MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Neisseria gonorrhoeae FA 1090 chromosome

Total Repeats: 1204

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002946	CCGTC	2	10	1361	1370	0 %	20 %	20 %	60 %	59800474
2	NC_002946	GCGCG	2	10	3109	3118	0 %	0 %	60 %	40 %	59800476
3	NC_002946	GAAAA	2	10	5432	5441	80 %	0 %	20 %	0 %	59800477
4	NC_002946	GGCGG	2	10	5704	5713	0 %	0 %	80 %	20 %	59800477
5	NC_002946	AACGG	2	10	6962	6971	40 %	0 %	40 %	20 %	59800478
6	NC_002946	CGGTT	2	10	7393	7402	0 %	40 %	40 %	20 %	59800478
7	NC_002946	TGTTT	2	10	16795	16804	0 %	80 %	20 %	0 %	59800489
8	NC_002946	CGGGT	2	10	18962	18971	0 %	20 %	60 %	20 %	59800490
9	NC_002946	TGCGG	2	10	25919	25928	0 %	20 %	60 %	20 %	59800497
10	NC_002946	TTCCG	2	10	28193	28202	0 %	40 %	20 %	40 %	59800501
11	NC_002946	CGACC	2	10	31549	31558	20 %	0 %	20 %	60 %	59800504
12	NC_002946	TGGTT	2	10	34603	34612	0 %	60 %	40 %	0 %	59800506
13	NC_002946	GCCGC	2	10	35295	35304	0 %	0 %	40 %	60 %	59800506
14	NC_002946	GTTTC	2	10	37719	37728	0 %	60 %	20 %	20 %	59800508
15	NC_002946	GATGC	2	10	41094	41103	20 %	20 %	40 %	20 %	59800511
16	NC_002946	CGGGC	2	10	42337	42346	0 %	0 %	60 %	40 %	59800512
17	NC_002946	CCGTG	2	10	43309	43318	0 %	20 %	40 %	40 %	59800514
18	NC_002946	TTTGG	2	10	45007	45016	0 %	60 %	40 %	0 %	59800515
19	NC_002946	TTTTC	2	10	52727	52736	0 %	80 %	0 %	20 %	59800520
20	NC_002946	TCAAA	2	10	53375	53384	60 %	20 %	0 %	20 %	59800520
21	NC_002946	GCCCG	2	10	55250	55259	0 %	0 %	40 %	60 %	59800520
22	NC_002946	TTGTT	2	10	55420	55429	0 %	80 %	20 %	0 %	59800520
23	NC_002946	GCCGG	2	10	57938	57947	0 %	0 %	60 %	40 %	59800521
24	NC_002946	CGGCT	2	10	60694	60703	0 %	20 %	40 %	40 %	59800525
25	NC_002946	CGTTG	2	10	63402	63411	0 %	40 %	40 %	20 %	59800526
26	NC_002946	AAAAT	2	10	64814	64823	80 %	20 %	0 %	0 %	59800528
27	NC_002946	TGCCT	2	10	66050	66059	0 %	40 %	20 %	40 %	59800529
28	NC_002946	TTTGG	2	10	68202	68211	0 %	60 %	40 %	0 %	59800530
29	NC_002946	CCCAA	2	10	70419	70428	40 %	0 %	0 %	60 %	59800531
30	NC_002946	CGGGG	2	10	70648	70657	0 %	0 %	80 %	20 %	59800531
31	NC_002946	CGCGG	2	10	70956	70965	0 %	0 %	60 %	40 %	59800531
32	NC_002946	GAAGA	9	45	75510	75554	60 %	0 %	40 %	0 %	59800533
33	NC_002946	CGGTG	2	10	76999	77008	0 %	20 %	60 %	20 %	59800534
34	NC_002946	AAACC	2	10	78029	78038	60 %	0 %	0 %	40 %	59800535
35	NC_002946	CGGTT	2	10	80474	80483	0 %	40 %	40 %	20 %	59800537
36	NC_002946	AAATC	2	10	80584	80593	60 %	20 %	0 %	20 %	59800537
37	NC_002946	GGCAG	2	10	81187	81196	20 %	0 %	60 %	20 %	59800538
38	NC_002946	GGCGC	2	10	83312	83321	0 %	0 %	60 %	40 %	59800539
39	NC_002946	ATGTG	2	10	84598	84607	20 %	40 %	40 %	0 %	59800539
40	NC_002946	GGCGG	2	10	89564	89573	0 %	0 %	80 %	20 %	59800544
41	NC_002946	GCACG	2	10	95073	95082	20 %	0 %	40 %	40 %	59800548
42	NC_002946	GAAAT	2	10	95140	95149	60 %	20 %	20 %	0 %	59800548
43	NC_002946	GCGTT	2	10	98779	98788	0 %	40 %	40 %	20 %	59800551
44	NC_002946	TTTGG	2	10	103995	104004	0 %	60 %	40 %	0 %	59800555
45	NC_002946	GTTTT	2	10	104718	104727	0 %	80 %	20 %	0 %	59800555
