MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Neisseria gonorrhoeae FA 1090 chromosome

Total Repeats: 38132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_002946	GCC	3	9	242914	242922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800692
4502	NC_002946	GGAC	2	8	242997	243004	25 %	0 %	50 %	25 %	59800692
4503	NC_002946	GCC	2	6	243261	243266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800693
4504	NC_002946	CGAC	2	8	243328	243335	25 %	0 %	25 %	50 %	59800693
4505	NC_002946	TGGCGT	2	12	243343	243354	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	59800693
4506	NC_002946	GCC	2	6	243369	243374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800693
4507	NC_002946	TTGGGC	2	12	243468	243479	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	59800693
4508	NC_002946	GC	3	6	243487	243492	0 %	0 %	50 %	50 %	59800693
4509	NC_002946	A	6	6	243534	243539	100 %	0 %	0 %	0 %	59800693
4510	NC_002946	CGA	2	6	243572	243577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800693
4511	NC_002946	TGG	2	6	243595	243600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59800693
4512	NC_002946	CAT	2	6	243602	243607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800693
4513	NC_002946	CGC	2	6	243608	243613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800693
4514	NC_002946	CGG	2	6	243629	243634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800693
4515	NC_002946	ATG	2	6	243718	243723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800693
4516	NC_002946	GCACG	2	10	243728	243737	20 %	0 %	40 %	40 %	59800693
4517	NC_002946	CAT	2	6	243740	243745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800693
4518	NC_002946	CCG	4	12	243748	243759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800693
4519	NC_002946	GAA	2	6	243795	243800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800693
4520	NC_002946	GCC	2	6	243828	243833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800693
4521	NC_002946	TGCC	2	8	243839	243846	0 %	25 %	25 %	50 %	59800693
4522	NC_002946	CTG	2	6	243855	243860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800693
4523	NC_002946	A	6	6	243954	243959	100 %	0 %	0 %	0 %	59800693
4524	NC_002946	CGGC	2	8	243980	243987	0 %	0 %	50 %	50 %	59800693
4525	NC_002946	TCT	2	6	244021	244026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59800693
4526	NC_002946	CTG	2	6	244047	244052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800693
4527	NC_002946	GCC	2	6	244127	244132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800693
4528	NC_002946	GAAA	2	8	244139	244146	75 %	0 %	25 %	0 %	59800693
4529	NC_002946	AAC	2	6	244200	244205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59800693
4530	NC_002946	ACC	2	6	244254	244259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	59800693
4531	NC_002946	GAA	2	6	244266	244271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800693
4532	NC_002946	GAA	2	6	244314	244319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800693
4533	NC_002946	GAA	2	6	244326	244331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800693
4534	NC_002946	AATTCG	2	12	244354	244365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	59800693
4535	NC_002946	CTG	2	6	244404	244409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800693
4536	NC_002946	GCC	2	6	244428	244433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800693
4537	NC_002946	AGC	2	6	244436	244441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800693
4538	NC_002946	GCG	2	6	244450	244455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800693
4539	NC_002946	AAAC	2	8	244656	244663	75 %	0 %	0 %	25 %	59800694
4540	NC_002946	GAC	2	6	244677	244682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800694
4541	NC_002946	GAT	2	6	244701	244706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800694
4542	NC_002946	T	6	6	244741	244746	0 %	100 %	0 %	0 %	59800694
4543	NC_002946	TTG	2	6	244813	244818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59800694
4544	NC_002946	T	7	7	244930	244936	0 %	100 %	0 %	0 %	59800695
4545	NC_002946	GGCG	2	8	245040	245047	0 %	0 %	75 %	25 %	59800695
4546	NC_002946	T	6	6	245050	245055	0 %	100 %	0 %	0 %	59800695
4547	NC_002946	TGGTCG	2	12	245094	245105	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	59800695
4548	NC_002946	CGGG	2	8	245118	245125	0 %	0 %	75 %	25 %	59800695
4549	NC_002946	GCC	2	6	245144	245149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800695
4550	NC_002946	CAT	2	6	245191	245196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800695
4551	NC_002946	CGA	2	6	245269	245274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800695
4552	NC_002946	TGC	2	6	245280	245285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800695
4553	NC_002946	GCA	2	6	245319	245324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800695
4554	NC_002946	AGGC	2	8	245334	245341	25 %	0 %	50 %	25 %	59800695
4555	NC_002946	ATTG	2	8	245374	245381	25 %	50 %	25 %	0 %	59800695
4556	NC_002946	GAC	2	6	245387	245392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800695
4557	NC_002946	GCA	2	6	245398	245403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800695
4558	NC_002946	CGG	3	9	245442	245450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800695
4559	NC_002946	TGC	2	6	245475	245480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800695
4560	NC_002946	GGT	3	9	245530	245538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59800695
4561	NC_002946	CGG	2	6	245539	245544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800695
4562	NC_002946	GCG	2	6	245549	245554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800695
4563	NC_002946	CCGT	2	8	245623	245630	0 %	25 %	25 %	50 %	59800695
4564	NC_002946	TTC	2	6	245705	245710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59800695
4565	NC_002946	AC	3	6	245720	245725	50 %	0 %	0 %	50 %	59800695
4566	NC_002946	GCC	2	6	245791	245796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800695
4567	NC_002946	TGC	2	6	245871	245876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800695
4568	NC_002946	CGC	2	6	246188	246193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800696
4569	NC_002946	TG	3	6	246202	246207	0 %	50 %	50 %	0 %	59800696
4570	NC_002946	GCC	2	6	246219	246224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800696
4571	NC_002946	CGT	2	6	246238	246243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800696
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4573	NC_002946	A	6	6	246363	246368	100 %	0 %	0 %	0 %	59800696
4574	NC_002946	GGC	2	6	246374	246379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800696
