MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Natronomonas moolapensis 8.8.11 complete genome

Total Repeats: 77008

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020388	CGG	2	6	201864	201869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452206061
5502	NC_020388	TCG	2	6	201902	201907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206061
5503	NC_020388	CGG	2	6	201947	201952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452206061
5504	NC_020388	TCG	2	6	201953	201958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206061
5505	NC_020388	GCGTC	2	10	201995	202004	0 %	20 %	40 %	40 %	452206061
5506	NC_020388	GAG	2	6	202042	202047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452206061
5507	NC_020388	GGTC	2	8	202115	202122	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5508	NC_020388	CGG	2	6	202127	202132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_020388	GCC	2	6	202158	202163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5510	NC_020388	CTC	2	6	202185	202190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452206062
5511	NC_020388	GC	3	6	202232	202237	0 %	0 %	50 %	50 %	452206062
5512	NC_020388	CGG	2	6	202248	202253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452206062
5513	NC_020388	CCG	2	6	202287	202292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452206062
5514	NC_020388	ACG	2	6	202325	202330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452206062
5515	NC_020388	GCGAC	2	10	202346	202355	20 %	0 %	40 %	40 %	452206062
5516	NC_020388	TCGGC	2	10	202377	202386	0 %	20 %	40 %	40 %	452206062
5517	NC_020388	TAC	2	6	202387	202392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452206062
5518	NC_020388	GTCGAG	2	12	202417	202428	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	452206062
5519	NC_020388	GC	3	6	202566	202571	0 %	0 %	50 %	50 %	452206062
5520	NC_020388	CGG	2	6	202580	202585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452206062
5521	NC_020388	TCG	2	6	202619	202624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206062
5522	NC_020388	CGG	2	6	202641	202646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452206062
5523	NC_020388	ACG	2	6	202649	202654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452206062
5524	NC_020388	ACG	2	6	202670	202675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452206062
5525	NC_020388	GGC	2	6	202712	202717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452206062
5526	NC_020388	GCGATC	2	12	202726	202737	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	452206062
5527	NC_020388	GGTGT	2	10	202762	202771	0 %	40 %	60 %	0 %	452206062
5528	NC_020388	GCC	2	6	202865	202870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452206062
5529	NC_020388	GCT	2	6	202920	202925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206062
5530	NC_020388	ACG	2	6	202937	202942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452206062
5531	NC_020388	CCCT	2	8	202966	202973	0 %	25 %	0 %	75 %	452206062
5532	NC_020388	ACG	2	6	203030	203035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452206062
5533	NC_020388	GCG	2	6	203038	203043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452206062
5534	NC_020388	TCG	2	6	203045	203050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206062
5535	NC_020388	GAG	2	6	203098	203103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452206062
5536	NC_020388	CCGG	2	8	203117	203124	0 %	0 %	50 %	50 %	452206062
5537	NC_020388	GATC	2	8	203145	203152	25 %	25 %	25 %	25 %	452206062
5538	NC_020388	GTC	2	6	203164	203169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206062
5539	NC_020388	CGA	2	6	203181	203186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452206062
5540	NC_020388	CGACAC	2	12	203205	203216	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	452206062
5541	NC_020388	CGG	2	6	203244	203249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452206062
5542	NC_020388	TCG	2	6	203291	203296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206062
5543	NC_020388	GACA	2	8	203305	203312	50 %	0 %	25 %	25 %	452206062
5544	NC_020388	ACGG	2	8	203331	203338	25 %	0 %	50 %	25 %	452206062
5545	NC_020388	TCG	2	6	203411	203416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206062
5546	NC_020388	GAC	2	6	203449	203454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452206062
5547	NC_020388	CGAG	2	8	203472	203479	25 %	0 %	50 %	25 %	452206062
5548	NC_020388	CG	3	6	203482	203487	0 %	0 %	50 %	50 %	452206062
5549	NC_020388	GC	4	8	203570	203577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5550	NC_020388	GT	3	6	203605	203610	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_020388	GT	3	6	203622	203627	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_020388	AC	3	6	203746	203751	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5553	NC_020388	AGT	2	6	203758	203763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_020388	TA	4	8	203785	203792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_020388	AAT	2	6	203859	203864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_020388	CGC	2	6	203917	203922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5557	NC_020388	CGG	2	6	203927	203932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_020388	AT	5	10	203957	203966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_020388	AGCC	2	8	204000	204007	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5560	NC_020388	CGG	2	6	204047	204052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_020388	GGT	2	6	204054	204059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_020388	CTG	2	6	204082	204087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206063
5563	NC_020388	CGC	3	9	204225	204233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452206063
5564	NC_020388	TCA	2	6	204248	204253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452206063
5565	NC_020388	AGG	2	6	204311	204316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452206063
5566	NC_020388	CGC	2	6	204348	204353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452206063
5567	NC_020388	GAC	2	6	204361	204366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452206063
5568	NC_020388	TTC	2	6	204394	204399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452206063
