MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Natronococcus occultus SP4 plasmid 2

Total Repeats: 7003

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019976	TCC	2	6	127450	127455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849508
3002	NC_019976	CTG	2	6	127540	127545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849508
3003	NC_019976	TC	3	6	127581	127586	0 %	50 %	0 %	50 %	435849508
3004	NC_019976	AG	3	6	127597	127602	50 %	0 %	50 %	0 %	435849508
3005	NC_019976	TCG	2	6	127607	127612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849508
3006	NC_019976	TCC	2	6	127788	127793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849508
3007	NC_019976	GGC	2	6	127886	127891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849508
3008	NC_019976	AGC	2	6	127967	127972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849508
3009	NC_019976	GTC	2	6	127973	127978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849508
3010	NC_019976	TCG	2	6	128060	128065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849508
3011	NC_019976	GGT	2	6	128096	128101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	435849508
3012	NC_019976	GAT	2	6	128102	128107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849508
3013	NC_019976	CTT	2	6	128249	128254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_019976	GTC	2	6	128304	128309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_019976	GAG	2	6	128319	128324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_019976	TTCT	2	8	128340	128347	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3017	NC_019976	CGA	2	6	128408	128413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_019976	CAC	2	6	128437	128442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3019	NC_019976	TCC	2	6	128443	128448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3020	NC_019976	TCG	2	6	128452	128457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_019976	GTG	2	6	128479	128484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_019976	CGA	2	6	128552	128557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_019976	CTC	2	6	128574	128579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3024	NC_019976	TCG	2	6	128614	128619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_019976	GCC	2	6	128755	128760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3026	NC_019976	TCG	2	6	128785	128790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_019976	ACG	2	6	128857	128862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_019976	GTC	2	6	128903	128908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_019976	CTG	2	6	128989	128994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_019976	GTC	2	6	129053	129058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_019976	ATT	2	6	129086	129091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_019976	CAGC	3	12	129099	129110	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3033	NC_019976	CGT	2	6	129134	129139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_019976	TAT	2	6	129198	129203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_019976	CTAAA	2	10	129213	129222	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3036	NC_019976	TAA	2	6	129253	129258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_019976	CAC	2	6	129357	129362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435849509
3038	NC_019976	AGTTC	2	10	129416	129425	20 %	40 %	20 %	20 %	435849509
3039	NC_019976	GATC	2	8	129429	129436	25 %	25 %	25 %	25 %	435849509
3040	NC_019976	TCAC	2	8	129476	129483	25 %	25 %	0 %	50 %	435849509
3041	NC_019976	CAA	2	6	129489	129494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435849509
3042	NC_019976	TCA	2	6	129632	129637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849509
3043	NC_019976	TCG	2	6	129665	129670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849509
3044	NC_019976	TCAG	2	8	129701	129708	25 %	25 %	25 %	25 %	435849509
3045	NC_019976	GAT	2	6	129726	129731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849509
3046	NC_019976	TCG	2	6	129893	129898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849509
3047	NC_019976	TTC	2	6	129996	130001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_019976	AAG	2	6	130010	130015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_019976	AG	3	6	130023	130028	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_019976	GTT	2	6	130037	130042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_019976	TC	3	6	130094	130099	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3052	NC_019976	AAT	2	6	130170	130175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_019976	AGT	2	6	130184	130189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_019976	ACG	2	6	130193	130198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_019976	TTC	2	6	130264	130269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849510
3056	NC_019976	CGC	2	6	130348	130353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	435849510
3057	NC_019976	GAC	2	6	130369	130374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849510
3058	NC_019976	GTC	2	6	130393	130398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849510
3059	NC_019976	TCG	2	6	130460	130465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849510
3060	NC_019976	AAC	2	6	130469	130474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435849510
3061	NC_019976	TCC	2	6	130484	130489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849510
3062	NC_019976	CGT	2	6	130500	130505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849510
3063	NC_019976	ACG	2	6	130544	130549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849510
