MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Neisseria gonorrhoeae FA 1090 chromosome

Total Repeats: 38132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_002946	AC	3	6	326659	326664	50 %	0 %	0 %	50 %	59800776
6002	NC_002946	TCTGCA	2	12	326682	326693	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	59800776
6003	NC_002946	ATCAA	2	10	326709	326718	60 %	20 %	0 %	20 %	59800776
6004	NC_002946	GCT	2	6	326781	326786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800776
6005	NC_002946	GCT	2	6	326790	326795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800776
6006	NC_002946	CGG	2	6	326850	326855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800776
6007	NC_002946	ATC	2	6	326943	326948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800776
6008	NC_002946	GAA	2	6	327170	327175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800777
6009	NC_002946	TTG	2	6	327200	327205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59800777
6010	NC_002946	A	6	6	327273	327278	100 %	0 %	0 %	0 %	59800777
6011	NC_002946	AGC	2	6	327650	327655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800778
6012	NC_002946	GGC	2	6	327757	327762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800778
6013	NC_002946	CGGGAA	2	12	327798	327809	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	59800778
6014	NC_002946	GCC	2	6	327877	327882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800778
6015	NC_002946	CTG	2	6	327916	327921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800778
6016	NC_002946	GAT	2	6	327931	327936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800778
6017	NC_002946	GGC	2	6	327937	327942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800778
6018	NC_002946	CGG	2	6	327987	327992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800778
6019	NC_002946	AAG	2	6	328065	328070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800778
6020	NC_002946	CGG	2	6	328119	328124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800778
6021	NC_002946	TGC	2	6	328246	328251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800778
6022	NC_002946	CAAGG	2	10	328252	328261	40 %	0 %	40 %	20 %	59800778
6023	NC_002946	CGG	2	6	328269	328274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800778
6024	NC_002946	TGCCGC	2	12	328291	328302	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	59800778
6025	NC_002946	CGGCAT	2	12	328386	328397	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	59800778
6026	NC_002946	GCAG	2	8	328461	328468	25 %	0 %	50 %	25 %	59800778
6027	NC_002946	GTCGG	2	10	328661	328670	0 %	20 %	60 %	20 %	59800779
6028	NC_002946	G	6	6	328690	328695	0 %	0 %	100 %	0 %	59800779
6029	NC_002946	TGAG	2	8	328703	328710	25 %	25 %	50 %	0 %	59800779
6030	NC_002946	TTGGT	2	10	328712	328721	0 %	60 %	40 %	0 %	59800779
6031	NC_002946	CGA	2	6	328761	328766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800779
6032	NC_002946	A	6	6	328879	328884	100 %	0 %	0 %	0 %	59800779
6033	NC_002946	A	6	6	328984	328989	100 %	0 %	0 %	0 %	59800779
6034	NC_002946	GGCA	2	8	329031	329038	25 %	0 %	50 %	25 %	59800779
6035	NC_002946	A	6	6	329057	329062	100 %	0 %	0 %	0 %	59800779
6036	NC_002946	CAA	2	6	329110	329115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59800779
6037	NC_002946	GAA	2	6	329185	329190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800779
6038	NC_002946	GAA	2	6	329221	329226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800779
6039	NC_002946	GCG	2	6	329260	329265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800779
6040	NC_002946	CG	3	6	329279	329284	0 %	0 %	50 %	50 %	59800779
6041	NC_002946	CAT	3	9	329286	329294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800779
6042	NC_002946	GAA	2	6	329326	329331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800779
6043	NC_002946	ACGCTG	2	12	329335	329346	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	59800779
6044	NC_002946	CGG	2	6	329387	329392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800779
6045	NC_002946	CCG	2	6	329416	329421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800779
6046	NC_002946	ACAA	2	8	329429	329436	75 %	0 %	0 %	25 %	59800779
6047	NC_002946	CTGG	2	8	329448	329455	0 %	25 %	50 %	25 %	59800779
6048	NC_002946	A	6	6	329473	329478	100 %	0 %	0 %	0 %	59800779
6049	NC_002946	TGCC	2	8	329495	329502	0 %	25 %	25 %	50 %	59800779
6050	NC_002946	GATT	2	8	329560	329567	25 %	50 %	25 %	0 %	59800779
6051	NC_002946	ATG	2	6	329799	329804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800780
6052	NC_002946	AATA	2	8	329808	329815	75 %	25 %	0 %	0 %	59800780
6053	NC_002946	GCTGCC	2	12	329880	329891	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	59800780
6054	NC_002946	TGT	2	6	329915	329920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59800780
6055	NC_002946	TTG	2	6	329923	329928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59800780
6056	NC_002946	ACC	2	6	329934	329939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	59800780
6057	NC_002946	AAG	2	6	329953	329958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800780
6058	NC_002946	CTT	2	6	329966	329971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59800780
6059	NC_002946	ATT	2	6	329986	329991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59800780
6060	NC_002946	CGG	2	6	330023	330028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800780
6061	NC_002946	CTT	2	6	330029	330034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59800780