5569	NC_020388	GCC	2	6	204442	204447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452206063
5570	NC_020388	GTC	2	6	204448	204453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206063
5571	NC_020388	GCG	2	6	204490	204495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452206063
5572	NC_020388	CGC	2	6	204501	204506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452206063
5573	NC_020388	CAT	2	6	204519	204524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452206063
5574	NC_020388	GAG	2	6	204592	204597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452206063
5575	NC_020388	GGT	2	6	204610	204615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452206063
5576	NC_020388	CGC	2	6	204648	204653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452206063
5577	NC_020388	GCG	2	6	204658	204663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452206063
5578	NC_020388	ATG	2	6	204688	204693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452206063
5579	NC_020388	TGA	2	6	204710	204715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452206063
5580	NC_020388	CTT	2	6	204723	204728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452206063
5581	NC_020388	CGA	2	6	204732	204737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452206063
5582	NC_020388	CCG	2	6	204839	204844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452206063
5583	NC_020388	GGT	2	6	204874	204879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452206063
5584	NC_020388	CGC	2	6	204941	204946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452206063
5585	NC_020388	CGG	2	6	204999	205004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452206063
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5587	NC_020388	CGG	2	6	205020	205025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452206063
5588	NC_020388	CAG	2	6	205030	205035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452206063
5589	NC_020388	TCG	3	9	205070	205078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206063
5590	NC_020388	TCA	2	6	205088	205093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452206063
5591	NC_020388	CG	3	6	205094	205099	0 %	0 %	50 %	50 %	452206063
5592	NC_020388	CAG	2	6	205113	205118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452206063
5593	NC_020388	TCG	2	6	205484	205489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206063
5594	NC_020388	GC	3	6	205502	205507	0 %	0 %	50 %	50 %	452206063
5595	NC_020388	CGG	2	6	205554	205559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452206063
5596	NC_020388	CAA	2	6	205579	205584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452206063
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5599	NC_020388	CGT	2	6	205662	205667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206063
5600	NC_020388	CGC	2	6	205668	205673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452206063
5601	NC_020388	TCG	2	6	205691	205696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206063
5602	NC_020388	AGG	2	6	205700	205705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452206063
5603	NC_020388	CCT	2	6	205725	205730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452206063
5604	NC_020388	GCT	2	6	205734	205739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206063
5605	NC_020388	CTA	2	6	205740	205745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452206063
5606	NC_020388	CGTG	2	8	205827	205834	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5607	NC_020388	TA	3	6	205841	205846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_020388	GCG	2	6	205856	205861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_020388	CTC	2	6	205969	205974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452206064
5610	NC_020388	CGG	2	6	205975	205980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452206064
5611	NC_020388	CCA	2	6	206023	206028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452206064
5612	NC_020388	CGT	2	6	206070	206075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206064
5613	NC_020388	TCG	2	6	206091	206096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206064
5614	NC_020388	GGC	2	6	206125	206130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452206064
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5617	NC_020388	GAG	2	6	206210	206215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452206064
5618	NC_020388	GGTC	2	8	206217	206224	0 %	25 %	50 %	25 %	452206064
5619	NC_020388	CGG	2	6	206241	206246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452206064
5620	NC_020388	CCGT	2	8	206247	206254	0 %	25 %	25 %	50 %	452206064
5621	NC_020388	CGG	2	6	206265	206270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452206064
5622	NC_020388	GCC	2	6	206277	206282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452206064
5623	NC_020388	TGCG	2	8	206295	206302	0 %	25 %	50 %	25 %	452206064
5624	NC_020388	CGA	2	6	206334	206339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452206064
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5632	NC_020388	CAGA	2	8	206599	206606	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5633	NC_020388	CGA	2	6	206648	206653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5730	NC_020388	TCGA	2	8	210522	210529	25 %	25 %	25 %	25 %	452206067
5731	NC_020388	GGA	2	6	210538	210543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452206067
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5733	NC_020388	GC	4	8	210556	210563	0 %	0 %	50 %	50 %	452206067
5734	NC_020388	CGAT	2	8	210624	210631	25 %	25 %	25 %	25 %	452206067
5735	NC_020388	GCC	2	6	210728	210733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452206067
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5739	NC_020388	GC	3	6	210858	210863	0 %	0 %	50 %	50 %	452206067
5740	NC_020388	TCG	2	6	210927	210932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206067
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5742	NC_020388	CCG	2	6	211036	211041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452206067
5743	NC_020388	C	7	7	211050	211056	0 %	0 %	0 %	100 %	452206067
5744	NC_020388	CGTT	2	8	211098	211105	0 %	50 %	25 %	25 %	452206067
5745	NC_020388	GC	3	6	211143	211148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5849	NC_020388	TCG	2	6	215176	215181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206071