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4577	NC_002946	CGT	2	6	246542	246547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800696
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4579	NC_002946	CAT	2	6	246630	246635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800696
4580	NC_002946	CAT	2	6	246665	246670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800696
4581	NC_002946	GCG	2	6	246673	246678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800696
4582	NC_002946	TTAAAT	2	12	246689	246700	50 %	50 %	0 %	0 %	59800696
4583	NC_002946	A	8	8	246918	246925	100 %	0 %	0 %	0 %	59800697
4584	NC_002946	AGGC	2	8	246958	246965	25 %	0 %	50 %	25 %	59800697
4585	NC_002946	ATC	2	6	246972	246977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800697
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4587	NC_002946	TCG	2	6	247132	247137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800698
4588	NC_002946	GGC	2	6	247203	247208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800698
4589	NC_002946	CG	4	8	247221	247228	0 %	0 %	50 %	50 %	59800698
4590	NC_002946	TCG	3	9	247229	247237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800698
4591	NC_002946	ATC	2	6	247244	247249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800698
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4593	NC_002946	ACG	2	6	247321	247326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800698
4594	NC_002946	GCC	3	9	247339	247347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800698
4595	NC_002946	GCC	2	6	247359	247364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800698
4596	NC_002946	TTG	2	6	247373	247378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59800698
4597	NC_002946	CGA	2	6	247392	247397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800698
4598	NC_002946	ACCGC	2	10	247424	247433	20 %	0 %	20 %	60 %	59800698
4599	NC_002946	TCG	2	6	247442	247447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800698
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4601	NC_002946	CCG	2	6	247469	247474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800698
4602	NC_002946	CGA	2	6	247494	247499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800698
4603	NC_002946	TGA	2	6	247502	247507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800698
4604	NC_002946	GTC	2	6	247525	247530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800698
4605	NC_002946	CG	3	6	247583	247588	0 %	0 %	50 %	50 %	59800698
4606	NC_002946	ATGCG	2	10	247589	247598	20 %	20 %	40 %	20 %	59800698
4607	NC_002946	CCG	2	6	247628	247633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800698
4608	NC_002946	CGC	2	6	247703	247708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800698
4609	NC_002946	AAC	2	6	247730	247735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59800698
4610	NC_002946	AAG	2	6	247781	247786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800698
4611	NC_002946	CGC	2	6	247791	247796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800698
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4613	NC_002946	GAA	2	6	247916	247921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800699
4614	NC_002946	GAT	2	6	247961	247966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800699
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4616	NC_002946	TGA	2	6	248005	248010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800699
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4618	NC_002946	CGG	2	6	248092	248097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800699
4619	NC_002946	CCG	2	6	248109	248114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800699
4620	NC_002946	ATCC	2	8	248116	248123	25 %	25 %	0 %	50 %	59800699
4621	NC_002946	A	6	6	248172	248177	100 %	0 %	0 %	0 %	59800699
4622	NC_002946	ACA	2	6	248233	248238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59800700
4623	NC_002946	GAG	2	6	248264	248269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	59800700
4624	NC_002946	CTG	2	6	248300	248305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800700
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4626	NC_002946	GCG	2	6	249107	249112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800701
4627	NC_002946	GTC	2	6	249158	249163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800701
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4653	NC_002946	CG	3	6	250437	250442	0 %	0 %	50 %	50 %	59800702
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4689	NC_002946	AAT	2	6	252518	252523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59800705
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4748	NC_002946	GCA	2	6	255322	255327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800708
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4752	NC_002946	GTC	2	6	255623	255628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800709
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4855	NC_002946	GGGC	2	8	262607	262614	0 %	0 %	75 %	25 %	59800714
4856	NC_002946	GAT	2	6	262675	262680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800714
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4858	NC_002946	GCGG	2	8	262824	262831	0 %	0 %	75 %	25 %	59800714
4859	NC_002946	AC	3	6	263062	263067	50 %	0 %	0 %	50 %	59800714
4860	NC_002946	GCT	2	6	263161	263166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800714
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4862	NC_002946	CCTTTG	2	12	263264	263275	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	59800714
4863	NC_002946	CCG	2	6	263298	263303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800714
4864	NC_002946	CGC	2	6	263314	263319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800714
4865	NC_002946	TGC	2	6	263333	263338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800714
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4867	NC_002946	TGAC	2	8	263381	263388	25 %	25 %	25 %	25 %	59800714
4868	NC_002946	CGC	2	6	263400	263405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800714
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4995	NC_002946	ATC	2	6	269348	269353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800723
4996	NC_002946	GTC	2	6	269354	269359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800723
4997	NC_002946	GTT	2	6	269375	269380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59800723
4998	NC_002946	GCG	2	6	269393	269398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800723
4999	NC_002946	CAC	2	6	269483	269488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	59800723
5000	NC_002946	GGC	2	6	269526	269531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800723

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