MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Neisseria gonorrhoeae FA 1090 chromosome

Total Repeats: 38132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_002946	ACCG	2	8	296541	296548	25 %	0 %	25 %	50 %	59800742
5502	NC_002946	T	6	6	296616	296621	0 %	100 %	0 %	0 %	59800742
5503	NC_002946	GTAAA	2	10	296624	296633	60 %	20 %	20 %	0 %	59800742
5504	NC_002946	TGC	2	6	297018	297023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800743
5505	NC_002946	GGC	2	6	297048	297053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800743
5506	NC_002946	GGCA	2	8	297057	297064	25 %	0 %	50 %	25 %	59800743
5507	NC_002946	TGCG	2	8	297087	297094	0 %	25 %	50 %	25 %	59800743
5508	NC_002946	TTG	2	6	297101	297106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59800743
5509	NC_002946	CTG	2	6	297113	297118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800743
5510	NC_002946	ATC	2	6	297157	297162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800743
5511	NC_002946	TTA	2	6	297255	297260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59800743
5512	NC_002946	GCC	2	6	297301	297306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800743
5513	NC_002946	ATTG	2	8	297327	297334	25 %	50 %	25 %	0 %	59800743
5514	NC_002946	ATG	2	6	297344	297349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800743
5515	NC_002946	GCG	2	6	297401	297406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800743
5516	NC_002946	AT	3	6	297460	297465	50 %	50 %	0 %	0 %	59800743
5517	NC_002946	GCG	2	6	297566	297571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800743
5518	NC_002946	AAT	2	6	297577	297582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59800743
5519	NC_002946	TGC	2	6	297587	297592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800743
5520	NC_002946	CGA	2	6	297617	297622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800743
5521	NC_002946	GAA	2	6	297655	297660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800743
5522	NC_002946	ACC	2	6	297674	297679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	59800743
5523	NC_002946	GCAA	2	8	297689	297696	50 %	0 %	25 %	25 %	59800743
5524	NC_002946	AGC	2	6	297779	297784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800743
5525	NC_002946	CGC	2	6	297804	297809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800743
5526	NC_002946	CAA	2	6	297969	297974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59800743
5527	NC_002946	CGAGC	2	10	298038	298047	20 %	0 %	40 %	40 %	59800743
5528	NC_002946	TGA	2	6	298064	298069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800743
5529	NC_002946	GAT	2	6	298090	298095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800743
5530	NC_002946	T	6	6	298103	298108	0 %	100 %	0 %	0 %	59800743
5531	NC_002946	TTG	2	6	298153	298158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59800743
5532	NC_002946	ATG	2	6	298187	298192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800743
5533	NC_002946	GAC	2	6	298237	298242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800743
5534	NC_002946	CTGC	2	8	298283	298290	0 %	25 %	25 %	50 %	59800743
5535	NC_002946	AAC	2	6	298447	298452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59800743
5536	NC_002946	ATT	2	6	298604	298609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59800743
5537	NC_002946	TGC	2	6	298620	298625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800743
5538	NC_002946	GGC	2	6	298635	298640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800743
5539	NC_002946	A	6	6	298673	298678	100 %	0 %	0 %	0 %	59800743
5540	NC_002946	ACA	2	6	298697	298702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59800743
5541	NC_002946	CGC	2	6	298771	298776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800743
5542	NC_002946	TTTGGA	2	12	298797	298808	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	59800743
5543	NC_002946	GCA	2	6	298827	298832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800743
5544	NC_002946	TCA	2	6	298879	298884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800744
5545	NC_002946	AAG	2	6	298930	298935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800744
5546	NC_002946	CCT	2	6	299049	299054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	59800744
5547	NC_002946	AAATAC	2	12	299079	299090	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	59800744
5548	NC_002946	CAA	2	6	299091	299096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59800744
5549	NC_002946	AAG	2	6	299100	299105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800744
5550	NC_002946	CGA	2	6	299108	299113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800744
5551	NC_002946	AAATT	2	10	299149	299158	60 %	40 %	0 %	0 %	59800744
5552	NC_002946	ATCAA	2	10	299185	299194	60 %	20 %	0 %	20 %	59800744
5553	NC_002946	GC	3	6	299287	299292	0 %	0 %	50 %	50 %	59800744
5554	NC_002946	AGA	2	6	299312	299317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800744
5555	NC_002946	TGA	3	9	299374	299382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800744
5556	NC_002946	GAA	2	6	299390	299395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800744
5557	NC_002946	A	6	6	299394	299399	100 %	0 %	0 %	0 %	59800744
5558	NC_002946	A	6	6	299579	299584	100 %	0 %	0 %	0 %	59800745
