MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Natronococcus occultus SP4 plasmid 1

Total Repeats: 169

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019975	CGA	2	6	138	143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849357
2	NC_019975	GAA	2	6	187	192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849357
3	NC_019975	GAC	2	6	223	228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849357
4	NC_019975	GAC	2	6	261	266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849357
5	NC_019975	AGT	2	6	293	298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849357
6	NC_019975	CGA	2	6	301	306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849358
7	NC_019975	TCG	2	6	363	368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849358
8	NC_019975	TGA	2	6	475	480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849358
9	NC_019975	CGG	2	6	620	625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849358
10	NC_019975	CGT	2	6	655	660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849358
11	NC_019975	GAG	2	6	671	676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849358
12	NC_019975	ATA	2	6	853	858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019975	AAC	2	6	953	958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019975	AAT	2	6	981	986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019975	GCA	2	6	1038	1043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019975	ACG	2	6	1070	1075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019975	CCG	2	6	1150	1155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_019975	CGA	2	6	1480	1485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849359
19	NC_019975	CCG	2	6	1506	1511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	435849359
20	NC_019975	GAG	2	6	1520	1525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849359
21	NC_019975	CAA	2	6	1558	1563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435849359
22	NC_019975	CGA	2	6	1570	1575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849359
23	NC_019975	TCG	2	6	1704	1709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849359
24	NC_019975	ACT	2	6	1791	1796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849360
25	NC_019975	ACG	2	6	1826	1831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849360
26	NC_019975	TCG	2	6	1891	1896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849360
27	NC_019975	TGT	2	6	1911	1916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849360
28	NC_019975	GAG	2	6	2020	2025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849360
29	NC_019975	TTC	2	6	2060	2065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849360
30	NC_019975	GGA	2	6	2067	2072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849360
31	NC_019975	GCA	2	6	2169	2174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849360
32	NC_019975	CGA	2	6	2196	2201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849360
33	NC_019975	TGG	2	6	2342	2347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	435849360
34	NC_019975	ACC	2	6	2372	2377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435849360
35	NC_019975	GAC	2	6	2406	2411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849361
36	NC_019975	TAG	2	6	2519	2524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849361
37	NC_019975	ACG	2	6	2581	2586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849361
38	NC_019975	CAG	3	9	2725	2733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849361
39	NC_019975	ACT	2	6	2776	2781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849361
40	NC_019975	GCG	2	6	2807	2812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849362
41	NC_019975	CGA	2	6	2827	2832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849362
42	NC_019975	AGG	2	6	2886	2891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849362
43	NC_019975	GAA	2	6	3089	3094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849363
44	NC_019975	GAA	2	6	3308	3313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849363
45	NC_019975	AAT	2	6	3327	3332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435849363
46	NC_019975	ACG	2	6	3422	3427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849364
47	NC_019975	GAG	2	6	3529	3534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849364
48	NC_019975	TGA	2	6	3540	3545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849364
49	NC_019975	AAC	2	6	3597	3602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019975	CGG	2	6	3797	3802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019975	CGG	2	6	3986	3991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849365
52	NC_019975	TGA	2	6	4010	4015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849365
53	NC_019975	AGT	2	6	4051	4056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849366
54	NC_019975	TTG	2	6	4163	4168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019975	CAT	2	6	4242	4247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019975	CTG	2	6	4279	4284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019975	ATG	2	6	4318	4323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019975	TAA	2	6	4431	4436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019975	ACG	2	6	4522	4527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019975	CAA	2	6	4653	4658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019975	TCC	2	6	4671	4676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_019975	TCC	2	6	4724	4729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_019975	ATC	2	6	4796	4801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019975	GTC	2	6	4864	4869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019975	AAC	2	6	4888	4893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019975	AGT	2	6	4925	4930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019975	CTC	2	6	4960	4965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_019975	GAA	2	6	5101	5106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019975	AAG	2	6	5107	5112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019975	TCG	2	6	5182	5187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849367
71	NC_019975	CAC	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435849367
72	NC_019975	GCG	2	6	5277	5282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849367
73	NC_019975	TTC	2	6	5292	5297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849367
74	NC_019975	CTC	2	6	5322	5327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849367
75	NC_019975	ATT	2	6	5376	5381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019975	TTC	2	6	5702	5707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849368
77	NC_019975	TCA	2	6	5745	5750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849368
78	NC_019975	ACC	2	6	5757	5762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435849368
79	NC_019975	CGG	2	6	5863	5868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849369
80	NC_019975	GCT	2	6	5886	5891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849369
81	NC_019975	CGG	2	6	5976	5981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849369
82	NC_019975	TCG	2	6	6008	6013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849369
83	NC_019975	GGT	2	6	6019	6024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	435849369
84	NC_019975	TTG	2	6	6154	6159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849370
85	NC_019975	CGG	2	6	6215	6220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849370
