MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Neisseria gonorrhoeae FA 1090 chromosome

Total Repeats: 38132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002946	GGTC	2	8	51522	51529	0 %	25 %	50 %	25 %	59800518
1002	NC_002946	CGAGGA	2	12	51630	51641	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	59800518
1003	NC_002946	ATG	2	6	51656	51661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800518
1004	NC_002946	T	6	6	52011	52016	0 %	100 %	0 %	0 %	59800519
1005	NC_002946	CGG	2	6	52085	52090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800519
1006	NC_002946	T	6	6	52102	52107	0 %	100 %	0 %	0 %	59800519
1007	NC_002946	TCA	2	6	52134	52139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800519
1008	NC_002946	GTTC	2	8	52209	52216	0 %	50 %	25 %	25 %	59800519
1009	NC_002946	AGA	3	9	52529	52537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800520
1010	NC_002946	TCA	2	6	52604	52609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800520
1011	NC_002946	GCGG	2	8	52650	52657	0 %	0 %	75 %	25 %	59800520
1012	NC_002946	T	6	6	52659	52664	0 %	100 %	0 %	0 %	59800520
1013	NC_002946	GCC	2	6	52686	52691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800520
1014	NC_002946	TTTTC	2	10	52727	52736	0 %	80 %	0 %	20 %	59800520
1015	NC_002946	GC	4	8	52890	52897	0 %	0 %	50 %	50 %	59800520
1016	NC_002946	GCC	2	6	52914	52919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800520
1017	NC_002946	CGG	2	6	52922	52927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800520
1018	NC_002946	CGC	2	6	52955	52960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800520
1019	NC_002946	CGGT	2	8	53015	53022	0 %	25 %	50 %	25 %	59800520
1020	NC_002946	TCCT	2	8	53040	53047	0 %	50 %	0 %	50 %	59800520
1021	NC_002946	ACCC	2	8	53059	53066	25 %	0 %	0 %	75 %	59800520
1022	NC_002946	AAT	2	6	53101	53106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59800520
1023	NC_002946	TCG	2	6	53188	53193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800520
1024	NC_002946	AT	3	6	53209	53214	50 %	50 %	0 %	0 %	59800520
1025	NC_002946	CAT	2	6	53234	53239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800520
1026	NC_002946	GAC	2	6	53271	53276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800520
1027	NC_002946	CGG	2	6	53300	53305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800520
1028	NC_002946	TCAAA	2	10	53375	53384	60 %	20 %	0 %	20 %	59800520
1029	NC_002946	GCC	2	6	53397	53402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800520
1030	NC_002946	CCA	2	6	53450	53455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	59800520
1031	NC_002946	GCCC	2	8	53471	53478	0 %	0 %	25 %	75 %	59800520
1032	NC_002946	GCC	2	6	53481	53486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800520
1033	NC_002946	T	7	7	53498	53504	0 %	100 %	0 %	0 %	59800520
1034	NC_002946	ATAC	2	8	53537	53544	50 %	25 %	0 %	25 %	59800520
1035	NC_002946	TAT	2	6	53555	53560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59800520
1036	NC_002946	CGC	2	6	53561	53566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800520
1037	NC_002946	GGC	2	6	53604	53609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800520
1038	NC_002946	GCG	2	6	53639	53644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800520
1039	NC_002946	TTA	2	6	53689	53694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59800520
1040	NC_002946	GCG	2	6	53722	53727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800520
1041	NC_002946	GCC	2	6	53778	53783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800520
1042	NC_002946	GCG	2	6	53841	53846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800520
1043	NC_002946	GCC	2	6	53856	53861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800520
1044	NC_002946	GC	3	6	53905	53910	0 %	0 %	50 %	50 %	59800520
1045	NC_002946	CGT	2	6	54038	54043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800520
1046	NC_002946	CCG	2	6	54064	54069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800520
1047	NC_002946	TGTCAT	2	12	54116	54127	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	59800520
1048	NC_002946	CTT	2	6	54128	54133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59800520
1049	NC_002946	T	6	6	54165	54170	0 %	100 %	0 %	0 %	59800520
1050	NC_002946	TGGT	2	8	54192	54199	0 %	50 %	50 %	0 %	59800520
1051	NC_002946	AT	3	6	54212	54217	50 %	50 %	0 %	0 %	59800520
1052	NC_002946	GCA	2	6	54248	54253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800520
1053	NC_002946	TCG	2	6	54268	54273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800520
1054	NC_002946	GCC	2	6	54354	54359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800520
1055	NC_002946	CGC	2	6	54386	54391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800520
1056	NC_002946	GCG	2	6	54463	54468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800520
1057	NC_002946	GCCG	2	8	54476	54483	0 %	0 %	50 %	50 %	59800520
1058	NC_002946	CGGG	2	8	54487	54494	0 %	0 %	75 %	25 %	59800520
1059	NC_002946	GGA	2	6	54518	54523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	59800520
1060	NC_002946	GCT	2	6	54531	54536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800520
1061	NC_002946	ATT	2	6	54774	54779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59800520
1062	NC_002946	CG	3	6	54794	54799	0 %	0 %	50 %	50 %	59800520
1063	NC_002946	GTT	2	6	54851	54856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59800520
1064	NC_002946	CAG	2	6	54861	54866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800520
1065	NC_002946	ATA	2	6	54885	54890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59800520
1066	NC_002946	ATTACT	2	12	54966	54977	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	59800520
1067	NC_002946	TCA	2	6	54985	54990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800520