46	NC_002946	GTATT	2	10	105232	105241	20 %	60 %	20 %	0 %	59800555
47	NC_002946	TCGCG	2	10	106036	106045	0 %	20 %	40 %	40 %	59800556
48	NC_002946	CGGTT	2	10	110152	110161	0 %	40 %	40 %	20 %	59800560
49	NC_002946	GAAAG	2	10	110785	110794	60 %	0 %	40 %	0 %	59800560
50	NC_002946	GGCAG	2	10	114081	114090	20 %	0 %	60 %	20 %	59800563
51	NC_002946	GAATC	2	10	116182	116191	40 %	20 %	20 %	20 %	59800565
52	NC_002946	TACCG	2	10	120897	120906	20 %	20 %	20 %	40 %	59800568
53	NC_002946	GGTGT	2	10	122811	122820	0 %	40 %	60 %	0 %	59800571
54	NC_002946	CGGCA	2	10	124896	124905	20 %	0 %	40 %	40 %	59800572
55	NC_002946	CAGCG	2	10	127697	127706	20 %	0 %	40 %	40 %	59800574
56	NC_002946	GCGTG	2	10	128117	128126	0 %	20 %	60 %	20 %	59800575
57	NC_002946	CGGTA	2	10	128166	128175	20 %	20 %	40 %	20 %	59800575
58	NC_002946	GGCGT	2	10	129482	129491	0 %	20 %	60 %	20 %	59800577
59	NC_002946	GCGCG	2	10	130072	130081	0 %	0 %	60 %	40 %	59800577
60	NC_002946	ACCGC	2	10	132725	132734	20 %	0 %	20 %	60 %	59800581
61	NC_002946	CTCAA	2	10	137925	137934	40 %	20 %	0 %	40 %	59800586
62	NC_002946	CCGCC	2	10	138199	138208	0 %	0 %	20 %	80 %	59800586
63	NC_002946	ACGGC	2	10	138250	138259	20 %	0 %	40 %	40 %	59800586
64	NC_002946	CCGAC	2	10	138508	138517	20 %	0 %	20 %	60 %	59800586
65	NC_002946	TGGTT	2	10	138766	138775	0 %	60 %	40 %	0 %	59800586
66	NC_002946	CCTGC	2	10	141080	141089	0 %	20 %	20 %	60 %	59800590
67	NC_002946	CAATA	2	10	144168	144177	60 %	20 %	0 %	20 %	59800594
68	NC_002946	CAAGC	2	10	145447	145456	40 %	0 %	20 %	40 %	59800594
69	NC_002946	CCGAA	2	10	146961	146970	40 %	0 %	20 %	40 %	59800596
70	NC_002946	GCGGG	2	10	147111	147120	0 %	0 %	80 %	20 %	59800596
71	NC_002946	GGCAG	2	10	153105	153114	20 %	0 %	60 %	20 %	59800603
72	NC_002946	CGGAA	2	10	156769	156778	40 %	0 %	40 %	20 %	59800605
73	NC_002946	CGGCG	2	10	157265	157274	0 %	0 %	60 %	40 %	59800605
74	NC_002946	AGGCG	2	10	159882	159891	20 %	0 %	60 %	20 %	59800609
75	NC_002946	GCGCG	2	10	160020	160029	0 %	0 %	60 %	40 %	59800609
76	NC_002946	CGGCG	2	10	164351	164360	0 %	0 %	60 %	40 %	59800615
77	NC_002946	GATGT	2	10	164556	164565	20 %	40 %	40 %	0 %	59800615
78	NC_002946	CCGCA	2	10	166665	166674	20 %	0 %	20 %	60 %	59800615
79	NC_002946	CAAAC	2	10	167634	167643	60 %	0 %	0 %	40 %	59800616
80	NC_002946	TTTTC	2	10	169455	169464	0 %	80 %	0 %	20 %	59800620
81	NC_002946	CGGCT	2	10	171426	171435	0 %	20 %	40 %	40 %	59800624
82	NC_002946	TTGCC	2	10	181106	181115	0 %	40 %	20 %	40 %	59800633
83	NC_002946	GTCCA	2	10	181367	181376	20 %	20 %	20 %	40 %	59800633
84	NC_002946	GAAGG	2	10	182023	182032	40 %	0 %	60 %	0 %	59800633
85	NC_002946	GCAGG	2	10	182671	182680	20 %	0 %	60 %	20 %	59800633
86	NC_002946	TGCCG	2	10	183998	184007	0 %	20 %	40 %	40 %	59800636
87	NC_002946	ATGCC	2	10	184132	184141	20 %	20 %	20 %	40 %	59800636
88	NC_002946	ACCGC	2	10	185313	185322	20 %	0 %	20 %	60 %	59800638
89	NC_002946	AGCGG	2	10	185680	185689	20 %	0 %	60 %	20 %	59800639
90	NC_002946	CGGCG	2	10	189200	189209	0 %	0 %	60 %	40 %	59800642
91	NC_002946	GGTAA	2	10	189664	189673	40 %	20 %	40 %	0 %	59800643