86	NC_019975	TCG	2	6	6238	6243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849370
87	NC_019975	CCA	2	6	6326	6331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_019975	TAA	2	6	6404	6409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019975	GTA	2	6	6428	6433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019975	CGA	2	6	6508	6513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849371
91	NC_019975	CAC	2	6	6586	6591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435849371
92	NC_019975	GAG	2	6	6656	6661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849371
93	NC_019975	CTT	2	6	6698	6703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849371
94	NC_019975	CGA	2	6	6798	6803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849372
95	NC_019975	GAG	2	6	6814	6819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849372
96	NC_019975	TGA	2	6	6879	6884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849372
97	NC_019975	TGA	2	6	6900	6905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849372
98	NC_019975	AGC	2	6	6926	6931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849372
99	NC_019975	GTG	2	6	7089	7094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	435849372
100	NC_019975	GAA	2	6	7463	7468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849373
101	NC_019975	GAC	2	6	7517	7522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849373
102	NC_019975	ACT	2	6	7591	7596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849373
103	NC_019975	ACG	2	6	7634	7639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849373
104	NC_019975	CGA	3	9	7647	7655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849374
105	NC_019975	CGA	2	6	7758	7763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849374
106	NC_019975	CGA	2	6	7800	7805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849374
107	NC_019975	TGG	2	6	7829	7834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019975	GAG	2	6	7853	7858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019975	CAC	2	6	8212	8217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_019975	CTA	2	6	8310	8315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019975	GGA	2	6	8373	8378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019975	CGT	2	6	8440	8445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849375
113	NC_019975	CGT	2	6	8547	8552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849375
114	NC_019975	GCG	2	6	8558	8563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849375
115	NC_019975	GCA	2	6	8571	8576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849375
116	NC_019975	CTG	2	6	8611	8616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849375
117	NC_019975	TCA	2	6	8624	8629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849375
118	NC_019975	CTC	2	6	8703	8708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849375
119	NC_019975	AAG	2	6	8717	8722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849375
120	NC_019975	AAC	2	6	8753	8758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435849375
121	NC_019975	GCA	2	6	8772	8777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849375
122	NC_019975	CAA	2	6	8789	8794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435849375
123	NC_019975	TGA	2	6	8865	8870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849375
124	NC_019975	AAG	2	6	8982	8987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019975	CAG	2	6	9046	9051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_019975	AGT	2	6	9174	9179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019975	GGT	2	6	9322	9327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019975	AGA	2	6	9665	9670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849377
129	NC_019975	GAA	2	6	9675	9680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849377
130	NC_019975	GGC	2	6	9711	9716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849377
131	NC_019975	ACG	2	6	9793	9798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
132	NC_019975	AGC	2	6	9868	9873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
133	NC_019975	TCG	2	6	9895	9900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849377
134	NC_019975	GGT	2	6	9990	9995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	435849377
135	NC_019975	ACG	2	6	10054	10059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
136	NC_019975	AAG	2	6	10143	10148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849377
137	NC_019975	GAG	2	6	10155	10160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849377
138	NC_019975	GCA	2	6	10177	10182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
139	NC_019975	ACG	2	6	10189	10194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
140	NC_019975	GAC	2	6	10233	10238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
141	NC_019975	GAA	2	6	10259	10264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849377
142	NC_019975	CCG	2	6	10309	10314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	435849377
143	NC_019975	AAC	2	6	10494	10499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435849377
144	NC_019975	CGA	2	6	10601	10606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
145	NC_019975	CGA	2	6	10637	10642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
146	NC_019975	GAC	2	6	10844	10849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
147	NC_019975	GAC	2	6	11001	11006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
148	NC_019975	CGT	2	6	11008	11013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849377
149	NC_019975	GGT	2	6	11164	11169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	435849377
150	NC_019975	CAC	2	6	11270	11275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435849377
151	NC_019975	GCT	2	6	11375	11380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849377
152	NC_019975	ACG	2	6	11383	11388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
153	NC_019975	ACG	2	6	11497	11502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
154	NC_019975	CGC	2	6	11518	11523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	435849377
155	NC_019975	AGC	2	6	11539	11544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
156	NC_019975	GAC	2	6	11582	11587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
157	NC_019975	CGA	2	6	11753	11758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
158	NC_019975	CAG	2	6	11847	11852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
159	NC_019975	TGA	2	6	11930	11935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849377
160	NC_019975	TCG	2	6	12048	12053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849377
161	NC_019975	GAG	2	6	12111	12116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849377
162	NC_019975	AAC	2	6	12327	12332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435849377
163	NC_019975	CGA	2	6	12383	12388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
164	NC_019975	TGG	2	6	12485	12490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	435849377
165	NC_019975	CGA	2	6	12506	12511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849377
166	NC_019975	GCT	2	6	12702	12707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849377
167	NC_019975	CTA	2	6	12733	12738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849377
168	NC_019975	GAA	2	6	12755	12760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849377
169	NC_019975	GGC	2	6	12869	12874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849377

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.