MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Neisseria gonorrhoeae FA 1090 chromosome

Total Repeats: 38132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_002946	GCA	2	6	161161	161166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161572978
3002	NC_002946	TGG	2	6	161169	161174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161572978
3003	NC_002946	CGC	2	6	161199	161204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161572978
3004	NC_002946	GCG	2	6	161213	161218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161572978
3005	NC_002946	GCC	2	6	161267	161272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161572978
3006	NC_002946	T	6	6	161383	161388	0 %	100 %	0 %	0 %	59800612
3007	NC_002946	GCT	2	6	161421	161426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800612
3008	NC_002946	CGC	2	6	161479	161484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800612
3009	NC_002946	GAA	2	6	161530	161535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800612
3010	NC_002946	ATT	2	6	161657	161662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59800612
3011	NC_002946	GAC	2	6	161665	161670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800612
3012	NC_002946	GGC	2	6	161676	161681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800612
3013	NC_002946	TCA	2	6	161693	161698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800612
3014	NC_002946	GTAT	2	8	161768	161775	25 %	50 %	25 %	0 %	59800612
3015	NC_002946	A	7	7	161783	161789	100 %	0 %	0 %	0 %	59800612
3016	NC_002946	GC	3	6	161868	161873	0 %	0 %	50 %	50 %	59800612
3017	NC_002946	CAA	2	6	161940	161945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59800612
3018	NC_002946	T	6	6	161961	161966	0 %	100 %	0 %	0 %	59800612
3019	NC_002946	TGCAAA	2	12	162015	162026	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	59800612
3020	NC_002946	GAA	2	6	162151	162156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800612
3021	NC_002946	TTGT	2	8	163019	163026	0 %	75 %	25 %	0 %	59800613
3022	NC_002946	GTG	2	6	163240	163245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59800614
3023	NC_002946	GCA	2	6	163254	163259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800614
3024	NC_002946	CGC	2	6	163264	163269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800614
3025	NC_002946	CGG	2	6	163278	163283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800614
3026	NC_002946	GCA	2	6	163293	163298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800614
3027	NC_002946	CTG	2	6	163326	163331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800614
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3029	NC_002946	CGC	2	6	163436	163441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800614
3030	NC_002946	CGG	3	9	163458	163466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800614
3031	NC_002946	CGC	2	6	163515	163520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800614
3032	NC_002946	GC	3	6	163519	163524	0 %	0 %	50 %	50 %	59800614
3033	NC_002946	AAC	2	6	163576	163581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59800614
3034	NC_002946	GCA	2	6	163712	163717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800614
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3036	NC_002946	TCTG	2	8	163811	163818	0 %	50 %	25 %	25 %	59800614
3037	NC_002946	TC	3	6	163878	163883	0 %	50 %	0 %	50 %	59800614
3038	NC_002946	AGA	2	6	163893	163898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800614
3039	NC_002946	A	7	7	164157	164163	100 %	0 %	0 %	0 %	59800615
3040	NC_002946	CCGT	2	8	164173	164180	0 %	25 %	25 %	50 %	59800615
3041	NC_002946	GCCT	2	8	164201	164208	0 %	25 %	25 %	50 %	59800615
3042	NC_002946	CGT	2	6	164258	164263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800615
3043	NC_002946	GGGC	2	8	164293	164300	0 %	0 %	75 %	25 %	59800615
3044	NC_002946	CGGCG	2	10	164351	164360	0 %	0 %	60 %	40 %	59800615
3045	NC_002946	CGG	2	6	164449	164454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800615
3046	NC_002946	CGG	2	6	164486	164491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800615
3047	NC_002946	GATGT	2	10	164556	164565	20 %	40 %	40 %	0 %	59800615
3048	NC_002946	ACC	2	6	164577	164582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	59800615
3049	NC_002946	TCG	2	6	164584	164589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800615
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3052	NC_002946	CGG	2	6	164639	164644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800615
3053	NC_002946	GCC	2	6	164659	164664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800615
3054	NC_002946	CAC	2	6	164753	164758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	59800615
3055	NC_002946	ACC	2	6	164793	164798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	59800615
3056	NC_002946	GTC	2	6	164904	164909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800615
3057	NC_002946	ACCGAT	2	12	165000	165011	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	59800615
