MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Natronococcus occultus SP4 plasmid 2

Total Repeats: 7003

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019976	CGG	2	6	47431	47436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_019976	GA	3	6	47445	47450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_019976	CTA	2	6	47506	47511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849440
1004	NC_019976	TCG	2	6	47519	47524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849440
1005	NC_019976	TCCTC	2	10	47538	47547	0 %	40 %	0 %	60 %	435849440
1006	NC_019976	ATC	2	6	47633	47638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849440
1007	NC_019976	TCT	2	6	47639	47644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849440
1008	NC_019976	GAA	2	6	47668	47673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849440
1009	NC_019976	CTTCG	2	10	47704	47713	0 %	40 %	20 %	40 %	435849440
1010	NC_019976	GCT	2	6	47726	47731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849440
1011	NC_019976	GTT	2	6	47797	47802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849440
1012	NC_019976	GGAA	2	8	47813	47820	50 %	0 %	50 %	0 %	435849440
1013	NC_019976	GAA	2	6	47858	47863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849440
1014	NC_019976	GAT	2	6	47914	47919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849440
1015	NC_019976	GTCA	2	8	48013	48020	25 %	25 %	25 %	25 %	435849440
1016	NC_019976	GCC	2	6	48077	48082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	435849440
1017	NC_019976	TCG	2	6	48164	48169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849440
1018	NC_019976	CTG	2	6	48336	48341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849440
1019	NC_019976	ACAGC	2	10	48399	48408	40 %	0 %	20 %	40 %	435849440
1020	NC_019976	CGT	2	6	48420	48425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849440
1021	NC_019976	CTT	2	6	48477	48482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849440
1022	NC_019976	GAA	2	6	48505	48510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849440
1023	NC_019976	TTC	2	6	48529	48534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849440
1024	NC_019976	GT	3	6	48588	48593	0 %	50 %	50 %	0 %	435849440
1025	NC_019976	AG	3	6	48649	48654	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_019976	GAG	2	6	48695	48700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_019976	TGA	2	6	48862	48867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849441
1028	NC_019976	AAG	2	6	48881	48886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849441
1029	NC_019976	CGGC	2	8	48950	48957	0 %	0 %	50 %	50 %	435849441
1030	NC_019976	CGCCGG	2	12	48983	48994	0 %	0 %	50 %	50 %	435849441
1031	NC_019976	TAGC	2	8	49003	49010	25 %	25 %	25 %	25 %	435849441
1032	NC_019976	GAC	2	6	49058	49063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849441
1033	NC_019976	ACG	3	9	49150	49158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849441
1034	NC_019976	AACTC	2	10	49159	49168	40 %	20 %	0 %	40 %	435849441
1035	NC_019976	TCA	2	6	49171	49176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849441
1036	NC_019976	CGA	2	6	49214	49219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849441
1037	NC_019976	CGG	2	6	49291	49296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849441
1038	NC_019976	CGGG	2	8	49309	49316	0 %	0 %	75 %	25 %	435849441
1039	NC_019976	CA	3	6	49342	49347	50 %	0 %	0 %	50 %	435849441
1040	NC_019976	TCG	3	9	49357	49365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849441
1041	NC_019976	CGG	2	6	49445	49450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849441
1042	NC_019976	CGGAG	2	10	49474	49483	20 %	0 %	60 %	20 %	435849441
1043	NC_019976	CGA	2	6	49612	49617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849441
1044	NC_019976	ATC	2	6	49641	49646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849441
1045	NC_019976	CAG	2	6	49652	49657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849441
1046	NC_019976	CGC	2	6	49700	49705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	435849441
1047	NC_019976	GCT	2	6	49709	49714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849441
1048	NC_019976	CGG	2	6	49738	49743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849441
1049	NC_019976	CCG	2	6	49753	49758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	435849441
1050	NC_019976	GAG	2	6	49779	49784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849441
1051	NC_019976	CGG	2	6	49808	49813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849441
1052	NC_019976	GAT	2	6	49857	49862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849441
1053	NC_019976	GTC	2	6	49902	49907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849441
1054	NC_019976	GAG	2	6	49980	49985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849441
1055	NC_019976	TCA	2	6	50020	50025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849441
1056	NC_019976	CCG	2	6	50036	50041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	435849441
1057	NC_019976	AGG	2	6	50098	50103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849441
1058	NC_019976	GGC	2	6	50150	50155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849441
1059	NC_019976	GGA	2	6	50171	50176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849441
1060	NC_019976	CGA	2	6	50180	50185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849441
1061	NC_019976	CGA	2	6	50255	50260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849441
1062	NC_019976	CGG	2	6	50302	50307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849441
1063	NC_019976	TCG	2	6	50308	50313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849441
1064	NC_019976	TC	3	6	50444	50449	0 %	50 %	0 %	50 %	435849441
1065	NC_019976	GC	3	6	50536	50541	0 %	0 %	50 %	50 %	435849441