1068	NC_002946	AGA	2	6	54993	54998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800520
1069	NC_002946	GAT	2	6	55012	55017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800520
1070	NC_002946	CCAA	2	8	55064	55071	50 %	0 %	0 %	50 %	59800520
1071	NC_002946	TG	3	6	55119	55124	0 %	50 %	50 %	0 %	59800520
1072	NC_002946	T	6	6	55144	55149	0 %	100 %	0 %	0 %	59800520
1073	NC_002946	GCCCG	2	10	55250	55259	0 %	0 %	40 %	60 %	59800520
1074	NC_002946	GGT	2	6	55260	55265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59800520
1075	NC_002946	CGG	2	6	55304	55309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800520
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1077	NC_002946	TTGTT	2	10	55420	55429	0 %	80 %	20 %	0 %	59800520
1078	NC_002946	TCGT	2	8	55530	55537	0 %	50 %	25 %	25 %	59800520
1079	NC_002946	ATA	2	6	55543	55548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59800520
1080	NC_002946	GTTTGC	2	12	55561	55572	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	59800520
1081	NC_002946	C	13	13	55580	55592	0 %	0 %	0 %	100 %	59800520
1082	NC_002946	GGC	2	6	55617	55622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800520
1083	NC_002946	CGA	2	6	57127	57132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800521
1084	NC_002946	GCT	2	6	57149	57154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800521
1085	NC_002946	TCG	2	6	57234	57239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800521
1086	NC_002946	GCC	2	6	57257	57262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800521
1087	NC_002946	GCC	2	6	57327	57332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800521
1088	NC_002946	GCC	2	6	57341	57346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800521
1089	NC_002946	GGAC	2	8	57394	57401	25 %	0 %	50 %	25 %	59800521
1090	NC_002946	GC	3	6	57461	57466	0 %	0 %	50 %	50 %	59800521
1091	NC_002946	GCG	2	6	57487	57492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800521
1092	NC_002946	G	6	6	57560	57565	0 %	0 %	100 %	0 %	59800521
1093	NC_002946	GCT	2	6	57616	57621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800521
1094	NC_002946	GAC	2	6	57653	57658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800521
1095	NC_002946	CGA	2	6	57673	57678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800521
1096	NC_002946	GGCT	2	8	57780	57787	0 %	25 %	50 %	25 %	59800521
1097	NC_002946	CG	4	8	57820	57827	0 %	0 %	50 %	50 %	59800521
1098	NC_002946	GC	3	6	57833	57838	0 %	0 %	50 %	50 %	59800521
1099	NC_002946	GCG	2	6	57843	57848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800521
1100	NC_002946	GGT	2	6	57860	57865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59800521
1101	NC_002946	CGC	2	6	57880	57885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800521
1102	NC_002946	ATG	2	6	57906	57911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800521
1103	NC_002946	TAG	2	6	57928	57933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800521
1104	NC_002946	GCCGG	2	10	57938	57947	0 %	0 %	60 %	40 %	59800521
1105	NC_002946	TG	4	8	57952	57959	0 %	50 %	50 %	0 %	59800521
1106	NC_002946	GC	3	6	57991	57996	0 %	0 %	50 %	50 %	59800521
1107	NC_002946	GCG	3	9	58041	58049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800521
1108	NC_002946	CCGA	2	8	58107	58114	25 %	0 %	25 %	50 %	59800521
1109	NC_002946	CGC	2	6	58129	58134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800521
1110	NC_002946	GCGT	2	8	58138	58145	0 %	25 %	50 %	25 %	59800521
1111	NC_002946	GAG	2	6	58172	58177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	59800521
1112	NC_002946	ATG	2	6	58200	58205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800521
1113	NC_002946	CGA	2	6	58670	58675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800522
1114	NC_002946	GGC	2	6	58685	58690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800522
1115	NC_002946	GGC	2	6	58693	58698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800522
1116	NC_002946	CTG	2	6	58707	58712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800522
1117	NC_002946	GCG	2	6	58786	58791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800522
1118	NC_002946	GAT	2	6	58818	58823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800522
1119	NC_002946	GGC	2	6	58826	58831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800522
1120	NC_002946	GTC	2	6	58845	58850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800522
1121	NC_002946	GGC	2	6	58886	58891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800522
1122	NC_002946	AT	3	6	58892	58897	50 %	50 %	0 %	0 %	59800522
1123	NC_002946	GGGCTT	2	12	58907	58918	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	59800522
1124	NC_002946	CGT	2	6	58982	58987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800522
1125	NC_002946	ACG	2	6	59019	59024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800522
1126	NC_002946	CAG	2	6	59030	59035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800522
1127	NC_002946	GC	3	6	59048	59053	0 %	0 %	50 %	50 %	59800522
1128	NC_002946	T	6	6	59072	59077	0 %	100 %	0 %	0 %	59800522
1129	NC_002946	TGA	2	6	59486	59491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800523
1130	NC_002946	GTC	2	6	59662	59667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800523
1131	NC_002946	GAA	2	6	59749	59754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800523
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1142	NC_002946	GGC	2	6	60514	60519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800525
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1252	NC_002946	A	6	6	66006	66011	100 %	0 %	0 %	0 %	59800529
1253	NC_002946	TGCCT	2	10	66050	66059	0 %	40 %	20 %	40 %	59800529
1254	NC_002946	CCT	2	6	66148	66153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	59800529
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