MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Natronomonas moolapensis 8.8.11 complete genome

Total Repeats: 77008

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_020388	CGGGT	2	10	167092	167101	0 %	20 %	60 %	20 %	452206025
4502	NC_020388	TCG	3	9	167125	167133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206025
4503	NC_020388	GGCC	2	8	167138	167145	0 %	0 %	50 %	50 %	452206025
4504	NC_020388	CCG	2	6	167147	167152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452206025
4505	NC_020388	AGG	2	6	167197	167202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452206025
4506	NC_020388	GTT	2	6	167207	167212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452206025
4507	NC_020388	CGA	2	6	167228	167233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452206025
4508	NC_020388	CCA	2	6	167249	167254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452206025
4509	NC_020388	CCGC	2	8	167265	167272	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4510	NC_020388	CGA	2	6	167279	167284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_020388	CGAG	2	8	167372	167379	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4512	NC_020388	AT	3	6	167380	167385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_020388	AT	3	6	167388	167393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_020388	GAAA	2	8	167411	167418	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_020388	A	6	6	167423	167428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_020388	TAA	2	6	167432	167437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_020388	TA	3	6	167530	167535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_020388	GCA	2	6	167544	167549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_020388	GAACG	2	10	167551	167560	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4520	NC_020388	ACG	2	6	167593	167598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452206026
4521	NC_020388	TA	3	6	167659	167664	50 %	50 %	0 %	0 %	452206026
4522	NC_020388	CGA	2	6	167682	167687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452206026
4523	NC_020388	GC	3	6	167714	167719	0 %	0 %	50 %	50 %	452206026
4524	NC_020388	CGG	3	9	167741	167749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452206026
4525	NC_020388	TCC	2	6	168055	168060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4526	NC_020388	CAG	2	6	168080	168085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_020388	TTC	2	6	168126	168131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_020388	C	6	6	168140	168145	0 %	0 %	0 %	100 %	452206027
4529	NC_020388	CCG	3	9	168173	168181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452206027
4530	NC_020388	GCT	2	6	168187	168192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206027
4531	NC_020388	GGA	2	6	168226	168231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452206027
4532	NC_020388	CTA	2	6	168244	168249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452206027
4533	NC_020388	CGG	2	6	168272	168277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452206027
4534	NC_020388	AGC	2	6	168384	168389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452206027
4535	NC_020388	CG	3	6	168392	168397	0 %	0 %	50 %	50 %	452206027
4536	NC_020388	TCG	2	6	168399	168404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206027
4537	NC_020388	CCG	2	6	168412	168417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452206027
4538	NC_020388	CGA	2	6	168465	168470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452206027
4539	NC_020388	GAC	2	6	168475	168480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452206027
4540	NC_020388	TAC	2	6	168503	168508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452206027
4541	NC_020388	CCT	2	6	168532	168537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452206027
4542	NC_020388	TCG	2	6	168759	168764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206027
4543	NC_020388	CGTC	2	8	168819	168826	0 %	25 %	25 %	50 %	452206027
4544	NC_020388	TCG	2	6	168930	168935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206027
4545	NC_020388	GTC	2	6	168944	168949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206027
4546	NC_020388	CGG	2	6	169012	169017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452206027
4547	NC_020388	CGT	2	6	169021	169026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206027
4548	NC_020388	GCT	2	6	169033	169038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206027
4549	NC_020388	GC	3	6	169045	169050	0 %	0 %	50 %	50 %	452206027
4550	NC_020388	GGTCG	2	10	169057	169066	0 %	20 %	60 %	20 %	452206027
4551	NC_020388	TCG	2	6	169296	169301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206027
4552	NC_020388	CG	3	6	169334	169339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4553	NC_020388	GCC	2	6	169340	169345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4554	NC_020388	GT	3	6	169356	169361	0 %	50 %	50 %	0 %	452206028
4555	NC_020388	TCG	2	6	169405	169410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206028
4556	NC_020388	TCCGA	2	10	169419	169428	20 %	20 %	20 %	40 %	452206028
4557	NC_020388	GCC	2	6	169444	169449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452206028
4558	NC_020388	CGG	2	6	169454	169459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452206028
4559	NC_020388	TCG	2	6	169531	169536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206028
4560	NC_020388	GCC	2	6	169549	169554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452206028
4561	NC_020388	CGT	3	9	169580	169588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206028
4562	NC_020388	TCGC	2	8	169609	169616	0 %	25 %	25 %	50 %	452206028
4563	NC_020388	CAT	2	6	169662	169667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452206028
4564	NC_020388	GCG	2	6	169679	169684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452206028
4565	NC_020388	GCCC	2	8	169690	169697	0 %	0 %	25 %	75 %	452206028
4566	NC_020388	GAA	2	6	169758	169763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452206028
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4568	NC_020388	GCC	2	6	169822	169827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452206028
4569	NC_020388	CCGA	2	8	169829	169836	25 %	0 %	25 %	50 %	452206028
4570	NC_020388	GTC	2	6	169845	169850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206028
4571	NC_020388	GTC	2	6	169867	169872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206028
4572	NC_020388	TCG	2	6	169894	169899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206028