1066	NC_019976	GGT	2	6	50695	50700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_019976	GAAATT	2	12	50724	50735	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_019976	CGA	2	6	50839	50844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_019976	CGA	2	6	50862	50867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_019976	CCA	2	6	50916	50921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_019976	CAT	2	6	50933	50938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_019976	CGA	2	6	50949	50954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_019976	GTC	2	6	50956	50961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_019976	CTC	2	6	51002	51007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_019976	TCG	2	6	51161	51166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_019976	CGC	2	6	51197	51202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1077	NC_019976	GTC	2	6	51214	51219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_019976	AAC	2	6	51256	51261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_019976	CGCT	2	8	51313	51320	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_019976	GCA	2	6	51358	51363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_019976	TGC	2	6	51378	51383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_019976	TGTC	2	8	51438	51445	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1083	NC_019976	AG	3	6	51504	51509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_019976	CGG	2	6	51571	51576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_019976	GA	3	6	51667	51672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_019976	CTC	2	6	51735	51740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_019976	AGCC	2	8	51802	51809	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1088	NC_019976	AAG	2	6	51811	51816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_019976	GGCT	2	8	51880	51887	0 %	25 %	50 %	25 %	435849442
1090	NC_019976	GTA	2	6	52116	52121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_019976	GAA	2	6	52149	52154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_019976	ATT	2	6	52162	52167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_019976	CCA	2	6	52176	52181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_019976	CTA	2	6	52244	52249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_019976	AGG	2	6	52299	52304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_019976	TGCGG	2	10	52352	52361	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1097	NC_019976	GAGC	2	8	52393	52400	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1098	NC_019976	T	6	6	52403	52408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_019976	GGA	2	6	52422	52427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_019976	GTG	2	6	52428	52433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_019976	CGA	2	6	52455	52460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_019976	GA	3	6	52619	52624	50 %	0 %	50 %	0 %	435849443
1103	NC_019976	CTT	2	6	52628	52633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849443
1104	NC_019976	CGT	2	6	52687	52692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849443
1105	NC_019976	TCA	2	6	52693	52698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849443
1106	NC_019976	GAAT	2	8	52735	52742	50 %	25 %	25 %	0 %	435849443
1107	NC_019976	TCC	2	6	52833	52838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849443
1108	NC_019976	TCG	2	6	52863	52868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849443
1109	NC_019976	TCG	2	6	52914	52919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849443
1110	NC_019976	ACC	2	6	52925	52930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435849443
1111	NC_019976	A	6	6	53055	53060	100 %	0 %	0 %	0 %	435849443
1112	NC_019976	T	6	6	53076	53081	0 %	100 %	0 %	0 %	435849443
1113	NC_019976	CA	3	6	53174	53179	50 %	0 %	0 %	50 %	435849443
1114	NC_019976	ATA	2	6	53193	53198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435849443
1115	NC_019976	TCTGC	2	10	53215	53224	0 %	40 %	20 %	40 %	435849443
1116	NC_019976	CGG	2	6	53326	53331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849444
1117	NC_019976	TCGGT	2	10	53343	53352	0 %	40 %	40 %	20 %	435849444
1118	NC_019976	TCG	2	6	53429	53434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849444
1119	NC_019976	GTC	3	9	53461	53469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849444
1120	NC_019976	ATC	2	6	53516	53521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849444
1121	NC_019976	CGA	2	6	53559	53564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849444
1122	NC_019976	CG	3	6	53623	53628	0 %	0 %	50 %	50 %	435849444
1123	NC_019976	GTT	2	6	53700	53705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849445
1124	NC_019976	CGA	2	6	53716	53721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849445
1125	NC_019976	TCG	2	6	53859	53864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849445
1126	NC_019976	TCC	2	6	53883	53888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849445
1127	NC_019976	TCG	2	6	53895	53900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849445
1128	NC_019976	ACG	2	6	53901	53906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849445
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1141	NC_019976	TCG	3	9	54363	54371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849445
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1238	NC_019976	GAAG	2	8	58360	58367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1240	NC_019976	AAGT	2	8	58389	58396	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1242	NC_019976	GCG	2	6	58544	58549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1244	NC_019976	CA	3	6	58594	58599	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1245	NC_019976	CAGT	2	8	58609	58616	25 %	25 %	25 %	25 %	435849451
1246	NC_019976	CGAT	2	8	58658	58665	25 %	25 %	25 %	25 %	435849451
1247	NC_019976	CGT	2	6	58677	58682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849451
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1252	NC_019976	ACT	2	6	58970	58975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1253	NC_019976	TTC	2	6	59059	59064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1254	NC_019976	ACAT	2	8	59110	59117	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1255	NC_019976	GCCAC	2	10	59153	59162	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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1257	NC_019976	GTC	2	6	59185	59190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1258	NC_019976	ACC	2	6	59280	59285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1273	NC_019976	ACCG	2	8	60354	60361	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1274	NC_019976	GTC	3	9	60366	60374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1280	NC_019976	CGATC	2	10	60487	60496	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1281	NC_019976	TTCT	2	8	60547	60554	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1383	NC_019976	CGA	2	6	65273	65278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849457
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1499	NC_019976	CGG	2	6	70914	70919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849461
1500	NC_019976	CGAT	2	8	70921	70928	25 %	25 %	25 %	25 %	435849461

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