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5867	NC_020388	GTCG	2	8	215941	215948	0 %	25 %	50 %	25 %	452206072
5868	NC_020388	CGC	2	6	215973	215978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452206072
5869	NC_020388	GGA	2	6	215979	215984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452206072
5870	NC_020388	TCG	2	6	216002	216007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206072
5871	NC_020388	CGA	2	6	216045	216050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452206072
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5885	NC_020388	ATCGA	2	10	216434	216443	40 %	20 %	20 %	20 %	452206072
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5894	NC_020388	CGTCGG	2	12	216702	216713	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	452206072
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5897	NC_020388	GTG	2	6	216836	216841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452206072
5898	NC_020388	CGT	2	6	216874	216879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206072
5899	NC_020388	CGGCGT	2	12	216885	216896	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	452206072
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5905	NC_020388	CGA	2	6	217014	217019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452206072
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5907	NC_020388	CGA	2	6	217080	217085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452206072
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5929	NC_020388	GAC	2	6	217787	217792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452206073
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5940	NC_020388	CGGG	2	8	218247	218254	0 %	0 %	75 %	25 %	452206074
5941	NC_020388	CGG	2	6	218274	218279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452206074
5942	NC_020388	CGC	3	9	218287	218295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452206074
5943	NC_020388	CGAC	2	8	218328	218335	25 %	0 %	25 %	50 %	452206074
5944	NC_020388	TCG	3	9	218336	218344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206074
5945	NC_020388	TCG	2	6	218417	218422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206074
5946	NC_020388	GTC	2	6	218440	218445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206074
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5948	NC_020388	TCG	2	6	218519	218524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206074
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5956	NC_020388	ACA	2	6	218791	218796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452206074
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5962	NC_020388	CGT	2	6	218898	218903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206074
5963	NC_020388	TCG	2	6	218921	218926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206074
5964	NC_020388	CGC	2	6	218961	218966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452206074
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5966	NC_020388	GCG	2	6	219066	219071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452206074
5967	NC_020388	CCGC	2	8	219108	219115	0 %	0 %	25 %	75 %	452206074
5968	NC_020388	CCCG	2	8	219204	219211	0 %	0 %	25 %	75 %	452206074
5969	NC_020388	TCG	2	6	219215	219220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206074
5970	NC_020388	GC	4	8	219250	219257	0 %	0 %	50 %	50 %	452206074
5971	NC_020388	ACCG	2	8	219285	219292	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5972	NC_020388	CGT	2	6	219297	219302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5973	NC_020388	GGC	2	6	219357	219362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452206075
5974	NC_020388	CGAT	2	8	219373	219380	25 %	25 %	25 %	25 %	452206075
5975	NC_020388	GGC	2	6	219399	219404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452206075
5976	NC_020388	CGA	2	6	219449	219454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452206075
5977	NC_020388	CTC	2	6	219456	219461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452206075
5978	NC_020388	CTC	2	6	219471	219476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452206075
5979	NC_020388	CCG	2	6	219481	219486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452206075
5980	NC_020388	CTC	2	6	219504	219509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452206075
5981	NC_020388	CGGT	2	8	219664	219671	0 %	25 %	50 %	25 %	452206075
5982	NC_020388	CTC	2	6	219675	219680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452206075
5983	NC_020388	GGC	2	6	219682	219687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452206075
5984	NC_020388	CGG	2	6	219749	219754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452206075
5985	NC_020388	TCG	2	6	219802	219807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206075
5986	NC_020388	GAG	2	6	219834	219839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452206075
5987	NC_020388	CGGT	2	8	219868	219875	0 %	25 %	50 %	25 %	452206075
5988	NC_020388	TCG	2	6	219911	219916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206075
5989	NC_020388	GTGGG	2	10	219959	219968	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
5990	NC_020388	TCGC	2	8	219989	219996	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5991	NC_020388	CGA	2	6	220006	220011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5992	NC_020388	CGT	2	6	220027	220032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5993	NC_020388	GGTCGT	3	18	220033	220050	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5994	NC_020388	CGG	2	6	220054	220059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5995	NC_020388	CGCGC	2	10	220090	220099	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5996	NC_020388	GGC	2	6	220157	220162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452206076
5997	NC_020388	G	6	6	220205	220210	0 %	0 %	100 %	0 %	452206076
5998	NC_020388	CTC	2	6	220251	220256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452206076
5999	NC_020388	GAC	2	6	220262	220267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452206076
6000	NC_020388	CGC	2	6	220268	220273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452206076

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