92	NC_002946	TTTCT	2	10	191370	191379	0 %	80 %	0 %	20 %	59800644
93	NC_002946	CCGTA	2	10	195045	195054	20 %	20 %	20 %	40 %	59800648
94	NC_002946	GCCGG	2	10	204689	204698	0 %	0 %	60 %	40 %	59800654
95	NC_002946	CGCGG	2	10	204740	204749	0 %	0 %	60 %	40 %	59800654
96	NC_002946	GGCAT	2	10	205997	206006	20 %	20 %	40 %	20 %	59800655
97	NC_002946	GCACG	2	10	208260	208269	20 %	0 %	40 %	40 %	59800658
98	NC_002946	GCCTT	2	10	209014	209023	0 %	40 %	20 %	40 %	59800659
99	NC_002946	TTCTT	2	10	210984	210993	0 %	80 %	0 %	20 %	59800660
100	NC_002946	GTCGC	2	10	212684	212693	0 %	20 %	40 %	40 %	59800662
101	NC_002946	CAAAC	2	10	213981	213990	60 %	0 %	0 %	40 %	59800663
102	NC_002946	CGTCC	2	10	214286	214295	0 %	20 %	20 %	60 %	59800664
103	NC_002946	CGTCG	2	10	215030	215039	0 %	20 %	40 %	40 %	59800665
104	NC_002946	CGGCG	2	10	217513	217522	0 %	0 %	60 %	40 %	59800667
105	NC_002946	GGCGT	2	10	221283	221292	0 %	20 %	60 %	20 %	59800670
106	NC_002946	GAATA	2	10	221496	221505	60 %	20 %	20 %	0 %	59800670
107	NC_002946	CGCGC	2	10	224111	224120	0 %	0 %	40 %	60 %	59800673
108	NC_002946	ATTAC	2	10	229415	229424	40 %	40 %	0 %	20 %	59800679
109	NC_002946	CCGTG	2	10	233699	233708	0 %	20 %	40 %	40 %	59800684
110	NC_002946	GGTCG	2	10	235432	235441	0 %	20 %	60 %	20 %	59800687
111	NC_002946	TTGCC	2	10	235459	235468	0 %	40 %	20 %	40 %	59800687
112	NC_002946	GGAAA	2	10	236525	236534	60 %	0 %	40 %	0 %	59800687
113	NC_002946	GTATT	2	10	237412	237421	20 %	60 %	20 %	0 %	59800688
114	NC_002946	CGGCG	2	10	237905	237914	0 %	0 %	60 %	40 %	59800688
115	NC_002946	GCGCG	2	10	238122	238131	0 %	0 %	60 %	40 %	59800688
116	NC_002946	TTGCG	2	10	238393	238402	0 %	40 %	40 %	20 %	59800688
117	NC_002946	TGGTC	2	10	239646	239655	0 %	40 %	40 %	20 %	59800689
118	NC_002946	GACAC	2	10	241724	241733	40 %	0 %	20 %	40 %	59800691
119	NC_002946	GCACG	2	10	243728	243737	20 %	0 %	40 %	40 %	59800693
120	NC_002946	ACCGC	2	10	247424	247433	20 %	0 %	20 %	60 %	59800698
121	NC_002946	ATGCG	2	10	247589	247598	20 %	20 %	40 %	20 %	59800698
122	NC_002946	TCCGA	2	10	249071	249080	20 %	20 %	20 %	40 %	59800701
123	NC_002946	CCGAA	2	10	250404	250413	40 %	0 %	20 %	40 %	59800702
124	NC_002946	TGATT	2	10	250561	250570	20 %	60 %	20 %	0 %	59800702
125	NC_002946	GGCGC	2	10	251269	251278	0 %	0 %	60 %	40 %	59800703
126	NC_002946	CCGAC	2	10	253354	253363	20 %	0 %	20 %	60 %	59800706
127	NC_002946	CGATT	2	10	256113	256122	20 %	40 %	20 %	20 %	59800710
128	NC_002946	GTGCC	2	10	256581	256590	0 %	20 %	40 %	40 %	59800710
129	NC_002946	TTTTG	2	10	261402	261411	0 %	80 %	20 %	0 %	59800713
130	NC_002946	ACGGT	2	10	263674	263683	20 %	20 %	40 %	20 %	59800715
131	NC_002946	GGTTT	2	10	264493	264502	0 %	60 %	40 %	0 %	59800716
132	NC_002946	TTCGG	2	10	264697	264706	0 %	40 %	40 %	20 %	59800716
133	NC_002946	TGCGG	2	10	264973	264982	0 %	20 %	60 %	20 %	59800716
134	NC_002946	AGGGC	2	10	265677	265686	20 %	0 %	60 %	20 %	59800717
135	NC_002946	ATGGC	2	10	266702	266711	20 %	20 %	40 %	20 %	59800718
136	NC_002946	GAGTG	2	10	266825	266834	20 %	20 %	60 %	0 %	59800718
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