3058	NC_002946	GAAG	2	8	165104	165111	50 %	0 %	50 %	0 %	59800615
3059	NC_002946	GCCG	2	8	165153	165160	0 %	0 %	50 %	50 %	59800615
3060	NC_002946	CTG	2	6	165189	165194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800615
3061	NC_002946	GAG	2	6	165258	165263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	59800615
3062	NC_002946	GTG	2	6	165309	165314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59800615
3063	NC_002946	ACG	2	6	165382	165387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800615
3064	NC_002946	CGA	2	6	165404	165409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800615
3065	NC_002946	CG	3	6	165414	165419	0 %	0 %	50 %	50 %	59800615
3066	NC_002946	AAAC	2	8	165540	165547	75 %	0 %	0 %	25 %	59800615
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3073	NC_002946	CGA	3	9	165788	165796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800615
3074	NC_002946	CTG	2	6	165798	165803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800615
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3090	NC_002946	CGC	2	6	166619	166624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800615
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3093	NC_002946	AGGA	2	8	166714	166721	50 %	0 %	50 %	0 %	59800615
3094	NC_002946	TCG	2	6	166744	166749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800615
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3101	NC_002946	GCA	2	6	167799	167804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800616
3102	NC_002946	TAAA	2	8	167839	167846	75 %	25 %	0 %	0 %	59800617
3103	NC_002946	ATCAAA	2	12	167919	167930	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	59800617
3104	NC_002946	A	8	8	167936	167943	100 %	0 %	0 %	0 %	59800617
3105	NC_002946	TTTATC	2	12	168009	168020	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	59800617
3106	NC_002946	TA	3	6	168021	168026	50 %	50 %	0 %	0 %	59800617
3107	NC_002946	AAAT	2	8	168047	168054	75 %	25 %	0 %	0 %	59800617
3108	NC_002946	A	6	6	168067	168072	100 %	0 %	0 %	0 %	59800617
3109	NC_002946	ATA	2	6	168132	168137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59800617
3110	NC_002946	AGG	2	6	168171	168176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	59800617
3111	NC_002946	TGA	2	6	168195	168200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800617
3112	NC_002946	TCTT	2	8	168238	168245	0 %	75 %	0 %	25 %	59800617
3113	NC_002946	TCA	2	6	168280	168285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800617
3114	NC_002946	AT	3	6	168287	168292	50 %	50 %	0 %	0 %	59800617
3115	NC_002946	TATT	2	8	168293	168300	25 %	75 %	0 %	0 %	59800617
3116	NC_002946	TAT	2	6	168360	168365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59800618
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3120	NC_002946	ATT	2	6	168741	168746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59800618
3121	NC_002946	TAT	2	6	168816	168821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59800619
3122	NC_002946	T	6	6	168821	168826	0 %	100 %	0 %	0 %	59800619
3123	NC_002946	A	6	6	168891	168896	100 %	0 %	0 %	0 %	59800619
3124	NC_002946	CCT	2	6	168941	168946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	59800619
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3129	NC_002946	CAA	2	6	169181	169186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59800620
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3353	NC_002946	ACGA	2	8	182763	182770	50 %	0 %	25 %	25 %	59800634
3354	NC_002946	CAGG	2	8	182771	182778	25 %	0 %	50 %	25 %	59800634
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3360	NC_002946	T	7	7	182914	182920	0 %	100 %	0 %	0 %	59800634
3361	NC_002946	GGCA	2	8	182940	182947	25 %	0 %	50 %	25 %	59800634
3362	NC_002946	AGG	2	6	183049	183054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	59800634
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3365	NC_002946	CGC	2	6	183258	183263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800635
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3491	NC_002946	TGC	2	6	190143	190148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800644
3492	NC_002946	TGTT	2	8	190181	190188	0 %	75 %	25 %	0 %	59800644
3493	NC_002946	GC	3	6	190240	190245	0 %	0 %	50 %	50 %	59800644
3494	NC_002946	ATGG	2	8	190314	190321	25 %	25 %	50 %	0 %	59800644
3495	NC_002946	GCG	3	9	190364	190372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800644
3496	NC_002946	CCG	2	6	190443	190448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800644
3497	NC_002946	A	6	6	190463	190468	100 %	0 %	0 %	0 %	59800644
3498	NC_002946	GCA	2	6	190595	190600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800644
3499	NC_002946	CAT	2	6	190788	190793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800644
3500	NC_002946	TGG	2	6	190823	190828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59800644

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