6062	NC_002946	CAAA	2	8	330047	330054	75 %	0 %	0 %	25 %	59800780
6063	NC_002946	CCG	2	6	330205	330210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800780
6064	NC_002946	GCG	2	6	330223	330228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800780
6065	NC_002946	GGCGC	2	10	330249	330258	0 %	0 %	60 %	40 %	59800780
6066	NC_002946	TA	3	6	330267	330272	50 %	50 %	0 %	0 %	59800780
6067	NC_002946	TGG	2	6	330331	330336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59800780
6068	NC_002946	TGG	2	6	330364	330369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59800780
6069	NC_002946	GGT	2	6	330413	330418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59800780
6070	NC_002946	CAAT	2	8	330454	330461	50 %	25 %	0 %	25 %	59800780
6071	NC_002946	CGA	2	6	330470	330475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800780
6072	NC_002946	GAA	2	6	330519	330524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800780
6073	NC_002946	AAG	2	6	330565	330570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800780
6074	NC_002946	AAG	2	6	330634	330639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800780
6075	NC_002946	GAA	2	6	330651	330656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800780
6076	NC_002946	GTC	2	6	330714	330719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800780
6077	NC_002946	GGAC	2	8	330734	330741	25 %	0 %	50 %	25 %	59800780
6078	NC_002946	CCGT	2	8	330772	330779	0 %	25 %	25 %	50 %	59800780
6079	NC_002946	CGCA	2	8	330810	330817	25 %	0 %	25 %	50 %	59800780
6080	NC_002946	CG	3	6	330880	330885	0 %	0 %	50 %	50 %	59800780
6081	NC_002946	ATC	2	6	330894	330899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800780
6082	NC_002946	ACCG	2	8	330921	330928	25 %	0 %	25 %	50 %	59800780
6083	NC_002946	TGC	2	6	330934	330939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800780
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6085	NC_002946	GC	3	6	330985	330990	0 %	0 %	50 %	50 %	59800780
6086	NC_002946	GTT	2	6	331034	331039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59800780
6087	NC_002946	TCTG	2	8	331128	331135	0 %	50 %	25 %	25 %	59800780
6088	NC_002946	CGG	2	6	331136	331141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800780
6089	NC_002946	CTG	2	6	331152	331157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800780
6090	NC_002946	CGA	2	6	331253	331258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800780
6091	NC_002946	AAG	2	6	331384	331389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800780
6092	NC_002946	CGC	2	6	331456	331461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800780
6093	NC_002946	GTGAT	2	10	331498	331507	20 %	40 %	40 %	0 %	59800780
6094	NC_002946	GGC	2	6	331515	331520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800780
6095	NC_002946	TTCG	2	8	331528	331535	0 %	50 %	25 %	25 %	59800780
6096	NC_002946	ACT	2	6	331599	331604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800780
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6099	NC_002946	GAA	2	6	331638	331643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800780
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6102	NC_002946	GGT	2	6	331817	331822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59800780
6103	NC_002946	CTG	2	6	331881	331886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800780
6104	NC_002946	GAA	2	6	331902	331907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800780
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6106	NC_002946	AT	3	6	332062	332067	50 %	50 %	0 %	0 %	59800781
6107	NC_002946	T	7	7	332081	332087	0 %	100 %	0 %	0 %	59800781
6108	NC_002946	A	6	6	332099	332104	100 %	0 %	0 %	0 %	59800781
6109	NC_002946	CCG	2	6	332161	332166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800781
6110	NC_002946	CAGC	2	8	332226	332233	25 %	0 %	25 %	50 %	59800781
6111	NC_002946	ATA	2	6	332237	332242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59800781
6112	NC_002946	AGGC	2	8	332254	332261	25 %	0 %	50 %	25 %	59800781
6113	NC_002946	GCA	2	6	332279	332284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800781
6114	NC_002946	GCC	2	6	332344	332349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800781
6115	NC_002946	GAA	2	6	332353	332358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800781
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6118	NC_002946	GCT	2	6	332496	332501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800781
6119	NC_002946	AGC	2	6	332518	332523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800781
6120	NC_002946	G	6	6	332551	332556	0 %	0 %	100 %	0 %	59800781
6121	NC_002946	GCT	2	6	332574	332579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800781
6122	NC_002946	CCG	2	6	332584	332589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800781
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6124	NC_002946	ATGG	2	8	332662	332669	25 %	25 %	50 %	0 %	59800781
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6495	NC_002946	TGGAC	2	10	354070	354079	20 %	20 %	40 %	20 %	59800806
6496	NC_002946	CGC	3	9	354099	354107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800806
6497	NC_002946	ATCC	2	8	354170	354177	25 %	25 %	0 %	50 %	59800806
6498	NC_002946	CAAC	2	8	354251	354258	50 %	0 %	0 %	50 %	59800806
6499	NC_002946	CGG	2	6	354323	354328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800806
6500	NC_002946	TG	3	6	354424	354429	0 %	50 %	50 %	0 %	59800807

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