3064	NC_019976	CTT	2	6	130599	130604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849510
3065	NC_019976	GAC	2	6	130651	130656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849510
3066	NC_019976	GAT	2	6	130716	130721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849511
3067	NC_019976	GCC	2	6	130770	130775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	435849511
3068	NC_019976	CGAC	2	8	130784	130791	25 %	0 %	25 %	50 %	435849511
3069	NC_019976	CGA	3	9	130814	130822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849511
3070	NC_019976	GTC	2	6	130824	130829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849511
3071	NC_019976	GTG	2	6	130848	130853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	435849511
3072	NC_019976	ACG	2	6	130861	130866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849511
3073	NC_019976	CG	3	6	130899	130904	0 %	0 %	50 %	50 %	435849511
3074	NC_019976	TG	3	6	130972	130977	0 %	50 %	50 %	0 %	435849511
3075	NC_019976	CGG	2	6	130979	130984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849511
3076	NC_019976	GTC	2	6	131010	131015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849511
3077	NC_019976	CGG	2	6	131024	131029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849511
3078	NC_019976	CGA	2	6	131030	131035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849511
3079	NC_019976	CGA	2	6	131077	131082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849511
3080	NC_019976	GAA	2	6	131124	131129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849511
3081	NC_019976	GAG	2	6	131145	131150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849511
3082	NC_019976	AGA	2	6	131168	131173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849511
3083	NC_019976	CT	3	6	131181	131186	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3084	NC_019976	TC	3	6	131212	131217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3085	NC_019976	ACT	2	6	131263	131268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_019976	TAGA	2	8	131284	131291	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_019976	TTA	2	6	131306	131311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_019976	TC	3	6	131343	131348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3089	NC_019976	TAAC	2	8	131415	131422	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3090	NC_019976	GAC	2	6	131433	131438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_019976	AC	3	6	131460	131465	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3092	NC_019976	CTAA	2	8	131481	131488	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3093	NC_019976	GAATTG	2	12	131494	131505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_019976	TCC	2	6	131524	131529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3095	NC_019976	CATC	2	8	131641	131648	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3096	NC_019976	AGA	2	6	131679	131684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_019976	ATT	2	6	131702	131707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_019976	CCTT	2	8	131708	131715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3099	NC_019976	ATATA	2	10	131720	131729	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_019976	CTG	3	9	131856	131864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_019976	ATAC	2	8	131889	131896	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3102	NC_019976	ACA	2	6	131905	131910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_019976	AGCG	2	8	131932	131939	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3104	NC_019976	CGGA	2	8	132005	132012	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3105	NC_019976	TCC	2	6	132153	132158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849512
3106	NC_019976	AGC	2	6	132180	132185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849512
3107	NC_019976	CAG	2	6	132188	132193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849512
3108	NC_019976	GTT	2	6	132230	132235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_019976	CGTTC	2	10	132252	132261	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3110	NC_019976	AG	3	6	132275	132280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_019976	ACC	2	6	132299	132304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3112	NC_019976	GCC	2	6	132316	132321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3113	NC_019976	T	6	6	132360	132365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_019976	TTC	2	6	132389	132394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_019976	ACC	2	6	132395	132400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3116	NC_019976	ACG	2	6	132428	132433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_019976	CGG	3	9	132468	132476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_019976	GCCA	2	8	132518	132525	25 %	0 %	25 %	50 %	435849513
3119	NC_019976	GTC	2	6	132528	132533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849513
3120	NC_019976	ACG	2	6	132592	132597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849513
3121	NC_019976	CGAG	2	8	132616	132623	25 %	0 %	50 %	25 %	435849513
3122	NC_019976	CGC	2	6	132626	132631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	435849513
3123	NC_019976	CGG	2	6	132746	132751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849513
3124	NC_019976	CGT	2	6	132761	132766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849513
3125	NC_019976	CAA	2	6	132767	132772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435849513
3126	NC_019976	GATC	2	8	132779	132786	25 %	25 %	25 %	25 %	435849513
3127	NC_019976	CCG	2	6	132814	132819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	435849513