5559	NC_002946	CGG	2	6	299605	299610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800745
5560	NC_002946	ACC	2	6	299657	299662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	59800745
5561	NC_002946	AAAC	2	8	299665	299672	75 %	0 %	0 %	25 %	59800745
5562	NC_002946	GCCCGT	2	12	299786	299797	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	59800746
5563	NC_002946	A	6	6	299802	299807	100 %	0 %	0 %	0 %	59800746
5564	NC_002946	GTC	2	6	299835	299840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800746
5565	NC_002946	CCG	2	6	299905	299910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800746
5566	NC_002946	GCT	2	6	300101	300106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800746
5567	NC_002946	GCT	2	6	300110	300115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800746
5568	NC_002946	AATG	2	8	300539	300546	50 %	25 %	25 %	0 %	161572977
5569	NC_002946	GCC	2	6	300620	300625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161572977
5570	NC_002946	GGC	2	6	300665	300670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161572977
5571	NC_002946	A	6	6	300899	300904	100 %	0 %	0 %	0 %	161572977
5572	NC_002946	GCC	2	6	300907	300912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161572977
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5574	NC_002946	CTT	2	6	301060	301065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161572977
5575	NC_002946	TCCG	2	8	301092	301099	0 %	25 %	25 %	50 %	161572977
5576	NC_002946	TCTT	2	8	301100	301107	0 %	75 %	0 %	25 %	161572977
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5579	NC_002946	CTT	2	6	301327	301332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161572977
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5583	NC_002946	A	6	6	301524	301529	100 %	0 %	0 %	0 %	59800748
5584	NC_002946	A	6	6	301587	301592	100 %	0 %	0 %	0 %	59800748
5585	NC_002946	TAA	2	6	301597	301602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59800748
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5587	NC_002946	CTG	2	6	301736	301741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800748
5588	NC_002946	ATC	2	6	301761	301766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800748
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5590	NC_002946	ATAAAT	2	12	302165	302176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59800749
5591	NC_002946	ATT	2	6	302204	302209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59800749
5592	NC_002946	TTC	2	6	302218	302223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59800749
5593	NC_002946	GAC	2	6	302231	302236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800749
5594	NC_002946	ATG	2	6	302271	302276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800749
5595	NC_002946	A	6	6	302386	302391	100 %	0 %	0 %	0 %	59800750
5596	NC_002946	CTTTAT	2	12	302419	302430	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	59800750
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5601	NC_002946	ATG	2	6	302687	302692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800750
5602	NC_002946	AGGGA	2	10	302732	302741	40 %	0 %	60 %	0 %	59800750
5603	NC_002946	GCA	2	6	302800	302805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800750
5604	NC_002946	AAT	2	6	302809	302814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59800750
5605	NC_002946	TGT	2	6	302818	302823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59800750
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5607	NC_002946	G	6	6	302876	302881	0 %	0 %	100 %	0 %	59800750
5608	NC_002946	GTT	2	6	302958	302963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59800750
5609	NC_002946	ACT	2	6	303000	303005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800750
5610	NC_002946	TGA	2	6	303024	303029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800750
5611	NC_002946	TTTA	2	8	303030	303037	25 %	75 %	0 %	0 %	59800750
5612	NC_002946	GAT	2	6	303054	303059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800750
5613	NC_002946	AACAT	2	10	303215	303224	60 %	20 %	0 %	20 %	59800751
5614	NC_002946	TGGAAG	2	12	303311	303322	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	59800751
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5617	NC_002946	TTGT	2	8	303452	303459	0 %	75 %	25 %	0 %	59800751
5618	NC_002946	GCG	2	6	303554	303559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800751
5619	NC_002946	TGA	2	6	303606	303611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800751
5620	NC_002946	A	6	6	303826	303831	100 %	0 %	0 %	0 %	59800751
5621	NC_002946	AAC	2	6	303929	303934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59800751
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5623	NC_002946	TGG	2	6	303971	303976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59800751
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5995	NC_002946	A	7	7	326252	326258	100 %	0 %	0 %	0 %	59800775
5996	NC_002946	GAT	2	6	326284	326289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800775
5997	NC_002946	GGCAG	2	10	326306	326315	20 %	0 %	60 %	20 %	59800775
5998	NC_002946	GGATT	2	10	326378	326387	20 %	40 %	40 %	0 %	59800775
5999	NC_002946	TTTA	2	8	326604	326611	25 %	75 %	0 %	0 %	59800776
6000	NC_002946	ATA	2	6	326624	326629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59800776

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