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4581	NC_020388	GAC	2	6	170151	170156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452206028
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4583	NC_020388	GAC	2	6	170181	170186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452206028
4584	NC_020388	CGA	2	6	170192	170197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452206028
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4586	NC_020388	TCG	2	6	170280	170285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4588	NC_020388	CAA	2	6	170315	170320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_020388	GAC	2	6	170355	170360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452206029
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4591	NC_020388	CCG	2	6	170375	170380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452206029
4592	NC_020388	ACCGGC	2	12	170455	170466	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	452206029
4593	NC_020388	C	6	6	170476	170481	0 %	0 %	0 %	100 %	452206029
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4602	NC_020388	GAC	2	6	170746	170751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452206029
4603	NC_020388	CCG	2	6	170753	170758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452206029
4604	NC_020388	CGGAT	2	10	170817	170826	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4605	NC_020388	GATCG	2	10	170829	170838	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4606	NC_020388	CGC	2	6	170893	170898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4607	NC_020388	GA	3	6	170899	170904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_020388	TCC	2	6	170972	170977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452206030
4609	NC_020388	TCG	2	6	170981	170986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206030
4610	NC_020388	CT	3	6	171064	171069	0 %	50 %	0 %	50 %	452206030
4611	NC_020388	CGC	2	6	171113	171118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452206030
4612	NC_020388	CGAC	2	8	171137	171144	25 %	0 %	25 %	50 %	452206030
4613	NC_020388	TCG	2	6	171170	171175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206030
4614	NC_020388	TCG	2	6	171191	171196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206030
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4617	NC_020388	TAC	2	6	171277	171282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452206030
4618	NC_020388	CGC	2	6	171336	171341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452206030
4619	NC_020388	GTC	2	6	171343	171348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206030
4620	NC_020388	TCGACG	2	12	171356	171367	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	452206030
4621	NC_020388	GCGCTC	3	18	171391	171408	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	452206030
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4623	NC_020388	GCG	2	6	171460	171465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452206030
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4865	NC_020388	CGT	2	6	179246	179251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206037
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4867	NC_020388	CGA	2	6	179350	179355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452206037
4868	NC_020388	GTC	2	6	179399	179404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206037
4869	NC_020388	CGG	2	6	179482	179487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452206037
4870	NC_020388	GC	3	6	179493	179498	0 %	0 %	50 %	50 %	452206037
4871	NC_020388	AAC	2	6	179568	179573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452206037
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4876	NC_020388	CGA	2	6	179728	179733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452206037
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4878	NC_020388	GTC	2	6	179779	179784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4879	NC_020388	GCT	2	6	179832	179837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452206038
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4884	NC_020388	ATCG	2	8	179994	180001	25 %	25 %	25 %	25 %	452206038
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4891	NC_020388	CCG	2	6	180135	180140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4923	NC_020388	CGG	3	9	181209	181217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452206040
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4972	NC_020388	CGG	2	6	183136	183141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4973	NC_020388	CCCA	2	8	183175	183182	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4974	NC_020388	CTA	2	6	183206	183211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4975	NC_020388	CGA	2	6	183280	183285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452206042
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4984	NC_020388	AGG	2	6	183507	183512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452206042
4985	NC_020388	CTC	2	6	183599	183604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452206042
4986	NC_020388	CG	4	8	183619	183626	0 %	0 %	50 %	50 %	452206042
4987	NC_020388	CGG	2	6	183676	183681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452206042
4988	NC_020388	AGG	2	6	183699	183704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452206042
4989	NC_020388	CCG	2	6	183767	183772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452206042
4990	NC_020388	TCC	2	6	183783	183788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452206042
4991	NC_020388	GCC	2	6	183793	183798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452206042
4992	NC_020388	GAT	2	6	183814	183819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452206042
4993	NC_020388	AACCG	2	10	183836	183845	40 %	0 %	20 %	40 %	452206042
4994	NC_020388	TCA	2	6	183855	183860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452206042
4995	NC_020388	CGC	2	6	183934	183939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452206042
4996	NC_020388	CAT	2	6	183955	183960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452206042
4997	NC_020388	CGA	2	6	183967	183972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452206042
4998	NC_020388	ATG	2	6	184040	184045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452206042
4999	NC_020388	CTC	2	6	184049	184054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452206042
5000	NC_020388	GCG	2	6	184080	184085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452206042

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