112	GAT	2	6	306680	306685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15676218
5369	NC_003112	TTTA	2	8	306690	306697	25 %	75 %	0 %	0 %	15676218
5370	NC_003112	CTT	2	6	306710	306715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15676218
5371	NC_003112	TGC	2	6	306739	306744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15676218
5372	NC_003112	TGC	2	6	306766	306771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15676218
5373	NC_003112	GGTTT	2	10	306777	306786	0 %	60 %	40 %	0 %	15676218
5374	NC_003112	TGC	2	6	306832	306837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15676218
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5378	NC_003112	GCT	2	6	306965	306970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15676218
5379	NC_003112	CTG	2	6	307017	307022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15676218
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5405	NC_003112	TGC	2	6	313528	313533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15676221
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5483	NC_003112	CG	3	6	319173	319178	0 %	0 %	50 %	50 %	15676228
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5485	NC_003112	A	6	6	319249	319254	100 %	0 %	0 %	0 %	15676228
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5491	NC_003112	T	7	7	319585	319591	0 %	100 %	0 %	0 %	15676229
5492	NC_003112	GCC	2	6	319625	319630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15676229
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5494	NC_003112	GATG	2	8	323478	323485	25 %	25 %	50 %	0 %	15676230
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5496	NC_003112	GAA	2	6	323522	323527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15676230
5497	NC_003112	CG	3	6	323532	323537	0 %	0 %	50 %	50 %	15676230
5498	NC_003112	CTG	2	6	323663	323668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15676230
5499	NC_003112	TTG	2	6	323681	323686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15676230
5500	NC_003112	CG	3	6	323690	323695	0 %	0 %	50 %	50 %	15676230

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