3128	NC_019976	ACGTCA	2	12	132838	132849	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	435849513
3129	NC_019976	GGC	2	6	132872	132877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849513
3130	NC_019976	CGAC	2	8	132898	132905	25 %	0 %	25 %	50 %	435849513
3131	NC_019976	CGGCG	2	10	132947	132956	0 %	0 %	60 %	40 %	435849513
3132	NC_019976	GAG	2	6	133098	133103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849513
3133	NC_019976	GAG	2	6	133110	133115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849513
3134	NC_019976	GGC	2	6	133118	133123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849513
3135	NC_019976	TGAACG	2	12	133213	133224	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	435849513
3136	NC_019976	GTCC	2	8	133255	133262	0 %	25 %	25 %	50 %	435849514
3137	NC_019976	GTCC	2	8	133276	133283	0 %	25 %	25 %	50 %	435849514
3138	NC_019976	CAGCCG	2	12	133313	133324	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	435849514
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3141	NC_019976	GTC	3	9	133409	133417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849514
3142	NC_019976	CCGAT	2	10	133485	133494	20 %	20 %	20 %	40 %	435849514
3143	NC_019976	CGA	3	9	133495	133503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849514
3144	NC_019976	CGACGG	2	12	133509	133520	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	435849514
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3146	NC_019976	GTC	2	6	133608	133613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849514
3147	NC_019976	GAC	2	6	133628	133633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849514
3148	NC_019976	TCG	2	6	133635	133640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849514
3149	NC_019976	AGCC	2	8	133662	133669	25 %	0 %	25 %	50 %	435849514
3150	NC_019976	GCC	2	6	133672	133677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	435849514
3151	NC_019976	GAT	2	6	133732	133737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849514
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3154	NC_019976	CGT	2	6	133813	133818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849514
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3156	NC_019976	CGA	2	6	133834	133839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849514
3157	NC_019976	CG	3	6	133841	133846	0 %	0 %	50 %	50 %	435849514
3158	NC_019976	TCG	2	6	133851	133856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849514
3159	NC_019976	CGG	2	6	133906	133911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849514
3160	NC_019976	GTC	2	6	133913	133918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849514
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3162	NC_019976	GCGA	2	8	134001	134008	25 %	0 %	50 %	25 %	435849514
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3202	NC_019976	CTA	2	6	135402	135407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849516
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3215	NC_019976	TC	3	6	136082	136087	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3216	NC_019976	ACGGA	2	10	136100	136109	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3217	NC_019976	GTACG	2	10	136197	136206	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3218	NC_019976	CGT	2	6	136224	136229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3219	NC_019976	ACGC	2	8	136260	136267	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3220	NC_019976	AC	3	6	136314	136319	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3221	NC_019976	ACT	2	6	136327	136332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3224	NC_019976	CAA	2	6	136497	136502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3227	NC_019976	AAT	2	6	136607	136612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3228	NC_019976	GAA	2	6	136646	136651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3229	NC_019976	TCG	3	9	136700	136708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849518
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3233	NC_019976	GTC	2	6	136909	136914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3234	NC_019976	CGA	2	6	136982	136987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849519
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3236	NC_019976	CTG	2	6	137010	137015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849519
3237	NC_019976	CGG	2	6	137061	137066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849519
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3239	NC_019976	CTCG	2	8	137108	137115	0 %	25 %	25 %	50 %	435849519
3240	NC_019976	ACCTG	2	10	137198	137207	20 %	20 %	20 %	40 %	435849519
3241	NC_019976	GGT	2	6	137287	137292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3242	NC_019976	TAC	2	6	137316	137321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3243	NC_019976	ACG	2	6	137376	137381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849520
3244	NC_019976	CTG	2	6	137382	137387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849520
3245	NC_019976	CGC	2	6	137425	137430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	435849520
3246	NC_019976	GTCG	2	8	137468	137475	0 %	25 %	50 %	25 %	435849520
3247	NC_019976	CCT	2	6	137495	137500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849520
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3368	NC_019976	CCG	2	6	141556	141561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3370	NC_019976	CGAT	2	8	141576	141583	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3493	NC_019976	GAG	2	6	146721	146726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849527
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