MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Natronococcus occultus SP4 plasmid 2

Total Repeats: 7003

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019976	CGAA	2	8	23468	23475	50 %	0 %	25 %	25 %	435849413
502	NC_019976	GAC	2	6	23518	23523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849413
503	NC_019976	CGA	2	6	23535	23540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849413
504	NC_019976	GAC	2	6	23547	23552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849413
505	NC_019976	TCG	2	6	23555	23560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849413
506	NC_019976	CGTT	2	8	23581	23588	0 %	50 %	25 %	25 %	435849413
507	NC_019976	TGC	2	6	23639	23644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849413
508	NC_019976	GAC	2	6	23695	23700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849413
509	NC_019976	CTA	2	6	23712	23717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849413
510	NC_019976	GCC	2	6	23754	23759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	435849413
511	NC_019976	GGAC	2	8	23790	23797	25 %	0 %	50 %	25 %	435849413
512	NC_019976	TCC	2	6	23909	23914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849413
513	NC_019976	GCAA	2	8	23940	23947	50 %	0 %	25 %	25 %	435849413
514	NC_019976	GTG	2	6	23978	23983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	435849413
515	NC_019976	CGA	2	6	24038	24043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849413
516	NC_019976	CGT	2	6	24060	24065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849413
517	NC_019976	AGC	2	6	24103	24108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849413
518	NC_019976	GGA	2	6	24159	24164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849413
519	NC_019976	GAT	2	6	24165	24170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849413
520	NC_019976	ACG	2	6	24230	24235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849413
521	NC_019976	GGC	2	6	24294	24299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849413
522	NC_019976	GCG	2	6	24303	24308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849413
523	NC_019976	CGA	3	9	24324	24332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849413
524	NC_019976	CAC	2	6	24369	24374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435849413
525	NC_019976	GAT	3	9	24378	24386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849413
526	NC_019976	CGA	2	6	24462	24467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849413
527	NC_019976	GGC	2	6	24484	24489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849413
528	NC_019976	GAA	2	6	24490	24495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849413
529	NC_019976	CTG	2	6	24500	24505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849413
530	NC_019976	CCG	2	6	24545	24550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	435849413
531	NC_019976	TC	3	6	24560	24565	0 %	50 %	0 %	50 %	435849413
532	NC_019976	CGAG	2	8	24678	24685	25 %	0 %	50 %	25 %	435849413
533	NC_019976	CGA	2	6	24736	24741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849413
534	NC_019976	CGTC	2	8	24747	24754	0 %	25 %	25 %	50 %	435849413
535	NC_019976	TC	3	6	24780	24785	0 %	50 %	0 %	50 %	435849413
536	NC_019976	CT	3	6	24809	24814	0 %	50 %	0 %	50 %	435849413
537	NC_019976	CTG	2	6	24820	24825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849413
538	NC_019976	ACG	2	6	24896	24901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849413
539	NC_019976	CGA	2	6	24918	24923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849413
540	NC_019976	CTG	2	6	24925	24930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849413
541	NC_019976	ATCGAT	2	12	24964	24975	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	435849413
542	NC_019976	CGG	2	6	24979	24984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849413
543	NC_019976	TCA	2	6	25025	25030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849413
544	NC_019976	GTG	2	6	25109	25114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	435849413
545	NC_019976	GAA	2	6	25141	25146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849413
546	NC_019976	CCTC	2	8	25157	25164	0 %	25 %	0 %	75 %	435849413
547	NC_019976	GAG	2	6	25171	25176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849413
548	NC_019976	TCG	2	6	25181	25186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849413
549	NC_019976	CA	3	6	25190	25195	50 %	0 %	0 %	50 %	435849413
550	NC_019976	CGC	2	6	25211	25216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	435849413
551	NC_019976	CGG	2	6	25251	25256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849413
552	NC_019976	TCG	2	6	25277	25282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849413
553	NC_019976	CGT	2	6	25374	25379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849413
554	NC_019976	ACGG	2	8	25532	25539	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
555	NC_019976	GA	3	6	25564	25569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
556	NC_019976	CTG	2	6	25603	25608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_019976	TCGT	2	8	25627	25634	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
558	NC_019976	TGG	2	6	25741	25746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	435849414
559	NC_019976	CCA	2	6	25781	25786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435849414
560	NC_019976	GAT	2	6	25840	25845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849414
561	NC_019976	CCG	2	6	25859	25864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	435849414
562	NC_019976	GGCT	2	8	25875	25882	0 %	25 %	50 %	25 %	435849414
563	NC_019976	ACA	2	6	25899	25904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435849414
564	NC_019976	GAC	2	6	25927	25932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849414
565	NC_019976	TC	3	6	25991	25996	0 %	50 %	0 %	50 %	435849414
566	NC_019976	GAG	2	6	26023	26028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849414
567	NC_019976	TGA	2	6	26061	26066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849414
568	NC_019976	GAAAAC	2	12	26211	26222	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
569	NC_019976	TCGTT	2	10	26296	26305	0 %	60 %	20 %	20 %	435849415
570	NC_019976	CGT	2	6	26371	26376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849415
571	NC_019976	GAC	2	6	26454	26459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849415
572	NC_019976	CTG	2	6	26536	26541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849415
573	NC_019976	CAG	2	6	26709	26714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849415
574	NC_019976	TCG	2	6	26728	26733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849415
575	NC_019976	CGT	2	6	26738	26743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849415
576	NC_019976	TGGC	2	8	26762	26769	0 %	25 %	50 %	25 %	435849415
577	NC_019976	TTC	2	6	26781	26786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849415
578	NC_019976	TCG	2	6	26839	26844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849415
579	NC_019976	CAT	2	6	26846	26851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849415
580	NC_019976	CCTGG	2	10	26867	26876	0 %	20 %	40 %	40 %	435849415
581	NC_019976	CATG	2	8	26918	26925	25 %	25 %	25 %	25 %	435849415
582	NC_019976	CGT	2	6	27029	27034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849415
583	NC_019976	GTC	2	6	27069	27074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849415
584	NC_019976	ACA	2	6	27123	27128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435849415
585	NC_019976	CAG	2	6	27129	27134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849415
586	NC_019976	CTG	2	6	27204	27209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_019976	TCG	2	6	27241	27246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849416
588	NC_019976	GAG	2	6	27354	27359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849416
589	NC_019976	AAG	2	6	27414	27419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849416
590	NC_019976	CCTC	2	8	27459	27466	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
591	NC_019976	GGT	2	6	27481	27486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_019976	GTTG	2	8	27496	27503	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
593	NC_019976	GA	3	6	27640	27645	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
594	NC_019976	AC	3	6	27671	27676	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
595	NC_019976	TGC	2	6	27708	27713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_019976	CGT	2	6	27771	27776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_019976	GAC	2	6	27822	27827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_019976	GTA	2	6	27891	27896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_019976	GCT	2	6	27977	27982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_019976	CGA	2	6	27995	28000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_019976	TC	3	6	28095	28100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
602	NC_019976	GAT	2	6	28153	28158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_019976	CGG	2	6	28245	28250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_019976	TGGG	2	8	28258	28265	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
605	NC_019976	AAGCG	2	10	28305	28314	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
606	NC_019976	AGGG	2	8	28318	28325	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
607	NC_019976	TAC	2	6	28370	28375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_019976	GTA	2	6	28393	28398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_019976	CAC	2	6	28406	28411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_019976	GTT	2	6	28421	28426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_019976	TCG	2	6	28449	28454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_019976	CAA	2	6	28589	28594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_019976	GCA	2	6	28802	28807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_019976	TCTCC	2	10	28884	28893	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
615	NC_019976	TCCCC	2	10	28900	28909	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
616	NC_019976	C	6	6	28906	28911	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
617	NC_019976	TC	3	6	28915	28920	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
618	NC_019976	GTT	2	6	28939	28944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_019976	TATCG	2	10	29002	29011	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
620	NC_019976	TG	3	6	29019	29024	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_019976	GTA	2	6	29062	29067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_019976	CACT	2	8	29081	29088	25 %	25 %	0 %	50 %	435849417
623	NC_019976	ACC	2	6	29102	29107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435849417
624	NC_019976	TCG	2	6	29141	29146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849417
625	NC_019976	CGA	2	6	29155	29160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849417
626	NC_019976	CCGA	2	8	29212	29219	25 %	0 %	25 %	50 %	435849417
627	NC_019976	GT	3	6	29270	29275	0 %	50 %	50 %	0 %	435849417
628	NC_019976	CACCGA	2	12	29311	29322	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	435849417
629	NC_019976	CAT	2	6	29404	29409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849417
630	NC_019976	CGC	2	6	29481	29486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	435849417
631	NC_019976	GTGCCT	2	12	29491	29502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849417
632	NC_019976	CGATT	2	10	29674	29683	20 %	40 %	20 %	20 %	435849417
633	NC_019976	CTT	2	6	29709	29714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_019976	TA	3	6	29721	29726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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639	NC_019976	CGA	2	6	29859	29864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849418
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642	NC_019976	GAG	2	6	29980	29985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849418
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649	NC_019976	CAGTT	2	10	30189	30198	20 %	40 %	20 %	20 %	435849418
650	NC_019976	TCT	2	6	30223	30228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
651	NC_019976	TCATA	2	10	30485	30494	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
652	NC_019976	ATTAA	2	10	30496	30505	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
653	NC_019976	GGT	2	6	30533	30538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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688	NC_019976	TAC	2	6	32314	32319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849421
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730	NC_019976	GGC	2	6	34481	34486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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732	NC_019976	TGTGT	2	10	34550	34559	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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751	NC_019976	CGG	2	6	35865	35870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
752	NC_019976	ACATCG	2	12	35933	35944	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
753	NC_019976	GAA	2	6	36091	36096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
754	NC_019976	TGC	2	6	36131	36136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
755	NC_019976	TGC	2	6	36224	36229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
756	NC_019976	ACTCA	2	10	36246	36255	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
757	NC_019976	TTC	2	6	36302	36307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849425
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